Histone H1-derived Peptide

别名: 组蛋白H1衍生肽
目录号: V60711 纯度: ≥98%
组蛋白H1衍生肽是一种磷酸肽,肽底物含有CDK最佳识别基序的序列。
Histone H1-derived Peptide CAS号: 889112-06-5
产品类别: Peptides | 多肽
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
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产品描述
组蛋白 H1 衍生肽是一种磷酸肽,该肽底物含有 CDK 最佳识别基序的序列。
组蛋白H1衍生肽(CAS号:889112-06-5)是一种合成磷酸肽,其结构仿照组蛋白H1连接区序列。该肽包含与细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)最佳识别基序(特别是CDK1-细胞周期蛋白B1)相匹配的序列。该肽是体外激酶活性测定的重要工具,可用于研究CDK活性、底物特异性和磷酸化依赖性信号通路。由于其与天然组蛋白序列的相似性,该肽也被用于蛋白质-DNA相互作用、染色质重塑和表观遗传调控的研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary target of Histone H1-derived Peptide is cyclin-dependent kinase 1 (CDK1) in complex with cyclin B1, as the peptide contains the optimal recognition motif for this enzyme. It is designed as a substrate for CDK1-cyclin B1, enabling detection of its kinase activity. Additionally, the peptide interacts with Pin1 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase) as a phosphorylated substrate, allowing studies of Pin1 binding characteristics and phosphorylation-dependent protein interactions relevant to cell cycle regulation.
体外研究 (In Vitro)
在体外,组蛋白H1衍生肽可作为CDK1-细胞周期蛋白B1的直接底物,发生磷酸化,磷酸化程度可通过定量分析来测定酶活性。它可作为磷酸肽底物,用于研究细胞周期中CDK的活性、底物特异性和磷酸化动力学。该肽还可用于结合实验,以研究其与Pin1的相互作用,从而为分析磷酸化如何影响细胞增殖中的蛋白质-蛋白质相互作用和下游信号级联反应提供了一个模型系统。
体内研究 (In Vivo)
由于组蛋白H1衍生肽的设计初衷是作为体外研究工具而非治疗药物,因此通常不进行体内研究。相反,其应用主要集中于离体分析细胞裂解液或组织提取物中的CDK活性。研究人员利用该肽检测和定量体内实验样本中的CDK1-细胞周期蛋白B1活性,从而在不向活体动物施用肽的情况下,将激酶活性与动物模型或疾病状态下的细胞周期进程联系起来。
酶活实验
激酶活性测定方案:反应混合物包含重组或免疫沉淀的 CDK1-cyclin B1、组蛋白 H1 衍生肽底物(通常为 50-200 uM)、ATP(包括 [γ-32P]ATP 或使用非放射性检测)和激酶缓冲液,于 30℃ 孵育 15-30 分钟。反应通过加入 SDS 上样缓冲液或点样至磷酸纤维素滤纸上终止。磷酸盐掺入肽的量可通过闪烁计数、磷酸化特异性抗体检测或质谱法测定。
细胞实验
基于细胞的实验方案:将细胞(例如,同步化的HeLa细胞或其他增殖细胞系)在含有蛋白酶和磷酸酶抑制剂的RIPA缓冲液中裂解。将细胞裂解液的蛋白浓度标准化,并用于如上所述的组蛋白H1衍生肽的体外激酶活性测定。或者,也可以将该肽固定在琼脂糖珠上,用于下拉实验,以捕获细胞裂解液中的相互作用蛋白,然后进行Western blot分析以鉴定CDK1或其他结合蛋白。
动物实验
由于该肽段是一种体外底物而非候选药物,因此利用该肽段进行体内药代动力学和药效学研究并不常见。在研究环境中,该肽段可用于体内药物治疗后的离体激酶活性测定。例如,对接受 CDK 抑制剂治疗的动物,收集并裂解其肿瘤组织,然后将裂解液与组蛋白 H1 衍生肽段孵育,以评估残余 CDK1 活性和治疗效果。
药代性质 (ADME/PK)
不适用——组蛋白H1衍生肽是一种用于体外生化分析的研究试剂,并非治疗性化合物。因此,其在生物体内的药代动力学特性,例如吸收、分布、代谢和排泄,尚未得到表征。该肽不适用于体内给药,其在生物基质中的稳定性仅在细胞裂解液或酶活性测定的反应缓冲液中具有意义。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于组蛋白H1衍生肽是一种研究级肽,仅用于体外生化和细胞实验,因此未对其进行毒性研究。该肽未用于动物或人体治疗,也缺乏全身毒性数据。鉴于缺乏全面的毒理学评估,建议采取标准的实验室安全预防措施来处理合成肽(避免吸入、皮肤接触和摄入)。
参考文献
[1]. Roderick G Walker, et al. High throughput screens yield small molecule inhibitors of Leishmania CRK3:CYC6 cyclin-dependent kinase. PLoS Negl Trop Dis. 2011 Apr 5;5(4):e1033.
其他信息
组蛋白H1衍生肽并非药物,也未获准用于临床。它是一种用于生物医学研究的化学工具,专门用于研究细胞周期调控中CDK1-细胞周期蛋白B1的活性。该肽包含CDK的最佳识别基序,广泛用于激酶活性测定,以筛选抑制剂、表征酶动力学并研究磷酸化依赖性信号通路。本品以冻干粉末形式提供,需用水性缓冲液复溶。不适用于治疗用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C56H101N17O15
精确质量
1251.766
CAS号
889112-06-5
PubChem CID
163332302
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
-6.9
tPSA
519
氢键供体(HBD)数目
17
氢键受体(HBA)数目
20
可旋转键数目(RBC)
42
重原子数目
88
分子复杂度/Complexity
2330
定义原子立体中心数目
11
SMILES
C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]2CCCN2C(=O)CNC(=O)CNC(=O)CN)O
InChi Key
MLODEUSVVAOABW-PNNPTOSWSA-N
InChi Code
InChI=1S/C56H101N17O15/c1-32(2)28-40(56(87)88)70-52(83)38(18-8-12-24-59)68-50(81)37(17-7-11-23-58)66-47(78)33(3)64-49(80)36(16-6-10-22-57)67-51(82)39(19-9-13-25-60)69-54(85)42-21-15-27-73(42)55(86)46(35(5)74)71-48(79)34(4)65-53(84)41-20-14-26-72(41)45(77)31-63-44(76)30-62-43(75)29-61/h32-42,46,74H,6-31,57-61H2,1-5H3,(H,62,75)(H,63,76)(H,64,80)(H,65,84)(H,66,78)(H,67,82)(H,68,81)(H,69,85)(H,70,83)(H,71,79)(H,87,88)/t33-,34-,35+,36-,37-,38-,39-,40-,41-,42-,46-/m0/s1
化学名
(2S)-2-[[(2S)-6-amino-2-[[(2S)-6-amino-2-[[(2S)-2-[[(2S)-6-amino-2-[[(2S)-6-amino-2-[[(2S)-1-[(2S,3R)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-1-[2-[[2-[(2-aminoacetyl)amino]acetyl]amino]acetyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]propanoyl]amino]-3-hydroxybutanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]hexanoyl]amino]hexanoyl]amino]propanoyl]amino]hexanoyl]amino]hexanoyl]amino]-4-methylpentanoic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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