| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 100mg |
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| 250mg |
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| 500mg |
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| 1g |
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| 5g |
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| 10g |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
As a PROTAC linker, Methyl 3-(hydroxymethyl)bicyclo[1.1.1]pentane-1-carboxylate does not have direct biological targets. Its role is to serve as a rigid, three-dimensional spacer for PROTAC synthesis. The BCP core provides a conformationally constrained scaffold that can improve metabolic stability and target binding selectivity. The hydroxymethyl group and methyl ester provide orthogonal handles for conjugation to target protein ligands and E3 ubiquitin ligase ligands. The BCP scaffold can act as a bioisostere for para-substituted benzene rings, offering enhanced solubility and reduced planarity compared to aromatic linkers.
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| 体外研究 (In Vitro) |
PROTAC包含两个不同的配体，它们通过一个连接子连接：一个是E692泛素连接酶的配体，另一个是靶蛋白的配体。PROTAC利用细胞内的泛素-蛋白酶体系统选择性地降解靶蛋白。
该化合物本身不具有直接的体外生物活性，因为它是一种化学连接剂。在PROTAC的开发过程中，该化合物的羟甲基和酯基被功能化，用于连接靶蛋白配体和E3连接酶配体。所得PROTAC在细胞实验中用于评估其对靶蛋白的降解能力。刚性BCP支架能够通过提供结合域明确的空间取向来增强三元复合物的形成，与柔性烷基连接剂相比，有望提高降解效力和选择性。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
目前尚未报道该化合物单独具有直接的体内活性。对于含有基于BCP的刚性连接基的PROTACs，其体内疗效在异种移植小鼠模型中进行评估。与线性烷基或PEG连接基相比，刚性三维BCP支架可通过降低酶促降解的敏感性来提高体内代谢稳定性。含BCP的PROTACs通常通过腹腔注射或静脉注射给药，并通过蛋白质印迹法评估肿瘤组织中靶蛋白的降解情况。由于其良好的理化性质，BCP支架也可能提高口服生物利用度。
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| 酶活实验 |
目前尚未建立针对该化合物的特定酶/受体结合方案。使用3-(羟甲基)双环[1.1.1]戊烷-1-羧酸甲酯进行PROTAC合成的标准合成方案包括对羟甲基和酯基进行选择性官能化。甲酯可在THF/水溶液中用LiOH或NaOH水解生成羧酸，该羧酸可用HATU或EDC活化，与含胺配体形成酰胺键。羟甲基可转化为甲苯磺酸酯或甲磺酸酯用于亲核取代反应，或氧化为醛或羧酸用于还原胺化或酰胺偶联反应。或者，羟甲基可先进行保护（例如，用TBS醚保护），以便进行选择性酯水解，然后再进行脱保护和偶联反应。产物通过柱色谱或高效液相色谱纯化。
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| 细胞实验 |
3-(羟甲基)双环[1.1.1]戊烷-1-羧酸甲酯不直接用于细胞实验评估。对于使用该BCP连接剂合成的PROTAC的细胞评估，标准方案包括将癌细胞系（例如HEK293、HeLa、MCF-7或A549）在含10%胎牛血清的DMEM或RPMI-1640培养基中，于37℃、5% CO2条件下培养。将细胞以适当密度接种于12孔或96孔板中，并使其过夜贴壁。加入浓度范围为0.1 nM至10 uM的PROTAC，作用4-72小时。使用特异性一抗，通过Western blotting检测细胞裂解液中的靶蛋白降解情况。使用MTT或CellTiter-Glo试剂盒检测细胞活力。所有实验条件均进行三次重复，以确保统计学可靠性。与柔性连接体相比，刚性 BCP 连接体可能能够在较低浓度下增强靶标降解。
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| 动物实验 |
对于使用基于BCP连接子合成的PROTAC进行的体内研究，标准动物实验方案包括免疫缺陷小鼠（裸鼠或NSG小鼠，6-8周龄）的异种移植模型。皮下注射约5×10⁶个癌细胞。当肿瘤体积达到约150-200 mm³时，将小鼠随机分组（每组n=5-10）。PROTAC以1-50 mg/kg的剂量腹腔注射或静脉注射给药，制剂溶剂包括10% DMSO、40% PEG300、5% Tween 80和45%生理盐水。每2-3天使用数字游标卡尺测量肿瘤体积。监测体重作为毒性指标。研究结束后，切除肿瘤并进行Western blotting靶蛋白分析。可采集血液进行药代动力学分析。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
目前尚未发表关于3-(羟甲基)双环[1.1.1]戊烷-1-羧酸甲酯的直接药代动力学研究。计算得到的分子式为C8H12O3，分子量为156.18 g/mol。该BCP骨架的预测logP值约为0.5-1.0，表明其具有中等的水溶性。与对位取代的苯环（典型的logP值约为2.0-2.5）相比，BCP骨架极性更强，logP值更低，这可以提高水溶性并减少PROTAC分子中的非靶向疏水相互作用。此外，BCP骨架的三维结构可以增强靶点结合选择性。对于含有该连接基团的PROTAC，其药代动力学性质取决于整体结构。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
甲基3-(羟甲基)双环[1.1.1]戊烷-1-羧酸酯的安全数据表明，该化合物仅供研究使用。应遵循标准实验室安全预防措施：佩戴防护手套、护目镜和实验服。在通风良好的通风橱内操作。避免吸入、摄入以及与皮肤和眼睛接触。该化合物应储存在-20℃，避光防潮。虽然具体的毒性数据有限，但该化合物应被视为潜在危险物质。本产品不适用于人类治疗用途。
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| 其他信息 |
3-(羟甲基)双环[1.1.1]戊烷-1-羧酸甲酯是一种PROTAC连接剂，其核心结构为双环[1.1.1]戊烷(BCP)，这是一种刚性的三维碳环骨架，可作为对位取代苯环、炔烃和叔丁基的生物等排体。BCP骨架在药物化学中应用日益广泛，用于取代平面芳香环，形成构象更受限的三维结构，从而提高代谢稳定性、增强溶解度并减少脱靶结合。在PROTAC中，像BCP这样的刚性连接剂可以通过在靶蛋白配体和E3泛素连接酶配体之间提供明确的空间取向来优化三元复合物的形成，从而可能增强降解效力和选择性。本产品仅供研究使用，尚未获批用于临床。
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| 分子式 |
C8H12O3
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|---|---|
| 分子量 |
156.18
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| 精确质量 |
156.079
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| CAS号 |
180464-87-3
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| PubChem CID |
10796998
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| 外观&性状 |
Colorless to light yellow liquid（Density: 1.352±0.06 g/cm3）
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| tPSA |
46.5
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| 氢键供体(HBD)数目 |
1
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| 可旋转键数目(RBC) |
3
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| 重原子数目 |
11
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| 分子复杂度/Complexity |
190
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
COC(=O)C12CC(C1)(C2)CO
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| InChi Key |
BYTLJVZXUYVJKN-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C8H12O3/c1-11-6(10)8-2-7(3-8,4-8)5-9/h9H,2-5H2,1H3
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| 化学名 |
methyl 3-(hydroxymethyl)bicyclo[1.1.1]pentane-1-carboxylate
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 6.4029 mL | 32.0143 mL | 64.0287 mL | |
| 5 mM | 1.2806 mL | 6.4029 mL | 12.8057 mL | |
| 10 mM | 0.6403 mL | 3.2014 mL | 6.4029 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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