| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 100mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
NCDM-32B targets the KDM4 (JMJD2) subfamily of Jumonji C domain-containing histone lysine demethylases (JHDMs). It specifically inhibits KDM4C (JMJD2C), a histone demethylase that removes methyl groups from histone H3 at lysine 9 and lysine 36. By inhibiting KDM4 demethylase activity, NCDM-32B alters chromatin structure and gene expression patterns. This mechanism is relevant in cancer research, as KDM4 overexpression is associated with various malignancies.
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| 体外研究 (In Vitro) |
体外实验表明，NCDM-32B 可抑制乳腺癌细胞的活力和转化表型。生化分析显示，该化合物对 KDM4 酶具有强效且特异性的抑制作用。研究人员已对其酶抑制活性和对人类癌细胞的影响进行了评估。关于 KDM4 抑制的详细 IC₅₀ 值，可查阅相关文献。该化合物对 KDM4 亚家族的选择性优于其他组蛋白去甲基化酶。
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| 体内研究 (In Vivo) |
公开资料中关于NCDM-32B的体内数据有限。鉴于其对KDM4酶和癌细胞系具有显著的体外活性，该化合物有望用于研究KDM4在肿瘤发生中的体内功能。该化合物的理化性质表明其具有体内给药的潜力。需要进一步研究以全面表征其体内疗效和药代动力学特征。
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| 酶活实验 |
NCDM-32B 的体外酶活性测定通常使用重组 KDM4 (JMJD2) 酶和组蛋白肽底物。将化合物溶解于 DMSO 中，并用测定缓冲液（50 mM HEPES，pH 7.5，50 μM Fe(NH₄)₂(SO₄)₂，1 mM α-酮戊二酸，2 mM 抗坏血酸）稀释。加入底物启动反应，并在 37°C 下孵育 30-60 分钟。通过 MALDI-TOF 质谱或荧光法测定甲醛生成量来检测去甲基化反应。IC₅₀ 值由剂量反应曲线计算得出。对照组包括 DMSO 溶剂和已知的 KDM 抑制剂。
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| 细胞实验 |
对于基于细胞的检测，乳腺癌细胞系（例如 MCF-7、MDA-MB-231）在含 10% FBS 的 DMEM 培养基中培养。将细胞接种于 96 孔板中，并用不同浓度（0.1-100 μM）的 NCDM-32B 处理 24-72 小时。采用 MTT 或 CellTiter-Glo 法评估细胞活力。组蛋白甲基化水平（H3K9me3、H3K36me3）通过蛋白质印迹法检测。基因表达变化通过 RT-PCR 分析。也可进行细胞增殖和克隆形成实验。所有处理均设置溶剂对照，并重复三次。
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| 动物实验 |
在体内，NCDM-32B 可通过腹腔注射 (IP) 或静脉注射 (IV) 给药于啮齿动物。该化合物配制于合适的溶剂中，例如 DMSO、PEG 或生理盐水。对于肿瘤异种移植模型，将携带乳腺癌肿瘤的免疫缺陷小鼠按不同给药方案进行给药。终点指标包括肿瘤体积测量、生存分析和生物标志物评估（肿瘤组织中组蛋白甲基化水平）。采集血液和组织样本进行药代动力学和药效学分析。所有操作均遵循机构动物护理指南。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
NCDM-32B（分子量 302.42，C₁₅H₃₀N₂O₄）可溶于二甲基亚砜（DMSO）。该化合物是一种具有金属螯合特性的羟肟酸类抑制剂。公开资料中鲜有关于其详细药代动力学参数（生物利用度、半衰期、清除率）的报道。该化合物通常储存于 -20°C。用于体内给药时，需配制成合适的载体以确保足够的暴露量。需要进一步开展 ADME 研究以全面表征其药代动力学特征。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
公开资料中关于 NCDM-32B 的毒理学数据有限。作为一种组蛋白去甲基化酶抑制剂，应考虑其对其他含 Jumonji 结构域蛋白的潜在脱靶效应。该化合物仅供研究使用，不适用于人类治疗。开发用于治疗用途需进行标准的安全性药理学和毒理学研究。操作该化合物时应遵循标准的实验室安全防护措施。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
NCDM-32B 是一种研究级化学探针，用于研究 KDM4 组蛋白去甲基化酶在癌症生物学和表观遗传学中的功能。其主要应用包括癌症研究、表观遗传学和药物研发。该化合物尚未获准用于临床，也未进入临床试验。目前仅供研究用途，可从多家化学品供应商处购买。其作用机制涉及抑制 KDM4 介导的组蛋白去甲基化，从而影响参与癌细胞增殖和存活的基因表达程序。
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| 分子式 |
C15H30N2O4
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|---|---|
| 分子量 |
302.415
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| 精确质量 |
302.221
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| CAS号 |
1239468-48-4
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| PubChem CID |
46901417
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| 外观&性状 |
White to light yellow solid powder
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| LogP |
2.059
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| tPSA |
70.08
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| 氢键供体(HBD)数目 |
1
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| 氢键受体(HBA)数目 |
5
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| 可旋转键数目(RBC) |
13
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| 重原子数目 |
21
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| 分子复杂度/Complexity |
295
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| InChi Key |
KDYRPQNFCURCQB-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C15H30N2O4/c1-16(2)12-9-7-5-4-6-8-10-14(18)17(20)13-11-15(19)21-3/h20H,4-13H2,1-3H3
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| 化学名 |
methyl 3-[9-(dimethylamino)nonanoyl-hydroxyamino]propanoate
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| 别名 |
NCDM 32B; NCDM32B; NCDM-32B
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
Ethanol : ~25 mg/mL (~82.67 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 3.3067 mL | 16.5333 mL | 33.0666 mL | |
| 5 mM | 0.6613 mL | 3.3067 mL | 6.6133 mL | |
| 10 mM | 0.3307 mL | 1.6533 mL | 3.3067 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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