| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 5mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
The primary molecular target of netropsin is DNA, specifically the minor groove of double-stranded DNA. Netropsin binds preferentially to AT-rich regions of the minor groove, interacting with the DNA bases through hydrogen bonding and van der Waals interactions. The compound binds to DNA with high affinity, with a binding constant (Ka) of 4.9 × 10⁵ M⁻¹ or higher. By binding to the minor groove, netropsin interferes with DNA replication and transcription processes. The compound also attenuates NOS2 (inducible nitric oxide synthase) induction by interfering with HMGA1 DNA binding to the core NOS2 promoter, thereby reducing NO production and improving survival in endotoxemia. Netropsin's binding to DNA also provides radioprotective ability against radiation-induced damage.
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| 体外研究 (In Vitro) |
二盐酸奈托普辛与双链DNA非插入性结合，这可能赋予其抗菌和抗病毒作用。它还能通过阻断HMGA1 DNA与NOS2核心启动子的结合来减弱NOS2的诱导，从而提高小鼠内毒素血症的存活率[2]。由于其强大的结合亲和力和优异的结构稳定性，DNA溶液中的二盐酸奈托普辛可以保护DNA免受辐射损伤。奈托普辛-DNA复合物不会被电离辐射产生的羟基自由基(OH*)发生辐射裂解[3]。体外研究表明，奈托普辛优先结合DNA小沟中富含AT的区域，且具有高亲和力(Ka = 4.9 × 10⁵ M⁻¹)。该化合物以非嵌入方式与双链DNA结合。奈托普辛通过与病毒DNA结合并干扰其复制和转录，具有潜在的抗菌和抗病毒特性。该化合物通过干扰HMGA1与NOS2核心启动子的DNA结合，减弱NOS2的诱导。在DNA溶液中，由于其高结合亲和力和结构稳定性，netropsin具有辐射防护能力，可抵抗辐射引起的损伤。在五种常见的DNA小沟结合剂中，netropsin的DNA结合亲和力排名第一，确保了其能够可靠地靶向富含AT序列，从而进行DNase I足迹分析。这些体外活性使netropsin成为生物化学和药理学研究中的有力工具。
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| 体内研究 (In Vivo) |
体内研究已证实二盐酸奈特罗普辛具有治疗潜力。该化合物通过干扰HMGA1 DNA与NOS2核心启动子的结合，减弱NOS2的诱导，从而提高小鼠内毒素血症的存活率。在内毒素血症小鼠模型中，奈特罗普辛治疗可提高存活率。该化合物的抗菌和抗病毒特性也在动物感染模型中进行了研究。奈特罗普辛可与病毒DNA的富含AT序列区域结合，为研究病毒复制和转录抑制机制提供了一种工具。体内实验方案通常包括腹腔注射或静脉注射奈特罗普辛，剂量根据初步毒性研究确定。终点指标包括存活率、细菌载量、细胞因子水平和组织病理学。然而，详细的体内实验方案和疗效数据尚未在公开领域得到广泛报道。
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| 酶活实验 |
在DNA结合实验中，可采用多种生物物理技术测定网状蛋白酶与DNA的结合情况。对于紫外-可见光谱或荧光光谱，将网状蛋白酶溶解于缓冲液（例如，10 mM Tris-HCl，pH 7.4，100 mM NaCl）中，并用递增浓度的牛胸腺DNA或合成的富含AT的寡核苷酸进行滴定。监测吸光度或荧光变化（猝灭或增强），并根据结合等温线计算结合参数（Ka、结合化学计量比）。对于圆二色性（CD）光谱，分别在有无DNA存在的情况下测量网状蛋白酶的CD光谱。对于DNase I足迹分析，将含有已知富含AT序列的DNA片段的一端用³²P标记，与netropsin（0.1-100 µM）孵育，然后用DNase I消化。消化产物通过变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，并通过放射自显影鉴定受保护区域（足迹）。对于NOS2启动子结合实验，通过电泳迁移率变动分析（EMSA）或染色质免疫沉淀（ChIP）评估netropsin干扰HMGA1 DNA与NOS2核心启动子结合的能力。
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| 细胞实验 |
在细胞学研究中，将细胞（例如巨噬细胞、癌细胞或其他细胞系）培养于含10%胎牛血清（FBS）和抗生素的适宜培养基（RPMI-1640或DMEM）中。细胞接种于6孔板或96孔板中。将二盐酸奈特罗普辛溶解于无菌水或PBS中，并用培养基稀释至最终浓度（通常为0.1-100 µM）。在NOS2诱导研究中，将细胞（例如RAW 264.7巨噬细胞）用奈特罗普辛处理1-2小时，然后用LPS（0.1-1 µg/ml）和/或IFN-γ刺激4-24小时。通过Western blot检测NOS2表达，并通过Griess法测定NO生成。在DNA损伤研究中，用奈特罗普辛处理细胞，并通过彗星试验或γ-H2AX染色评估DNA损伤。在辐射防护研究中，细胞在暴露于电离辐射前先用网状蛋白酶处理，然后评估细胞活力和DNA损伤情况。在抗病毒研究中，病毒感染的细胞用网状蛋白酶处理，并通过噬斑试验或qPCR检测病毒复制情况。
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| 动物实验 |
体内研究采用成年小鼠（6-8周龄）。内毒素血症模型中，小鼠腹腔注射LPS（10-20 mg/kg）以诱导内毒素血症。将二盐酸奈特罗普辛溶于无菌生理盐水中，以1-50 mg/kg的剂量腹腔或静脉注射给药，通常为单次给药或在LPS刺激前后多次给药。监测小鼠存活24-72小时。采集血样用于检测NO、细胞因子（TNF-α、IL-1β、IL-6）和肝酶。采集肝脏和肺组织进行组织病理学检查。抗病毒研究中，小鼠感染病毒后，预防性或治疗性地给予奈特罗普辛。通过噬斑试验或qPCR检测组织中的病毒载量。在放射防护研究中，小鼠在接受全身照射前用网状蛋白酶进行治疗，并评估其存活率、造血功能恢复情况和 DNA 损伤情况。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
由于奈特罗普辛二盐酸盐主要用作研究试剂而非治疗药物，因此其药代动力学数据有限。作为一种具有DNA结合特性的小分子，奈特罗普辛预计会分布于多种组织，尤其是在细胞周转率高的组织中。该化合物的代谢可能涉及肝脏代谢，并通过胆汁和肾脏排泄清除。然而，目前尚未有关于奈特罗普辛的ADME（吸收、分布、代谢和排泄）研究报道。该化合物主要用于体外研究，不适用于体内药代动力学表征。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
由于奈特罗普辛主要用作研究试剂，因此其毒理学数据有限。该化合物是一种碱性细胞毒性多肽，在高浓度下可能具有细胞毒性。在细胞实验中，奈特罗普辛对细胞活力的影响呈浓度依赖性。目前尚未报道其急性毒性LD50值或器官特异性毒性数据。与所有化学试剂一样，处理奈特罗普辛二盐酸盐时应采取适当的安全预防措施，包括使用个人防护装备（手套、实验服、护目镜）并在通风良好的区域操作。
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| 参考文献 |
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| 其他信息 |
从链霉菌（Streptomyces netropsis）中分离得到的一种碱性多肽。它具有细胞毒性，能够与DNA的AT区牢固且特异性地结合，因此适用于遗传学研究。
二盐酸奈特普辛（Netropsin dihydrochloride，CAS 18133-22-7）是一种DNA小沟结合剂，最初也是从链霉菌中分离得到的。它能以高亲和力（Ka = 4.9 × 10⁵ M⁻¹）优先结合DNA小沟中富含AT的区域，从而干扰DNA的复制和转录过程。该化合物具有潜在的抗菌和抗病毒特性，并且能够通过减弱NOS2的诱导来提高小鼠内毒素血症的存活率。奈特普辛还具有辐射防护作用，能够抵抗辐射引起的损伤。在所有DNA小沟结合剂中，它的DNA结合亲和力排名第一，并被广泛用作核酸研究中的分子探针。二盐酸奈特普辛仅供研究使用。 |
| 分子式 |
C18H26N10O3.HCL
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|---|---|
| 分子量 |
466.92518
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| 精确质量 |
466.196
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| CAS号 |
18133-22-7
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| 相关CAS号 |
1438-30-8;18133-22-7 (HCl);63770-20-7 (Alt. HCl);
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| PubChem CID |
5351456
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| 外观&性状 |
Off-white to yellow solid powder
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| LogP |
2.423
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| tPSA |
208.93
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| 氢键供体(HBD)数目 |
8
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| 氢键受体(HBA)数目 |
5
|
| 可旋转键数目(RBC) |
9
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| 重原子数目 |
32
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| 分子复杂度/Complexity |
723
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| InChi Key |
FSOYOTWCAMRRGU-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C18H26N10O3.ClH/c1-27-9-11(6-12(27)16(30)23-4-3-14(19)20)26-17(31)13-5-10(8-28(13)2)25-15(29)7-24-18(21)22;/h5-6,8-9H,3-4,7H2,1-2H3,(H3,19,20)(H,23,30)(H,25,29)(H,26,31)(H4,21,22,24);1H
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| 化学名 |
N-[5-[(3-amino-3-iminopropyl)carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]-4-[[2-(diaminomethylideneamino)acetyl]amino]-1-methylpyrrole-2-carboxamide;hydrochloride
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意： 请将本产品存放在密封且受保护的环境中（例如氮气保护），避免吸湿/受潮和光照。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~125 mg/mL (~248.32 mM)
H2O : ~20 mg/mL (~39.73 mM) |
|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.1416 mL | 10.7082 mL | 21.4165 mL | |
| 5 mM | 0.4283 mL | 2.1416 mL | 4.2833 mL | |
| 10 mM | 0.2142 mL | 1.0708 mL | 2.1416 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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