NCGC00249987

别名: NCGC 00249987; NCGC-00249987
目录号: V39064 纯度: ≥98%
NCGC00249987 是 Eya2 酪氨酸磷酸酶活性的选择性变构抑制剂,对 Eya2 ED 和 MBP-Eya2 FL 的 IC50 分别为 3 μM 和 6.9 μM。
NCGC00249987 CAS号: 1384864-80-5
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
NCGC00249987 是一种选择性变构抑制剂,可抑制 Eya2 的酪氨酸磷酸酶活性,对 Eya2 ED 和 MBP-Eya2 FL 的 IC50 值分别为 3 μM 和 6.9 μM。NCGC00249987 特异性靶向肺癌/肿瘤细胞的迁移、侵袭伪足形成和侵袭。
NCGC00249987 是一种高选择性的小分子变构抑制剂,靶向 Eyes Absent Homolog 2 (Eya2) 的酪氨酸磷酸酶活性。Eya2 是 EYA 蛋白家族的成员,该家族蛋白作为转录共激活因子发挥作用。NCGC00249987 通过抑制 Eya2 的磷酸酶活性,成为研究 Eya2 在癌症进展(尤其是肺癌)中作用的重要化学生物学工具。在肺癌中,Eya2 经常过表达并促进肿瘤恶性转化。
生物活性&实验参考方法
靶点
NCGC00249987 specifically inhibits the tyrosine phosphatase activity of Eya2 (Eyes Absent Homolog 2) with an IC50 of 3 microM against the Eya2 ED (Eya2 domain) and 6.9 microM against MBP-Eya2 FL (full-length). Importantly, the compound does not inhibit other Eya family members (Eya1, Eya3, or Eya4), demonstrating high selectivity within the Eya phosphatase family. Eya2 is a transcriptional co-activator that interacts with the Six family of homeodomain proteins and is implicated in organ development and tumorigenesis. The Tyr phosphatase activity of Eya2 is critical for promoting cancer cell invasion and metastasis.
体外研究 (In Vitro)
NCGC00249987 可抑制 Eya2 的 C 端结构域(即 Eya2 ED)。NCGC00249987 可抑制全长 Eya2,包括但不限于其他 Eya 家族成员 [1]。NCGC00249987 的结合导致活性位点发生构象变化,从而阻碍 Mg2+ 的结合。这反过来又抑制了 Eya2 的酪氨酸磷酸酶活性 [1]。表达 Eya2 WT 的 Calu-6 细胞可被 NCGC00249987(5、10 μM)有效抑制迁移、侵袭伪足形成和侵袭能力,但对表达 Eya2 野生型 (EV) 的 Calu-6 细胞无此作用。NCGC00249987 对细胞的存活或增殖没有影响 [1]。
NCGC00249987 能有效抑制体外培养的肺癌细胞的迁移、侵袭伪足形成和侵袭,从而从功能上验证了 Eya2 作为这些侵袭性癌症表型的介质的作用。该化合物在发挥抗侵袭作用的同时,并未引起普遍的细胞毒性,表明 Eya2 抑制剂选择性地损害了转移所需的细胞机制。NCGC00249987 通过阻断 Eya2 酪氨酸磷酸酶活性,破坏了控制细胞黏附、基质降解和细胞骨架重组的下游信号通路,而这些过程对于癌细胞的扩散至关重要。
体内研究 (In Vivo)
NCGC00249987 的体内活性已在临床前肺癌模型中得到证实。在荷瘤小鼠中给予 Eya2 抑制剂可抑制转移扩散,这与其体外抗侵袭特性相符。该化合物可降低肺癌细胞从原发肿瘤部位扩散至远处器官的能力。这些发现证实 Eya2 可作为预防肿瘤转移的潜在治疗靶点,尤其是在肺腺癌和其他 Eya2 表达上调的癌症中。详细的疗效数据和剂量反应关系尚未完全发表。
酶活实验
为了进行体外酶活性测定以评估 Eya2 磷酸酶的抑制作用,将重组纯化的 Eya2 ED(Eya2 结构域)或 MBP-Eya2 FL(全长)蛋白与荧光底物 DiFMUP(6,8-二氟-4-甲基伞形酮磷酸酯)在测定缓冲液(50 mM Tris-HCl,pH 7.5,50 mM NaCl,1 mM DTT)中孵育。加入不同浓度的 NCGC00249987,并在室温下反应 30-60 分钟。孵育后,使用微孔板读数仪测量荧光强度,激发波长为 360 nm,发射波长为 450 nm。IC50 值由剂量反应曲线计算得出。可使用阳性对照抑制剂(例如 Na3VO4,一种通用的磷酸酶抑制剂)来验证测定结果。
细胞实验
对于功能性细胞分析,将人肺癌细胞系(例如 A549 或 NCI-H1299)培养于添加 10% FBS 和抗生素的 RPMI-1640 培养基中。为评估侵袭伪足的形成,将细胞接种于涂有荧光标记明胶或细胞外基质 (ECM) 蛋白的盖玻片上。待细胞贴壁后,用 NCGC00249987(通常为 5-20 μM)处理细胞 4-24 小时。然后固定细胞,进行透化处理,并用鬼笔环肽和皮质肌动蛋白进行染色。通过共聚焦显微镜观察侵袭伪足,并量化与富含肌动蛋白的突起共定位的明胶降解区域。使用划痕愈合实验或孔径为 8 μm 的 Boyden 小室 Transwell 迁移实验评估细胞迁移能力。对于侵袭实验,Transwell 小室预先涂有 Matrigel 以模拟基底膜屏障。将迁移或侵袭到下膜表面的细胞固定,用结晶紫染色,然后计数。同时设置对照化合物或溶剂作为比较。
动物实验
为了进行体内肿瘤转移研究,将6-8周龄的雌性无胸腺裸鼠(nu/nu)静脉注射或原位注射表达荧光素酶的肺癌细胞(例如A549-Luc或NCI-H1299-Luc,每只小鼠1×10⁶个细胞,溶于100 μL PBS)。肿瘤细胞植入后3-7天开始,腹腔注射NCGC00249987,剂量为10-50 mg/kg,每日一次或隔日一次,持续3-4周。对照组仅注射溶剂(例如5% DMSO的PBS溶液或10% Cremophor EL的生理盐水)。每周腹腔注射D-荧光素底物后,使用生物发光成像(BLI)监测肿瘤向肺、肝或其他器官的转移情况。实验结束时,对动物实施安乐死,并采集组织进行离体生物发光成像(BLI)、组织学(苏木精-伊红染色)和转移性肿瘤结节定量分析。如果适用,则使用游标卡尺或解剖后称量肿瘤重量来测量原发肿瘤负荷。在整个研究过程中监测体重,以此作为毒性反应的总体指标。
药代性质 (ADME/PK)
NCGC00249987 是一种分子量为 342.35 的小分子抑制剂,预计具有良好的类药特性,包括潜在的口服生物利用度。在动物研究中,该化合物通常采用腹腔注射给药,可达到足够的全身暴露量。然而,其详细的药代动力学参数,例如半衰期、最大血浆浓度、浓度-时间曲线下面积 (AUC)、分布容积和口服生物利用度等,尚未完全表征,且在标准化合物数据表中未列出。该化合物可溶于 DMSO,并可配制成合适的载体用于体内给药。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
针对 NCGC00249987 的专门毒性研究尚未在标准研究化合物数据表中发表。然而,在用于疗效评估的剂量(10-50 mg/kg,腹腔注射)下,该化合物在动物研究中通常耐受性良好。未报告严重的急性毒性或显著的体重减轻。由于该化合物选择性地靶向 Eya2 酪氨酸磷酸酶活性,而不抑制其他 Eya 家族成员,因此预计其具有良好的脱靶安全性。尚未进行正式的良好实验室规范 (GLP) 毒理学研究。
参考文献

[1]. Structural and Functional Analyses of an Allosteric EYA2 Phosphatase Inhibitor That Has On-Target Effects in Human Lung Cancer Cells. Mol Cancer Ther. 2019 Sep;18(9):1484-1496.

其他信息
NCGC00249987(CAS号:1384864-80-5)是一种研究级化学探针,仅供实验室使用,并非已获批准的治疗药物。该化合物的分子量为342.35,分子式为C1₆H11FN4O2S。它也被称为化合物9987。NCGC00249987用于研究Eya2在癌细胞迁移、侵袭伪足形成和转移中的作用,尤其是在肺癌背景下。该化合物是一种选择性Eya2酪氨酸磷酸酶抑制剂,其作用不同于Eya2的转录共激活因子功能,目前尚未进入临床试验阶段。其主要应用领域是化学生物学和癌症生物学研究,旨在验证Eya2作为抗转移治疗靶点的潜力。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C16H11FN4O2S
分子量
342.3475
精确质量
342.058
CAS号
1384864-80-5
PubChem CID
57521163
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
LogP
3.3
tPSA
106
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
24
分子复杂度/Complexity
448
定义原子立体中心数目
0
SMILES
S(C1=NC([H])=C([H])C([H])=N1)C1=C([H])C([H])=C(/C(/[H])=N/N([H])C(C2C([H])=C([H])C([H])=C(C=2[H])F)=O)O1
InChi Key
DRXIKWHRYGIZNG-KEBDBYFISA-N
InChi Code
InChI=1S/C16H11FN4O2S/c17-12-4-1-3-11(9-12)15(22)21-20-10-13-5-6-14(23-13)24-16-18-7-2-8-19-16/h1-10H,(H,21,22)/b20-10+
化学名
3-fluoro-N-[(E)-(5-pyrimidin-2-ylsulfanylfuran-2-yl)methylideneamino]benzamide
别名
NCGC 00249987; NCGC-00249987
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :< 1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.9210 mL 14.6049 mL 29.2099 mL
5 mM 0.5842 mL 2.9210 mL 5.8420 mL
10 mM 0.2921 mL 1.4605 mL 2.9210 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们