| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 5mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
The mechanism of action of DB0662 involves binding to a specific kinase of interest (target protein) and to an E3 ubiquitin ligase, bringing them into close proximity. This leads to the ubiquitination of the kinase and its subsequent degradation by the 26S proteasome. The compound is designed for kinase-targeted protein degradation and can be used in studies of diseases mediated by abnormal kinase activity. It may also be used for the identification of degradable kinases (i.e., kinases that can be effectively degraded by this compound or related PROTACs) and optimal kinases (i.e., those that are most effectively degraded by this molecular design). The specific kinase(s) targeted by DB0662 are not specified in the search results; the compound is described as a general tool for studying kinase degradation. It likely targets a panel of kinases or a specific kinase family, depending on the warhead used. DB0662 is a research tool for validating the utility of PROTACs in targeting previously "undruggable" kinases or for overcoming resistance to kinase inhibitors.
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| 体外研究 (In Vitro) |
体外研究表明，DB0662 是一种靶向激酶的蛋白质降解化合物。它很可能是一种 PROTAC（蛋白水解靶向嵌合体），能够促进特定激酶的降解。该化合物可用于基于细胞的检测，以评估其降低靶激酶水平的能力。标准实验方案包括用不同浓度（0.01-10 uM）的 DB0662 处理细胞（例如癌细胞系）6-48 小时。然后通过蛋白质印迹或靶向蛋白质组学（例如 NanoString、质谱）检测靶激酶及其下游信号蛋白的水平。计算化合物的效力（DC50，即 50% 降解浓度）和最大降解率（Dmax，即饱和降解时靶标的百分比）。此外，还可以评估该化合物对细胞增殖（MTT 法）和细胞活力（CellTiter-Glo 法）的影响。与传统激酶抑制剂相比，DB0662 可能具有不同的药理学特性，因为它能消除靶蛋白，而不仅仅是抑制其催化活性。这可能导致通路持续抑制，并有可能克服由激酶突变引起的耐药性，这些突变会干扰抑制剂的结合。DB0662 的特异性可通过蛋白质组范围的质谱分析来评估，以识别脱靶降解蛋白。该化合物很可能被用作探针，以发现哪些激酶是“可降解的”（即，可通过 PROTAC 设计有效降解），哪些是不可降解的。
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| 体内研究 (In Vivo) |
DB0662 的体内活性数据尚未公开。作为一种 PROTAC，其体内疗效取决于其药代动力学特性（例如口服生物利用度、半衰期、组织分布）以及其在体内同时与靶激酶和 E3 连接酶结合的能力。PROTAC 的典型动物研究采用皮下异种移植小鼠肿瘤模型。DB0662 将以 10-100 mg/kg 的剂量，每日或隔日，通过腹腔注射 (ip) 或静脉注射 (iv) 给药，持续 2-4 周。研究将测量肿瘤生长抑制情况，并在终点收集肿瘤组织，通过蛋白质印迹法和免疫组化 (IHC) 检测靶激酶的降解情况。此外，还将验证该化合物在体内诱导蛋白质降解的能力。搜索结果中未找到相关具体数据。
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| 酶活实验 |
DB0662 的非细胞检测方法包括表面等离子共振 (SPR) 或等温滴定量热法 (ITC)，用于测量该化合物与靶激酶和 E3 连接酶（例如 CRBN 或 VHL）的结合亲和力。标准的 SPR 检测方法是将纯化的激酶或 E3 连接酶固定在传感器芯片上，然后注入浓度递增的 DB0662 (1-1000 nM) 以确定结合动力学 (ka, kd) 和亲和力 (Kd)。也可以使用微尺度热泳 (MST) 检测。为了评估三元复合物的形成（PROTAC 同时与激酶和 E3 连接酶结合），可以进行时间分辨荧光共振能量转移 (TR-FRET) 检测或采用顺序注射（先注射激酶，再注射 PROTAC，最后注射 E3 连接酶）的表面等离子共振 (SPR) 检测。例如，将生物素标记的靶激酶固定在链霉亲和素传感器芯片上。注入DB0662（0.1-10 uM），随后注入含有E3连接酶（例如CRBN或VHL）的溶液。注入E3连接酶后响应单位的增加表明三元复合物的形成。可以测定三元复合物形成的动力学和复合物的半衰期。对于均相TR-FRET检测，靶激酶用供体荧光团（例如铽）标记，E3连接酶用受体荧光团（例如d2）标记。加入DB0662使两种蛋白质彼此靠近，从而导致FRET信号增强。计算三元复合物形成的EC50值。在泛素化分析中，将纯化的组分（激酶、E3连接酶、E2泛素结合酶、泛素、ATP）与DB0662在试管中于37℃孵育1-2小时。然后将反应物进行SDS-PAGE电泳，并用抗泛素抗体进行免疫印迹，以检测激酶上多聚泛素链的形成。高分子量条带的增加表明发生了泛素化。使用纯化的26S蛋白酶体和泛素化激酶的无细胞降解分析可用于评估降解的最后步骤。
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| 细胞实验 |
对于基于细胞的研究，表达靶激酶的癌细胞系（例如 HEK293、HeLa 或特定癌细胞系）在含有 10% FBS 和 1% 青霉素-链霉素的 DMEM 培养基中，于 37℃、5% CO2 培养箱中培养。将细胞接种于 6 孔板（3-5×10⁵ 个细胞/孔），并用不同浓度（0.001-10 uM）的 DB0662 处理 6-48 小时。阳性对照：已知的 PROTAC 或靶激酶抑制剂。阴性对照：DMSO 溶剂。处理后，用 PBS 洗涤细胞，并在含有蛋白酶和磷酸酶抑制剂的 RIPA 裂解缓冲液中裂解细胞。将蛋白裂解液（20-50 ug）进行SDS-PAGE电泳分离，然后用针对靶激酶、下游信号蛋白（例如磷酸化ERK、总ERK）和内参（例如GAPDH、β-肌动蛋白）的抗体进行免疫印迹分析。通过密度扫描法定量条带强度，并将数据拟合到四参数逻辑方程，计算DC50和Dmax值。为了确定降解是否由蛋白酶体介导，将细胞与DB0662和蛋白酶体抑制剂（例如MG132，10 uM）或NEDD8激活酶抑制剂（MLN4924，可阻止泛素化）共同处理。这些抑制剂对靶蛋白水平的恢复证实了靶向降解。为了评估 E3 连接酶的作用，细胞需预先用 E3 连接酶的竞争性配体（例如，用来那度胺处理 CRBN，或用 VHL 配体处理 VHL）进行处理，以阻断 DB0662 与 E3 连接酶的结合。靶蛋白水平的恢复表明该降解是由该特定 E3 连接酶介导的。对于细胞增殖实验，将细胞接种于 96 孔板（5×103 个细胞/孔），并用 DB0662（0.001-10 uM）处理 48-96 小时，然后通过 MTT 或 CellTiter-Glo 检测细胞活力。此外，还可以评估 DB0662 对克隆形成（软琼脂克隆形成实验）和细胞迁移（划痕实验）的影响。细胞周期分析中，细胞用DB0662处理24-48小时，用70%乙醇固定，用碘化丙啶（PI）和RNase染色，并通过流式细胞术进行分析。细胞凋亡可通过Annexin V-FITC/PI染色和流式细胞术评估，或通过检测caspase-3/7活性进行评估。蛋白质组学分析中，细胞用DB0662或DMSO处理6-24小时，提取蛋白质，用胰蛋白酶消化，并通过LC-MS/MS进行分析。对数千种蛋白质的倍数变化进行定量，并通过显著下调的蛋白质（靶标降解蛋白）与非靶标蛋白的数量来评估降解的选择性。该化合物还可用于研究目标降解的动力学，通过时间进程（例如，0、2、4、8、12、24、48 小时）进行，并评估“钩状效应”（由于二元复合物的形成，在高浓度下降解较低）。
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| 动物实验 |
DB0662 的体内实验方案尚未公开。对于典型的 PROTAC，疗效研究通常在异种移植小鼠模型中进行。将癌细胞（例如 5×10⁶ 个细胞）皮下注射到 6-8 周龄的雌性无胸腺裸鼠的侧腹部。当肿瘤体积达到 100-200 mm³ 时，将小鼠随机分组（每组 n=8-10）。DB0662 的配制溶剂包括 10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80 和 45% 生理盐水，或配制于更复杂的 PROTAC 专用溶剂（例如 10% DMSO、30% PEG400、10% Solutol HS15 和 50% 水）。该化合物以10、30或100 mg/kg的剂量，通过腹腔注射（ip）或静脉注射（iv）给药，每日一次或隔日一次，持续14-28天。对照组仅接受赋形剂，阳性对照组接受标准治疗药物或激酶抑制剂。每2-3天使用游标卡尺测量肿瘤体积，并监测体重。在研究终点，切除肿瘤，称重，并进行Western blotting分析，以评估靶蛋白降解和下游信号通路。进行靶蛋白、Ki-67（增殖）和cleaved caspase-3（凋亡）的免疫组织化学（IHC）检测。在研究结束时采集血样，进行血清生化（ALT、AST、BUN、肌酐）和血液学检查。在药代动力学 (PK) 研究中，将小鼠分成若干组（每时间点 n=3），分别单次静脉注射或腹腔注射 DB0662（例如，10 mg/kg），并在 0、0.25、0.5、1、2、4、6、8、12 和 24 小时采集血浆样本。采用液相色谱-串联质谱法 (LC-MS/MS) 测定化合物浓度。计算血浆半衰期 (t1/2)、最大浓度 (Cmax)、曲线下面积 (AUC) 和清除率 (CL)。在药效学 (PD) 研究中，单次给药后在不同时间点采集肿瘤组织，以评估体内靶点降解动力学。可建立 PK（暴露量）与 PD（降解）之间的关系模型。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
DB0662 的详细药代动力学数据尚不可用。作为一种 PROTAC（分子量 932 Da，LogP 值可能为 3-5），其水溶性可能较低，但渗透性中等至良好。由于 PROTAC 的分子量和极性较高，其口服生物利用度通常较差，因此在临床前研究中通常采用腹腔注射 (ip) 或静脉注射 (iv) 给药。其血浆半衰期可能较短（例如 1-4 小时），分布容积 (Vd) 可能中等至较高。该化合物可能通过 CYP450 酶代谢，并可能发生 II 期结合反应。对于体外试验，应使用 DMSO 配制储备液（例如 10-50 mM），然后用细胞培养基稀释，使最终 DMSO 浓度低于 0.1%。该化合物应以粉末形式储存于 -20℃，并避光防潮。溶液应分装后储存在-80℃，并在3-6个月内使用。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
DB0662 的临床前毒性数据尚不可用。作为一种 PROTAC，其安全性可能与传统激酶抑制剂有所不同。靶向激酶在正常组织中的降解以及对其他蛋白质的非靶向降解均可能导致不良反应。在细胞活力测定中，该化合物对敏感癌细胞系的 IC50 值可能在低微摩尔至亚微摩尔范围内。在动物模型中，剂量限制性毒性可能包括肝毒性、胃肠道紊乱或血液学效应。目前尚无遗传毒性、hERG 抑制或生殖毒性数据。操作时应遵循标准安全防护措施（佩戴手套、实验服和护目镜）。该化合物仅供研究使用，不得用于人体。
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| 参考文献 |
[1]. Nathanael S. Gray, et al. Compounds for targeted protein degradation of kinases. WO2022093742.
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| 其他信息 |
DB0662 是一种用于研究激酶靶向蛋白降解的化合物。它被归类为 PROTAC（蛋白水解靶向嵌合体），用于研究激酶靶向蛋白降解的生物学效应。它并非药物，也未获得 FDA 批准。该化合物以固体粉末形式供应，应在 -20°C 下避光防潮保存。在 DMSO 溶液中，应在 -80°C 下保存。该化合物是化学生物学研究的重要工具，可用于验证新的激酶靶点，并开发针对由激酶活性异常引起的疾病的新疗法。它属于一类利用泛素-蛋白酶体系统清除致病蛋白的分子，这类分子相比传统抑制剂具有诸多优势，包括有望克服耐药性以及靶向激酶的非酶促功能。
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| 分子式 |
C47H44F3N11O7
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|---|---|
| 分子量 |
931.916979789734
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| 精确质量 |
931.337
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| CAS号 |
2769753-51-5
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| PubChem CID |
165412591
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| 外观&性状 |
Light yellow to yellow solid powder
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| LogP |
4.4
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| tPSA |
203
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| 氢键供体(HBD)数目 |
3
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| 氢键受体(HBA)数目 |
16
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| 可旋转键数目(RBC) |
12
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| 重原子数目 |
68
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| 分子复杂度/Complexity |
1870
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
CC1=C(C=C(C=C1)NC(=O)C2=CC(=CC=C2)C(F)(F)F)N3CC4=CN=C(N=C4N(C3=O)C)NC5=CN=C(C=C5)N6CCN(CC6)CCCOC7=CC=CC8=C7C(=O)N(C8=O)C9CCC(=O)NC9=O
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| InChi Key |
PAYXBIAZSMSRHO-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C47H44F3N11O7/c1-27-10-11-31(53-41(63)28-6-3-7-30(22-28)47(48,49)50)23-35(27)60-26-29-24-52-45(56-40(29)57(2)46(60)67)54-32-12-14-37(51-25-32)59-19-17-58(18-20-59)16-5-21-68-36-9-4-8-33-39(36)44(66)61(43(33)65)34-13-15-38(62)55-42(34)64/h3-4,6-12,14,22-25,34H,5,13,15-21,26H2,1-2H3,(H,53,63)(H,52,54,56)(H,55,62,64)
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| 化学名 |
N-[3-[7-[[6-[4-[3-[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindol-4-yl]oxypropyl]piperazin-1-yl]pyridin-3-yl]amino]-1-methyl-2-oxo-4H-pyrimido[4,5-d]pyrimidin-3-yl]-4-methylphenyl]-3-(trifluoromethyl)benzamide
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO: 50 mg/mL (53.65 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.0731 mL | 5.3653 mL | 10.7305 mL | |
| 5 mM | 0.2146 mL | 1.0731 mL | 2.1461 mL | |
| 10 mM | 0.1073 mL | 0.5365 mL | 1.0731 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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