PDZ1i

目录号: V47404 纯度: ≥98%
PDZ1i 是一种有效的 BBB(血脑屏障)穿透性、特异性 MDA-9/Syntenin 抑制剂。
PDZ1i CAS号: 2083618-79-3
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
PDZ1i 是一种强效的、可穿透血脑屏障的特异性 MDA-9/Syntenin 抑制剂。PDZ1i 可抑制胶质母细胞瘤 (GBM) 的关键信号通路,例如 FAK 和 EGFRvIII。PDZ1i 可减少 MMP 的分泌。PDZ1i 可提高患有脑肿瘤小鼠的生存率并减少肿瘤侵袭。
PDZ1i(2083618-79-3,113B7)是一种强效、可穿透血脑屏障的特异性MDA-9/Syntenin抑制剂,能够抑制胶质母细胞瘤的关键信号通路,减少MMP的分泌,并增强胶质母细胞瘤细胞的放射敏感性。它能提高荷瘤小鼠的生存率并减少肿瘤侵袭,因此在胶质母细胞瘤研究中具有广阔的应用前景。
生物活性&实验参考方法
靶点
Target: MDA-9/Syntenin (also known as SDCBP, a PDZ domain-containing scaffolding protein). PDZ1i binds to the PDZ1 domain of Syntenin, disrupting its interactions with key signaling partners, including FAK and EGFRvIII, thereby inhibiting downstream signaling pathways critical for GBM cell migration, invasion, and radiation resistance.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,PDZ1i可抑制辐射诱导的胶质母细胞瘤(GBM)细胞侵袭,增强GBM细胞的放射敏感性,并损害GBM相关信号通路,包括Src/EphA2、EGFRvIII/FAK和NF-κB通路。它能减少GBM细胞中MMP-2和MMP-9的分泌,从而降低其侵袭能力。此外,它还能以剂量依赖的方式抑制关键的GBM信号通路,包括FAK和EGFRvIII。
体内研究 (In Vivo)
在体内实验中,PDZ1i 可提高荷瘤小鼠的存活率并减少肿瘤侵袭。它能抑制胶质母细胞瘤 (GBM) 的关键信号通路,减少基质金属蛋白酶 (MMP) 的分泌,并在原位 GBM 异种移植模型中增强放射治疗的疗效。PDZ1i 可穿透血脑屏障,因此在全身给药后能够有效靶向脑肿瘤。
酶活实验
对于无细胞检测:将重组Syntenin PDZ1结构域蛋白固定在传感器芯片上。将不同浓度(0-100 uM)的PDZ1i肽流过芯片,并通过表面等离子共振(SPR)测量其结合亲和力(KD)。或者,使用标记肽底物的荧光偏振检测可以确定PDZ结构域结合抑制的IC50值。
细胞实验
对于基于细胞的检测:将人胶质母细胞瘤细胞系(U87-MG、U251、LN229)接种于96孔板中,并用PDZ1i(5-50 uM,24-72 h)处理。采用MTT或CCK-8法评估细胞活力。采用Transwell和Matrigel侵袭实验检测细胞迁移和侵袭能力。采用明胶酶谱法或ELISA法定量MMP-2和MMP-9的分泌。采用磷酸化特异性抗体通过Western blot检测FAK和EGFRvIII的磷酸化水平。
动物实验
对于体内动物研究:通过颅内注射U87-MG或患者来源的胶质母细胞瘤(GBM)细胞,在裸鼠体内建立原位GBM异种移植模型。PDZ1i以10-30 mg/kg的剂量腹腔注射给药,每日一次,持续14-21天,可单独使用或与放射治疗(2 Gy × 5次)联合使用。采用生物发光成像监测肿瘤体积。记录生存期,并通过免疫组织化学分析脑组织切片,检测肿瘤侵袭、Ki67增殖指数和MMP表达。
药代性质 (ADME/PK)
PDZ1i 的药代动力学特性:该化合物是一种小分子抑制剂(分子量 516.0,ClogP 值约为 2.9),可穿透血脑屏障 (BBB)。小鼠腹腔注射后,预计血浆暴露量中等,脑组织暴露量显著,脑血浆浓度比可能大于 0.3。末端半衰期估计为 2-4 小时,清除率中等。目前尚未发表正式的药代动力学参数(Cmax、Tmax、AUC)。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚未有关于PDZ1i毒性数据的报道。基于其靶向Syntenin的作用机制(Syntenin在癌症中过度表达,但在正常组织中表达较低),PDZ1i可能存在治疗窗口。在小鼠模型中,治疗剂量下未观察到急性毒性或体重减轻。尚未进行长期安全性研究。PDZ1i仅供研究使用。
参考文献

[1]. Inhibition of radiation-induced glioblastoma invasion by genetic and pharmacological targeting of MDA-9/Syntenin. Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Jan 10;114(2):370-375.

其他信息
PDZ1i是一种尚未获准临床应用的在研化合物。它是一种很有前景的胶质母细胞瘤(GBM)治疗候选药物,尤其与放射治疗联合使用可克服放射抗性。它在其他Syntenin过表达的癌症中也具有潜在的应用价值,包括乳腺癌(三阴性乳腺癌,TNBC)、黑色素瘤和肝细胞癌。目前,PDZ1i正处于GBM的临床前开发阶段。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C28H26N8O4
分子量
538.557244777679
精确质量
538.207
CAS号
2083618-79-3
PubChem CID
134517006
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
2.4
tPSA
154
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
7
重原子数目
40
分子复杂度/Complexity
1130
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C1C2=C(CCC2)N=C2N=C(C(NC3C=C(C)C(=CC=3C)NC(CCC3=NN=C(C4C=CC=CC=4)O3)=O)=O)NN12
InChi Key
DWWDFNUIUZQWOP-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C28H26N8O4/c1-15-14-21(30-25(38)24-32-28-31-19-10-6-9-18(19)27(39)36(28)35-24)16(2)13-20(15)29-22(37)11-12-23-33-34-26(40-23)17-7-4-3-5-8-17/h3-5,7-8,13-14H,6,9-12H2,1-2H3,(H,29,37)(H,30,38)(H,31,32,35)
化学名
N-[2,5-dimethyl-4-[3-(5-phenyl-1,3,4-oxadiazol-2-yl)propanoylamino]phenyl]-2-oxo-1,8,10,12-tetrazatricyclo[7.3.0.03,7]dodeca-3(7),8,10-triene-11-carboxamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.8568 mL 9.2840 mL 18.5680 mL
5 mM 0.3714 mL 1.8568 mL 3.7136 mL
10 mM 0.1857 mL 0.9284 mL 1.8568 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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