NCC-149

别名: NCC149 NCC 149 NCC-149 N-羟基-3-[1-(苯基硫代)甲基-1H-1,2,3-三氮唑-4-基]苯甲酰胺
目录号: V26313 纯度: ≥98%
NCC-149 (NCC149; NCC 149) 是一种新型、有效、选择性的组蛋白脱乙酰酶 8 (HDAC8) 抑制剂,IC50 为 70 nM。
NCC-149 CAS号: 1316652-41-1
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
NCC-149(NCC149;NCC 149)是一种新型、高效且选择性的组蛋白去乙酰化酶8 (HDAC8) 抑制剂,IC50 为 70 nM。
NCC-149(CAS 1316652-41-1),又名 N-羟基-3-[1-(苯硫基)甲基-1H-1,2,3-三唑-4-基]苯甲酰胺,是一种小分子研究化合物,分子式为 C₁₆H₁₄N₄O₂S,分子量为 326.37 g/mol。该化合物具有羟肟酸结构单元、三唑环和苯硫基取代基,提示其可能具有金属螯合或酶抑制活性。它为浅黄色至棕色粉末,经高效液相色谱法 (HPLC) 测定,纯度 >96.0%。该化合物被归类为研究级化学品,仅供实验室使用。其结构特征,特别是羟肟酸基团,是能够螯合金属离子并抑制金属酶(例如组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 或基质金属蛋白酶 (MMP))的化合物的典型特征。三唑环可提供额外的氢键和π-π堆积相互作用,从而与生物靶标结合。
生物活性&实验参考方法
靶点
NCC-149 is a hydroxamic acid-containing compound, and based on its structural features, it is hypothesized to target metal-dependent enzymes such as histone deacetylases (HDACs) or matrix metalloproteinases (MMPs). Hydroxamic acids are well-established pharmacophores that chelate zinc ions in the active sites of HDACs and MMPs, thereby inhibiting their enzymatic activity. The compound may also interact with other metalloenzymes or proteins through the triazole and phenylthio moieties, which can engage in hydrogen bonding and hydrophobic interactions. However, specific target validation studies for NCC-149 have not been published, and its precise molecular target remains to be confirmed experimentally. The compound is primarily used as a research tool for studying metalloenzyme inhibition and related biological pathways. Further biochemical assays (e.g., enzyme activity assays, binding studies) are needed to definitively establish its target profile.
体外研究 (In Vitro)
NCC-149(5 μM;3 天)可显著降低 P19 细胞中 NeuN 的表达水平 [1]。NCC-149(0-40 μM;4 天)以剂量依赖的方式降低胚状体细胞的体积 [1]。NCC-149(5 和 20 μM;24 小时)抑制 P19 细胞的增殖 [1]。NCC-149(2.5 和 5 μM;24 小时)通过 G2/M 期阻滞延缓细胞发育 [1]。由于 NCC-149 是一种相对较新的研究化学品,其体外活性数据有限。基于其羟肟酸结构,预计它在无细胞和基于细胞的实验中均对锌依赖性酶(如 HDAC 或 MMP)表现出抑制活性。含羟肟酸的化合物通常对其靶酶的 IC₅₀ 值在纳摩尔至微摩尔范围内。该化合物的活性可通过生化分析中利用重组酶测定酶抑制率,或通过评估细胞表型(例如组蛋白高乙酰化(用于评估 HDAC 抑制)或细胞外基质降解减少(用于评估 MMP 抑制))来评价。三唑和苯硫基可能有助于靶点选择性和结合亲和力。然而,由于缺乏已发表的实验数据,NCC-149 的特异性效力和选择性仍有待确定。
体内研究 (In Vivo)
目前已发表的文献中尚无NCC-149的体内活性数据。作为一种研究级化合物,其尚未在动物模型中进行药代动力学或药效学评估。根据其分子量(326.37 g/mol)和亲脂性(由于苯硫基的存在),该化合物可能具有中等的口服生物利用度和血脑屏障通透性,但这些特性尚未得到实验证实。未来需要开展研究,以评估其在与其潜在靶点相关的疾病模型(例如,HDAC抑制剂的癌症模型或MMP抑制剂的炎症模型)中的体内疗效。该化合物目前仅可用于体外研究,尚未进入临床前或临床开发阶段。
酶活实验
NCC-149 的体外酶/受体结合试验通常涉及使用荧光或比色底物测定重组 HDAC 或 MMP 酶的抑制情况。典型的实验方案如下:将重组人 HDAC 或 MMP 酶与不同浓度的 NCC-149(0.1 nM 至 100 μM)在测定缓冲液(例如,50 mM Tris-HCl,pH 8.0,137 mM NaCl,2.7 mM KCl,1 mM MgCl₂)中于 37°C 孵育 30 分钟。加入荧光底物(例如,HDAC 的底物为 Ac-肽-AMC,MMP 的底物为 DQ-明胶),并使用微孔板读数仪连续监测 60-120 分钟的荧光强度。通过将抑制曲线拟合到四参数逻辑模型来计算 IC₅₀ 值。阳性对照包括已知的抑制剂,例如曲古抑菌素A(用于抑制HDAC)或马立马司他(用于抑制MMP)。每个浓度均进行三次重复测试,且实验至少重复三次。
细胞实验
Western Blot 分析[1]
细胞类型: P19 细胞
测试浓度: 5 μM
孵育时间: 3 天
实验结果: NeuN 表达水平显著降低。

细胞增殖实验[1]
细胞类型: P19 细胞
测试浓度: 5 和 20 μM
孵育时间: 24 小时
实验结果: 细胞增殖受到抑制。

细胞周期分析[1]
细胞类型: P19 细胞
测试浓度: 2.5 和 5 μM
孵育时间: 24 小时
实验结果: 结果显示 G2/M 期细胞显著增加,S 期细胞略有减少。

RT-PCR[1]
细胞类型: P19 细胞
测试浓度: 25 μM 或 2.5 和 5 μM
孵育时间: 4 天 (25 μM) 或 48 小时 (2.5 和 5 μM)
实验结果: HDAC8 mRNA 水平表达未见降低。细胞周期蛋白B1和细胞周期蛋白A2的基因表达分别显著降低和部分降低。
体外细胞实验将评估NCC-149对癌细胞系或其他相关细胞类型的影响。典型实验方案:将细胞(例如HeLa或MDA-MB-231)以5,000-10,000个细胞/孔的密度接种于96孔板中,并使其过夜贴壁。用浓度范围为0.1 μM至100 μM的NCC-149处理细胞24-72小时。根据制造商的说明,使用MTT或CellTiter-Glo试剂盒评估细胞活力。对于HDAC抑制,在处理6-24小时后,使用抗乙酰化组蛋白H3或H4抗体通过Western blot检测组蛋白乙酰化水平。通过Annexin V/PI染色和流式细胞术评估细胞凋亡。采用碘化丙啶染色分析细胞周期分布。每种条件均进行三次重复测试,且实验至少重复三次。实验包括DMSO溶剂对照和阳性对照(例如,用于抑制HDAC的辛酰苯胺异羟肟酸)。
动物实验
目前尚未有关于NCC-149的体内动物研究报道。如果开展此类研究,评估羟肟酸类化合物的典型方案是:将化合物以10至100 mg/kg的剂量,每日或隔日给药,持续2-4周,通过灌胃或腹腔注射的方式给予荷瘤小鼠(例如,异种移植模型)。每2-3天用游标卡尺测量肿瘤体积,并监测体重以评估毒性。研究结束后,收集肿瘤组织进行组织病理学检查和生物标志物分析(例如,通过免疫组化或蛋白质印迹法检测组蛋白乙酰化)。同时采集血浆样本进行药代动力学分析。然而,由于NCC-149是一种研究级化合物,尚无已发表的体内数据,因此这些方案仅为假设,并基于类似含羟肟酸类化合物的标准操作流程。
药代性质 (ADME/PK)
已发表的文献中尚未对NCC-149的药代动力学特性进行表征。根据其理化性质(分子量326.37 g/mol,LogP值由结构估算),该化合物预计具有中等的口服生物利用度,但尚未通过实验证实。羟肟酸基团的存在可能导致其通过葡萄糖醛酸化或硫酸化快速代谢,这在该类化合物中较为常见。该化合物的血浆蛋白结合率、分布容积、半衰期和清除率仍不清楚。对于含羟肟酸的化合物,啮齿动物的典型半衰期为1-4小时,口服生物利用度为10-50%,具体数值取决于化合物的结构。然而,这些只是一般估计值,并非针对NCC-149。需要进行药代动力学研究才能准确确定这些参数。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
已发表的文献中没有关于NCC-149的毒理学数据。作为一种研究级化合物,它尚未经过正式的毒理学测试。含羟肟酸的化合物可能表现出与金属螯合相关的毒性,包括致畸性、血液学效应和胃肠道紊乱。处理该化合物时应遵循标准的实验室安全预防措施:使用个人防护装备(手套、护目镜、实验服)并在通风良好的通风橱中进行操作。该化合物应储存在室温下或按照供应商的说明储存。目前尚无遗传毒性、致癌性或生殖毒性数据。研究人员在操作前应查阅安全数据表(SDS)并遵循机构的化学品安全指南。该化合物不属于危险药物,但由于含有硫醚和羟肟酸部分,因此应谨慎处理。
参考文献

[1]. HDAC8 regulates neural differentiation through embryoid body formation in P19 cells. Biochem Biophys Res Commun. 2018 Mar 25;498(1):45-51.

其他信息
关于NCC-149的补充信息:该化合物的CAS号为1316652-41-1。其分子式为C₁₆H₁₄N₄O₂S,分子量为326.37 g/mol。该化合物为浅黄色至棕色粉末,HPLC纯度>96.0%。其别名包括N-羟基-3-[1-(苯硫基)甲基-1H-1,2,3-三唑-4-基]苯甲酰胺。MDL编号为MFCD21363002。该化合物为研究级化学品,仅供实验室使用。目前尚无该化合物的临床试验、FDA批准或研究性新药(IND)申请。基于羟肟酸药效团,推测其作用机制可能涉及金属酶抑制,但尚未经过实验验证。需要进一步的生物化学和细胞学研究来充分表征其生物活性和治疗潜力。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C16H14N4O2S
分子量
326.374
精确质量
326.083
CAS号
1316652-41-1
PubChem CID
135567459
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
熔点
153 °C(dec.)
折射率
1.691
LogP
1.6
tPSA
108.83
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
23
分子复杂度/Complexity
392
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
DORPIZJGSLWDIY-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C16H14N4O2S/c21-16(18-22)13-6-4-5-12(9-13)15-10-20(19-17-15)11-23-14-7-2-1-3-8-14/h1-10,22H,11H2,(H,18,21)
化学名
N-hydroxy-3-[1-(phenylsulfanylmethyl)triazol-4-yl]benzamide
别名
NCC149 NCC 149 NCC-149
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~125 mg/mL (~383.00 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.0640 mL 15.3200 mL 30.6401 mL
5 mM 0.6128 mL 3.0640 mL 6.1280 mL
10 mM 0.3064 mL 1.5320 mL 3.0640 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们