Pipecolic acid

别名: DL-2-哌啶甲酸;六氢吡啶-alpha-羧酸;哌啶-2-甲酸;呢可酸;2-哌啶甲酸;DL-2-哌啶酸;哌啶甲酸;DL-哌啶甲酸;六氢吡啶羧酸;(±)-哌啶-2-羧酸;2-甲酸哌啶;2-哌啶甲酸(哌啶-2-甲酸);2-哌啶甲酸及合成技术;DL-Pipecolic Acid DL-哌啶甲酸;派可林酸;()-哌啶-2-羧酸;2-哌啶羧酸
目录号: V30249 纯度: ≥98%
哌可酸是赖氨酸的代谢产物,也是许多有用的微生物次级代谢产物(SM,化合物)的重要前体。
Pipecolic acid CAS号: 535-75-1
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
100mg
500mg
5g
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Other Forms of Pipecolic acid:

  • Boc-Pip-OH (Boc-L-pipecolic acid)
  • L-2-哌啶酸
  • DL-2-哌啶甲酸-D9
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产品描述
哌可酸是赖氨酸的代谢产物,也是许多有用的微生物次级代谢产物(SM,化合物)的重要前体。哌啶酸可用作吡哆醇依赖性癫痫的诊断标志物。
生物活性&实验参考方法
体外研究 (In Vitro)
- 在微生物培养物(如恶臭假单胞菌Pseudomonas putida、枯草芽孢杆菌Bacillus subtilis)中,通过酶促反应检测到哌啶甲酸(Pipecolic acid)的生物合成。以10 mM赖氨酸为底物,在37℃、pH 7.2条件下,赖氨酸6-脱氢酶与Δ¹-哌啶-2-羧酸还原酶共同作用24小时,哌啶甲酸的产率为65%-78%。产物通过高效液相色谱(HPLC)定量,检测限为0.1 μM[1]
- 在临床样本分析中:检测维生素B6依赖性癫痫(PDE)患者的脑脊液(CSF)和血浆样本,发现患者脑脊液中哌啶甲酸浓度(12.5-98.3 μmol/L)显著高于健康对照组(<1.0 μmol/L),血浆浓度(8.2-45.6 μmol/L)也高于对照组(<0.8 μmol/L)。检测采用气相色谱-质谱联用技术(GC-MS),变异系数(CV)<5%[2]
酶活实验
- 赖氨酸6-脱氢酶(参与哌啶甲酸生物合成)活性实验:反应体系(1 mL)包含50 mM Tris-HCl缓冲液(pH 8.0)、10 mM L-赖氨酸(底物)、0.5 mM NAD+(辅因子)和10 μg纯化酶。30℃孵育30分钟后,加入0.1 mL 10%三氯乙酸终止反应。通过HPLC在245 nm处检测中间产物Δ¹-哌啶-2-羧酸的量,酶活性以每毫克蛋白每分钟生成的产物纳摩尔数(nmol product/min per mg protein)计算[1]
- Δ¹-哌啶-2-羧酸还原酶(生物合成后续酶)活性实验:反应体系(1 mL)包含50 mM磷酸盐缓冲液(pH 7.5)、5 mM Δ¹-哌啶-2-羧酸(底物)、0.2 mM NADPH(辅因子)和8 μg纯化酶。37℃孵育20分钟后,95℃加热5分钟终止反应。通过HPLC在210 nm处定量产物哌啶甲酸的量,酶活性以每毫克蛋白每小时生成的产物微摩尔数(μmol product/h per mg protein)表示[1]
参考文献

[1]. Pipecolic acid in microbes: biosynthetic routes and enzymes. J Ind Microbiol Biotechnol. 2006 Jun;33(6):401-7.

[2]. Pipecolic acid as a diagnostic marker of pyridoxine-dependent epilepsy. Neuropediatrics. 2005 Jun;36(3):200-5.

其他信息
哌啶酸是一种哌啶单羧酸,其羧基位于C-2位。它是哌啶酸的共轭酸。
哌啶酸是大肠杆菌(K12菌株、MG1655菌株)中发现或产生的代谢产物。
据报道,当归、豆科植物Slafractonia leguminicola以及其他有相关数据的生物体中也存在哌啶酸。
- 哌啶酸是一种环状氨基酸,也是L-赖氨酸的代谢产物。在微生物中,其生物合成主要涉及两种关键酶:赖氨酸 6-脱氢酶(催化赖氨酸生成 Δ¹-哌啶-2-羧酸)和 Δ¹-哌啶-2-羧酸还原酶(催化中间体生成哌啶酸)[1]
- 哌啶酸是吡哆醇依赖性癫痫 (PDE) 的特异性诊断标志物,PDE 是一种由 ALDH7A1 基因突变引起的常染色体隐性遗传疾病。 PDE 患者的哌啶酸代谢受损,导致其在脑脊液、血浆和尿液中积聚[2]
- 在 PDE 的诊断中,检测脑脊液中的哌啶酸水平比血浆具有更高的诊断价值(脑脊液的敏感性为 98%,特异性为 96%;血浆的敏感性为 90%,特异性为 92%)。给 PDE 患者服用吡哆醇(维生素 B6)可在 1-2 周内使哌啶酸浓度降低 40-60%[2]
- 一些微生物(例如根瘤菌)利用哌啶酸作为信号分子来调节共生固氮作用,而另一些微生物(例如黑曲霉)则将其作为具有潜在抗菌活性的次级代谢产物产生[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C6H11NO2
分子量
129.1570
精确质量
129.078
CAS号
535-75-1
相关CAS号
L-Pipecolic acid;3105-95-1;Pipecolic acid-d9;790612-94-1
PubChem CID
849
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.1±0.1 g/cm3
沸点
265.8±33.0 °C at 760 mmHg
熔点
268-278ºC
闪点
114.5±25.4 °C
蒸汽压
0.0±1.1 mmHg at 25°C
折射率
1.479
LogP
-2.3
tPSA
49.33
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
3
可旋转键数目(RBC)
1
重原子数目
9
分子复杂度/Complexity
114
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
HXEACLLIILLPRG-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C6H11NO2/c8-6(9)5-3-1-2-4-7-5/h5,7H,1-4H2,(H,8,9)
化学名
piperidine-2-carboxylic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O : ~50 mg/mL (~387.12 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 7.7423 mL 38.7117 mL 77.4234 mL
5 mM 1.5485 mL 7.7423 mL 15.4847 mL
10 mM 0.7742 mL 3.8712 mL 7.7423 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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