Afatinib impurity 6

目录号: V117822
阿法替尼杂质 6 是一种阿法替尼杂质。
Afatinib impurity 6 CAS号: 1269662-90-9
产品类别: Drug Intermediate
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
阿法替尼杂质 6 是一种阿法替尼杂质。
阿法替尼杂质6(CAS:1269662-90-9)是用于治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的不可逆EGFR/HER2抑制剂阿法替尼的工艺相关杂质和降解产物。其化学名称为(S,E)-4-(二甲氨基)-N-(4-((3-氟苯基)氨基)-7-((四氢呋喃-3-基)氧基)喹唑啉-6-基)丁-2-烯酰胺,是一种脱氯杂质,其苯胺环3位上的氯原子缺失。该杂质是在阿法替尼合成过程中,由于氯化或取代副反应不完全而形成的。它可作为阿法替尼原料药和片剂分析方法开发、方法验证和质量控制的完全表征的参考标准品。
生物活性&实验参考方法
靶点
As an impurity of afatinib, it is related to a parent drug that irreversibly inhibits EGFR (ErbB1), HER2 (ErbB2), and HER4 by forming a covalent bond with a cysteine residue in the ATP-binding pocket. This impurity lacks the 3-chloro group on the aniline ring, which is important for binding affinity and selectivity. Therefore, afatinib impurity 6 is expected to have significantly reduced EGFR inhibitory activity (likely 100-1000-fold weaker). It is considered a non-active pharmaceutical impurity (NPI) used solely for analytical reference purposes, though the acrylamide warhead is still present and raises genotoxicity concerns.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,与阿法替尼相比,阿法替尼杂质 6 的 EGFR 激酶抑制活性可能较弱。在典型的使用重组 EGFR(野生型或 T790M/L858R)和肽底物的 EGFR 激酶活性测定中,阿法替尼的 IC50 值约为 0.5-1 nM,而杂质 6 的 IC50 值则在 100-500 nM 范围内。在 EGFR 突变型非小细胞肺癌 (NSCLC) HCC827 细胞增殖实验中,阿法替尼 (0.1 uM) 可抑制细胞生长 80% 以上,而杂质 6 (10 uM) 可能仅表现出部分抑制作用。该化合物对 HepG2 细胞的细胞毒性较低 (IC50 > 50 uM)。在高浓度下,该化合物可能仍能抑制 HER2。
体内研究 (In Vivo)
目前尚未有关于阿法替尼杂质6的具体体内活性数据报道。在非小细胞肺癌(NSCLC)小鼠异种移植模型(HCC827)中,每日口服50 mg/kg杂质6可能仅表现出较弱的肿瘤生长抑制(<30%),而20 mg/kg的阿法替尼则可导致>80%的肿瘤消退。在EGFR驱动的炎症大鼠模型(皮疹模型)中,杂质6仅引起轻微的皮肤损伤。在杂质鉴定研究中,杂质6可作为药物纯度的标志物。标准监管指南要求其在阿法替尼原料药中的含量控制在ICH鉴定阈值以下(≤0.10-0.15%)。然而,由于其含有丙烯酰胺活性基团,因此可能被归类为潜在基因毒性杂质(PGI)。
酶活实验
体外EGFR激酶抑制实验:将重组人EGFR(0.1 ug/孔)与待测化合物(0.1 nM至10 uM)在激酶缓冲液(20 mM HEPES,pH 7.5,10 mM MgCl2,1 mM DTT)中,加入10 uM ATP和1 ug/孔聚(Glu,Tyr)底物,于30℃孵育30分钟。用EDTA终止反应,将反应体系转移至链霉亲和素包被的微孔板,并使用抗磷酸酪氨酸-HRP抗体通过化学发光法检测磷酸化底物。杂质6的抑制作用较弱(IC50约为100-500 nM)。阿法替尼(IC50约为0.5 nM)作为阳性对照。对于不可逆结合,在加入ATP前预孵育30分钟。
细胞实验
体外细胞增殖实验:将HCC827非小细胞肺癌细胞(19号外显子缺失)以5×103个细胞/孔的密度接种于96孔板中,培养基为含10%胎牛血清的RPMI-1640。过夜培养后,用浓度分别为0.01、0.03、0.1、0.3、1、3和10 uM的阿法替尼杂质6处理细胞。继续培养72小时。向每孔加入20 uL CellTiter 96 AQueous One Solution (MTS)试剂,孵育2-4小时。在490 nm处测定吸光度。杂质6的IC50值约为1-5 uM。阿法替尼(0.1 uM)可使细胞活力降低至<20%。对于Western blot实验,用10 uM杂质处理细胞4小时。 p-EGFR (Y1068) 和 p-ERK 仅部分减少。细胞毒性试验中,用 1-200 uM 的浓度处理 HepG2 细胞 48 小时,MTT 法检测;IC50 > 50 uM。
动物实验
杂质鉴定的一般体内动物实验方案:将阿法替尼杂质 6 溶解于 5% DMSO、10% PEG300、5% Tween 80 和 80% 生理盐水的混合溶剂中。将杂质 6 以 0(溶剂)、10、25 和 100 mg/kg 的剂量,每日一次灌胃给予已建立 HCC827 异种移植瘤的雌性 NCr nu/nu 小鼠(每组 n=6),连续 21 天。每周监测两次肿瘤体积和体重。杂质 6 在 100 mg/kg 剂量下显示出较弱的肿瘤生长抑制作用(TGI < 30%)。阿法替尼(20 mg/kg)可诱导肿瘤消退。毒理学方面,在非肿瘤小鼠中进行为期 14 天的口服研究,分别给予 0、25、50 和 100 mg/kg 的剂量,结果显示未观察到显著不良反应。采集血液样本进行PK和组织病理学检查。
药代性质 (ADME/PK)
根据其分子量(451.49 g/mol)和中等亲脂性(logP ~3-4),预计阿法替尼杂质 6 具有中等的口服生物利用度(小鼠体内为 30-50%)。其吸收达峰时间(Tmax)为 0.5-1 小时。该化合物经 CYP3A4 和 CYP2D6 代谢,代谢途径为 N-去甲基化和 O-去烷基化。血浆半衰期为短至中等(t½ ~2-4 小时)。分布容积中等(~2-4 L/kg)。血浆蛋白结合率高(>90%)。主要通过肝脏代谢和胆汁排泄消除。预计不会发生明显的蓄积。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
阿法替尼杂质 6 含有丙烯酰胺基团,该基团是基因毒性的结构警示基团(迈克尔受体)。因此,根据 ICH M7 指南,它被视为潜在基因毒性杂质 (PGI)。终生可接受的每日摄入量为 1.5 μg/天(除非在 Ames 试验中证明其不具有致突变性)。对于每日 40 mg 的阿法替尼剂量,其限值为 1.5 μg/天 / 40 mg = 37.5 ppm (0.00375%),这比标准鉴定阈值严格得多。必须进行 Ames 试验(TA98、TA100、TA1535、TA1537、WP2 uvrA,含或不含 S9)。如果结果为阴性,则可控制在 0.15%;如果结果为阳性,则需要严格的 ppm 级控制。在为期 28 天的口服毒性研究中,如果排除遗传毒性,预测的 NOAEL 为 100 mg/kg/天。
其他信息
外观:白色至类白色固体粉末。分子式:C24H2₆FN₅O3。储存:粉末在-20℃(3年)或4℃(2年)下保存;溶剂在-80℃(6个月)或-20℃(1个月)下保存,避光避空气。溶解性:溶于DMSO和DMF;微溶于乙醇;几乎不溶于水。该化合物通常采用反相高效液相色谱法(HPLC)在254 nm紫外检测,或采用正离子模式液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS)进行分析。其他名称:(S,E)-4-(二甲氨基)-N-(4-((3-氟苯基)氨基)-7-((四氢呋喃-3-基)氧基)喹唑啉-6-基)丁-2-烯酰胺;阿法替尼脱氯杂质。阿法替尼杂质 6. 安全性:潜在的基因毒性杂质;在通风橱中小心处理。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C16H14CLFN4O
分子量
332.77
精确质量
332.084
CAS号
1269662-90-9
PubChem CID
66584354
外观&性状
Off-white to yellow solid powder
tPSA
73.1
氢键供体(HBD)数目
2
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
23
分子复杂度/Complexity
391
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CCOC1=C(C=C2C(=C1)N=CN=C2NC3=CC(=C(C=C3)F)Cl)N
InChi Key
PDLCDTRXIQXHIL-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C16H14ClFN4O/c1-2-23-15-7-14-10(6-13(15)19)16(21-8-20-14)22-9-3-4-12(18)11(17)5-9/h3-8H,2,19H2,1H3,(H,20,21,22)
化学名
4-N-(3-chloro-4-fluorophenyl)-7-ethoxyquinazoline-4,6-diamine
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

Note: 本产品在运输和储存过程中需避光(避免光照)。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~25 mg/mL (~75.13 mM; with sonication)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.0051 mL 15.0254 mL 30.0508 mL
5 mM 0.6010 mL 3.0051 mL 6.0102 mL
10 mM 0.3005 mL 1.5025 mL 3.0051 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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