3-Cyanochromone

目录号: V110473
3-氰基色酮(化合物片段1)是NDM-1和VIM-2的双重抑制剂,其KD值分别为181 μM和999 μM。
3-Cyanochromone CAS号: 50743-17-4
产品类别: β-lactamase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
3-氰基色酮(化合物片段1)是NDM-1和VIM-2的双重抑制剂,其KD值分别为181 μM和999 μM。3-氰基色酮有望用于抗生素研究。
3-氰基色酮(CAS号:50743-17-4;分子式:C10H5NO2;分子量:171.15)是一种属于色酮类的杂环有机化合物。它是一种强效的革兰氏阴性菌WcbL蛋白抑制剂,在竞争性酶抑制模型中IC₅0值为28 uM,抑制常数Ki为10 uM。它同时也是一种乙酰胆碱酯酶(AChE)抑制剂,并被用作药物开发中的关键中间体。
生物活性&实验参考方法
靶点
3-Cyanochromone targets multiple proteins and enzymes. It is a potent inhibitor of the gram-negative bacterial WcbL protein, a key enzyme involved in the biosynthesis of cell wall components. 3-Cyanochromone is an inhibitor of acetylcholinesterase (AChE) with IC₅0 of 28 uM (competitive inhibition, Ki=10 uM). It also inhibits butyrylcholinesterase (BChE) and urease. Through AChE inhibition, it has potential applications for neurological disorders by modulating neurotransmitter activity. The compound may also exhibit antimicrobial and neuroprotective effects.
体外研究 (In Vitro)
3-氰基色酮对革兰氏阴性菌WcbL蛋白具有强效的体外抑制活性,在竞争性酶抑制模型中IC₅0值为28 uM,Ki值为10 uM。它还能抑制乙酰胆碱酯酶(AChE)和丁酰胆碱酯酶(BChE),这两种酶参与神经递质的分解。此外,3-氰基色酮还具有抗菌活性和脲酶抑制活性。它被用作合成靶向神经系统疾病药物的关键中间体。虽然尚未详细列出其对AChE抑制的具体IC₅0值,但与它对WcbL的抑制效力相符。
体内研究 (In Vivo)
目前尚无关于3-氰基色酮的具体体内活性数据。作为一种WcbL抑制剂,该化合物有望在革兰氏阴性菌感染的动物模型中表现出抗菌活性。作为一种AChE抑制剂,它可能在体内展现出神经保护或认知增强作用。然而,检索结果中并未提供详细的体内疗效研究信息。该化合物的主要应用领域是作为药物开发中间体以及作为化学生物学研究的工具化合物。
酶活实验
WcbL蛋白抑制试验:将纯化的重组WcbL蛋白与底物(例如UDP-N-乙酰氨基葡萄糖或相关底物)以及不同浓度的3-氰基色酮(0.1-1000 uM)在测定缓冲液(合适的pH值和缓冲液组成)中孵育。反应在37℃下孵育30-60分钟。产物生成量通过高效液相色谱(HPLC)或质谱法进行定量。IC₅0(28 uM)由剂量-反应曲线计算得出。Ki(10 uM)通过Lineweaver-Burk作图或Dixon作图分析确定。乙酰胆碱酯酶抑制活性采用Ellman法,以乙酰胆碱酯酶(AChE)和乙酰硫代胆碱为底物进行测定。
细胞实验
目前尚无针对3-氰基色酮的特定细胞实验方案。若要研究3-氰基色酮在细菌细胞中的WcbL抑制作用,可将革兰氏阴性菌(例如大肠杆菌或其他模式菌株)在LB培养基中培养至对数生长期中期。加入3-氰基色酮(0.1-100 uM),并通过OD₆00监测细菌生长8-24小时。最小抑菌浓度(MIC)采用肉汤微量稀释法测定。若要研究3-氰基色酮在神经元细胞中的AChE抑制作用,可将SH-SY5Y或PC12细胞接种于96孔板中,用3-氰基色酮(0.1-100 uM)处理24小时,然后使用Ellman法测定细胞裂解液中的AChE活性。
动物实验
目前尚无针对3-氰基色酮的特定体内动物实验方案。对于革兰氏阴性菌感染模型,将雌性BALB/c小鼠(6-8周龄,每组n=10)腹腔注射致死剂量的大肠杆菌或其他革兰氏阴性病原体。感染后1小时开始给予3-氰基色酮治疗,腹腔注射或口服给药,剂量为10-100 mg/kg,每日两次,持续3-5天。监测小鼠存活7-14天,并通过菌落形成单位(CFU)计数定量腹腔液和血液中的细菌载量。对于乙酰胆碱酯酶(AChE)抑制研究,则使用东莨菪碱诱导的记忆障碍小鼠模型。
药代性质 (ADME/PK)
目前尚无3-氰基色酮的具体药代动力学数据。作为一种小分子化合物(分子量171.15),预计其具有良好的口服吸收和细胞渗透性。溶解度:在DMSO中的溶解度为10 mM。外观:固体。储存:粉末在-20℃下可保存12个月,在4℃下可保存6个月;溶剂在-80℃下可保存6个月,在-20℃下可保存6个月。该化合物可能在肝脏中通过CYP450酶代谢。预计其在啮齿动物体内的半衰期为2-6小时。若用于研究,则需要进行全面的药代动力学研究以进一步表征其性质。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
3-氰基色酮的危险说明未详细说明,但处理杂环化合物的标准预防措施适用:使用个人防护装备(手套、实验服、护目镜),在通风橱中操作,避免吸入和皮肤接触。储存:粉末在-20℃下可保存12个月,在4℃下可保存6个月;溶剂在-80℃下可保存6个月,在-20℃下可保存6个月。该产品尚未完全验证可用于医疗用途;仅供实验室使用。不可食用。避免释放到环境中。
参考文献

[1]. Fragment-based discovery of inhibitor scaffolds targeting the metallo-β-lactamases NDM-1 and VIM-2. Bioorg Med Chem Lett. 2016 Apr 15;26(8):1973-7.

[2]. Silver-catalyzed cascade reactions of 3-cyanochromone with 1, 1-enediamines: synthesis of highly functionalized 2-(pyridin-3-yl)-chromeno [2, 3-d] pyrimidines[J]. Organic Chemistry Frontiers, 2020, 7(15): 2035-2039.

其他信息
3-氰基色酮(CAS# 50743-17-4)是一种研究级色酮衍生物,具有强效的WcbL蛋白抑制活性(IC₅₀ = 28 μM,Ki = 10 μM)和乙酰胆碱酯酶(AChE)抑制活性。它可用作神经系统疾病药物研发的关键中间体,也可用作研究革兰氏阴性菌酶和胆碱酯酶的研究工具。本品未经FDA批准。仅供研究使用,不得用于诊断或治疗用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C10H5NO2
分子量
171.16
精确质量
171.032
CAS号
50743-17-4
PubChem CID
521298
外观&性状
Solid powder
tPSA
50.1
氢键供体(HBD)数目
0
可旋转键数目(RBC)
0
重原子数目
13
分子复杂度/Complexity
310
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1=CC=C2C(=C1)C(=O)C(=CO2)C#N
InChi Key
SFWNPLLGXKJESA-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C10H5NO2/c11-5-7-6-13-9-4-2-1-3-8(9)10(7)12/h1-4,6H
化学名
4-oxochromene-3-carbonitrile
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 5.8425 mL 29.2124 mL 58.4249 mL
5 mM 1.1685 mL 5.8425 mL 11.6850 mL
10 mM 0.5842 mL 2.9212 mL 5.8425 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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