Ledipasvir impurity 53

目录号: V117910
雷迪帕韦杂质 53 是一种雷迪帕韦杂质。
Ledipasvir impurity 53 CAS号: 1129634-43-0
产品类别: Drug Intermediate
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
雷迪帕韦杂质 53 是一种雷迪帕韦杂质。
雷迪帕韦杂质53(CAS:1129634-43-0)是HCV NS5A抑制剂雷迪帕韦(与索非布韦联合用于治疗慢性丙型肝炎)的工艺相关杂质。从化学角度来看,它是一种脱氟或脱甲基杂质,很可能是开链或环状氨基甲酸酯衍生物。该杂质是在雷迪帕韦合成过程中,由于吡咯烷和芴部分偶联不完全或在脱保护步骤中形成的。它是雷迪帕韦原料药和固定剂量复方片剂分析方法开发、方法验证和质量控制(QC)的完全表征的参考标准品。
生物活性&实验参考方法
靶点
As an impurity of ledipasvir, it is related to a parent drug that inhibits the HCV NS5A protein, a critical component of the viral replication complex, blocking RNA replication and virion assembly. However, this impurity lacks the full symmetric bis-carbamate pharmacophore and the fluorene rings essential for high-affinity NS5A binding. Therefore, ledipasvir impurity 53 is not expected to possess significant NS5A inhibitory activity. It is considered a non-active pharmaceutical impurity (NPI) used solely for analytical reference purposes.
体外研究 (In Vitro)
目前尚未报道ledipasvir杂质53的具体体外生物活性数据。在采用Huh-7细胞的标准HCV复制子检测(基因型1a或1b)中,ledipasvir的EC50约为0.01-0.1 nM。相比之下,杂质53在浓度高达10 uM时可能不表现出抑制作用(EC50 > 10 uM)。在采用重组NS5A结构域I和荧光偏振探针的NS5A结合试验中,杂质53不会置换探针。其在Huh-7细胞中的细胞毒性较低,IC50 > 100 uM。
体内研究 (In Vivo)
未见该杂质的体内活性报道。在HCV感染小鼠模型(人源化肝脏的uPA-SCID嵌合小鼠)中,雷迪帕韦(10 mg/kg,口服)可使血清HCV RNA水平降低4个log以上,而相同剂量的杂质53则无此作用。在杂质鉴定研究中,该杂质可作为药物纯度和稳定性的标志物。标准监管指南要求雷迪帕韦原料药中该杂质的含量控制在ICH鉴定阈值以下(≤0.10-0.15%)。
酶活实验
体外HCV NS5A结合试验(荧光偏振法):将重组HCV NS5A I结构域(100 nM)、荧光标记的高亲和力探针(10 nM)和待测化合物(雷迪帕韦杂质53,0.1 nM至10 uM)在结合缓冲液(20 mM Tris-HCl,pH 7.5,150 mM NaCl,1 mM DTT,0.01% Tween 20)中于25℃孵育60分钟。在485/535 nm处测量荧光偏振。杂质53未显示置换作用(IC50 > 10 uM)。雷迪帕韦(IC50 ~0.1 nM)作为阳性对照。对于基于细胞的试验,使用表达HCV基因1b型复制子和荧光素酶的Huh-7细胞。
细胞实验
体外细胞活力检测:将Huh-7细胞以1×10⁴个/孔的密度接种于96孔板中,培养基为含10% FBS的DMEM。24小时后,用浓度分别为0.1、1、10、30、100和200 uM的ledipasvir杂质53(由DMSO储备液配制,最终DMSO浓度≤0.5%)处理细胞。在37℃、5% CO2条件下培养48小时。向每个孔中加入20 uL MTT溶液(5 mg/mL),继续培养4小时。吸出培养基,加入100 uL DMSO,并在570 nm处测定吸光度。该杂质的细胞毒性较低,IC50 > 100 uM。在100 uM浓度下未观察到LDH释放增加。
动物实验
杂质鉴定的一般体内动物实验方案:将雷迪帕韦杂质 53 溶解于 5% DMSO、10% PEG300、5% Tween 80 和 80% 生理盐水的混合溶剂中。将上述溶剂以 0(溶剂)、10、25 和 100 mg/kg 的剂量,每日一次灌胃给予携带 Huh-7 HCV 复制子异种移植瘤的雄性 SCID 小鼠(每组 n=6),连续 14 天。监测小鼠体重和临床症状。杂质 53 未显示抗 HCV 活性。雷迪帕韦(10 mg/kg)可使复制子活性降低 90% 以上。采集血液样本进行血液学和临床化学分析,并进行尸检和组织病理学检查。
药代性质 (ADME/PK)
根据其分子量(约 600-700 Da)和高亲脂性,雷迪帕韦杂质 53 预计由于溶解度差和 P-gp 外排作用,其口服生物利用度较低(小鼠体内 <20%)。其吸收达峰时间 (Tmax) 为 1-2 小时。该化合物经 CYP3A4 代谢。血浆半衰期为短至中等(t½ ~2-4 小时)。分布容积较大(>5 L/kg)。血浆蛋白结合率极高(>99%)。主要通过胆汁排泄消除。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无关于雷迪帕韦杂质53的专门毒理学数据。根据其结构(该结构缺乏已知的基因毒性结构警示,氨基甲酸酯和吡咯烷基团不具有致突变性),该杂质被认为不具有基因毒性。在一项为期28天的大鼠重复给药口服毒性研究中,预测的无观察到不良反应剂量(NOAEL)为100 mg/kg/天。预计该化合物在Ames试验中呈阴性。按照ICH Q3A/B标准鉴定阈值0.15%进行常规控制是可以接受的。
其他信息
外观:白色至类白色固体粉末。分子式:(未公开;预期为C4₉H₅₅F2N₈O₆或类似分子式)。储存:粉末储存于-20℃(3年)或4℃(2年);溶剂储存于-80℃(6个月)或-20℃(1个月),避光保存。溶解性:溶于DMSO和DMF;几乎不溶于水。该化合物通常采用反相高效液相色谱法(HPLC)结合254 nm紫外检测或液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS)进行分析。其他名称:雷迪帕韦脱氟杂质;雷迪帕韦杂质53。安全性:作为危险品处理;避免吸入和皮肤接触。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C13H21NO4
分子量
255.31
精确质量
255.147
CAS号
1129634-43-0
相关CAS号
Ledipasvir impurity 53
PubChem CID
57611019
外观&性状
Colorless to light yellow liquid
tPSA
55.8
氢键供体(HBD)数目
0
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
18
分子复杂度/Complexity
368
定义原子立体中心数目
1
SMILES
CC(C)(C)OC(=O)N1CC2(CC2)C[C@H]1C(=O)OC
InChi Key
PCTAHDKKGGKHQK-VIFPVBQESA-N
InChi Code
InChI=1S/C13H21NO4/c1-12(2,3)18-11(16)14-8-13(5-6-13)7-9(14)10(15)17-4/h9H,5-8H2,1-4H3/t9-/m0/s1
化学名
5-O-tert-butyl 6-O-methyl (6S)-5-azaspiro[2.4]heptane-5,6-dicarboxylate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.9168 mL 19.5840 mL 39.1681 mL
5 mM 0.7834 mL 3.9168 mL 7.8336 mL
10 mM 0.3917 mL 1.9584 mL 3.9168 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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