12-Amino-1-dodecanol

目录号: V113404
12-氨基-1-十二醇是一种PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC分子。
12-Amino-1-dodecanol CAS号: 67107-87-3
产品类别: PROTAC Linkers
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
12-氨基-1-十二醇是一种PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC分子。
12-氨基-1-十二醇(CAS号:67107-87-3)是一种PROTAC连接剂,分子式为C12H27NO,分子量为201.35 g/mol。该化合物具有12个碳原子的线性烷基链,一端连接伯胺,另一端连接伯醇。它为白色至类白色粉末或结晶固体,熔点为79-83℃。该化合物的密度为0.9+/-0.1 g/cm3,在760 mmHg压力下的沸点为303.6+/-15.0℃。这种氨基醇可作为PROTAC合成的双功能结构单元,提供长而柔性的12碳间隔基。
生物活性&实验参考方法
靶点
As a PROTAC linker, 12-Amino-1-dodecanol does not have direct biological targets. Its role is to serve as a chemical building block for the synthesis of PROTAC molecules. The primary amine and primary alcohol provide orthogonal functional groups for selective conjugation to target protein ligands and E3 ubiquitin ligase ligands. The 12-carbon alkyl chain provides an extended, flexible spacer length. According to reported literature, ideal linker lengths for PROTACs range from 12 to over 20 carbons, making this dodecyl chain well-suited for optimal PROTAC activity and ternary complex formation.
体外研究 (In Vitro)
PROTAC包含两个不同的配体,它们通过一个连接子连接:一个是E109泛素连接酶的配体,另一个是靶蛋白的配体。PROTAC利用细胞内的泛素-蛋白酶体系统选择性地降解靶蛋白。
该化合物本身不具有直接的体外生物活性,因为它是一种化学连接剂。在PROTAC的开发过程中,首先对该化合物的醇基和胺基进行选择性功能化,以连接靶蛋白配体和E3泛素连接酶配体。然后,在细胞实验中评估所得PROTAC对靶蛋白的降解能力。这种长而灵活的12碳连接剂使PROTAC能够跨越三元复合物界面,有效地定位靶蛋白和E3泛素连接酶,从而促进其泛素化。
体内研究 (In Vivo)
目前尚未报道12-氨基-1-十二醇单独具有直接的体内活性。对于使用该长链烷基连接基合成的PROTACs,其体内疗效在异种移植小鼠模型中进行评估。12碳烷基链为在拥挤的细胞环境中形成三元复合物提供了最佳的灵活性和长度,从而可能增强降解效力和选择性。使用该连接基的PROTACs通过腹腔或静脉注射给药,并通过蛋白质印迹法评估肿瘤组织中靶蛋白的降解情况。
酶活实验
目前尚未建立针对该化合物的特定酶/受体结合方案。使用12-氨基-1-十二醇进行PROTAC合成的标准合成方案涉及胺基和醇基的选择性偶联。伯醇可通过转化为甲苯磺酸酯或甲磺酸酯进行亲核取代反应活化,或氧化为醛或羧酸进行还原胺化或酰胺偶联反应。伯胺可使用HATU、EDC或DCC等酰胺偶联试剂与羧酸反应。或者,可先对胺基进行保护(例如使用Boc或Fmoc),以便选择性地官能化醇基,然后脱保护并在胺基处进行偶联。产物通过柱色谱或制备型高效液相色谱纯化。
细胞实验
12-氨基-1-十二醇不直接用于细胞实验评估。对于使用该长链烷基连接基合成的PROTAC的细胞评估,标准方案包括在含10%胎牛血清的DMEM或RPMI-1640培养基中,于37℃、5% CO2条件下培养癌细胞系(例如HEK293、HeLa、MCF-7)。将细胞以适当密度接种于12孔或96孔板中,并使其过夜贴壁。加入浓度范围为0.1 nM至10 uM的PROTAC,孵育4-72小时。使用特异性一抗,通过Western blotting检测细胞裂解液中的靶蛋白降解情况。使用MTT或CellTiter-Glo试剂盒测定细胞活力。所有实验条件均进行三次重复,以确保统计学可靠性。
动物实验
对于使用12-氨基-1-十二醇合成的PROTAC进行的体内研究,标准动物实验方案包括免疫缺陷小鼠(裸鼠或NSG小鼠,6-8周龄,18-22克)的异种移植模型。皮下注射约5×10⁶个癌细胞。当肿瘤体积达到约150-200 mm³时,将小鼠随机分组(每组5-10只)。腹腔注射PROTAC,剂量为1-50 mg/kg,制剂溶剂包括10% DMSO、40% PEG300、5% Tween 80和45%生理盐水。每2-3天使用数字游标卡尺测量肿瘤体积。监测体重作为毒性指标。研究结束时,切除肿瘤,称重,并通过蛋白质印迹法进行靶蛋白分析。可采集血液样本进行药代动力学分析。
药代性质 (ADME/PK)
目前尚未发表关于12-氨基-1-十二醇的直接药代动力学研究。计算得到的分子式为C12H27NO,分子量为201.35 g/mol。该化合物的预测logP值约为3.0-3.5,表明其具有较高的亲脂性,这归因于其较长的12碳烷基链。这种高亲脂性可以增强膜渗透性,但也可能导致水溶性较差。对于含有该连接基的PROTAC,其药代动力学性质取决于完整PROTAC分子的整体结构。该12碳连接基的长度在已报道的PROTAC活性最佳碳链长度范围(12至20个以上碳原子)内。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
根据安全数据表,12-氨基-1-十二醇应按照标准实验室防护措施进行操作。该化合物可能引起皮肤和眼睛刺激。应将其储存在阴凉、干燥、避光处(建议低于15℃)。避免吸入、吞咽以及与皮肤和眼睛接触。操作时应佩戴防护手套、护目镜和实验服。在通风良好的通风橱内进行操作。该化合物仅供研究使用,不得用于人体治疗。
其他信息
12-氨基-1-十二醇是一种PROTAC连接子,其结构包含一条12碳的线性烷基链,并带有正交的氨基和醇羟基官能团。该连接子也称为12-氨基十二烷-1-醇。其12碳链长度处于已报道的PROTAC最佳连接子长度范围(12至20个以上碳原子)内,为靶蛋白、PROTAC和E3泛素连接酶之间形成有效的三元复合物提供了必要的灵活性和作用范围。正交官能团使得PROTAC可以通过选择性偶联化学方法进行模块化组装。该产品用于PROTAC靶向蛋白降解的研究,仅供研究使用,尚未获批用于临床。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C12H27NO
分子量
201.35
精确质量
201.209
CAS号
67107-87-3
PubChem CID
5182020
外观&性状
White to off-white solid powder
tPSA
46.3
氢键供体(HBD)数目
2
可旋转键数目(RBC)
11
重原子数目
14
分子复杂度/Complexity
96.3
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C(CCCCCCO)CCCCCN
InChi Key
IIWXYWWVCBRBCJ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C12H27NO/c13-11-9-7-5-3-1-2-4-6-8-10-12-14/h14H,1-13H2
化学名
12-aminododecan-1-ol
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

Note: 本产品在运输和储存过程中需避光(避免光照)。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.9665 mL 24.8324 mL 49.6648 mL
5 mM 0.9933 mL 4.9665 mL 9.9330 mL
10 mM 0.4966 mL 2.4832 mL 4.9665 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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