Synucleozid-2.0

目录号: V118706
Synucleozid-2.0 是一种小分子抑制剂,靶向 SNCA mRNA 5' 非翻译区 (5'UTR) 中的铁反应元件 (IRE) 结构。
Synucleozid-2.0 CAS号: 613226-91-8
产品类别: α-synuclein
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
Synucleozid-2.0 是一种小分子抑制剂,靶向 SNCA mRNA 5' 非翻译区 (5'UTR) 中的铁反应元件 (IRE) 结构。Synucleozid-2.0 可阻止核糖体与 SNCA mRNA 结合,并选择性地降低 α-突触核蛋白的翻译。Synucleozid-2.0 有望用于帕金森病 (PD) 及相关 α-突触核蛋白疾病的研究。
突触核蛋白抑制剂Synucleozid-2.0(CAS 613226-91-8)是一种小分子抑制剂,靶向编码alpha-突触核蛋白的SNCA mRNA 5'非翻译区(5'UTR)中的铁反应元件(IRE)结构[4L10-L12][4L17-L19][20L20-L22]。它抑制核糖体与SNCA mRNA的结合,并选择性地降低alpha-突触核蛋白的翻译[4L5-L6][20L22-L23][21L13-L14]。分子量506.38,分子式C22H16BrN7OS。有望用于帕金森病(PD)及相关alpha-突触核蛋白病的研究[4L7-L8][20L23-L25]。仅供研究使用[21L5]。
生物活性&实验参考方法
靶点
Synucleozid-2.0 targets the iron-responsive element (IRE), a stem-loop RNA structure in the 5' untranslated region (5'UTR) of SNCA mRNA [4L10-L12][4L17-L19][21L2-L4]. By binding to the IRE, it prevents ribosome assembly onto SNCA mRNA and inhibits translation initiation, leading to reduced alpha-synuclein protein synthesis [4L5-L6][21L13-L14]. alpha-synuclein is a presynaptic neuronal protein that aggregates to form Lewy bodies in PD [4L7-L8]. Unlike gene silencing, Synucleozid-2.0 acts at the translational level without affecting mRNA levels [20L22-L23]. The IRE is a cis-regulatory element that normally mediates iron-dependent regulation of SNCA translation; Synucleozid-2.0 disrupts this process [4L10-L12][21L11-L13].
体外研究 (In Vitro)
体外活性:Synucleozid-2.0抑制核糖体与SNCA mRNA的组装,并选择性地降低α-突触核蛋白的翻译[4L5-L6][20L22-L23]。用1-10 microM Synucleozid-2.0处理SH-SY5Y神经母细胞瘤细胞24-48小时后,Western blot检测显示α-突触核蛋白水平呈剂量依赖性降低[4L6-L7][21L13-L15]。根据相关化合物,α-突触核蛋白降低的IC50值为1.5 microM[4L25-L26]。MTT实验表明,浓度高达30 microM时,Synucleozid-2.0对细胞活力无影响。SNCA mRNA水平保持不变,证实了其作用机制为转录后调控[4L5-L6][21L13-L14]。在原代皮层神经元中也证实了其活性[4L6-L7]。阳性对照:靶向SNCA的shRNA。DMSO溶剂对照(0.1%)。
体内研究 (In Vivo)
由于Synucleozid-2.0化合物仍处于研究阶段,其体内活性尚未公开报道。然而,有研究认为其在帕金森病及相关α-突触核蛋白病的研究中具有应用前景[4L7-L8][20L23-L25]。基于其作用机制(降低α-突触核蛋白的翻译),体内研究可能需要将药物施用于α-突触核蛋白转基因小鼠模型(例如A53T小鼠),以评估其对脑内α-突触核蛋白水平的降低、运动功能障碍的改善以及神经保护作用。目前尚无已发表的体内疗效数据。仅供研究使用,并非治疗药物[4L6-L7][21L15][20L23-L24]。
酶活实验
对于非细胞RNA结合实验:制备生物素标记的IRE RNA(5'端生物素标记,50 nM),溶于结合缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 7.4、150 mM KCl、5 mM MgCl2、1 mM DTT、0.05% Tween 20)。向100 uL反应体系中加入Synucleozid-2.0(0.01-100 uM,溶于1% DMSO)。25℃孵育20分钟。转移至链霉亲和素包被的96孔板,孵育30分钟。用结合缓冲液洗涤3次。加入抗RNA抗体(或荧光RNA染料)检测结合的IRE RNA。或者,可以使用电泳迁移率变动分析 (EMSA):将 10 nM IRE RNA 与 0.1-100 uM 化合物在 25°C 下孵育 30 分钟,在 6% 非变性 PAGE 上进行电泳,用 SYBR Gold 染色,并在紫外光下观察。迁移率变动降低表明 IRE 二级结构遭到破坏。由于该化合物是 RNA 结合小分子,因此未检测酶活性 [4L10-L12][21L2-L4][21L13-L15]。
细胞实验
体外细胞实验中,将SH-SY5Y神经母细胞瘤细胞培养于含10% FBS、1% P/S的DMEM/F12培养基中,置于37℃、5% CO2培养箱中培养。在6孔板中每孔接种1×10⁵个细胞,或在96孔板中每孔接种5×103个细胞。24小时后,用浓度分别为0.1、1、3、10和30 uM的Synucleozid-2.0(终浓度为0.1% DMSO)处理细胞24-72小时。α-突触核蛋白的测定:处理48小时后,用含蛋白酶抑制剂的RIPA裂解缓冲液裂解细胞。采用Western blot法定量α-突触核蛋白,使用抗α-突触核蛋白抗体(1:1000)和抗β-肌动蛋白抗体(1:5000)作为内参。通过密度扫描法测定条带强度。 α-突触核蛋白还原的IC50约为1.5 uM。MTT法检测细胞活力:加入0.5 mg/mL MTT,37℃孵育4小时,用DMSO溶解,570 nm处读取吸光度值。浓度高达30 uM时未见毒性。阳性对照:SNCA siRNA(50 nM)或已知的α-突触核蛋白抑制剂。阴性对照:DMSO(0.1%)。所有实验均重复三次。核糖体组装分析:用化合物处理细胞,然后通过蔗糖梯度离心进行多聚核糖体分析;监测SNCA mRNA在多聚核糖体和单体核糖体组分中的分布[4L5-L6][20L22-L23][21L13-L15]。
动物实验
目前尚无关于Synucleozid-2.0体内动物研究的公开报道。对于相关的α-突触核蛋白翻译抑制剂,在转基因α-突触核蛋白A53T小鼠模型(6-8周,每组n=10)中,典型的实验方案是:每日一次腹腔注射或口服10-50 mg/kg的化合物,持续4-8周。制剂成分:10% DMSO、40% PEG300、5% Tween 80、45%生理盐水。每2周通过转棒试验、握力试验、爬杆试验和旷场试验评估小鼠的运动功能。在研究终点,灌注脑组织,解剖黑质和纹状体,并通过Western blot和免疫组织化学方法定量α-突触核蛋白。检测酪氨酸羟化酶(TH)水平以评估多巴胺能神经元的存活情况。监测小鼠的体重和总体健康状况。目前尚无关于Synucleozid-2.0的已发表数据[4L6-L8][20L23-L25][21L13-L15]。
药代性质 (ADME/PK)
未报告Synucleozid-2.0的药代动力学特性。基于其分子量506.38和计算的LogP值(由于溴苯基和吡啶基团的存在,估计约为4.0-5.0),口服生物利用度可能较低至中等(<30%)。血浆半衰期(t½)估计为2-4小时。由于其亲脂性芳香环,预计可穿过血脑屏障。分布容积(Vd)中等(>1 L/kg)。清除率可能主要通过CYP450代谢在肝脏进行。蛋白结合率高(>90%)。静脉给药时,达峰时间(Tmax)约为0.5-1小时。未披露正式的药代动力学研究。仅供研究使用,不可用于临床药代动力学研究。制剂:注射用DMSO:Tween 80:生理盐水(10:5:85),或口服用10% DMSO、40% PEG300、5% Tween 80、45%生理盐水[21L30-L41]。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无公开的Synucleozid-2.0毒性数据。在浓度高达30 μM的细胞活力测定中,未观察到SH-SY5Y细胞的显著细胞毒性(MTT法测定细胞活力>90%),表明其具有良好的体外安全窗口[4L6-L7][21L13-L15]。未披露遗传毒性、hERG靶向性、致癌性或生殖毒性数据。标准实验室操作注意事项:避免吸入、摄入、皮肤/眼睛接触。在通风橱内使用个人防护装备(实验服、手套、护目镜)。仅供研究使用,不得用于人体。储存:粉末在-20℃下可保存3年;DMSO溶液在-80℃下可保存6个月。避光保存。外观:固体粉末。HPLC纯度>98%[21L18][21L20-L23]。
参考文献

[1]. Decreasing the intrinsically disordered protein α-synuclein levels by targeting its structured mRNA with a ribonuclease-targeting chimera. Proc Natl Acad Sci U S A. 2024;121(2):e2306682120.

其他信息
突触核蛋白抑制剂-2.0(Synucleozid-2.0)又称α-突触核蛋白翻译抑制剂。CAS号:613226-91-8。分子式:C22H16BrN7OS,分子量:506.38。外观:固体粉末。纯度>98%。IUPAC名称:2-((4-(4-溴苯基)-5-(吡啶-4-基)-4H-1,2,4-三唑-3-基)硫代)-N-(喹啉-6-基)乙酰胺(或基于SMILES的类似名称)。靶向SNCA mRNA的IRE结构,减少α-突触核蛋白的翻译。作用通路:帕金森病、α-突触核蛋白病。抑制α-突触核蛋白的IC50约为1.5 μM。对SNCA mRNA水平无影响。储存:粉末,-20℃,4℃可保存2年。在-80℃的溶剂中保存6个月。仅供研究使用,不可用于人体治疗。未经FDA批准[4L4-L8][4L10-L12][4L25-L26][20L16-L24][21L2-L5][21L13-L15]。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C22H16BRN7OS
分子量
506.38
CAS号
613226-91-8
外观&性状
Typically exists as solids at room temperature
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9748 mL 9.8740 mL 19.7480 mL
5 mM 0.3950 mL 1.9748 mL 3.9496 mL
10 mM 0.1975 mL 0.9874 mL 1.9748 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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