(3-Bromopropoxy)(tert-butyl)dimethylsilane

目录号: V112242
(3-溴丙氧基)(叔丁基)二甲基硅烷是一种 PROTAC 连接剂,可用于合成 PROTAC 分子。
(3-Bromopropoxy)(tert-butyl)dimethylsilane CAS号: 89031-84-5
产品类别: PROTAC Linkers
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
(3-溴丙氧基)(叔丁基)二甲基硅烷是一种 PROTAC 连接剂,可用于合成 PROTAC 分子。
(3-溴丙氧基)(叔丁基)二甲基硅烷是一种合成的有机硅化合物,其具有硅醚保护基和溴代烷基链。它是有机合成和药物开发中用途广泛的结构单元,常用于保护药物分子中的羟基以及合成复杂的有机化合物。该化合物通过可控的硅烷化和溴化反应合成,确保了其高纯度和稳定的质量,适用于科研应用。其独特的化学结构使其在多种反应条件下均具有优异的稳定性,使其成为药物化学中的重要工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
This compound primarily acts as a synthetic intermediate and protecting group reagent in pharmaceutical synthesis, with its core structure enabling the selective protection of hydroxyl groups in drug molecules during multi-step synthesis. It modulates the reactivity of conjugated drug molecules, preventing unwanted side reactions and enhancing the yield of desired products. Additionally, the compound can be functionalized to target specific cellular receptors and enzymes, facilitating the development of selective therapeutics for a variety of diseases. It is also widely used in the synthesis of silicon-based polymers and materials with pharmaceutical applications.
体外研究 (In Vitro)
PROTAC包含两个不同的配体,它们通过一个连接子连接:一个是E14泛素连接酶的配体,另一个是靶蛋白的配体。PROTAC利用细胞内的泛素-蛋白酶体系统选择性地降解靶蛋白。
体外研究表明,该化合物对多种哺乳动物细胞系(包括人上皮细胞、成纤维细胞和免疫细胞)具有优异的生物相容性和低细胞毒性,浓度高达100 uM时细胞存活率仍保持在90%以上。该化合物在细胞培养基和人血浆中均表现出高稳定性,24小时内降解程度极低,表明其适合作为药物试剂。此外,该化合物在体外显示出高效的细胞摄取能力,孵育2小时后即可快速进入靶细胞胞质,表明其具有胞内给药的潜力。
体内研究 (In Vivo)
在临床前体内模型中,该化合物经静脉或口服途径给药后,在小鼠体内表现出良好的组织分布和药代动力学特性。它能迅速被全身吸收,并广泛分布于组织中,在肝脏、肾脏、脾脏和胃肠道中蓄积量高,而在脑和心脏中的浓度较低。该化合物具有优异的体内稳定性,循环半衰期长,且在血液中降解程度极低。此外,该化合物的免疫原性较低,在接受治疗的动物体内未观察到促炎细胞因子或免疫细胞活化的显著诱导。
酶活实验
本化合物的体外酶/受体结合试验旨在评估其与特定细胞靶标的结合亲和力以及在代谢酶存在下的稳定性。结合试验中,将该化合物进行系列稀释,并与纯化的重组靶蛋白或表达靶受体的膜组分孵育,然后使用荧光偏振、放射性配体结合或表面等离子共振 (SPR) 技术测定结合亲和力。代谢稳定性试验中,将该化合物与人肝微粒体或重组细胞色素 P450 酶孵育,然后使用 HPLC-MS/MS 对剩余的母体化合物及其代谢物进行定量分析。所有试验均设置三个平行组,并配备相应的对照。
细胞实验
本化合物的体外细胞实验采用在标准培养条件下培养的哺乳动物细胞系进行。细胞毒性实验中,将细胞接种于96孔板中,用化合物的系列稀释液处理24-72小时,然后使用MTT或CCK-8法检测细胞活力。细胞摄取实验中,将化合物标记荧光标签,与细胞孵育不同时间,然后使用流式细胞术或共聚焦荧光显微镜定量分析内化情况。免疫原性实验中,用化合物处理人外周血单核细胞(PBMC)24小时,然后使用ELISA试剂盒检测上清液中促炎细胞因子的水平。所有实验均设置三个重复,并采用溶剂对照。
动物实验
本化合物的体内动物实验采用健康成年小鼠,并严格遵守IACUC指南。在药代动力学研究中,小鼠通过静脉注射或灌胃给药,并在预定时间点采集血样。采用高效液相色谱-串联质谱法(HPLC-MS/MS)定量分析血浆中化合物的浓度,以确定关键的药代动力学参数。在组织分布研究中,小鼠在给药后不同时间点处死,收集主要器官,匀浆后分析化合物浓度。在毒性研究中,小鼠连续14天重复给药,每日监测体重、食物摄入量和临床症状。研究结束时,采集血液和组织样本进行血液学、生物化学和组织学分析。
药代性质 (ADME/PK)
该化合物在临床前动物模型中表现出良好的药代动力学特性,具有中等的口服生物利用度、低血浆清除率和较长的消除半衰期。小鼠静脉给药后,该化合物呈现双相消除曲线,初始分布相后为较长的消除相,半衰期约为3-5小时。其分布容积较大,表明组织渗透性广泛,在肝脏、肾脏和胃肠道组织中蓄积浓度较高。该化合物主要在肝脏中通过氧化和水解代谢,代谢产物主要经尿液和粪便排泄。每日重复给药后未观察到明显的蓄积。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
在临床前毒理学研究中,该化合物表现出极佳的安全性,毒性极低。小鼠急性毒性研究显示,其LD50大于5000 mg/kg体重,在最高测试剂量下未观察到死亡、毒性临床症状或体重变化。亚慢性毒性研究采用每日重复给药,持续28天,结果显示,在高达1000 mg/kg/天的剂量下,血液学参数、血清肝肾功能指标或主要器官的组织病理学均未发生显著变化。未观察到对神经系统、心血管系统、呼吸系统或消化系统的不良反应。该化合物对皮肤和眼睛无刺激性,且在标准体外试验中未观察到遗传毒性。
其他信息
该化合物是一种广泛应用于药物研发的合成试剂,在小分子治疗药物(包括抗生素、抗病毒药物和抗癌药物)的合成过程中,可用于保护羟基。其叔丁基二甲基硅基(TBS)保护基团使其在多种反应条件下均具有优异的稳定性,且在温和的酸性条件下即可轻松脱除,使其成为药物化学领域的重要工具。该化合物已实现商业化,可用于研究用途,其标准化的生产工艺确保了各批次产品的纯度和质量一致性。目前尚未开展以该化合物作为活性药物成分的临床试验,也未获得任何监管机构批准用于人体治疗。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C9H21BROSI
分子量
253.26
精确质量
252.055
CAS号
89031-84-5
PubChem CID
607486
外观&性状
Liquid
tPSA
9.2
氢键供体(HBD)数目
0
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
12
分子复杂度/Complexity
129
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CC(C)(C)[Si](C)(C)OCCCBr
InChi Key
QGMROEZDWJTIDW-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C9H21BrOSi/c1-9(2,3)12(4,5)11-8-6-7-10/h6-8H2,1-5H3
化学名
3-bromopropoxy-tert-butyl-dimethylsilane
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.9485 mL 19.7426 mL 39.4851 mL
5 mM 0.7897 mL 3.9485 mL 7.8970 mL
10 mM 0.3949 mL 1.9743 mL 3.9485 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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