(R)-ACE-OH

别名: (R)-ACE-OH; (R)-ACE OH
目录号: V115632
(R)-ACE-OH 是 (S)-ACE-OH 的对映异构体。
(R)-ACE-OH CAS号: 3095569-90-4
产品类别: Drug Isomer
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
(R)-ACE-OH 是 (S)-ACE-OH 的对映异构体。 简介: (R)-ACE-OH 是兽用镇静剂乙酰丙嗪 (Acepromazine, ACE) 的酮基还原后产生的两种对映异构体之一,也是活性代谢物 (S)-ACE-OH 的无活性对映体。在研究中,它主要作为对照化合物被鉴定和表征。与 (S)-型对映体不同,(R)-ACE-OH 在所有测试中均无活性,这证明了靶向 TRIM21-NUP98 相互作用的分子胶降解剂活性具有严格的立体特异性 [1]。
生物活性&实验参考方法
体外研究 (In Vitro)
- 立体选择性细胞毒性: (R)-ACE-OH 在 ACE 敏感 (A549) 和不敏感 (DLD-1) 的细胞系中,无论是否存在 IFNγ,均无活性。与 (S)-ACE-OH 形成鲜明对比,它没有显示出干扰素增强的细胞毒性 [1]。
- 无法诱导蛋白质降解: 在 IFNγ 预刺激的 A549 细胞中,(R)-ACE-OH (10 µM) 处理 8 小时未触发核孔蛋白 NUP35、SMPD4 和 GLE1 的降解,而 (S)-ACE-OH 则可以 [1]。
酶活实验
- 等温滴定量热法 (ITC) 测定结合亲和力: ITC 实验在 25°C 下使用 MicroCal PEAQ-ITC 进行。将纯化的 TRIM21D355A 的 PRYSPRY 结构域透析后(缓冲液:20 mM HEPES, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, pH 8.0, 1% DMSO)以 20-25 µM 的浓度加入样品池中。将 (R)-ACE-OH 从 100 mM DMSO 母液中稀释至 300-500 µM(最终 DMSO 浓度为 1%)。滴定程序包括一次 0.4 µL 的初始注射和 18 次 2 µL 的注射,搅拌速度为 1000 rpm。测得 (R)-ACE-OH 与 PRYSPRY 结构域的结合亲和力(Kd)为 9.11 µM [1]。
- ITC 测定三元复合物形成: 为探究三元复合物的形成,将 NUP98APD (注射器中 200 µM) 滴定到含有预孵育了 (R)-ACE-OH (100 µM) 的全长 His-Lipoyl-TRIM21D355A (50 µM) 的样品池中。实验结果显示,尽管观察到 NUP98APD 与 TRIM21D355A;(R)-ACE-OH 复合物的结合,但其亲和力 (Kd = 57.2 µM,置信区间: 38.2-76.2 µM) 比与 (S)-ACE-OH 形成的复合物低 17 倍 [1]。
- GST Pull-Down 实验: 将 His-Lipoyl-TRIM21 (WT 或 D355A) 与 GST-NUP98APD 按 1:1 摩尔比在 pull-down 实验缓冲液中混合。向蛋白混合物中加入 DMSO、(S)-ACE-OH 或 (R)-ACE-OH。冰上孵育后,将混合物与谷胱甘肽琼脂糖珠一起孵育。通过 SDS-PAGE 和考马斯亮蓝染色分析结合蛋白。实验表明,在 (R)-ACE-OH 存在下,GST-NUP98APD 不能有效拉下 His-Lipoyl-TRIM21,这与 (S)-ACE-OH 的效果相反 [1]。
- CEBIT(基于冷凝物的试管内生物分子相互作用富集)实验: 形成 SmF-EGFP-SH3-NUP98APD 和 SmF-EGFP-PRM 冷凝物。将含有 TRIM21D355A-3xFLAG 的细胞裂解液或纯化的 TRIM21D355A-3xFLAG 蛋白与不同浓度的 (R)-ACE-OH 一起孵育。通过离心沉淀冷凝物,并用蛋白质印迹法进行分析。该实验证明,(R)-ACE-OH 未能像 (S)-ACE-OH 那样以剂量依赖的方式富集冷凝物中的 TRIM21 [1]。
- 体外泛素化实验: 在含有 ATP 的缓冲液中,混合纯化的 TRIM21D355A-3xFLAG、SmF-EGFP-PRM、SmF-EGFP-SH3-NUP98APD、UBA1 (E1)、七种 E2 酶的混合物以及泛素,进行体外泛素化反应。在加入酶之前 30 分钟加入 (R)-ACE-OH。结果显示,用抗泛素和抗 GFP 抗体检测,(R)-ACE-OH 未能诱导 SmF-EGFP-SH3-NUP98APD 和 SmF-EGFP-PRM 的多聚泛素化 [1]。
细胞实验
- 细胞活力测定: 为获得浓度-反应曲线,将细胞(如 A549, DLD-1)接种在 96 孔板中,并使用数字分配器加入梯度稀释的 (R)-ACE-OH。三天后,按照制造商说明使用发光法细胞活力检测试剂盒测量细胞存活率。该实验证实,无论是否存在 IFNγ,(R)-ACE-OH 在这两种细胞系中均无活性 [1]。
- 检测蛋白质降解的蛋白质印迹法: A549 细胞先用 IFNγ 预处理,再用 (R)-ACE-OH 或 (S)-ACE-OH 处理 8 小时。细胞在含有苯并酶和蛋白酶抑制剂的 SDS 裂解缓冲液中裂解。蛋白裂解液经 SDS-PAGE 分离,转移到硝酸纤维素膜上,然后用靶蛋白(如 NUP35, SMPD4, GLE1)和内参(β-actin)的一抗进行孵育。这证实了 (R)-ACE-OH 与 (S)-ACE-OH 不同,不能诱导特定核孔蛋白的降解 [1]。
参考文献

[1]. Selective degradation of multimeric proteins by TRIM21-based molecular glue and PROTAC degradersJ. Cell. 2024 Dec 12;187(25):7126-7142.e20.

其他信息
- 无活性对映体: (R)-ACE-OH 作为关键的阴性对照,证明了依赖于 TRIM21 的降解和细胞毒性的分子胶活性完全取决于 (S) 对映体的构型。通过化学衍生化和 X 射线衍射确定了两种对映体的绝对构型 [1]。
- 结构比较: TRIM21 PRYSPRY 结构域与 (R)-ACE-OH 的共晶体结构(分辨率 1.74 Å)显示,虽然三环吩噻嗪环同样占据疏水口袋,但其脂肪链的取向不同。(R)-ACE-OH 的胺基延伸到口袋外部,这与 (S)-ACE-OH 的胺基与 E389 和 Q395 形成极性相互作用的构型不同,为其无活性提供了结构基础 [1]。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C19H24N2OS
分子量
328.47
精确质量
328.1609345
CAS号
3095569-90-4
相关CAS号
(S)-ACE-OH
外观&性状
Typically exists as solids at room temperature
别名
(R)-ACE-OH; (R)-ACE OH
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.0444 mL 15.2221 mL 30.4442 mL
5 mM 0.6089 mL 3.0444 mL 6.0888 mL
10 mM 0.3044 mL 1.5222 mL 3.0444 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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