Deoxyribonucleic acid sodium salt

别名: Deoxyribonucleic acid sodium salt from salmon testes 鲑鱼精DNA;脱氧核糖核酸钠盐(鲑鱼睾丸);DNA(SALMON SPERM ) 鲑鱼精DNA;鲑鱼精DNA SMDNA;DNA钠盐(鲑鱼睾丸)/脱氧核糖核酸钠(鲑鱼睾丸);DNA钠盐鲑鱼精/鲑鱼精DNA
目录号: V56819 纯度: A260 units/mg solid > 15
来自鲑鱼睾丸的氧核糖核酸钠盐
Deoxyribonucleic acid sodium salt CAS号: 438545-06-3
产品类别: Natural Products
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
250mg
500mg
1g
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产品描述
鲑鱼精子脱氧核糖核酸 (SS-DNA) 可用于研究 DNA 与结合剂、插入剂、修饰剂、检测剂和增稠剂之间的物理化学相互作用。鲑鱼精子 DNA 已被用于研究磁性介孔二氧化硅纳米粒子 (M-MSN) 的负载能力和聚合物纳米层结构的结合能力。SS-DNA 可作为开发 DNA 检测方法的基质。
脱氧核糖核酸钠盐(CAS#: 438545-06-3),俗称 DNA 钠盐或鲑鱼精子 DNA (SS-DNA),是一种含有遗传信息的长双螺旋分子。它通常提取自鲑鱼精子,并以钠盐形式存在。DNA 钠盐广泛应用于分子生物学研究,用作 Northern 印迹、Southern 印迹和原位杂交实验中的封闭剂,以及用于研究 DNA 与各种结合剂、插入剂、修饰剂、检测剂和增稠剂之间的物理化学相互作用。
生物活性&实验参考方法
靶点
Deoxyribonucleic acid sodium salt does not have a specific pharmacological target in the traditional sense of drug-receptor interactions. As a nucleic acid polymer, it serves as a substrate for various DNA-binding proteins and enzymes, including DNA polymerases, restriction endonucleases, DNA ligases, and transcription factors. In research applications, it is used to study protein-DNA interactions, DNA repair mechanisms, and the effects of DNA-binding compounds. It is also used as a carrier or blocking agent in hybridization assays to reduce non-specific binding.
体外研究 (In Vitro)
在体外,DNA钠盐可用作底物,研究DNA与各种分子(包括嵌入剂、沟槽结合剂、修饰剂、检测剂和增稠剂)之间的物理化学相互作用。它可作为研究DNA结构、稳定性和配体结合后构象变化的模型系统。此外,它还用于凝胶阻滞实验以研究蛋白质-DNA相互作用,以及用于核酸酶保护实验以评估DNA结合蛋白的特异性。DNA钠盐还可用作结合研究中的竞争性抑制剂,以评估DNA靶向化合物的特异性。
体内研究 (In Vivo)
DNA钠盐本身并不具有直接的体内药理活性,不可用于治疗。然而,它被广泛应用于各种研究领域,例如作为核酸递送载体、某些疫苗制剂中的免疫刺激剂以及基于DNA的生物传感器的组成部分。在动物模型中,可以施用DNA钠盐来研究其对免疫系统的影响或评估DNA结合药物的药代动力学。其主要的体内应用领域是研究而非治疗。
酶活实验
用于DNA钠盐的体外酶/受体结合实验通常涉及研究DNA与DNA结合蛋白或小分子之间的相互作用。对于蛋白质-DNA结合研究,常用的方法是电泳迁移率变动分析(EMSA),即将DNA钠盐与目标蛋白孵育,然后将生成的复合物在非变性聚丙烯酰胺凝胶上进行分离。对于小分子-DNA相互作用,则采用紫外-可见吸收光谱、荧光光谱、圆二色谱和等温滴定量热法(ITC)等技术来测定结合亲和力和相互作用模式。
细胞实验
体外细胞DNA钠盐检测方法包括培养细胞并用DNA钠盐处理,以评估其对细胞过程的影响。DNA钠盐可用作转染载体或模型底物,用于研究DNA的摄取和细胞内转运。在细胞检测中,DNA钠盐可与荧光染料标记,以观察细胞摄取和定位。它还可用于细胞增殖或活力检测,以评估DNA结合化合物的细胞毒性。通常采用标准细胞培养方案和合适的细胞系(例如HEK293、HeLa)。
动物实验
涉及DNA钠盐的体内动物研究通常侧重于将其用作研究工具而非治疗剂。在疫苗研究中,DNA钠盐可用作佐剂或载体。在DNA结合药物的药代动力学研究中,DNA钠盐可用于评估体内药物-DNA结合情况。研究人员通过各种途径(口服、静脉注射、腹腔注射)以特定剂量向动物施用DNA钠盐,并采集样本以分析DNA的分布、代谢和清除情况。具体的实验方案取决于具体的研究应用。
药代性质 (ADME/PK)
DNA钠盐的药代动力学特性取决于其分子量、制剂和给药途径。作为一种高分子量聚合物,口服DNA钠盐后,其在胃肠道的吸收并不显著。静脉注射后,它能迅速被肝脏和脾脏清除。在血液和组织中,它会被核酸酶降解为寡核苷酸和核苷酸,这些寡核苷酸和核苷酸进一步代谢为尿酸,并最终随尿液排出体外。完整DNA在循环中的半衰期通常很短(几分钟到几小时)。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
DNA钠盐的毒性通常较低,因为它是一种天然存在的生物聚合物。当以高剂量或通过特定途径给药时,它可能引发免疫反应,包括细胞因子释放和通过Toll样受体9 (TLR9)识别未甲基化的CpG基序来激活先天免疫系统。在细胞培养中,DNA钠盐在用于杂交和结合研究的浓度下通常无毒。标准的毒理学评估将包括免疫原性、致热性和核酸诱导炎症的可能性评估。
其他信息
脱氧核糖核酸钠盐是一种研究级试剂,未获准用于治疗用途。它通常提取自鲑鱼精子,并有多种纯度等级可供选择。其应用包括:用作杂交实验(Northern印迹、Southern印迹、原位杂交)中的封闭剂;用作研究DNA-配体相互作用的底物;用作核酸递送载体;以及用作DNA定量分析的标准品。它是分子生物学、生物化学和生物物理学研究中的重要工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
CAS号
438545-06-3
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
来源
Deoxyribonucleic acid sodium salt from salmon testes
别名
Deoxyribonucleic acid sodium salt from salmon testes
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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