cis-Ned19

别名: cis-Ned-19
目录号: V61342 纯度: ≥98%
cis-Ned19 是一种化学探针。
cis-Ned19 CAS号: 1137264-00-6
产品类别: Others 12
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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5mg
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产品描述
cis-Ned19 是一种化学探针。cis-Ned19 可阻断 NAADP 信号通路,并对细胞中的 NAADP 受体进行荧光标记。
cis-Ned19(CAS# 1137264-00-6)是一种细胞渗透性荧光化学探针,可作为烟酸腺嘌呤二核苷酸磷酸 (NAADP) 信号通路的选择性非竞争性拮抗剂。NAADP 被认为是包括淋巴细胞在内的多种真核细胞类型中最有效的钙动员第二信使之一。cis-Ned19 是通过虚拟筛选策略发现的,现已成为研究 NAADP 介导的钙从酸性细胞内储存库(如溶酶体和内溶酶体)释放的重要工具。该化合物的显著特点在于它不仅能够阻断 NAADP 信号通路,还能直接对细胞中的 NAADP 受体进行荧光标记。这种双重功能使研究人员既能抑制又能可视化NAADP受体,使其成为研究NAADP在各种生理和病理过程中作用的有力探针。顺式-Ned19的开发是一项重大进展,因为它提供了一种特异性的药理学工具来解析NAADP的功能,而此前由于缺乏选择性抑制剂,解析NAADP的功能一直是一项挑战。它的发现使得众多研究得以开展,这些研究探索了NAADP在钙信号传导、自噬和溶酶体功能中的作用。该化合物以其特异性而著称,因为它不会影响其他钙反应,例如凝血酶信号通路,而凝血酶信号通路至少部分受胞内钙库操纵性内流(SOCE)的调控。总而言之,顺式-Ned19是NAADP研究领域的重要化学探针,有助于探索这一独特的钙信号通路在健康和疾病中的作用。
生物活性&实验参考方法
靶点
cis-Ned19 primarily targets the NAADP receptor, which has been identified as the two-pore channels (TPCs) located on the membranes of acidic organelles, specifically lysosomes and endolysosomal vesicles. It acts as a specific antagonist of the NAADP-mediated calcium signaling pathway. The compound's mechanism involves the inhibition of calcium release from these acidic stores by acting on the TPC complex. Studies indicate that Ned-19 has two binding sites on the NAADP receptor, suggesting a complex mode of interaction. The compound competes with NAADP for binding to its receptor, as demonstrated by its ability to displace [32P]NAADP in binding assays. This competitive binding effectively blocks NAADP from triggering calcium release, thereby antagonizing the downstream signaling events. Furthermore, cis-Ned19's primary mechanism involves binding to the NAADP receptor and preventing NAADP-induced calcium release from acidic organelles. Its specificity for the NAADP pathway is highlighted by its inability to inhibit calcium release mediated by other second messengers such as inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) and cyclic ADP-ribose (cADPR), as shown in concentration-inhibition curves. This selectivity makes it a valuable tool for specifically studying NAADP-dependent calcium mobilization without interfering with other major calcium signaling pathways.
体外研究 (In Vitro)
在基于细胞的实验中,顺式-Ned19用于阻断NAADP介导的钙信号传导。其活性通常通过测量其抑制不同细胞类型中NAADP诱导的钙释放的能力来评估。例如,它能拮抗小鼠胰岛β细胞中NAADP介导的钙离子峰值。在原代记忆CD4+ T细胞中,Ned-19已被证实能够抑制T细胞受体(TCR)介导的钙离子内流及其下游效应功能,例如增殖和细胞因子产生。该研究揭示,细胞外和细胞内钙库(包括内质网和溶酶体样酸性钙库)均参与TCR介导的钙离子内流,而Ned-19能够有效抑制这一过程。此外,顺式-Ned19能够荧光标记NAADP受体,其激发波长和发射波长最大值分别约为365 nm和410 nm。这种荧光特性使研究人员能够可视化受体的定位,并有可能追踪其在活细胞中的动态变化。该化合物已通过虚拟筛选被鉴定为一种用于研究NAADP依赖性钙动员通路的选择性化学探针。它能够抑制多种细胞类型(包括免疫细胞和神经元)中的NAADP信号传导,这凸显了其作为研究NAADP在各种细胞功能中作用的广谱工具的实用性。
体内研究 (In Vivo)
已发表的文献中关于顺式-Ned19体内活性的数据相对有限,因为其主要应用是在细胞系统中作为化学探针。然而,一些研究已探索了其在动物模型中的作用。例如,有报道称Ned-19能显著抑制小鼠的肿瘤生长、血管生成和肺转移,表明NAADP信号通路在癌症进展中可能发挥作用。此外,在抗CD3小鼠模型中抑制NAADP可改善疾病进程,提示NAADP信号通路可能参与炎症或免疫反应。这些发现凸显了靶向NAADP通路的治疗潜力。尽管这些结果令人鼓舞,但关于顺式-Ned19的系统性和详细体内疗效研究尚未得到充分记录,需要进一步研究以全面了解其在生物体内的药代动力学和药效学。然而,该化合物作为研究工具的实用性仍然是其应用的核心,为深入了解NAADP信号通路的生物学意义提供了重要线索。
酶活实验
用于检测顺式-Ned19的非细胞受体结合分析通常采用放射性标记的NAADP进行竞争性结合实验。在这些实验中,测定化合物从其受体上置换[32P]NAADP的能力。例如,一项研究表明Ned-19与[32P]NAADP竞争结合,并通过孵育5天后[32P]NAADP结合的恢复情况来确定Ned-19 (10 μM)和NAADP (10 nM)的解离程度。此外,还绘制了Ned-19对[32P]NAADP结合的浓度-抑制曲线。这些实验通常使用钙动员生物测定法进行,例如海胆卵匀浆,这是一种成熟的钙释放研究系统。在该系统中,利用钙离子指示染料(如Fluo-3)监测细胞内钙库的释放,并测定顺式-Ned19对NAADP介导的钙释放的抑制作用。通过证明顺式-Ned19在半数最大浓度下不抑制其他第二信使(如IP3和cADPR)介导的钙释放,证实了其特异性。这些无细胞实验对于在分子水平上表征该化合物的结合亲和力、选择性和作用机制至关重要。
细胞实验
在体外细胞实验中,通常使用不同浓度的顺式-Ned19(cis-Ned19,浓度范围通常在1-100 µM之间)处理细胞30分钟至数小时。主要检测指标是使用钙敏感染料(例如Fura-2或Fluo-4)测量NAADP诱导的钙释放。例如,在一项关于记忆性CD4+ T细胞的研究中,研究人员探讨了Ned-19对TCR活化的影响。他们用Ned-19处理细胞,并测量TCR介导的钙流。结果表明,Ned-19抑制了这种钙流及其下游效应功能,包括细胞增殖和细胞因子产生。在另一个例子中,研究人员使用NAADP-AM(一种细胞可渗透的NAADP类似物)来释放记忆性CD4+ T细胞中的钙,结果发现Ned-19抑制了这种钙流,证实了其作为NAADP通路拮抗剂的作用。此外,可利用顺式-Ned19的荧光特性(激发/发射波长为365/410 nm),通过荧光显微镜观察NAADP受体的标记情况。这些实验对于确认该化合物的作用机制以及研究NAADP信号在不同细胞环境中的功能后果至关重要。
动物实验
已有关于顺式-Ned19的体内动物研究报道,但其文献资料不如体外实验那样详尽。一项研究表明,Ned-19能显著抑制小鼠的肿瘤生长、血管生成和肺转移,提示NAADP信号通路在癌症进展中起着关键作用。另一项体内模型研究发现,在抗CD3小鼠模型中抑制NAADP可改善疾病进程,表明NAADP在炎症反应中发挥作用。这些研究通常包括通过注射或其他合适的途径给动物给药,然后监测疾病进展、肿瘤生长或其他相关的生理参数。然而,现有文献中并非总是完整描述具体的实验方案,例如具体的剂量、给药途径和治疗方案。顺式-Ned19的主要应用是在细胞系统中研究NAADP信号通路,其体内应用目前仍处于研究阶段。需要开展更多研究来建立该化合物全面的体内疗效和安全性数据。
药代性质 (ADME/PK)
顺式-Ned19的药代动力学特性,包括吸收、分布、代谢和排泄(ADME),在已发表的同行评审研究中尚未得到充分表征。作为一种研究探针,其开发和应用主要集中于将其用作体外和细胞实验中研究NAADP信号传导的工具。虽然已知它是一种细胞渗透性化合物,表明它可以穿过生物膜,但诸如生物利用度、半衰期、蛋白结合率和代谢途径等详细的药代动力学参数尚未公开。这种缺乏全面药代动力学数据的情况在许多非治疗用途的研究化学品中很常见。该化合物的主要价值在于其在实验环境中选择性调节NAADP信号传导的能力,而非作为具有优化药物特性的候选药物。因此,其药代动力学特征并非研究的重点。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
公开文献中没有关于顺式-Ned19的毒理学数据。作为一种研究用化学品,其安全性尚未在标准毒理学研究中得到系统评估。现有信息主要集中于其作为NAADP拮抗剂的生物活性及其作为荧光探针的用途。研究人员在处理该化合物时应遵循标准实验室安全操作规程,包括使用适当的个人防护装备并在通风良好的区域工作。由于缺乏毒理学数据,顺式-Ned19仅供研究用途,未经批准用于人体。
参考文献

[1]. Identification of a chemical probe for NAADP by virtual screening. Nat Chem Biol. 2009 Apr;5(4):220-6.

其他信息
顺式-Ned19 是一种用于研究 NAADP 信号通路的科研工具。它作为 NAADP 化学探针的发现是一项重大突破,相关研究成果已发表在《自然化学生物学》等高影响力期刊上。顺式-Ned19 可用于研究 NAADP 在多种生理过程中的作用,包括钙信号传导、自噬和溶酶体功能。该化合物兼具拮抗剂和荧光标记物的双重功能,使其成为一种独特且极具价值的试剂。需要注意的是,顺式-Ned19 是其“顺式”非对映异构体,其“反式”对应物(反式-Ned19)也用于研究。该化合物通常以粉末形式储存于 -20°C,可溶于 DMSO。它仅供科研用途,不得用于治疗或诊断。顺式-Ned19 的开发为深入理解 NAADP 在健康和疾病中的作用铺平了道路,使其成为钙信号传导领域不可或缺的工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C30H31FN4O3
分子量
514.59
精确质量
514.238
CAS号
1137264-00-6
PubChem CID
1427626
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
LogP
4.657
tPSA
80.83
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
38
分子复杂度/Complexity
810
定义原子立体中心数目
2
SMILES
O1C2=CC=CC=C2OCC1CNCCOCCOC
InChi Key
FUHCEERDBRGPQZ-LSYYVWMOSA-N
InChi Code
InChI=1S/C30H31FN4O3/c1-38-27-11-10-19(16-20(27)18-34-12-14-35(15-13-34)26-9-5-3-7-23(26)31)28-29-22(17-25(33-28)30(36)37)21-6-2-4-8-24(21)32-29/h2-11,16,25,28,32-33H,12-15,17-18H2,1H3,(H,36,37)/t25-,28-/m0/s1
化学名
(1S,3S)-1-[3-[[4-(2-fluorophenyl)piperazin-1-yl]methyl]-4-methoxyphenyl]-2,3,4,9-tetrahydro-1H-pyrido[3,4-b]indole-3-carboxylic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9433 mL 9.7165 mL 19.4329 mL
5 mM 0.3887 mL 1.9433 mL 3.8866 mL
10 mM 0.1943 mL 0.9716 mL 1.9433 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们