PCNA-I1

别名: 3-甲基-2-噻吩羧酸 [(1-羟基-2-萘基)亚甲基]酰肼
目录号: V27135 纯度: ≥98%
PCNA-I1 是一种有效的 PCNA(增殖细胞核抗原)抑制剂。
PCNA-I1 CAS号: 444930-42-1
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
PCNA-I1 是一种强效的 PCNA(增殖细胞核抗原)抑制剂。PCNA-I1 可直接与 PCNA 三聚体结合,解离常数 (Kd) 为 0.41 μM,并在体外和体内均显示出抗肿瘤作用。
PCNA-I1(CAS 编号:444930-42-1)是一种首创的选择性小分子抑制剂,靶向增殖细胞核抗原 (PCNA)。PCNA 是一种重要的 DNA 复制和修复因子,在癌细胞中经常过表达。PCNA-I1 的分子式为 C17H14N2O2S,分子量为 310.37 g/mol,是一种羟基萘亚甲基噻吩甲酰肼衍生物。PCNA-I1 选择性地与 PCNA 的三聚体环结合,破坏其染色质结合和蛋白质-蛋白质相互作用,而不影响其整体蛋白水平。它代表了一类新型抗癌药物,其靶向PCNA骨架而非酶活性位点,为抑制肿瘤细胞中的DNA复制和修复提供了一种独特的策略。该化合物在体外和体内模型中均展现出强大的抗肿瘤作用,尤其是在前列腺癌研究中。PCNA-I1可诱导多种癌细胞系发生DNA损伤、细胞凋亡和自噬,且在转化细胞中的疗效优于非转化细胞,凸显了其治疗窗口。该化合物为黄色至浅黄色固体粉末,密度为1.3±0.1 g/cm³,logP值为5.3,在DMSO中的溶解度最高可达100 mg/mL。PCNA-I1目前仅用于研究用途,尚未进入临床试验阶段。
生物活性&实验参考方法
靶点
PCNA (proliferating cell nuclear antigen) trimers. PCNA-I1 directly binds to PCNA trimers with a dissociation constant (Kd) of approximately 0.2 to 0.41 μM. PCNA is a DNA sliding clamp that serves as a critical scaffold for numerous proteins involved in DNA replication, DNA repair, chromatin remodeling, and cell cycle regulation. By targeting PCNA, PCNA-I1 disrupts the protein-protein interactions mediated by PCNA, particularly its chromatin association, without directly inhibiting its enzymatic activity. This mechanism of action is distinct from traditional DNA-damaging agents or kinase inhibitors, as it targets the structural platform rather than catalytic functions. The compound's selectivity for PCNA trimers over other cellular proteins contributes to its specificity and reduced off-target effects. PCNA-I1 induces S and G2/M phase cell cycle arrest in tumor cells, consistent with the role of PCNA in DNA replication and checkpoint control. The compound's ability to reduce the level of PCNA associated with chromatin in PC3 prostate cancer cells has been demonstrated, confirming its target engagement. PCNA-I1 represents a promising approach to target the "undruggable" PCNA scaffold, validating PCNA as a potential anticancer target.
体外研究 (In Vitro)
PCNA-I1 对多种不同组织类型的肿瘤细胞系均表现出强效的抗增殖活性。该化合物抑制癌细胞生长的 IC50 值约为 0.2 μM。在前列腺癌细胞中,PCNA-I1 可诱导雄激素敏感型 LNCaP 细胞和雄激素非依赖型 PC-3 细胞的 DNA 损伤和凋亡。该化合物还能诱导 PC-3 细胞自噬,表明其具有多种细胞死亡诱导机制。PCNA-I1 诱导肿瘤细胞 S 期和 G2/M 期细胞周期阻滞的效率高于非转化细胞,提示其具有一定的癌细胞选择性。该化合物可增强顺铂诱导的 DNA 损伤和凋亡,表明其具有与传统化疗药物联合治疗的潜力。PCNA-I1 以剂量依赖的方式降低 PC3 细胞中染色质结合的 PCNA 水平,证实了其靶点结合和功能活性。该化合物的效力和疗效体现在其能够破坏PCNA介导的蛋白质-蛋白质相互作用,而这种相互作用对于快速分裂的癌细胞中的DNA复制和修复至关重要。在对癌细胞有效的浓度下,PCNA-I1对非转化细胞没有显著影响,这支持了其治疗窗口。
体内研究 (In Vivo)
PCNA-I1在体内展现出抗肿瘤作用,这已在临床前模型中得到证实。该化合物在异种移植模型中抑制肿瘤生长,与其体外抗增殖和促凋亡活性相一致。PCNA-I1已在前列腺癌模型中进行评估,其靶向PCNA染色质结合。该化合物诱导DNA损伤、细胞凋亡和自噬的能力转化为体内肿瘤生长抑制。PCNA-I1已被证明可增强顺铂的体内抗肿瘤疗效,支持其作为联合治疗药物的潜力。该化合物的作用机制是靶向PCNA骨架,预计对多种依赖PCNA功能的肿瘤类型有效。公开资料中关于该化合物的详细体内药代动力学和药效学数据有限,但其抗肿瘤活性已在多项临床前研究中得到验证。PCNA-I1是一种有前景的先导化合物,有望进一步开发成为靶向抗癌疗法。
酶活实验
PCNA-I1 与 PCNA 三聚体的结合可通过表面等离子共振 (SPR) 或等温滴定量热法 (ITC) 测定解离常数 (Kd) 来评估。该方法包括将重组 PCNA 三聚体固定在传感器芯片上,并使不同浓度的 PCNA-I1 流过芯片表面,从而测量结合动力学。此外,也可采用荧光偏振或荧光共振能量转移 (FRET) 检测来测量 PCNA-I1 对标记的 PCNA 结合肽的置换作用。PCNA-I1 与 PCNA 三聚体的 Kd 值约为 0.2 至 0.41 μM。这些无细胞检测证实了 PCNA-I1 与 PCNA 三聚体之间的直接相互作用,从而验证了该化合物的作用机制。这些检测通常在生理 pH 值和离子强度的缓冲体系中进行,并设置对照以确保特异性和可重复性。
细胞实验
PCNA-I1 的细胞活性在一系列癌细胞系中进行评估,包括前列腺癌细胞(LNCaP、PC-3)和其他肿瘤类型。细胞在适宜的培养基(例如,含 10% FBS 的 RPMI-1640)中于 37°C、5% CO₂ 条件下培养,并用浓度范围为 0.1 至 10 μM 的 PCNA-I1 处理 24-72 小时。采用 MTT、CCK-8 或 CellTiter-Glo 检测法评估细胞活力和增殖,以确定 IC50 值。通过免疫荧光或蛋白质印迹法检测 γ-H2AX 灶的形成来评估 DNA 损伤。通过 Annexin V/PI 染色、caspase-3/7 活性检测和 PARP 裂解蛋白质印迹法评估细胞凋亡。通过 LC3-II/I 转化、p62 降解和 GFP-LC3 斑点形成来评估自噬。细胞周期分布通过碘化丙啶染色和流式细胞术进行分析。PCNA染色质结合通过染色质分级分离后进行PCNA蛋白印迹分析来检测。每个实验均包含溶剂对照(DMSO)和适当的阳性对照(例如,顺铂用于检测DNA损伤),以验证检测系统的有效性。
动物实验
PCNA-I1 的体内疗效在小鼠异种移植模型中采用人癌细胞系进行评估,特别是前列腺癌细胞,例如 PC-3 或 LNCaP。将肿瘤细胞皮下植入免疫缺陷小鼠(例如裸鼠或 NSG 小鼠)体内。当肿瘤达到预定大小(通常为 100-200 mm³)时,将小鼠随机分为治疗组和对照组。PCNA-I1 通过腹腔注射或灌胃给药,剂量根据临床前研究确定。该化合物配制成澄清溶液(1% DMSO、40% PEG300、5% Tween 80 和 54% ddH₂O)或均质 CMC-Na 悬浮液。使用游标卡尺测量肿瘤生长情况,并使用公式(长 × 宽²)/2 计算肿瘤体积。在整个研究过程中监测体重和临床症状,以评估耐受性。研究结束时,采集肿瘤组织进行组织病理学分析、免疫组织化学分析(Ki67用于检测增殖,cleaved caspase-3用于检测凋亡)和生化分析(PCNA染色质结合、DNA损伤标志物)。每组样本量通常为6-10只动物。
药代性质 (ADME/PK)
分子量:310.37。分子式:C17H14N2O2S。CAS号:444930-42-1。外观:浅黄色至黄色固体粉末。密度:1.3±0.1 g/cm³。LogP:5.3。溶解度:DMSO:62 mg/mL (199.76 mM)。体内制剂:澄清溶液(1% DMSO,40% PEG300,5% Tween 80,54% ddH₂O)或CMC-Na均相悬浮液(≥5 mg/mL)。储存:粉末-20℃保存3年;4℃保存2年;溶剂保存-80℃保存6个月;-20℃保存1个月。运输:室温。纯度:≥98%。 PCNA-I1 具有细胞渗透性,在临床前模型中表现出强大的抗肿瘤活性和良好的安全性。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无公开的PCNA-I1全面毒理学数据。该化合物仅供研究使用,尚未完成临床开发所需的完整临床前毒理学评估。在基于细胞的试验中,PCNA-I1在对癌细胞有效的浓度下,对非转化细胞未显示出明显的细胞毒性,表明其具有一定的选择性。在动物研究中,PCNA-I1在测试剂量下通常耐受性良好,未报告明显的体重减轻或明显的毒性症状。标准的毒性研究包括啮齿动物急性毒性评估、重复给药毒性研究(14天和28天)以及遗传毒性筛选(Ames试验、微核试验)。该化合物的作用机制是靶向PCNA,提示其潜在毒性可能仅限于增殖组织,例如骨髓、胃肠道上皮和皮肤。然而,体外观察到的癌细胞选择性可能转化为体内良好的治疗窗口。
参考文献

[1]. Small-molecule targeting of proliferating cell nuclear antigen chromatin association inhibits tumor cell growth. Mol Pharmacol. 2012 Jun;81(6):811-9.

其他信息
PCNA-I1 又称 PCNA 抑制剂 1,其化学名称为 N'-[(1E)-(1-羟基萘-2-基)亚甲基]-3-甲基噻吩-2-甲酰肼,PubChem CID:135533619。PCNA-I1 是一种首创的小分子抑制剂,靶向 PCNA 三聚体,代表了一种新型的抗癌治疗方法。PCNA-I1 可诱导癌细胞发生 DNA 损伤、凋亡和自噬。该化合物因其高质量和研究价值,已被《自然医学》等高影响力期刊引用。PCNA-I1 是研究 PCNA 生物学和验证 PCNA 作为治疗靶点的宝贵工具。目前尚未有关于该化合物的临床试验报道。PCNA-I1 仅供研究使用,不得用于人体。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C17H14N2O2S
分子量
310.37
精确质量
310.077
CAS号
444930-42-1
PubChem CID
135533619
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
折射率
1.667
LogP
5.3
tPSA
89.9
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
22
分子复杂度/Complexity
429
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CC1=C(SC=C1)C(=O)N/N=C/C2=C(C3=CC=CC=C3C=C2)O
InChi Key
NZWTWRNHYZNWNW-VCHYOVAHSA-N
InChi Code
InChI=1S/C17H14N2O2S/c1-11-8-9-22-16(11)17(21)19-18-10-13-7-6-12-4-2-3-5-14(12)15(13)20/h2-10,20H,1H3,(H,19,21)/b18-10+
化学名
N-[(E)-(1-hydroxynaphthalen-2-yl)methylideneamino]-3-methylthiophene-2-carboxamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~322.20 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.2220 mL 16.1098 mL 32.2196 mL
5 mM 0.6444 mL 3.2220 mL 6.4439 mL
10 mM 0.3222 mL 1.6110 mL 3.2220 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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