Mad1 (6-21)

目录号: V61617 纯度: ≥98%
Mad1 (6-21) 是 Mad1 蛋白的 6-21 片段。
Mad1 (6-21) CAS号: 880150-82-3
产品类别: Peptides | 多肽
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
Mad1 (6-21) 是 Mad1 蛋白的 6-21 片段。Mad1 (6-21) 与哺乳动物 Sin3A PAH2 结合,Kd 值为 ~29 nM。
Mad1 (6-21) (CAS#: 880150-82-3) 是一种合成肽片段,来源于 Mad1(有丝分裂阻滞缺陷蛋白 1)蛋白,特异性地包含第 6 至 21 位氨基酸残基。该肽序列为 RMNIQMLLEAADYLER(16 个氨基酸)。Mad1 是纺锤体组装检查点 (SAC) 的关键组成部分,确保有丝分裂过程中染色体的正确分离。该肽片段被用作研究蛋白质-蛋白质相互作用的工具,特别是研究 Mad1 与 Sin3A 转录共抑制复合物之间的结合,以及探索细胞周期调控和有丝分裂检查点控制的分子机制。
生物活性&实验参考方法
靶点
Mad1 (6-21) targets the PAH2 (paired amphipathic helix 2) domain of the mammalian Sin3A protein. The peptide binds directly to the Sin3A PAH2 domain with high affinity (Kd approximately 29 nM). This interaction is mediated by an amphipathic alpha-helical structure formed by Mad1 (6-21) upon binding. The PAH2 domain of mSin3A consists of a left-handed four-helix bundle, with helices alpha1 and alpha2 creating a deep hydrophobic pocket that serves as the main contact surface for the Mad1 peptide. This binding is critical for Mad1's function in transcriptional regulation and cell cycle control.
体外研究 (In Vitro)
mSin3A的PAH2结构域所形成的左旋四螺旋束结构,其转角区域和所有四个螺旋上的残基构成了一个紧密的结构域,并具有一个大的疏水核心。由α1和α2螺旋形成的深疏水腔是Mad1(6-21)肽的主要接触面。在复合物中,Mad1(6-21)形成一个两亲性α螺旋,主要通过该螺旋的非极性表面与PAH2相互作用[1]。
体外实验表明,Mad1 (6-21) 与哺乳动物 Sin3A 的 PAH2 结构域具有很强的结合亲和力,解离常数 (Kd) 约为 29 nM。该肽段结合后呈现两亲性 α-螺旋结构,主要通过其非极性表面与 PAH2 结构域相互作用。这种高亲和力相互作用使得该肽段成为研究 Mad1-Sin3A 结合以及绘制 Mad1 蛋白与 Sin3A 转录共抑制复合物相互作用界面的理想工具。目前尚未报道其具有直接的酶活性。
体内研究 (In Vivo)
由于Mad1 (6-21)肽段通常用作结构和生化研究中的结合探针,而非治疗剂,因此通常不进行使用该肽段的体内研究。全长Mad1蛋白对于体内纺锤体组装检查点功能至关重要,但单独的肽段片段并不能替代全长蛋白。体内相关性研究是通过基于肽段结合研究获得的结构信息,对全长Mad1蛋白进行诱变来实现的。
酶活实验
Sin3A PAH2-Mad1相互作用的无细胞结合分析方案:将重组Sin3A PAH2结构域蛋白固定在生物传感器芯片(SPR)或96孔板中。将不同浓度的合成Mad1 (6-21)肽(例如1-500 nM)流过固定化的蛋白,并通过响应单位(SPR)或荧光偏振(如果进行了荧光标记)来测量结合情况。计算结合和解离速率,并通过非线性曲线拟合确定Kd值。也可以使用等温滴定量热法(ITC)来测量结合热力学。
细胞实验
基于细胞的结合研究:使用表达荧光标记的Sin3A的细胞来评估Mad1 (6-21)肽与全长Mad1竞争Sin3A结合的能力。然而,在标准条件下,该肽不具有细胞渗透性。在下拉实验中,将生物素化的Mad1 (6-21)肽固定在链霉亲和素磁珠上,并与表达Sin3A的细胞裂解液孵育。洗脱结合的蛋白质,并通过Western印迹法检测,以确认特异性相互作用并鉴定Mad1序列的其他结合伴侣。
动物实验
由于Mad1 (6-21)肽段缺乏膜渗透性,且其主要用作生化工具,因此通常不进行体内动物实验。转基因小鼠模型可用于研究全长Mad1蛋白相应区域突变的影响。这些突变会破坏Mad1-Sin3A的结合,预计会影响细胞周期进程和有丝分裂检查点功能,但不会直接给动物注射该肽段。
药代性质 (ADME/PK)
由于Mad1 (6-21)肽并非候选药物,因此未对其进行药代动力学研究。作为一种由16个氨基酸组成的肽(分子量约为1966 Da),它不具备口服生物利用度,若在体内给药,则会被胃肠道和血液中的蛋白酶迅速降解。该肽的设计用途仅限于体外生化和结构研究,用于研究蛋白质-蛋白质相互作用,不适用于全身给药。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于Mad1 (6-21) 是一种研究用肽,在无细胞和基于细胞的结合试验中均以低浓度(纳摩尔至低微摩尔)使用,因此尚未对其进行毒性研究。该肽未用于动物毒理学评估。由于其毒理学特性尚未明确,因此应遵循合成肽的标准实验室安全操作规程(避免吸入、皮肤接触和注射)。
参考文献
[1]. K Brubaker, et al. Solution structure of the interacting domains of the Mad-Sin3 complex: implications for recruitment of a chromatin-modifying complex. Cell. 2000 Nov 10;103(4):655-65.
其他信息
Mad1 (6-21) 并非药物,也无临床应用或监管批准。它是一种研究级肽,用于研究 Mad1 纺锤体检查点蛋白与 Sin3A 转录共抑制复合物之间的分子相互作用。其高亲和力结合(Kd ~29 nM)使其成为结构生物学研究(包括核磁共振和 X 射线晶体学)、蛋白质相互作用图谱绘制和细胞周期研究的宝贵工具。该肽序列为 H-Arg-Met-Asn-Ile-Gln-Met-Leu-Leu-Glu-Ala-Ala-Asp-Tyr-Leu-Glu-Arg-OH。不可用于治疗用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C84H140N24O26S2
分子量
1966.28561687469
精确质量
1964.981
CAS号
880150-82-3
相关CAS号
Mad1 (6-21) (TFA)
PubChem CID
168013263
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
-5.2
tPSA
893
氢键供体(HBD)数目
29
氢键受体(HBA)数目
31
可旋转键数目(RBC)
70
重原子数目
136
分子复杂度/Complexity
4070
定义原子立体中心数目
17
SMILES
[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N)(C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@H](C(=O)O)CCCNC(N)=N)CC1C=CC(O)=CC=1
InChi Key
ZBAJHFNGYUVVPZ-ZJZZMTSFSA-N
InChi Code
InChI=1S/C84H140N24O26S2/c1-13-43(8)66(108-80(131)59(38-62(87)111)107-73(124)52(28-32-135-11)96-69(120)48(85)16-14-30-92-83(88)89)81(132)100-49(22-25-61(86)110)71(122)99-53(29-33-136-12)74(125)103-57(36-42(6)7)77(128)104-55(34-40(2)3)75(126)97-50(23-26-63(112)113)70(121)95-44(9)67(118)94-45(10)68(119)102-60(39-65(116)117)79(130)106-58(37-46-18-20-47(109)21-19-46)78(129)105-56(35-41(4)5)76(127)98-51(24-27-64(114)115)72(123)101-54(82(133)134)17-15-31-93-84(90)91/h18-21,40-45,48-60,66,109H,13-17,22-39,85H2,1-12H3,(H2,86,110)(H2,87,111)(H,94,118)(H,95,121)(H,96,120)(H,97,126)(H,98,127)(H,99,122)(H,100,132)(H,101,123)(H,102,119)(H,103,125)(H,104,128)(H,105,129)(H,106,130)(H,107,124)(H,108,131)(H,112,113)(H,114,115)(H,116,117)(H,133,134)(H4,88,89,92)(H4,90,91,93)/t43-,44-,45-,48-,49-,50-,51-,52-,53-,54-,55-,56-,57-,58-,59-,60-,66-/m0/s1
化学名
(4S)-4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S,3S)-2-[[(2S)-4-amino-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-amino-5-carbamimidamidopentanoyl]amino]-4-methylsulfanylbutanoyl]amino]-4-oxobutanoyl]amino]-3-methylpentanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]-4-methylsulfanylbutanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]-5-[[(2S)-1-[[(2S)-1-[[(2S)-1-[[(2S)-1-[[(2S)-1-[[(2S)-1-[[(1S)-4-carbamimidamido-1-carboxybutyl]amino]-4-carboxy-1-oxobutan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-(4-hydroxyphenyl)-1-oxopropan-2-yl]amino]-3-carboxy-1-oxopropan-2-yl]amino]-1-oxopropan-2-yl]amino]-1-oxopropan-2-yl]amino]-5-oxopentanoic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 0.5086 mL 2.5429 mL 5.0857 mL
5 mM 0.1017 mL 0.5086 mL 1.0171 mL
10 mM 0.0509 mL 0.2543 mL 0.5086 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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