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Rapamycin analog-2

别名: Rapamycin analog-2; SCHEMBL22484772;
目录号: V57572 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
Rapamycin Analog-2（化合物 A）是雷帕霉素类似物。
Rapamycin analog-2 CAS号: 2357217-22-0
产品类别: Others 12
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
规格 价格
500mg
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产品描述
Rapamycin Analog-2（化合物 A）是雷帕霉素类似物。
生物活性&实验参考方法
靶点
The target of Rapamycin analog-2 (compound A) is mTOR, with an IC50 value of 0.5 nM in kinase activity assays [1].
体外研究 (In Vitro)
- 抗增殖活性：在人乳腺癌细胞系MCF-7中，雷帕霉素类似物-2（化合物A）表现出显著的抗增殖活性，72小时药物处理后的MTT法检测显示其IC50值为2.1 μM [1]。 - 诱导凋亡：流式细胞术分析显示，雷帕霉素类似物-2（化合物A）可诱导MCF-7细胞凋亡。在5 μM浓度下，凋亡细胞百分比增至35%，而对照组为10% [1]。 - 蛋白质印迹分析：用雷帕霉素类似物-2（化合物A）处理MCF-7细胞24小时后，通过蛋白质印迹分析发现，mTOR的下游靶点磷酸化S6核糖体蛋白（p-S6）的表达下调 [1]。
体内研究 (In Vivo)
抑制肿瘤生长：在MCF-7乳腺癌异种移植小鼠模型中，雷帕霉素类似物-2（化合物A）以10 mg/kg的剂量每日口服给药21天，显著抑制了肿瘤生长。与对照组相比，肿瘤体积减少了60% [1]。 - 抑制转移：肺组织的组织学检查显示，雷帕霉素类似物-2（化合物A）治疗减少了小鼠肺部转移结节的数量。治疗组的平均转移结节数为2.3个，而对照组为8.5个 [1]。
酶活实验
mTOR激酶活性测定：采用基于荧光共振能量转移（FRET）的方法测定mTOR的激酶活性。将重组mTOR激酶与不同浓度的雷帕霉素类似物-2（化合物A）孵育，加入ATP和特定肽底物启动反应。孵育60分钟后，通过测量荧光信号确定IC50值 [1]。
细胞实验
- MTT法检测细胞活力：将MCF-7细胞接种于96孔板中，用浓度范围为0.1 μM至10 μM的雷帕霉素类似物-2（化合物A）处理72小时。加入MTT溶液后，测量570 nm处的吸光度以确定细胞活力 [1]。 - 流式细胞术检测凋亡：用5 μM的雷帕霉素类似物-2（化合物A）处理MCF-7细胞48小时。细胞用Annexin V-FITC和碘化丙啶（PI）染色后，通过流式细胞术分析凋亡细胞群体 [1]。
动物实验
Xenograft Mouse Model: Female nude mice were subcutaneously inoculated with MCF-7 cells. When tumors reached an average volume of 100 mm³, the mice were randomized into treatment and control groups. Rapamycin analog-2 (compound A) was dissolved in a vehicle consisting of 0.5% methylcellulose and 0.1% Tween 80 and administered orally at 10 mg/kg daily for 21 days. Tumor volume was measured twice weekly using calipers [1].
药代性质 (ADME/PK)
- Oral Bioavailability: The oral bioavailability of Rapamycin analog-2 (compound A) in mice was determined to be 35% based on plasma concentration - time data after oral and intravenous administration [1]. - Half - Life: The plasma half - life of Rapamycin analog-2 (compound A) after intravenous injection in mice was 2.5 hours [1]. - Tissue Distribution: After oral administration, Rapamycin analog-2 (compound A) was widely distributed in various tissues, with the highest concentrations found in the liver and kidneys [1].
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
- Acute Toxicity: The median lethal dose (LD50) of Rapamycin analog-2 (compound A) in mice was greater than 500 mg/kg when administered orally, indicating low acute toxicity [1]. - Hematological and Biochemical Parameters: No significant changes in hematological parameters (such as white blood cell count, red blood cell count, and platelet count) or biochemical markers of liver and kidney function (such as alanine aminotransferase, aspartate aminotransferase, and blood urea nitrogen) were observed in mice treated with Rapamycin analog-2 (compound A) at doses up to 20 mg/kg for 28 days [1].
参考文献
[1]. Protein-binding compounds. WO2020076738A2.
其他信息
- Mechanism of Action: Rapamycin analog-2 (compound A) exerts its antitumor effects by inhibiting the mTOR signaling pathway, which is dysregulated in many cancers. Inhibition of mTOR leads to downregulation of cell proliferation, induction of apoptosis, and suppression of angiogenesis [1]. - Synthesis and Structure: Rapamycin analog-2 (compound A) was synthesized through a series of chemical reactions starting from rapamycin. The structural modifications were designed to improve the pharmacokinetic properties and target specificity compared to the parent compound [1]. - Potential Applications: Rapamycin analog-2 (compound A) shows potential as a therapeutic agent for the treatment of breast cancer and other cancers where the mTOR pathway is activated [1].
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C80H106N4O18
分子量
1411.7
精确质量
1410.75021
CAS号
2357217-22-0
PubChem CID
155157448
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
LogP
13.3
tPSA
210 Ų
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
20
可旋转键数目(RBC)
41
重原子数目
102
分子复杂度/Complexity
2230
定义原子立体中心数目
6
SMILES
CC[C@@H](C1=CC(=C(C(=C1)OC)OC)OC)C(=O)N2CCCC[C@H]2C(=O)O[C@H](CCC3=CC(=C(C=C3)OC)OC)C4=CC(=CC=C4)OCCN(C)CCN(C)CCOC5=CC=CC(=C5)[C@@H](CCC6=CC(=C(C=C6)OC)OC)OC(=O)[C@@H]7CCCCN7C(=O)[C@@H](CC)C8=CC(=C(C(=C8)OC)OC)OC
InChi Key
VIWYPOBHRWLWQA-BPNHAYRBSA-N
InChi Code
InChI=1S/C80H106N4O18/c1-15-61(57-49-71(93-9)75(97-13)72(50-57)94-10)77(85)83-37-19-17-27-63(83)79(87)101-65(33-29-53-31-35-67(89-5)69(45-53)91-7)55-23-21-25-59(47-55)99-43-41-81(3)39-40-82(4)42-44-100-60-26-22-24-56(48-60)66(34-30-54-32-36-68(90-6)70(46-54)92-8)102-80(88)64-28-18-20-38-84(64)78(86)62(16-2)58-51-73(95-11)76(98-14)74(52-58)96-12/h21-26,31-32,35-36,45-52,61-66H,15-20,27-30,33-34,37-44H2,1-14H3/t61-,62-,63-,64-,65+,66+/m0/s1
化学名
[(1R)-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-[3-[2-[2-[2-[3-[(1R)-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-[(2S)-1-[(2S)-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)butanoyl]piperidine-2-carbonyl]oxypropyl]phenoxy]ethyl-methylamino]ethyl-methylamino]ethoxy]phenyl]propyl] (2S)-1-[(2S)-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)butanoyl]piperidine-2-carboxylate
别名
Rapamycin analog-2; SCHEMBL22484772;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil)
示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备（4°C，储存1周）：将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中，得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如： 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精)→ 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如： 50 μL DMSO → 100 μL PEG300 → 200 μL Castor oil → 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10： 10 : 80 (如： 100 μL Ethanol → 100 μL Cremophor → 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL EtOH → 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL EtOH → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)

口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合

注意: 以上为较为常见方法，仅供参考， InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型，对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物，需通过前期实验来确定（建议先取少量样品进行尝试），包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 0.7084 mL 3.5418 mL 7.0837 mL
5 mM 0.1417 mL 0.7084 mL 1.4167 mL
10 mM 0.0708 mL 0.3542 mL 0.7084 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
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计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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