Phytoene desaturase-IN-1

目录号: V43636 纯度: ≥98%
八氢番茄红素去饱和酶-IN-1是一种有效的八氢番茄红素去饱和酶 (PDS) 抑制剂 (Kd: 65.9 μM),与 Phe301 残基形成 π-π 堆积效应。
Phytoene desaturase-IN-1 CAS号: 2765793-54-0
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
植物烯脱氢酶抑制剂-IN-1 是一种强效的植物烯脱氢酶 (PDS) 抑制剂 (Kd: 65.9 μM),它与 Phe301 残基形成 π-π 堆积效应。植物烯脱氢酶抑制剂-IN-1 具有广谱(作用范围广)的苗后除草活性。植物烯脱氢酶抑制剂-IN-1 可诱导白化叶片中 PDS mRNA 的减少、植物烯的积累以及活性氧 (ROS) 的产生。植物烯脱氢酶抑制剂-IN-1 可用于农业生产。
植物烯脱氢酶抑制剂-IN-1 (CAS: 2765793-54-0) 是一种强效的植物烯脱氢酶 (PDS) 抑制剂,分子式为 C18H13ClF3N3O2S,分子量为 427.83。该化合物通过与Phe301残基的π-π堆积效应抑制PDS,其Kd值为65.9 μM。它通过诱导PDS mRNA减少以及白化叶片中植物烯和活性氧(ROS)的积累,表现出广谱的苗后除草活性。该化合物可用于农业生产领域。
生物活性&实验参考方法
靶点
Phytoene desaturase-IN-1 targets phytoene desaturase (PDS), a key enzyme in the carotenoid biosynthesis pathway. PDS catalyzes the desaturation of phytoene, the first committed step in carotenoid synthesis. By inhibiting PDS with a Kd of 65.9 μM through a π-π stacking interaction with the Phe301 residue, the compound blocks carotenoid production. This inhibition leads to the accumulation of phytoene and reactive oxygen species (ROS), resulting in the characteristic albino leaf phenotype and herbicidal activity.
体外研究 (In Vitro)
植物甾烯脱氢酶-IN-1 (1b,375-750 g/ha,25 天) 对包括 ECCHG、DIGSA、SETFA、ABUJU、AMARE 和 ECLPR 在内的六种杂草表现出广谱除草活性 [1]。当植物甾烯脱氢酶-IN-1 (750 g/ha,14 天) 下调 PDS mRNA 水平并导致植物甾烯积累时,会出现白化叶片表型 [1]。植物甾烯脱氢酶-IN-1 (750 g/ha,3 天) 调节 ROS 相关酶的活性并诱导 ROS 积累 [1]。体外实验表明,植物甾烯脱氢酶-IN-1 对植物甾烯脱氢酶 (PDS) 具有强效抑制作用,其 Kd 值为 65.9 μM。该化合物在375-750克/公顷的施用剂量下,对六种杂草表现出广谱除草活性。它能下调PDS mRNA水平并诱导植物甾烯积累,从而导致叶片白化表型。此外,它还能诱导活性氧(ROS)积累并调节ROS相关酶的活性。
体内研究 (In Vivo)
由于植物甾烯脱氢酶-IN-1是一种用于农业的除草剂,因此其在动物模型中的具体体内数据并不适用。该化合物的活性是在植物系统中而非动物模型中评估的。其除草效果是通过在杂草出苗后施用来验证的。
酶活实验
体外酶活性测定法测定了植物烯脱氢酶-IN-1对植物烯脱氢酶(PDS)的抑制作用。将该酶与不同浓度的化合物及其底物植物烯一起孵育。通过监测植物烯转化为下游类胡萝卜素的速率来测定酶活性。结合实验测得其Kd值为65.9 μM。
细胞实验
RT-PCR[1]
细胞类型: 白化叶片
测试浓度: 750 g/ha
培养时间: 14 天
实验结果: PDS mRNA 水平降低了 30%,从而限制了植物烯的催化脱氢过程,导致植物烯积累。
在杂草中进行了植物体内植物烯脱氢酶-IN-1 的体外测定。该化合物在出苗后以 375-750 g/ha 的剂量施用。对处理过的植物进行白化叶片表型、PDS mRNA 水平(通过 RT-PCR)、植物烯积累和 ROS 水平的评估。这些测定证实了该化合物的除草活性及其作用机制。
动物实验
由于植物甾烯脱氢酶-IN-1是一种农业用除草剂,因此不适用于体内动物实验。该化合物不适用于动物。其生物学意义在于植物系统。
药代性质 (ADME/PK)
由于植物甾烯脱氢酶-IN-1是一种除草剂而非治疗剂,因此其药代动力学特性不适用。该化合物的分子式为C18H13ClF3N3O2S,分子量为427.83。溶解度:DMSO:125 mg/mL(292.17 mM;需超声处理)。储存:粉末在-20°C下可保存3年;溶剂在-80°C下可保存6个月。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于植物甾烯脱氢酶-IN-1是一种用于农业研究的除草剂,因此其毒理学数据有限。该化合物仅供研究使用,不得用于人类治疗。处理该化合物时应遵循标准的实验室安全预防措施。目前尚无具体的毒性数据。
参考文献

[1]. Discovery of (5-(Benzylthio)-4-(3-(trifluoromethyl)phenyl)-4 H-1,2,4-triazol-3-yl) Methanols as Potent Phytoene Desaturase Inhibitors through Virtual Screening and Structure Optimization. J Agric Food Chem. 2022 Aug 10.

其他信息
植物甾烯脱氢酶-IN-1的CAS号为2765793-54-0,分子式为C18H13ClF3N3O2S,分子量为427.83。它是一种强效的植物甾烯脱氢酶(PDS)抑制剂,Kd值为65.9 μM。它具有广谱的苗后除草活性。纯度:通常≥98%。不可用于人体;仅供科研和农业用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C18H13CLF3N3O2S
分子量
427.82793211937
精确质量
427.036
CAS号
2765793-54-0
PubChem CID
164886646
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
LogP
4
tPSA
93.3
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
28
分子复杂度/Complexity
535
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1=CC(=CC(=C1)N2C(=NN=C2SCC(=O)C3=CC=C(C=C3)Cl)CO)C(F)(F)F
InChi Key
NKQUGCNEDWUGHV-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C18H13ClF3N3O2S/c19-13-6-4-11(5-7-13)15(27)10-28-17-24-23-16(9-26)25(17)14-3-1-2-12(8-14)18(20,21)22/h1-8,26H,9-10H2
化学名
1-(4-chlorophenyl)-2-[[5-(hydroxymethyl)-4-[3-(trifluoromethyl)phenyl]-1,2,4-triazol-3-yl]sulfanyl]ethanone
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~125 mg/mL (~292.17 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3374 mL 11.6869 mL 23.3738 mL
5 mM 0.4675 mL 2.3374 mL 4.6748 mL
10 mM 0.2337 mL 1.1687 mL 2.3374 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们