(1S,2R)-Bedaquiline

别名: Bedaquiline Impurity 16 (Standard); (1S,2R)-1-(6-bromo-2-methoxyquinoline-3-yl)-4-(dimethylamino)-2-(naphth-1-yl)-1- (Standard)
目录号: V120990
(1S,2R)-Bedaquiline CAS号: 857086-93-2
产品类别: Reference Standards
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产品描述
(1S,2R)-贝达喹啉(CAS 857086-93-2)是一种化学化合物,分子式为C32H31BrN2O2,分子量为555.51 g/mol。它是贝达喹啉的单一对映异构体,具体而言是(1S,2R)立体异构体,也称为(1S,2R)-TMC207或(1S,2R)-R207910。贝达喹啉是一种二芳基喹啉类抗分枝杆菌药物,用于治疗耐多药结核病(MDR-TB)。该特定异构体是合成多种活性化合物(包括活性药物成分富马酸贝达喹啉)的药物中间体。它还可用作贝达喹啉制剂质量控制的杂质参考标准。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary target of (1S,2R)-bedaquiline is the mycobacterial ATP synthase, specifically subunit c (AtpE) of the F0F1-ATP synthase complex. Bedaquiline inhibits ATP synthase by binding to the oligomeric c-ring of the F0 domain, thereby disrupting ATP synthesis in Mycobacterium tuberculosis. This unique mechanism of action is distinct from other anti-tuberculosis drugs. The stereochemistry is critical for activity, with the (1S,2R) isomer being the active enantiomer and the (1R,2S) isomer being significantly less active.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,贝达喹啉(该异构体来源于其外消旋体)对结核分枝杆菌具有强效的抗分枝杆菌活性,包括耐多药(MDR)和广泛耐药(XDR)菌株。其90%菌株的最低抑菌浓度(MIC₉0)范围为0.015至0.12 microg/mL。该化合物具有独特的作用机制,且与现有抗结核药物无交叉耐药性。贝达喹啉对复制型和非复制型结核分枝杆菌均表现出杀菌活性。(1S,2R)异构体是其抗分枝杆菌活性的主要贡献者。
体内研究 (In Vivo)
在体内,贝达喹啉已在结核病动物模型中显示出疗效。在慢性结核病感染的小鼠模型中,口服贝达喹啉(25-50 mg/kg)4-8周可显著降低肺部和脾脏的细菌载量,与未治疗的对照组相比差异显著。贝达喹啉与其他抗结核药物(例如异烟肼、利福平、吡嗪酰胺)联合使用时,显示出协同或叠加作用。贝达喹啉是人类耐多药结核病治疗方案的基石,可显著改善治疗效果并降低死亡率。
酶活实验
针对此类化合物的非细胞生化分析以分枝杆菌ATP合酶为靶点。标准方案使用由表达结核分枝杆菌F0F1-ATP合酶的耻垢分枝杆菌制备的反向膜囊泡。ATP水解活性通过偶联酶法测定:将囊泡(20-50 ug蛋白)与不同浓度的测试化合物(1 nM至10 uM)在测定缓冲液(50 mM MOPS,5 mM MgCl2,pH 7.5)中于37℃孵育。加入2 mM ATP启动反应,并在340 nm处监测NADH氧化10-20分钟。或者,也可以通过基于荧光素酶的测定法测定ATP合成活性。IC₅0值由剂量反应曲线计算得出。
细胞实验
贝达喹啉的细胞实验采用结核分枝杆菌菌株(例如H37Rv),在添加了OADC增菌剂和0.05% Tween 80的Middlebrook 7H9肉汤中培养。根据CLSI指南,采用标准肉汤微量稀释法:将培养物培养至对数生长期中期,并稀释至约5 × 10⁵ CFU/mL。在96孔板中制备一系列倍比稀释的测试化合物(0.001-1 ug/mL)。在37℃、5% CO2条件下培养7-14天后,将抑制可见细菌生长的最低浓度确定为最小抑菌浓度(MIC)。对于时间-杀菌动力学研究,在不同时间点(0、1、3、5、7、10、14天)将样品接种于7H10琼脂平板上,以确定菌落形成单位(CFU)的减少情况。
动物实验
贝达喹啉的体内动物实验在结核病小鼠模型中进行。BALB/c小鼠(6-8周龄)的标准实验方案包括气溶胶感染结核分枝杆菌H37Rv(约100 CFU/肺)。感染后2-4周(肺部菌群达到稳定期)开始,每日一次口服贝达喹啉,剂量为12.5-50 mg/kg,持续4-8周。对照组接受赋形剂或标准抗结核药物(异烟肼25 mg/kg + 利福平10 mg/kg)。实验终点包括处死时肺和脾脏的菌落形成单位(CFU)计数、肺组织病理学评分(苏木精-伊红染色和抗酸染色)、存活率和体重变化。此外,还进行了药物联合研究以评估协同作用。
药代性质 (ADME/PK)
(1S,2R)异构体的药代动力学数据来源于外消旋贝达喹啉,后者是临床批准的药物。贝达喹啉在人体内末端消除半衰期较长,约为5.5个月,这是由于其从组织隔室缓慢释放所致。口服给药后,血浆药物浓度达峰时间(Tmax)约为4-6小时。食物可使贝达喹啉的口服生物利用度提高约2倍。贝达喹啉的蛋白结合率很高(>99.9%),主要与白蛋白和α1-酸性糖蛋白结合。它经CYP3A4代谢为N-单去甲基代谢物,该代谢物也具有抗结核活性。该异构体通常以粉末形式储存在-20℃,避光防潮。溶解性:可溶于DMSO(2-5 mg/mL)和有机溶剂,但难溶于水。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
(1S,2R)-贝达喹啉的毒性特征源自其外消旋体药物。贝达喹啉在动物研究和人体试验中均表现出剂量依赖性肝毒性,其中转氨酶升高是最常见的不良反应。临床试验中,最常报告的不良反应包括恶心、关节痛、头痛和淀粉酶升高。心脏毒性,特别是QTc间期延长(剂量依赖性,平均延长约15-20毫秒),是一种值得注意的不良反应,需要进行心电图监测。约2-4%的患者会出现肝毒性(3级或4级ALT升高)。贝达喹啉在临床试验中带有黑框警告,提示其会增加死亡率。作为一种研究用化学品,应采取标准安全预防措施:在通风橱内操作,并佩戴适当的个人防护装备。
其他信息
补充信息:该化合物的IUPAC名称为(1S,2R)-1-(6-溴-2-甲氧基喹啉-3-基)-4-(二甲氨基)-2-(萘-1-基)-1-苯基丁-2-醇。它是一种白色至类白色固体,纯度≥98%,由商业供应商提供。同义词包括(1S,2R)-TMC207和(1S,2R)-R207910。该化合物仅供研究和分析用途,不得用于人类或兽医用途。它可从化学品供应商处购买,作为药物中间体和用于药物质量控制的杂质参考标准品。如需进一步研究,用户可参考分析证书以获取特定批次的纯度数据。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C32H31BRN2O2
分子量
555.50
CAS号
857086-93-2
外观&性状
Typically exists as solids at room temperature
别名
Bedaquiline Impurity 16 (Standard); (1S,2R)-1-(6-bromo-2-methoxyquinoline-3-yl)-4-(dimethylamino)-2-(naphth-1-yl)-1- (Standard)
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.8002 mL 9.0009 mL 18.0018 mL
5 mM 0.3600 mL 1.8002 mL 3.6004 mL
10 mM 0.1800 mL 0.9001 mL 1.8002 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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