LXH-3-71

目录号: V115333
LXH-3-71 是一种强效的分子胶 PHGDH 降解剂。
LXH-3-71 CAS号: 2251753-65-6
产品类别: PHGDH
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
LXH-3-71 是一种强效的分子胶 PHGDH 降解剂。LXH-3-71 可与 PHGDH 和 DDB1-CRL E3 连接酶形成动态嵌合体。LXH-3-71 可在体外和体内调控结直肠癌细胞 (CRC) 的干性。LXH-3-71 可用于结直肠癌的研究。
LXH-3-71 是一种新型“分子胶”,可诱导 3-磷酸甘油酸脱氢酶 (PHGDH) 的降解。PHGDH 是丝氨酸合成途径中的关键酶,也是癌症干细胞 (CSC) 的调控因子。LXH-3-71 与 PHGDH 的 Cys281 位点共价结合,促进 PHGDH 与 DDB1-CRL E3 连接酶形成动态嵌合体,进而导致 PHGDH 的泛素化和蛋白酶体降解。该化合物在体外和体内均能调节结直肠癌细胞 (CRC) 的干性,并被用于结直肠癌的研究。此外,它还可作为 DDB1-CRL E3 连接酶的新型配体,用于 PROTAC 的开发。
生物活性&实验参考方法
靶点
LXH-3-71 targets PHGDH (3-phosphoglycerate dehydrogenase), which is the first enzyme in the phosphorylated serine synthesis pathway. PHGDH is intricately associated with the regulation of numerous cancer stem cells. As a molecular glue, LXH-3-71 does not inhibit PHGDH's enzymatic activity; instead, it promotes the interaction between PHGDH and the DDB1-CRL E3 ligase complex (a cullin-RING E3 ligase with DDB1 adapter). This leads to polyubiquitination and subsequent proteasomal degradation of PHGDH. By degrading PHGDH, LXH-3-71 reduces the stemness of colorectal cancer cells. The compound covalently binds to Cys281 of PHGDH.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,LXH-3-71 能显著诱导结直肠癌细胞中 PHGDH 的降解,从而调节癌症干细胞的特性。这种降解具有选择性和显著性,可在不影响 PHGDH 生物合成功能的情况下降低癌细胞的干性。作为一种分子胶,LXH-3-71 与 PHGDH 的 Cys281 位点共价结合,促进其与 DDB1-CRL E3 连接酶形成动态嵌合体,进而导致泛素化和蛋白酶体介导的降解。该机制可降低结直肠癌细胞的增殖并改变其干细胞样特性。此外,该化合物还被用作 DDB1-CRL E3 连接酶的新型配体,有助于开发靶向 EGFR 和 CDK4 降解的新型 PROTAC 分子。
体内研究 (In Vivo)
LXH-3-71 已被证实具有体内疗效,能够调节结直肠癌细胞的干性并抑制 CRC 模型中的肿瘤生长。它能显著诱导 PHGDH 降解,从而在体内调节结直肠癌细胞 (CRC) 的干性。该化合物已被用于开发新型 PROTAC 分子。其体内疗效支持进一步研究,有望成为一种潜在的结直肠癌治疗策略,即通过靶向 PHGDH 降解而非抑制其酶活性。具体剂量和给药途径信息:详见原始研究文献(《中国药学学报》B辑,2024)。仅供研究使用。
酶活实验
无细胞结合实验证实 LXH-3-71 与 PHGDH 的 Cys281 位点共价结合。典型的下拉实验如下:将重组 PHGDH 蛋白与生物素标记的 LXH-3-71 (0.1-10 uM) 在结合缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 7.5、150 mM NaCl、1 mM DTT)中于 4℃ 孵育 1 小时。加入链霉亲和素磁珠以捕获蛋白-配体复合物。洗涤后,洗脱结合的蛋白,并使用抗 PHGDH 抗体进行 SDS-PAGE 和 Western blot 分析。为进行竞争实验,加入过量的未标记 LXH-3-71 (100 uM)。这证实了直接的共价结合。质谱分析可以鉴定 Cys281 的修饰。这些无细胞实验是确定 LXH-3-71 作为分子胶的关键。
细胞实验
在细胞降解实验中,将结直肠癌细胞(例如 HCT-116、HT-29)接种于 6 孔板中(5 × 10⁵ 个细胞/孔),培养基为含 10% FBS 的 DMEM。24 小时后,用 LXH-3-71(0.1-100 uM)处理细胞 6-24 小时。为抑制蛋白酶体活性,先用 MG132(10 uM,1 小时)预处理细胞。用含蛋白酶抑制剂的 RIPA 裂解缓冲液裂解细胞。取 30 ug 蛋白裂解液进行 SDS-PAGE 电泳分离,并用抗 PHGDH 抗体进行免疫印迹分析。GAPDH 或 β-肌动蛋白用作上样对照。通过密度扫描法定量 PHGDH 的降解。可计算 LC50 值。对于癌症干性检测,进行球体形成实验:将细胞接种于超低吸附培养板中,培养基为添加生长因子(EGF、bFGF)的无血清DMEM/F12培养基。LXH-3-71可减少球体的大小和数量,表明干性降低。
动物实验
在结直肠癌异种移植模型中评估体内疗效。将5 × 10⁶个HCT-116细胞悬浮于0.1 mL PBS中,皮下注射至6-8周龄、18-22 g的雌性BALB/c裸鼠体内。当肿瘤体积达到150-200 mm³时,将小鼠随机分组(n=8)。将LXH-3-71配制成10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween-80 + 45%生理盐水溶液,并以10-50 mg/kg的剂量每日腹腔注射给药,持续14-21天。每周测量两次肿瘤体积(V = 长 × 宽² × 0.5)和体重。研究结束时,切除肿瘤组织,称重,并进行蛋白质印迹(PHGDH 水平)和免疫组化(Ki-67、cleaved caspase-3)分析。计算肿瘤生长抑制率(TGI)。该方案基于评估 PHGDH 降解剂的标准体内实验方法。
药代性质 (ADME/PK)
所提供的数据表中未报告 LXH-3-71 的药代动力学性质。作为一种与 PHGDH(分子量约为 456.20)共价结合的分子胶,它可能在啮齿动物中具有中等至较高的口服生物利用度。由于与靶点的共价结合,其末端半衰期 (t1/2) 可能会延长。体内使用时,请按上述方法配制。储存方法:粉末,-20℃ 保存,可稳定保存 2 年。体外实验时,请溶于 DMSO(50 mg/mL)。请勿反复冻融。本品不可用于人体。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
LXH-3-71 的临床前毒性数据尚不可用。作为用于体外和体内癌症研究的研究化学品,应按照标准实验室安全防护措施进行操作:佩戴手套、实验服和护目镜。避免吸入和皮肤接触。该化合物不适用于人类治疗用途。未报告急性口服 LD50 数据。储存于 -20°C。根据当地法规进行处置。潜在的靶向毒性可能与正常组织中 PHGDH 的降解有关,但需要进一步研究。
参考文献

[1]. Molecular glue triggers degradation of PHGDH by enhancing the interaction between DDB1 and PHGDH. Acta Pharm Sin B. 2024;14(9):4001-4013.

其他信息
LXH-3-71的CAS号为2251753-65-6,分子式为C24H28N4O4S,分子量为468.57。它又被称为PHGDH降解剂,一种分子胶。仅供研究使用。相关文献见《中国药学学报B辑》,2024年,doi: 10.1016/j.apsb.2024.06.001。该化合物与PHGDH的Cys281残基共价结合。它可用作DDB1-CRL E3连接酶的配体,用于开发靶向EGFR和CDK4的新型PROTAC分子。研究应用:结直肠癌、癌症干细胞、靶向蛋白降解。纯度>98%。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C41H59N3O4
分子量
657.92
CAS号
2251753-65-6
外观&性状
Typically exists as solids at room temperature
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.5199 mL 7.5997 mL 15.1994 mL
5 mM 0.3040 mL 1.5199 mL 3.0399 mL
10 mM 0.1520 mL 0.7600 mL 1.5199 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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