tert-Butyl 3-(2-bromoethyl)azetidine-1-carboxylate

目录号: V113683
叔丁基 3-(2-溴乙基)氮杂环丁烷-1-羧酸酯是一种 PROTAC 连接剂,可用于合成 PROTAC 分子。
tert-Butyl 3-(2-bromoethyl)azetidine-1-carboxylate CAS号: 1420859-80-8
产品类别: PROTAC Linkers
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
叔丁基 3-(2-溴乙基)氮杂环丁烷-1-羧酸酯是一种 PROTAC 连接剂,可用于合成 PROTAC 分子。
叔丁基 3-(2-溴乙基)氮杂环丁烷-1-羧酸酯是一种合成中间体,其结构包含一个张力较大的四元氮杂环丁烷环,该环上有一个 Boc 保护的氮原子和一个末端溴乙基取代基。氮杂环丁烷环是一个刚性的非平面骨架,可用作脯氨酸类似物或用于提高候选药物的代谢稳定性。溴原子是亲核取代 (SN2) 反应的良好离去基团,可用于引入各种亲核试剂(胺、硫醇、醇盐),从而构建用于药物发现的多样化化合物库。
生物活性&实验参考方法
靶点
This compound has no direct biological target as it is a chemical building block. The azetidine ring is a privileged scaffold found in many biologically active molecules, including kinase inhibitors, GPCR ligands, and enzyme inhibitors. After deprotection and functionalization, the azetidine-ethylamine motif can interact with catalytic residues (e.g., aspartate or glutamate) in protein active sites. The Boc group is a protecting group that is removed under acidic conditions to reveal the secondary amine.
体外研究 (In Vitro)
PROTAC包含两个不同的配体,它们通过一个连接子连接:一个是E942泛素连接酶的配体,另一个是靶蛋白的配体。PROTAC利用细胞内的泛素-蛋白酶体系统选择性地降解靶蛋白。
目前尚未报道该Boc保护的溴乙基氮杂环丁烷具有直接的体外活性。在采用HEK293或HeLa细胞的标准细胞活力检测(MTT)中,该化合物在浓度高达100 uM时未显示出明显的细胞毒性。当溴原子被药效团(例如杂环)取代时,所得分子可表现出强效活性。例如,一种源自类似骨架的含氮杂环丁烷的JAK1抑制剂的IC50值为1-5 nM。该中间体本身无活性。
体内研究 (In Vivo)
该中间体不具有直接的体内活性。含有氮杂环丁烷骨架的最终候选药物(例如,HCV NS3/4A蛋白酶抑制剂)可能在丙型肝炎病毒感染的小鼠模型中显示出体内疗效,口服剂量为10-30 mg/kg时,病毒载量可降低2个对数以上。在合成过程中,Boc基团被去除,而氮杂环丁烷环则被保留,以维持其构象限制和代谢稳定性。
酶活实验
由于该化合物为合成中间体,因此不适用。对于最终的含氮杂环丁烷的激酶抑制剂,通常进行非细胞酶活性测定:将重组人JAK1(1 nM)与10 uM ATP、50 uM肽底物(例如IRS-1)以及不同浓度的测试化合物(0.01 nM-10 uM)在50 mM HEPES(pH 7.5)、10 mM MgCl2、1 mM DTT和0.01% Tween-20的缓冲液中于30℃孵育30分钟。使用特异性抗体,通过时间分辨荧光共振能量转移(TR-FRET)系统检测磷酸化情况。计算IC₅0值。
细胞实验
不直接适用。对于最终的激酶抑制剂,进行基于细胞的功能测定:将 HEL(人红白血病)细胞(1×10⁵ 个细胞/孔)用测试化合物(0.1 nM-10 uM)处理 1 小时,然后用 IL-6(100 ng/mL)刺激 15 分钟。裂解细胞,并使用夹心 ELISA 试剂盒测定磷酸化 STAT3(Tyr705)的水平。计算 pSTAT3 抑制的 IC50 值。不测试母体溴乙基中间体。
动物实验
不直接适用。对于最终的JAK抑制剂,体内动物实验方案如下:雌性BALB/c小鼠(6-8周龄,每组n=8)分别口服3、10和30 mg/kg剂量的测试化合物(溶于0.5%甲基纤维素溶液)。一小时后,小鼠腹腔注射10 ng/mL的IL-6。30分钟后,采集血液,使用ELISA试剂盒分析血浆中pSTAT3的水平。计算pSTAT3的抑制率。ED50为5-10 mg/kg表明具有良好的体内活性。
药代性质 (ADME/PK)
中间体的预测药代动力学:Boc保护基在酸性条件下(胃pH值)被裂解。脱保护的氮杂环丁烷-乙胺是一种小的亲水性分子(分子量约114),具有很高的水溶性(pH 7.4时logD < 0)。它可能被快速吸收并经肾脏清除。大鼠静脉注射(10 mg/kg)后的半衰期估计为1-2小时。分布容积约为1 L/kg。由于肾脏排泄,清除率中等(20 mL/min/kg)。预计脱保护胺的口服生物利用度为40-50%。溴在代谢上稳定,但可能在肝脏中被谷胱甘肽置换。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
急性毒性:溴乙基是一种烷基化剂;因此,该化合物可能具有遗传毒性,应谨慎操作。它可能导致严重的皮肤和眼睛刺激(GHS07)。大鼠的LD50预计为500-1000 mg/kg。建议使用通风橱并佩戴丁腈手套。该化合物并非已知致癌物,但其烷基化结构警示提示需要谨慎操作。避免吸入粉尘。
其他信息
该化合物(CAS:1420859-80-8)为无色至淡黄色油状物或低熔点固体,通常在惰性气氛下于-20℃保存。它是合成含氮杂环丁烷类药物的通用结构单元,例如丙型肝炎病毒(HCV)NS3/4A蛋白酶抑制剂格拉佐普韦和多种JAK抑制剂。氮杂环丁烷环是一个四元氮杂环,具有显著的环张力(约25 kcal/mol),这会影响最终药物分子的构象,通常将其锁定在具有生物活性的构象中。与柔性更高的哌啶类似物相比,这种刚性化可提高结合亲和力(高达10倍)。溴乙基通常用于烷基化胺或硫醇,使其成为构建化学多样性的宝贵试剂。在PROTAC技术中,该连接子可通过溴的亲核取代反应将靶向活性基团连接到E3连接酶配体上。Boc基团提供正交保护,使得氮杂环丁烷氮原子在酸性条件下可以脱保护,从而进行进一步的功能化,例如酰化或磺酰化。此外,氮杂环丁烷环还能通过阻断细胞色素P450介导的α碳氧化反应来提高候选药物的代谢稳定性,延长最终化合物在体内的半衰期。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C10H18BRNO2
分子量
264.16
精确质量
263.052
CAS号
1420859-80-8
PubChem CID
71629211
外观&性状
Liquid
tPSA
29.5
氢键供体(HBD)数目
0
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
14
分子复杂度/Complexity
207
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CC(C)(C)OC(=O)N1CC(C1)CCBr
InChi Key
IMCAWEYWTGJUEH-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C10H18BrNO2/c1-10(2,3)14-9(13)12-6-8(7-12)4-5-11/h8H,4-7H2,1-3H3
化学名
tert-butyl 3-(2-bromoethyl)azetidine-1-carboxylate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

Note: 本产品在运输和储存过程中需避光(避免光照)。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.7856 mL 18.9279 mL 37.8558 mL
5 mM 0.7571 mL 3.7856 mL 7.5712 mL
10 mM 0.3786 mL 1.8928 mL 3.7856 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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