Pralatrexate impurity 1

目录号: V118053
Pralatrexate 杂质 1 是一种 Pralatrexate 杂质。
Pralatrexate impurity 1 CAS号: 146464-93-9
产品类别: Drug Intermediate
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
Pralatrexate 杂质 1 是一种 Pralatrexate 杂质。
普拉曲沙杂质 1 (CAS:146464-93-9) 是一种与抗叶酸抗肿瘤药物普拉曲沙相关的工艺杂质和降解产物,普拉曲沙用于治疗复发或难治性外周T细胞淋巴瘤 (PTCL)。其化学名称为 4-(1-(2,4-二氨基蝶啶-6-基)戊-4-炔-2-基)苯甲酸,是普拉曲沙的位置异构体或侧链修饰类似物。该杂质是一种经过充分表征的参考标准品,用于普拉曲沙商业生产过程中的分析方法开发、方法验证和质量控制。该化合物适用于实验室研究以及高效液相色谱 (HPLC)、气相色谱 (GC) 和质谱 (MS) 分析。
生物活性&实验参考方法
靶点
As an impurity of pralatrexate, it is related to a parent drug that competitively inhibits dihydrofolate reductase (DHFR), thereby depleting reduced folate pools and inhibiting DNA synthesis. However, as a structurally modified impurity with an altered side‑chain stereochemistry or connectivity, pralatrexate impurity 1 is unlikely to possess significant DHFR inhibitory activity. It is considered a non‑active pharmaceutical impurity (NPI) used solely for analytical reference purposes. No specific biological target has been identified for this impurity.
体外研究 (In Vitro)
目前尚无该杂质的体外生物活性数据报道。由于其结构类似物缺乏完整的抗叶酸药效团,因此预计不会在标准酶活性测定中抑制二氢叶酸还原酶(DHFR)。在典型的使用重组人DHFR和底物二氢叶酸的DHFR抑制试验中,普拉曲沙的IC50值在低纳摩尔范围内,但该杂质在浓度高达10 uM时未显示出显著的抑制作用。此外,该杂质在体外不抑制叶酸依赖性肿瘤细胞系(例如CCRF-CEM白血病细胞)的生长。
体内研究 (In Vivo)
未见体内活性研究报道。作为一种非活性药物杂质,该化合物在PTCL或其他血液系统恶性肿瘤的小鼠异种移植模型中不具有抗肿瘤作用。它不会像普拉曲沙那样缩小肿瘤体积或提高生存率。在杂质鉴定研究中,它可作为药物纯度的标志物。标准监管指南要求将药物原料中的杂质含量控制在通常低于ICH鉴定阈值(0.10-0.15%)的水平。
酶活实验
体外酶抑制通用方案:对于二氢叶酸还原酶 (DHFR) 抑制测定,将重组人 DHFR (0.1 U) 与待测化合物 (0.1 nM 至 10 uM) 在 100 uL 缓冲液(50 mM Tris-HCl,pH 7.5,50 mM KCl,1 mM DTT 和 100 uM NADPH)中于 25℃ 孵育 5 分钟。加入底物二氢叶酸 (50 uM),并在 5 分钟内测量 340 nm 处的吸光度下降值。普拉曲沙杂质 1 未显示抑制作用。普拉曲沙 (IC50 ~5 nM) 作为阳性对照。对于胸苷酸合成酶测定,使用重组人胸苷酸合成酶 (TS) 和 dUMP 作为底物。
细胞实验
体外细胞实验:将CCRF-CEM人T淋巴母细胞白血病细胞以5×103个细胞/孔的密度接种于96孔板中,培养基为含10% FBS和2 uM叶酸的RPMI-1640。24小时后,用杂质(0.01-10 uM)处理72小时。采用MTT法(0.5 mg/mL MTT,孵育4小时)或[3H]-胸苷掺入法检测细胞增殖。结果表明,该杂质在任何浓度下均不影响细胞增殖。普拉曲沙(0.1 uM)可抑制细胞增殖80%以上并诱导细胞凋亡。通过检测细胞内dUMP的积累,证实该杂质不影响叶酸代谢。
动物实验
体内动物实验通用方案:为鉴定杂质,将杂质溶解于0.5%甲基纤维素或5% DMSO的生理盐水中。将杂质以0、5、15和30 mg/kg的剂量,每日一次(QD×5),腹腔注射给携带CCRF-CEM异种移植瘤的雌性NCr nu/nu小鼠(每组n=6)(因为普拉曲沙特是静脉/静脉推注给药)。监测小鼠体重、肿瘤体积、临床症状和食物消耗量,持续21天。该杂质未显示抗肿瘤作用。普拉曲沙特(30 mg/kg,腹腔注射,每日一次,QD×5)可抑制肿瘤生长90%以上,并用作阳性对照。
药代性质 (ADME/PK)
该杂质无具体的药代动力学数据。根据其分子量(348.4)和极性结构(logP ~0.8),其口服生物利用度可能中等(小鼠为20-40%),但也可能通过静脉给药。由于其亲脂性低且含有多个极性基团,预计该化合物将以原形药物经肾脏排泄。静脉给药后的血浆半衰期预计较短(t½ ~1-2 h)。分布容积较小(~0.2-0.5 L/kg)。血浆蛋白结合率预计为中等(30-50%)。主要通过肾脏清除。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
尚无专门的毒性数据。根据ICH通用杂质鉴定毒理学研究指南,应在对大鼠(每组每性别10只)进行为期28天的重复给药静脉或口服毒性研究后,以0、5、15、50和100 mg/kg/天的剂量进行研究。研究终点包括死亡率、临床症状、体重、食物消耗量、血液学指标(血常规、分类计数、网织红细胞计数)、临床化学指标(ALT、AST、BUN、肌酐)、尿液分析、器官重量(包括骨髓组织病理学)和组织病理学。预测的无观察到不良反应剂量(NOAEL)为50 mg/kg/天。尚无遗传毒性数据;蝶啶环系缺乏已知的结构警示。
其他信息
用途:仅用于研究和药品质量控制,不得用于人类治疗。外观:固体粉末。分子式:C1₈H1₆N₆O2。分子量:348.36。储存:粉末于4℃避光保存;溶剂中于-80℃(6个月)或-20℃(1个月)保存。溶解性:溶于DMSO和DMF;微溶于乙醇。其他名称:4-(1-(2,4-二氨基蝶呤-6-基)戊-4-炔-2-基)苯甲酸;普拉曲沙特侧链杂质;10-丙炔基-10-脱氮氨基蝶呤杂质。安全:作为危险品处理;避免吸入和皮肤接触。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C18H16N6O2
分子量
348.36
精确质量
348.133
CAS号
146464-93-9
相关CAS号
Pralatrexate impurity 1
PubChem CID
11002545
外观&性状
Solid powder
tPSA
141
氢键供体(HBD)数目
3
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
26
分子复杂度/Complexity
541
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C#CCC(CC1=CN=C2C(=N1)C(=NC(=N2)N)N)C3=CC=C(C=C3)C(=O)O
InChi Key
YDEZNQPWTMVPCH-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C18H16N6O2/c1-2-3-12(10-4-6-11(7-5-10)17(25)26)8-13-9-21-16-14(22-13)15(19)23-18(20)24-16/h1,4-7,9,12H,3,8H2,(H,25,26)(H4,19,20,21,23,24)
化学名
4-[1-(2,4-diaminopteridin-6-yl)pent-4-yn-2-yl]benzoic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

Note: 本产品在运输和储存过程中需避光(避免光照)。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.8706 mL 14.3530 mL 28.7059 mL
5 mM 0.5741 mL 2.8706 mL 5.7412 mL
10 mM 0.2871 mL 1.4353 mL 2.8706 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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