| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
DMNB-caged-Serine does not have a defined biological target in its caged form; it is a synthetic amino acid analog designed for light-induced uncaging. Upon exposure to UV or visible blue light, the DMNB caging group is photolyzed, releasing free L-serine. The released serine then targets its natural biological receptors and enzymes, including serine transporters, serine hydroxymethyltransferase (SHMT), and incorporation into proteins by the cellular translation machinery as a catalytic residue, hydrogen bonding partner, or site of post-translational modification. DMNB-caged-Serine can be used as a catalytic residue, hydrogen bonding partner or site of post-translational modification.
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| 体外研究 (In Vitro) |
DMNB-笼状丝氨酸可阻止磷酸化，并阻止受体 Msn5 的输出，因为它取代了调节 Pho4 核输出的磷酸化丝氨酸位点 [1]。
体外研究表明，DMNB笼状丝氨酸在黑暗中稳定，在光解之前不会干扰正常的细胞过程。当以毫摩尔浓度将其引入酿酒酵母的培养基中，使其响应琥珀终止密码子（TAG）而掺入蛋白质中时，便可实现对哺乳动物蛋白质化学组成的控制。当细胞暴露于可见蓝光（405 nm）时，笼状基团被移除，释放出天然丝氨酸残基，并以时间和空间可控的方式恢复其生物活性。该方法已被用于利用基因编码的光笼状氨基酸来控制蛋白质磷酸化。该化合物在黑暗中浓度高达5 mM时对细胞的毒性极低，因此可用于长期培养和表达研究。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
由于DMNB-笼状丝氨酸主要是一种体外和离体研究工具，因此其体内活性数据有限。该化合物旨在通过遗传密码扩展技术整合到活细胞或生物体的蛋白质中。在体内应用中，通常将笼状氨基酸施用于经过基因改造的生物体，这些生物体已被设计成将其整合到特定的蛋白质位点。光解后，释放的丝氨酸可以用于在体内（例如斑马鱼胚胎或秀丽隐杆线虫）对蛋白质功能进行光学控制。然而，关于哺乳动物体内研究的详细报道并不多见。体内应用面临的挑战包括如何将笼状氨基酸高效递送至靶组织以及激活光的穿透深度。
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| 酶活实验 |
DMNB笼状丝氨酸的非细胞检测方法主要包括光化学表征，以确定其脱笼反应的效率和动力学。典型的实验方案是使用紫外-可见吸收光谱和高效液相色谱（HPLC）分析。将DMNB笼状丝氨酸溶解于生理缓冲液（例如，10 mM磷酸盐缓冲液，pH 7.4）中，浓度为50-100 uM。将溶液置于石英比色皿中，并用波长为365 nm的紫外灯或激光（或波长为405 nm的蓝色LED）照射，光强和照射时间（例如，0、5、10、30、60秒）各不相同。记录照射前后的吸收光谱，以监测DMNB基团特征吸收峰（约350 nm）的降低情况。同时，可采用高效液相色谱（HPLC）（C18反相柱，水/乙腈等度洗脱）将笼状化合物与释放的丝氨酸和光解副产物分离。通过监测起始原料的消失或未笼状丝氨酸随时间的生成，计算光解速率常数（k_photo）和量子产率（Φ）。质谱（LC-MS）可用于确认释放产物（L-丝氨酸，m/z 106.1）和亚硝基副产物的身份。在特定光照条件下测定笼状基团的半衰期，可用于优化实验参数。
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| 细胞实验 |
在基于细胞的实验中，DMNB-笼状丝氨酸被用于遗传密码扩展系统。例如，在酿酒酵母或经基因工程改造表达正交氨酰-tRNA合成酶/tRNA对（该酶/tRNA对可识别琥珀终止密码子TAG）的哺乳动物细胞中，细胞在缺乏丝氨酸的特定合成培养基中培养。向培养基中添加浓度为1-5 mM的DMNB-笼状丝氨酸，诱导蛋白表达。表达后，对笼状蛋白进行纯化或进行原位研究。对于活细胞光解实验，用PBS洗涤表达笼状蛋白的细胞，然后用405 nm LED或共聚焦激光器照射0-10分钟。光解效率可通过SDS-PAGE和Western blotting（使用针对笼状残基或报告标签的抗体）或功能性检测（例如测量激酶活性或蛋白质相互作用的恢复）进行评估。时空控制可通过共聚焦显微镜实现，该方法照射特定感兴趣区域，并监测活化蛋白的扩散。应使用标准细胞活力检测方法（例如，MTT、活/死细胞染色）评估笼蔽组和紫外线照射的细胞毒性。
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| 动物实验 |
由于DMNB笼状丝氨酸主要用于靶向蛋白调控，因此其体内实验方案尚未标准化。对于使用秀丽隐杆线虫或斑马鱼等模式生物的研究人员，通常通过显微注射将笼状氨基酸导入胚胎或添加到水中。例如，可以将表达笼状蛋白的秀丽隐杆线虫置于琼脂垫上，并滴加一滴含有1-10 mM DMNB笼状丝氨酸的M9缓冲液。进行光解时，使用紫外激光（365 nm）或405 nm二极管激光，通过显微镜物镜聚焦，照射特定细胞或组织数毫秒至数分钟。然后观察其生物学效应（例如，突变表型的恢复、信号通路的激活）。对照组动物应置于黑暗环境中，以确认笼状化合物在无光照条件下不具有活性。在哺乳动物中，可以探索DMNB笼状丝氨酸的全身给药途径（例如腹腔注射），但其在循环系统中的稳定性以及穿过细胞膜并整合到蛋白质中的能力是主要障碍。因此，它并非全身体内研究的标准候选药物。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
由于DMNB-笼状丝氨酸是一种用于化学生物学和光遗传学的研究工具，因此目前尚无其作为治疗药物的药代动力学数据。作为一种受保护的氨基酸，它不适用于全身给药。如果体内给药，由于其分子量小（300.26 Da）且极性高（含有多个氧原子和氮原子），笼状氨基酸很可能被肾脏迅速清除。它也可能被酯酶或其他酶代谢，或被环境光光解，导致丝氨酸过早释放。因此，其药代动力学高度依赖于给药途径和实验模型。对于体外光解，其半衰期取决于光强度和波长，而非代谢酶。通常情况下，该化合物在避光条件下于溶液中稳定，溶液可在-20℃下长期保存。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
在用于蛋白质表达的浓度（细胞培养中为 1-5 mM）下，DMNB-笼状丝氨酸在黑暗中通常被认为无毒。然而，光解的副产物，例如 4,5-二甲氧基-2-亚硝基苄醇，在高浓度或长时间暴露下可能具有细胞毒性。该化合物也具有光反应性，应尽量减少紫外线照射以防止意外脱笼。标准安全操作措施包括佩戴手套和护目镜，并在通风橱中处理粉末。该化合物仅供研究使用，不可用于人类治疗。目前尚未有关于该特定笼状化合物的遗传毒性、致癌性或生殖毒性研究报告。在哺乳动物细胞系（例如 HEK293、HeLa）中进行的细胞活力测定表明，在黑暗中浓度高达 5 mM 的情况下，DMNB-笼状丝氨酸在 72 小时内不会显著影响细胞增殖或活力。
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| 参考文献 |
[1]. Edward A Lemke, et al. Control of protein phosphorylation with a genetically encoded photocaged amino acid. Nat Chem Biol. 2007 Dec;3(12):769-72.
[2]. Qing Shao, et al. Photoactive molecules for applications in molecular imaging and cell biology. Chem Soc Rev. 2010 Aug;39(8):2835-46. [3]. Brieke C, et al. Light-controlled tools. Angew Chem Int Ed Engl. 2012 Aug 20;51(34):8446-76. |
| 其他信息 |
DMNB笼状丝氨酸也称为O-(4,5-二甲氧基-2-硝基苄基)-L-丝氨酸。它是一种光笼氨基酸，以DMNB作为蓝光敏感笼状基团。它可溶于DMSO（例如，浓度为150 mg/mL），水溶性较低。该产品应以粉末形式储存于-20℃，避光防潮，在此条件下至少可稳定保存2年。溶液（例如DMSO溶液）应分装后储存于-80℃，并避光保存。这种笼状氨基酸是时空调控蛋白质结构和功能的有效工具，可用于利用光研究细胞和生物体内的动态过程。它常用于光遗传学、蛋白质工程以及需要精确调控氨基酸可用性的研究，例如利用基因编码的光笼氨基酸控制蛋白质磷酸化。
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| 分子式 |
C12H16N2O7-
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|---|---|
| 分子量 |
300.265
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| 精确质量 |
300.095
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| CAS号 |
780009-55-4
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| PubChem CID |
16741276
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| 外观&性状 |
Light yellow to light brown solid powder
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| LogP |
-2.2
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| tPSA |
137
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
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| 氢键受体(HBA)数目 |
8
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| 可旋转键数目(RBC) |
7
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| 重原子数目 |
21
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| 分子复杂度/Complexity |
360
|
| 定义原子立体中心数目 |
1
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| SMILES |
COC1=C(C=C(C(=C1)COC[C@@H](C(=O)O)N)[N+](=O)[O-])OC
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| InChi Key |
HYSPNOMZFGNKBR-QMMMGPOBSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C12H16N2O7/c1-19-10-3-7(5-21-6-8(13)12(15)16)9(14(17)18)4-11(10)20-2/h3-4,8H,5-6,13H2,1-2H3,(H,15,16)/t8-/m0/s1
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| 化学名 |
(2S)-2-amino-3-[(4,5-dimethoxy-2-nitrophenyl)methoxy]propanoic acid
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO: 250 mg/mL (832.61 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 3.3303 mL | 16.6517 mL | 33.3034 mL | |
| 5 mM | 0.6661 mL | 3.3303 mL | 6.6607 mL | |
| 10 mM | 0.3330 mL | 1.6652 mL | 3.3303 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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