(3-Aminocyclobutyl)methanol hydrochloride

目录号: V113965
(3-氨基环丁基)甲醇盐酸盐是一种 PROTAC 连接剂,可用于合成 PROTAC 分子。
(3-Aminocyclobutyl)methanol hydrochloride CAS号: 130369-06-1
产品类别: PROTAC Linkers
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
(3-氨基环丁基)甲醇盐酸盐是一种 PROTAC 连接剂,可用于合成 PROTAC 分子。
(3-氨基环丁基)甲醇盐酸盐 (CAS 130369-06-1) 是一种 PROTAC 连接子,由一个刚性的四元环丁烷环、一个伯胺基和一个羟甲基组成。其盐酸盐具有水溶性,适用于生物偶联。这种小巧紧凑的骨架提供了一个受限的非芳香间隔基,用于在 PROTAC 合成中将 E3 连接酶配体连接到靶蛋白配体。
生物活性&实验参考方法
靶点
As a synthetic PROTAC linker, this compound has no direct biological target. It serves as a rigid, short spacer to connect an E3 ubiquitin ligase ligand and a target protein ligand. The cyclobutane ring imposes a fixed exit vector, which can pre-organize the PROTAC for optimal ternary complex formation. The primary amine can be acylated, and the primary alcohol can be activated (e.g., tosylate) for nucleophilic substitution.
体外研究 (In Vitro)
PROTAC包含两个不同的配体,它们通过一个连接子连接:一个是E13泛素连接酶的配体,另一个是靶蛋白的配体。PROTAC利用细胞内的泛素-蛋白酶体系统选择性地降解靶蛋白。
未报道分离的连接子具有直接的体外活性。在最终的PROTAC中,刚性环丁基连接子会影响降解参数(DC50和Dmax)。与柔性连接子相比,这种受限的几何结构可以提高降解选择性并降低DC50值。在处理24-48小时后,使用表达靶标的细胞,通过基于细胞的检测(Western blot或HTRF)来测量降解情况。
体内研究 (In Vivo)
目前尚无关于该连接子单独使用时直接体内活性的报道。对于最终的PROTAC,其体内疗效通过动物模型(例如异种移植模型)进行评估,具体方法是通过免疫组化(IHC)或蛋白质印迹法检测组织中靶蛋白的敲低情况,并评估肿瘤生长抑制情况。环丁烷环通常代谢稳定,与柔性连接子相比,可降低脱靶降解。盐酸盐可提高其在静脉注射时的溶解度。
酶活实验
不适用于分离的连接基团。对于最终的PROTAC,伯胺用HATU或EDCI与羧酸配体酰化。伯醇可以进行甲苯磺酰化(TsCl、吡啶)或甲磺酰化(MsCl、TEA)以进行亲核取代,或者氧化成醛/羧酸以进行进一步的偶联。环丁烷环结构通过核磁共振(NMR)(特征性高场位移)进行确认。最终PROTAC与其靶标的结合亲和力通过表面等离子共振(SPR)或时间分辨荧光共振能量转移(TR-FRET)进行测定。
细胞实验
对于体外细胞实验,将最终的 PROTAC(包含该连接子)溶解于 DMSO 中,配制成 10-50 mM 的储备液。接种靶标表达细胞(例如,6 孔板中每孔 5×10⁵ 个细胞),并使其过夜贴壁。用递增浓度的 PROTAC(0.1 nM 至 10 uM)处理细胞 48 小时。收集细胞,用冰冷的 PBS 洗涤,并在含有蛋白酶抑制剂的 RIPA 缓冲液中裂解(冰上 30 分钟)。将裂解液在 4℃ 下以 16,000 g 离心 15 分钟。通过 BCA 法定量蛋白质浓度。使用靶标特异性一抗(1:1000)和 HRP 标记的二抗(1:5000)进行 Western blot 分析。用 ECL 显色,并通过密度扫描法定量条带强度以确定 DC50 值。
动物实验
对于体内动物实验,将最终的PROTAC配制成含有10% DMSO、40% PEG300、5% Tween 80和45%生理盐水的溶剂。对携带皮下异种移植瘤的BALB/c裸鼠(每组n=5)进行腹腔注射(IP),剂量为10-30 mg/kg。分别于给药后0、0.5、1、2、4、8、12和24小时经尾静脉采血。离心分离血浆,并储存于-80℃。取50 μL血浆,加入内标和乙腈,涡旋混匀,离心,取上清液进行LC-MS/MS分析。实验结束时收集肿瘤组织,进行Western blot分析,检测靶蛋白水平。
药代性质 (ADME/PK)
目前尚无分离连接子的药代动力学数据。对于最终的PROTAC,刚性环丁基连接子赋予其良好的代谢稳定性。典型的啮齿动物药代动力学参数包括:半衰期(t1/2)为3-8小时,清除率(CL)为15-35 mL/min/kg,分布容积(Vd)为1-4 L/kg,口服生物利用度(F%)为10-25%。极性羟甲基和氨基可以提高溶解度并降低分布容积。伯胺可能在体内发生乙酰化。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无分离连接子的毒性数据。对于最终的PROTAC,在为期7天的探索性毒性研究中,对大鼠(每组每性别3只)进行了安全性评估,剂量分别为10、30和100 mg/kg(腹腔注射)。终点指标包括临床观察、体重、血清生化指标(ALT、AST、BUN、肌酐)以及主要器官的组织病理学检查。环丁烷环通常无毒。盐酸盐形式在典型剂量下耐受性良好。
其他信息
该PROTAC连接剂的分子式为C5H12ClNO,分子量为137.61 g/mol。外观为白色至类白色结晶固体。纯度通常≥95%。储存条件:粉末在2-8℃下可保存3年,溶剂在-80℃下可保存6个月。可溶于DMSO和水(由于其为盐酸盐)。它也称为顺式-3-氨基环丁烷甲醇盐酸盐和3-氨基环丁烷-1-甲醇盐酸盐。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C5H12CLNO
分子量
137.61
CAS号
130369-06-1
外观&性状
White to off-white solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 7.2669 mL 36.3346 mL 72.6691 mL
5 mM 1.4534 mL 7.2669 mL 14.5338 mL
10 mM 0.7267 mL 3.6335 mL 7.2669 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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