PARPi-FL

别名: PARPiFL; PARPi FL; PARPi-FL
目录号: V27112 纯度: ≥98%
PARPi-FL 是 PARP1 的小分子荧光抑制剂。
PARPi-FL CAS号: 1380359-84-1
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
PARPi-FL 是一种 PARP1 小分子荧光抑制剂。PARPi-FL 是一种选择性探针,可用作体内胶质母细胞瘤的成像剂。
PARPi-FL(CAS 编号:1380359-84-1)是一种靶向聚(ADP-核糖)聚合酶 1 (PARP1) 的小分子荧光抑制剂。PARPi-FL 的分子式为 C34H32BF3N6O3,分子量为 640.46 g/mol,是一种荧光 PARP 抑制剂缀合物,由 PARP 抑制剂(奥拉帕尼)与 BODIPY FL 荧光团偶联而成。该化合物的IUPAC名称为硼(4-((3-((4-(3-(5-((3,5-二甲基-2H-吡咯-2-亚甲基-.kappa.N)甲基)-1H-吡咯-2-基-.kappa.N)-1-氧代丙基)-1-哌嗪基)羰基)-4-氟苯基)甲基)-1(2H)-邻苯二甲嗪酮)二氟-, (T-4)。PARPi-FL是一种强效的PARP抑制剂,IC50为12 nM。该化合物选择性地与PARP1结合,并被用作荧光成像剂,用于肿瘤的检测、诊断和手术引导。PARPi-FL在多种癌细胞系中与PARP免疫染色共定位,并在肿瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞中积累。该化合物用于胶质母细胞瘤的成像和口腔癌的检测。 PARPi-FL 仅供研究使用,不可用于人类治疗。
生物活性&实验参考方法
靶点
PARP1 (poly(ADP-ribose) polymerase 1). PARPi-FL is a small-molecule fluorescent inhibitor targeting PARP1. PARP1 is a nuclear enzyme that plays a critical role in DNA repair, particularly in the base excision repair pathway. By detecting DNA damage, PARP1 catalyzes the synthesis of poly(ADP-ribose) (PAR) chains, which recruit other DNA repair proteins to the site of damage. PARP1 is often overexpressed in cancer cells, making it a promising target for cancer therapy and imaging. PARPi-FL is a potent PARP inhibitor with an IC50 of 12 nM. The compound binds selectively to PARP1 and is utilized as a fluorescent imaging agent. PARPi-FL colocalizes with PARP immunostaining in multiple cancer cell lines in vivo and accumulates in tumor cells and tumor-associated macrophages.
体外研究 (In Vitro)
PARPi-FL 是一种强效的 PARP 抑制剂,IC50 值为 12 nM。该化合物选择性地与 PARP1 结合,并可用作荧光成像剂。PARPi-FL 在多种癌细胞系中与 PARP 免疫染色共定位,并在肿瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞中积累。该化合物的荧光特性使其能够可视化细胞和组织中的 PARP1,从而有助于肿瘤的检测、诊断和手术引导。PARPi-FL 已用于胶质母细胞瘤的成像和口腔癌的检测。该化合物对 PARP1 的高亲和力和选择性,以及其强烈的绿色荧光,使其成为 PARP1 成像和靶向药物筛选研究的有力工具。
体内研究 (In Vivo)
PARPi-FL 已在体内被研究作为一种用于肿瘤检测的荧光成像剂。该化合物可在肿瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞中积聚,从而实现体内肿瘤的可视化。PARPi-FL 已被用于胶质母细胞瘤的成像和口腔癌的检测。该化合物在体内与多种癌细胞系中的 PARP 免疫染色共定位的能力证实了其靶向特异性。PARPi-FL 的荧光特性使其能够对肿瘤进行实时成像,从而有助于手术引导和肿瘤检测。临床前研究提供了详细的体内药代动力学和成像数据。PARPi-FL 仅供研究使用,不得用于人体治疗。
酶活实验
PARP1酶抑制试验采用重组PARP1酶和荧光或放射性标记的底物(例如生物素标记的NAD+)。将酶与底物在测定缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 8.0、10 mM MgCl₂、1 mM DTT)中于室温孵育30-60分钟。PARP1活性通过标记的NAD+掺入PAR链来测定。PARPi-FL用DMSO进行系列稀释后加入反应混合物中。PARP1抑制的IC50值为12 nM。每个浓度均进行重复测试,IC50值通过非线性回归分析计算。设置适当的阳性对照(例如奥拉帕尼)和溶剂对照以验证试验结果。
细胞实验
在癌细胞系(例如胶质母细胞瘤、口腔癌)中评估细胞PARP1抑制和成像。将细胞在含有5% CO₂的37°C适宜培养基中培养,并用浓度为0.1至10 μM的PARPi-FL处理1至24小时。通过荧光显微镜观察PARP1的结合和定位。通过测量PAR的生成来评估细胞裂解液中PARP1的活性。使用MTT或LDH法评估细胞活力。每个实验均包含溶剂对照(DMSO)和适当的阳性对照(例如奥拉帕尼),以验证检测系统的有效性。
动物实验
在小鼠癌症模型(包括胶质母细胞瘤和口腔癌异种移植瘤)中对PARPi-FL进行体内成像。该化合物通过静脉或腹腔注射给药,剂量根据临床前研究确定。荧光成像采用合适的成像系统(例如,IVIS、共聚焦显微镜)。通过测量肿瘤和正常组织中的荧光强度来评估肿瘤蓄积和生物分布。在肿瘤切除模型中评估该化合物指导手术切除的能力。每组样本量通常为6-10只动物。
药代性质 (ADME/PK)
分子量:640.46。分子式:C34H32BF3N6O3。CAS号:1380359-84-1。IUPAC名称:硼,(4-((3-((4-(3-(5-((3,5-二甲基-2H-吡咯-2-亚甲基-.kappa.N)甲基)-1H-吡咯-2-基-.kappa.N)-1-氧代丙基)-1-哌嗪基)羰基)-4-氟苯基)甲基)-1(2H)-邻苯二甲嗪基)二氟-,(T-4)。别名:PARPi-FL;Olaparib-bodipy FL;PARPiFL。外观:固体。纯度:通常>95%。溶解性:溶于DMSO。储存:通常储存于-20℃。 PARPi-FL 是一种荧光 PARP1 抑制剂,用于成像和肿瘤检测。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无PARPi-FL的公开毒理学数据。该化合物仅供研究使用,尚未完成临床开发所需的完整临床前毒理学评估。作为一种荧光成像剂,PARPi-FL的使用剂量相对较低,预计毒性极小。标准的毒性研究包括啮齿动物急性毒性评估和遗传毒性筛选。该化合物仅供研究使用,不得用于人类治疗。
参考文献

[1]. Poly(ADP-ribose) polymerase inhibitors in prostate cancer: a cornerstone in precision oncology. Pharmacogenomics. 2021 Dec;22(18):1237-1250.

[2]. PARPi-FL--a fluorescent PARP1 inhibitor for glioblastoma imaging. Neoplasia. 2014 May;16(5):432-40. doi: 10.1016/j.neo.2014.05.005. Epub 2014 Jun 23.

其他信息
奥拉帕尼-BODIPY FL目前正在进行临床试验NCT03085147(一种用于检测舌癌和口腔癌的染料)。
硼二吡咯亚甲基修饰的奥拉帕尼荧光成像剂是一种基于PARP1抑制剂奥拉帕尼的聚(ADP-核糖)聚合酶1型(PARP1)荧光成像剂,其中奥拉帕尼的环丙烷基被绿色荧光染料硼二吡咯亚甲基(BODIPY)荧光团(FL)取代,具有潜在的荧光成像活性。给药后,荧光PARP1抑制剂PARPi-FL中的奥拉帕尼结合部分特异性靶向并结合PARP1,PARP1通常在癌细胞中过表达。表达PARP1的癌细胞可以通过荧光成像进行观察。PARP1是一种核酶,可催化核蛋白的翻译后ADP核糖基化;它由单链 (SS) DNA 断裂激活,并在某些肿瘤细胞中过表达;它在 DNA 修复、肿瘤细胞耐药性和存活中发挥着关键作用。
PARPi-FL 也称为 Olaparib-bodipy FL 和 PARPiFL。其 IUPAC 名称为硼,(4-((3-((4-(3-(5-((3,5-二甲基-2H-吡咯-2-亚甲基-.kappa.N)甲基)-1H-吡咯-2-基-.kappa.N)-1-氧代丙基)-1-哌嗪基)羰基)-4-氟苯基)甲基)-1(2H)-邻苯二甲嗪酮)二氟-,(T-4)。PARPi-FL 是一种靶向 PARP1 的小分子荧光抑制剂,IC50 为 12 nM。该化合物可选择性地与PARP1结合,并用作荧光成像剂,有助于肿瘤的检测、诊断和手术引导。PARPi-FL用于胶质母细胞瘤的成像和口腔癌的检测。目前尚未有关于该化合物的临床试验报道。PARPi-FL仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C34H32BF3N6O3
分子量
640.47
精确质量
640.258
CAS号
1380359-84-1
PubChem CID
70697686
外观&性状
Yellow to orange solid powder
tPSA
90
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
47
分子复杂度/Complexity
1430
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
IGUTVNUEFKPBGK-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C34H32BF3N6O3/c1-21-17-22(2)43-31(21)20-25-9-8-24(44(25)35(43,37)38)10-12-32(45)41-13-15-42(16-14-41)34(47)28-18-23(7-11-29(28)36)19-30-26-5-3-4-6-27(26)33(46)40-39-30/h3-9,11,17-18,20H,10,12-16,19H2,1-2H3,(H,40,46)
化学名
4-[[3-[4-[3-(2,2-difluoro-10,12-dimethyl-1-aza-3-azonia-2-boranuidatricyclo[7.3.0.03,7]dodeca-3,5,7,9,11-pentaen-4-yl)propanoyl]piperazine-1-carbonyl]-4-fluorophenyl]methyl]-2H-phthalazin-1-one
别名
PARPiFL; PARPi FL; PARPi-FL
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.5614 mL 7.8068 mL 15.6135 mL
5 mM 0.3123 mL 1.5614 mL 3.1227 mL
10 mM 0.1561 mL 0.7807 mL 1.5614 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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