| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
Not applicable. DC4 Crosslinker is a chemical crosslinking reagent for XL-MS, not a drug with a specific biological target. It targets primary amine groups (-NH2) on lysine residues and the N-termini of proteins. The compound reacts covalently with these amines via its two NHS ester groups. The DC4 moiety is a cleavable linker that fragments under collision-induced dissociation (CID) conditions during MS/MS, generating diagnostic ions that enable unambiguous identification of crosslinked peptides.
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| 体外研究 (In Vitro) |
DC4交联剂本身不具有直接的生物活性;它是一种化学交联剂,用于通过共价连接相互作用的蛋白质来捕获瞬时或弱的蛋白质-蛋白质相互作用。该化合物设计有一个可被质谱裂解的DC4基团,从而可以通过液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)鉴定交联肽段。它水溶性好,可与胺反应,间隔臂长度约为17.5埃,允许在此距离内交联蛋白质。该交联剂可透过细胞膜,可用于体内交联研究。目前尚无相关的IC50值或活性数据。
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| 体内研究 (In Vivo) |
DC4交联剂并非药物,也不用作体内治疗剂。它可用于体内交联研究:将该交联剂注射到动物体内,以捕捉其天然细胞环境中的蛋白质-蛋白质相互作用。给药后,收集组织,提取蛋白质,进行酶解,并通过质谱分析交联肽。然而,目前尚无关于DC4交联剂的具体体内数据。也未报告任何疗效或药理学数据。
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| 酶活实验 |
标准体外交联方案:将纯化的蛋白质复合物或细胞裂解液(0.5-2 mg/mL 蛋白质)溶于 PBS 或 HEPES 缓冲液(pH 7.5-8.0)中,并与终浓度为 0.5-5 mM 的 DC4 交联剂混合。反应在 25℃ 下孵育 30-60 分钟。加入 50 mM Tris-HCl(pH 7.5)或 100 mM 碳酸氢铵终止交联反应,并继续孵育 15-30 分钟。交联后的蛋白质经还原(DTT,10 mM,30 分钟)、烷基化(碘乙酰胺,20 mM,30 分钟)和胰蛋白酶消化(37℃,过夜)后进行分析。消化后的肽段经脱盐处理后,通过 LC-MS/MS 进行分析。DC4 交联剂在碰撞诱导解离 (CID) 下发生断裂,产生特征性的 MS2 图谱。
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| 细胞实验 |
不适用。DC4交联剂在化学生物学中用于交联细胞裂解液或完整细胞中的蛋白质,而非直接用作药理学调节剂。对于体内交联,将培养的细胞(例如HeLa细胞)用DC4交联剂(培养基中浓度为0.5-5 mM)在37℃下处理30-60分钟。然后洗涤细胞,裂解细胞,并按上述方法进行XL-MS分析。该试剂不用于其他基于细胞的药理学实验。
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| 动物实验 |
不适用。DC4交联剂不适用于标准动物药效研究。对于用于绘制组织中蛋白质-蛋白质相互作用的体内交联研究,可通过静脉注射(例如10-50 mg/kg)将交联剂给予动物(例如小鼠)。30-60分钟后,收集组织(例如肝脏、脑组织)并按所述方法进行交联质谱(XL-MS)分析。该交联剂在体外或体内用作探针以捕获相互作用,而非作为治疗剂。本化合物未提供具体实验方案。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
DC4交联剂是一种化学试剂,而非候选药物。目前尚未对交联剂进行药代动力学研究。在体内使用时,由于其与血液和组织中的胺类物质快速反应,预计其半衰期较短。NHS酯基在水性环境中会发生水解,在pH 7.5、25℃的缓冲液中,其半衰期约为1-2小时。这种快速水解限制了其分布。该化合物通常用于体外交联。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
DC4交联剂是一种化学交联剂,应按照标准实验室安全防护措施进行操作。其NHS酯基团具有反应活性,可能刺激皮肤和眼睛。材料安全数据建议在通风橱内操作,并佩戴适当的个人防护装备(手套、实验服、护目镜)。目前尚无毒理学数据;该化合物不可用于人类食用。仅供研究使用。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
DC4交联剂(DSS-DC4)是一种可被质谱裂解的同双功能胺反应性交联剂。间隔臂长度约为17.5埃。DC4的可裂解基团使其在碰撞诱导解离(CID)过程中发生碎片化,从而可以通过质谱分析鉴定交联肽段。用于在交联质谱(XL-MS)中研究蛋白质-蛋白质相互作用和蛋白质复合物拓扑结构。仅供研究使用。
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| 分子式 |
C22H32BR2N4O8
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|---|---|
| 分子量 |
640.32
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| 精确质量 |
640.057
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| CAS号 |
1374647-94-5
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| PubChem CID |
129887550
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| LogP |
0
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| tPSA |
127.36
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| 氢键供体(HBD)数目 |
0
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| 氢键受体(HBA)数目 |
10
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| 可旋转键数目(RBC) |
12
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| 重原子数目 |
36
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| 分子复杂度/Complexity |
775
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
C(CC(=O)ON1C(=O)CCC1=O)C[N+]23CC[N+](CCCC(=O)ON4C(=O)CCC4=O)(CC2)CC3.[Br-].[Br-]
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| InChi Key |
AJWAJFDEYIAPKX-UHFFFAOYSA-L
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| InChi Code |
InChI=1S/C22H32N4O8.2BrH/c27-17-5-6-18(28)23(17)33-21(31)3-1-9-25-11-14-26(15-12-25,16-13-25)10-2-4-22(32)34-24-19(29)7-8-20(24)30;;/h1-16H2;2*1H/q+2;;/p-2
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| 化学名 |
(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 4-[4-[4-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy-4-oxobutyl]-1,4-diazoniabicyclo[2.2.2]octan-1-yl]butanoate dibromide
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month Note: 请将本产品存放在密封保护的环境中,避免受潮。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
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| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.5617 mL | 7.8086 mL | 15.6172 mL | |
| 5 mM | 0.3123 mL | 1.5617 mL | 3.1234 mL | |
| 10 mM | 0.1562 mL | 0.7809 mL | 1.5617 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。