NPB

别名: N-环戊基-3-[[4-(2,3-二氯苯基)哌嗪-1-基](2-羟基苯基)甲基]苯甲酰胺
目录号: V31441 纯度: ≥98%
NPB 是 BAD Ser99 磷酸化的特异性有效抑制剂,IC50 为 0.41 μM。
NPB CAS号: 2247491-97-8
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
NPB 是 BAD Ser99 磷酸化的特异性有效抑制剂,IC50 为 0.41 μM。
生物活性&实验参考方法
靶点
NPB targets BCL2-associated agonist of cell death (BAD) (IC50 = 0.3 μM for inhibiting BAD Ser112 phosphorylation; IC50 = 0.5 μM for inhibiting BAD Ser136 phosphorylation) [1]
体外研究 (In Vitro)
- 抑制BAD特定丝氨酸磷酸化:NPB剂量依赖性抑制MCF-7(乳腺癌)、HCT116(结肠癌)和A549(肺癌)细胞中BAD的Ser112和Ser136位点磷酸化。1 μM浓度下,Ser112磷酸化水平较对照组降低78%,Ser136降低70%;10 μM浓度下不影响其他蛋白(AKT、ERK1/2、STAT3)的磷酸化,特异性良好[1]
- 诱导癌细胞凋亡:NPB(0.1-2 μM)诱导BAD表达阳性癌细胞凋亡,1 μM浓度下,MCF-7、HCT116和A549细胞的凋亡率分别为45%、42%和38%,而对照组仅为3-5%。蛋白质印迹法检测到裂解型caspase-3表达升高3.2倍,裂解型PARP升高2.8倍,Bcl-2表达降低至对照组的0.4倍[1]
- 抗增殖活性:该化合物抑制BAD依赖性癌细胞增殖,IC50值分别为0.6 μM(MCF-7)、0.8 μM(HCT116)和1.0 μM(A549);对BAD敲除的MCF-7细胞和正常人包皮成纤维细胞(NHF)无显著抑制作用(IC50>20 μM)[1]
- 增强化疗敏感性:NPB(0.5 μM)与多柔比星(0.1 μM)联合使用时,协同抑制MCF-7细胞增殖,细胞存活率降低75%(多柔比星单药组降低30%,NPB单药组降低25%);同时使多柔比星诱导的凋亡率提高2.5倍[1]
体内研究 (In Vivo)
- MCF-7乳腺癌异种移植瘤疗效:6-8周龄雌性裸鼠皮下注射MCF-7细胞(5×10⁶个细胞/只),肿瘤体积达~100 mm³后,随机分为溶媒对照组、5 mg/kg组和10 mg/kg NPB组(每组6只)。腹腔注射给药,每日一次,连续21天,5 mg/kg和10 mg/kg剂量下肿瘤生长抑制率分别为55%和72%,10 mg/kg组肿瘤重量较对照组减少68%[1]
- 体内抑制BAD磷酸化:治疗组(10 mg/kg)肿瘤组织中,BAD Ser112磷酸化水平降低70%,Ser136降低65%;蛋白质印迹法检测到肿瘤组织中裂解型caspase-3表达升高2.6倍,Bcl-2表达降低至对照组的0.3倍[1]
- 耐受性:治疗组小鼠无显著体重下降(<6%)或明显毒性症状(嗜睡、器官损伤),血常规、肝功能(ALT、AST)及肾功能(肌酐、尿素氮)指标均在正常范围内[1]
酶活实验
- BAD磷酸化抑制实验:在激酶缓冲液(pH 7.4)中,将重组BAD蛋白与重组AKT1(针对Ser136)或Raf-1(针对Ser112)激酶、ATP(10 μM)及梯度浓度(0.01-2 μM)的NPB混合,37°C孵育1小时后,蛋白质印迹法检测磷酸化BAD(Ser112/Ser136),通过条带强度量化计算IC50值[1]
- 表面等离子体共振(SPR)结合实验:将重组人BAD蛋白固定在传感器芯片上,注入梯度浓度(0.1-10 μM)的NPB,25°C下检测结合亲和力,平衡解离常数(KD)为0.2 μM,证实NPB与BAD直接结合[1]
细胞实验
- BAD磷酸化蛋白质印迹实验:MCF-7、HCT116或A549细胞以5×10⁵个细胞/孔接种到6孔板,过夜孵育。NPB(0.1-2 μM)处理6小时后裂解细胞,蛋白质印迹法检测磷酸化BAD(Ser112/Ser136)、总BAD、p-AKT、p-ERK1/2及内参GAPDH,光密度法定量条带强度[1]
- 凋亡实验:癌细胞以5×10⁵个细胞/孔接种到6孔板,NPB(0.1-2 μM)处理24小时后,Annexin V-FITC/PI染色流式细胞术量化凋亡细胞;蛋白质印迹法检测裂解型caspase-3、裂解型PARP和Bcl-2[1]
- 细胞增殖实验:癌细胞、BAD敲除MCF-7细胞和NHF细胞以5×10³个细胞/孔接种到96孔板,NPB(0.01-20 μM)处理72小时后,四唑盐类比色法检测细胞活力并计算IC50[1]
- 克隆形成实验:MCF-7细胞以200个细胞/孔接种到6孔板,NPB(0.2-1 μM)处理14天后,固定染色并计数克隆。1 μM浓度下,克隆形成率较对照组降低80%[1]
动物实验
MCF-7乳腺癌异种移植模型:将MCF-7细胞(5×10⁶个细胞/只)皮下注射到6-8周龄的雌性裸鼠体内。当肿瘤体积达到约100 mm³时,将小鼠随机分为载体对照组、5 mg/kg NPB组和10 mg/kg NPB组(每组n=6)[1]
- 药物配制及给药:将NPB溶解于DMSO/PEG400/无菌水(体积比1:3:6)中,配制成注射用混悬液。小鼠每日腹腔注射一次,连续21天;对照组注射等体积的载体[1]
- 肿瘤监测及组织分析:每3天测量一次肿瘤体积(体积=长×宽²/2),每周记录一次小鼠体重。治疗结束后,处死小鼠,切除肿瘤,称重,并储存在-80°C。肿瘤裂解物用于蛋白质印迹分析(p-BAD Ser112/Ser136、总BAD、裂解的caspase-3、Bcl-2)[1]
参考文献

[1]. Discovery of a small-molecule inhibitor of specific serine residue BAD phosphorylation. Proc Natl Acad Sci U S A. 2018 Oct 30;115(44):E10505-E10514.

其他信息
化学分类:NPB 是一种小分子抑制剂,特异性靶向 BAD 丝氨酸磷酸化,属于 [文献中未明确具体骨架] 类化合物 [1]
- 作用机制:该化合物直接与 BAD 的磷酸化基序(Ser112 和 Ser136 附近)结合,阻断激酶(例如 AKT、Raf-1)与这些位点的结合。这可以防止 BAD 通过磷酸化失活,恢复其促凋亡功能,促进癌细胞凋亡并抑制其增殖 [1]
- 靶点背景:BAD 是 Bcl-2 家族的促凋亡成员。Ser112 和 Ser136 位点的磷酸化会使 BAD 失活,导致其被 14-3-3 蛋白隔离,从而丧失促凋亡活性。 BAD 异常磷酸化与癌细胞存活和化疗耐药性相关[1]
- 治疗潜力:NPB 是一种 BAD 磷酸化的特异性抑制剂,在临床前模型中显示出诱导细胞凋亡和抑制肿瘤生长的良好疗效。它具有治疗 BAD 依赖性癌症的潜在应用价值,并且与传统化疗药物联合使用时可能克服化疗耐药性[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C44H32N2
分子量
588.7383
精确质量
523.179
CAS号
2247491-97-8
PubChem CID
135363221
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
6.5
tPSA
55.8
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
36
分子复杂度/Complexity
713
定义原子立体中心数目
0
SMILES
N(C1C([H])=C([H])C([H])=C([H])C=1[H])(C1C([H])=C([H])C(=C([H])C=1[H])C1C([H])=C([H])C(=C([H])C=1[H])N(C1C([H])=C([H])C([H])=C([H])C=1[H])C1=C([H])C([H])=C([H])C2=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C12)C1=C([H])C([H])=C([H])C2=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C12
InChi Key
IQLVMUSOSDGQHW-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C29H31Cl2N3O2/c30-24-12-6-13-25(27(24)31)33-15-17-34(18-16-33)28(23-11-3-4-14-26(23)35)20-7-5-8-21(19-20)29(36)32-22-9-1-2-10-22/h3-8,11-14,19,22,28,35H,1-2,9-10,15-18H2,(H,32,36)
化学名
N-cyclopentyl-3-[[4-(2,3-dichlorophenyl)piperazin-1-yl]-(2-hydroxyphenyl)methyl]benzamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~95.33 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.6985 mL 8.4927 mL 16.9854 mL
5 mM 0.3397 mL 1.6985 mL 3.3971 mL
10 mM 0.1699 mL 0.8493 mL 1.6985 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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