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PD089828

别名: PD 089828; PD089828; 179343-17-0; PD089,828; PD-089,828; 1-(2-Amino-6-(2,6-dichlorophenyl)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-3-(tert-butyl)urea; 1-[2-amino-6-(2,6-dichlorophenyl)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-yl]-3-tert-butylurea; CHEMBL57366; PD 089828; RRWSNCZYJCOEFX-UHFFFAOYSA-N; PD089828 1-(2-氨基-6-(2,6-二氯苯基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(叔丁基)脲
目录号: V27177 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
PD-089828 是 FGFR-1、PDGFR-β 和 EGFR 的 ATP 竞争性抑制剂（IC50 分别为 0.15、1.76、5.47 µM）和 c-Src 酪氨酸激酶的非竞争性抑制剂（IC50=0.18 µM）。
PD089828 CAS号: 179343-17-0
产品类别: New1
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
100mg
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产品描述
PD-089828 是 FGFR-1、PDGFR-β 和 EGFR 的 ATP 竞争性抑制剂（IC50 分别为 0.15、1.76、5.47 µM）和 c-Src 酪氨酸激酶的非竞争性抑制剂（IC50=0.18 µM）。 PD-089828 还抑制 MAPK，IC50 为 7.1 µM。 PD-089828 在体外抑制 PDGF、EGF 和 bFGF 介导的酪氨酸激酶受体自身磷酸化。 PD-089828 具有持续的细胞活性。
生物活性&实验参考方法
靶点
FGFR-1 (IC50 = 0.15 µM); PDGFR-β(IC50 = 1.76 µM); EGFR (IC50 = 5.47 µM)
体外研究 (In Vitro)
PD-089828（0.5-20 µM；2 小时）可抑制 PDGFR 自磷酸化，IC50 为 0.82 µM [1]。 PD-089828（1-50 µM；2 小时）抑制 EGFR 自身磷酸化，IC50 为 10.9 µM [1]。 PD 089828 已被证明可有效抑制 A121(p) 细胞中的 FGFR-1 磷酸化，IC50 值为 0.63 µM[1]。 PD-089828（10 µM；8 天）的 IC50 为 1.8 µM，以浓度依赖性方式抑制血清刺激的细胞生长 [1]。 PD-089828 对 PDGF- 的 IC50 值为 0.8，对 EGF- 的 IC50 值为 1.7，对 bFGF 诱导的有丝分裂的 IC50 值为 0.48 µM，可抑制所有三种生长因子产生的 DNA 合成的增加 [1]。
PD 089828是一种新结构类别的新型蛋白酪氨酸激酶抑制剂，即6-芳基吡啶并[2,3-d]嘧啶，通过筛选化合物库并测定蛋白酪氨酸激酶活性来鉴定。发现PD 089828抑制人全长成纤维细胞生长因子（FGF）受体-1（FGFR-1）、血小板衍生生长因子（PDGF）受体β亚基（PDGFR-beta）、Src非受体酪氨酸激酶（c-Src）和表皮生长因子（EGF）受体（EGFR）酪氨酸激酶，其半最大抑制效力（IC50值）分别为0.15+/-0.02（n=4）、0.18+/-0.04（n=3）、1.76+/-0.28（n=4”和5.47+/-0.78（n=6）微M。PD 089828进一步被表征为生长因子受体酪氨酸激酶（FGFR-1、PDGFRβ和EGFR）的ATP竞争性抑制剂，但是c-Src酪氨酸激酶相对于ATP的非竞争性抑制剂。此外，PD 089828抑制了血管SMC（VSMC）中PDGF和EGF刺激的受体自磷酸化以及A121细胞中碱性FGF介导的酪氨酸磷酸化，IC50值与观察到的受体酪氨酸激酶活性抑制效力相似。PD 089828对VSMC中PDGF受体自磷酸化的抑制作用迅速发生，在药物暴露后5分钟内达到最大效果。单次暴露后的抑制作用持续时间长，但也可迅速逆转，发生在药物取出后5分钟内。由于PD 089828抑制了PDGF刺激的受体自磷酸化，PDGF诱导的下游信号蛋白（包括磷酸肌醇-3-激酶（PI-3K）、生长因子受体结合蛋白-2（GRB2）、SH-2结构域和胶原样（Shc）以及磷脂酶Cγ（PLCgamma））与VSMC PDGF受体的关联也被阻断。PD 089828还抑制了PDGF诱导的44-kDa和42-kDa丝裂原活化蛋白激酶亚型的酪氨酸磷酸化。此外，PD 089828的作用在功能测定中得到了证实，其中PDGF刺激的DNA合成、PDGF引导的迁移和血清刺激的VSMC生长都受到了与PDGF受体自磷酸化相同的程度的抑制（IC50=0.8、4.5和1.8微M）。这些结果突出了PD 089828作为一种新型、广泛活性的蛋白酪氨酸激酶抑制剂的生物学特性，具有持久但可逆的细胞效应。这些广泛作用的非选择性抑制剂作为抗增殖和抗迁移剂的潜在治疗用途可能扩展到癌症、动脉粥样硬化和再狭窄等疾病，其中已知存在生长信号通路冗余[1]。
细胞实验
细胞增殖测定 [1]
细胞类型：血管平滑肌细胞（血清刺激生长）
测试浓度： 10 µM
孵育时间：连续 8 天
实验结果：浓度依赖性抑制血清刺激的细胞生长，IC50 值为 1.8 µM。
蛋白质印迹分析[1]
细胞类型：血管平滑肌细胞（用 PDGF-BB 30 ng/ml 刺激）
测试浓度： 0.5-20 µM
孵育时间： 2 小时
实验结果： 抑制 PDGFR 自身磷酸化，IC50 为 0.82 µM 。
参考文献

[1]. Inhibition of growth factor-mediated tyrosine phosphorylation in vascular smooth muscle by PD 089828, a new synthetic protein tyrosine kinase inhibitor. J Pharmacol Exp Ther. 1997 Jun;281(3):1446-56.
其他信息
通过筛选成纤维细胞生长因子受体 (FGFr) 和血小板衍生生长因子受体 (PDGFr) 酪氨酸激酶抑制剂的化合物库，开发出了一系列新型的 ATP 竞争性吡啶并[2,3-d]嘧啶类酪氨酸激酶抑制剂。最初的先导化合物 1-[2-氨基-6-(2,6-二氯苯基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-基]-3-叔丁基脲 (4b，PD-089828) 被发现是一种广谱酪氨酸激酶抑制剂。化合物 4b 对 PDGFr、FGFr、EGFR 和 c-src 酪氨酸激酶的抑制 IC50 值分别为 1.11、0.13、0.45 和 0.22 μM。后续的构效关系研究合成了一系列新的类似物，与最初的先导化合物相比，这些类似物具有更高的效力、溶解度和生物利用度。例如，在化合物 4b 的 2 位引入 [4-(二乙氨基)丁基]氨基侧链，得到化合物 6c，其效力和生物利用度均得到增强。化合物 6c 能抑制 PDGF 刺激的血管平滑肌细胞增殖，IC50 值为 0.3 μM。此外，将化合物 4b 中的 6-(2,6-二氯苯基) 部分替换为 6-(3',5'-二甲氧基苯基) 官能团，得到一种高选择性的 FGFr 酪氨酸激酶抑制剂 4e。化合物 4e 对 FGFr 酪氨酸激酶的抑制 IC50 为 0.060 μM，而该化合物 (4e) 对 PDGFr、FGFr、EGFR、c-src 和 InsR 酪氨酸激酶的抑制 IC50 均大于 50 μM。
总之，我们公开了一系列新型 ATP 竞争性吡啶并[2,3-d]嘧啶酪氨酸激酶抑制剂。基于初始先导化合物 PD-089828 (4b) 开展的构效关系研究，使得后续化合物的效力、溶解度和生物利用度均优于母体化合物。尽管 ATP 结合位点在该庞大的酶家族中高度保守，但通过结构修饰，我们设计出了 FGF 选择性化合物。最后，筛选出的化合物PD-161570 (6c) 可抑制体外血管平滑肌细胞增殖，而血管平滑肌细胞增殖是心血管疾病的重要组成部分。https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9240345/
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C18H18CL2N6O
分子量
405.28112
精确质量
404.092
元素分析
C, 53.34; H, 4.48; Cl, 17.50; N, 20.74; O, 3.95
CAS号
179343-17-0
PubChem CID
5328112
外观&性状
White to light yellow solid powder
LogP
5.545
tPSA
105.82
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
27
分子复杂度/Complexity
521
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CC(NC(NC1=NC2=NC(=NC=C2C=C1C1=C(Cl)C=CC=C1Cl)N)=O)(C)C
InChi Key
RRWSNCZYJCOEFX-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C18H18Cl2N6O/c1-18(2,3)26-17(27)25-15-10(13-11(19)5-4-6-12(13)20)7-9-8-22-16(21)24-14(9)23-15/h4-8H,1-3H3,(H4,21,22,23,24,25,26,27)
化学名
1-[2-amino-6-(2,6-dichlorophenyl)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-yl]-3-tert-butylurea
别名
PD 089828; PD089828; 179343-17-0; PD089,828; PD-089,828; 1-(2-Amino-6-(2,6-dichlorophenyl)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-3-(tert-butyl)urea; 1-[2-amino-6-(2,6-dichlorophenyl)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-yl]-3-tert-butylurea; CHEMBL57366; PD 089828; RRWSNCZYJCOEFX-UHFFFAOYSA-N; PD089828
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~10 mg/mL (~24.67 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil)
示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备（4°C，储存1周）：将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中，得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如： 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精)→ 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如： 50 μL DMSO → 100 μL PEG300 → 200 μL Castor oil → 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10： 10 : 80 (如： 100 μL Ethanol → 100 μL Cremophor → 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL EtOH → 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL EtOH → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)

口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合

注意: 以上为较为常见方法，仅供参考， InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型，对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物，需通过前期实验来确定（建议先取少量样品进行尝试），包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.4674 mL 12.3371 mL 24.6743 mL
5 mM 0.4935 mL 2.4674 mL 4.9349 mL
10 mM 0.2467 mL 1.2337 mL 2.4674 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
+
计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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