| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
|---|---|---|---|
| 5mg |
|
||
| 10mg |
|
||
| 50mg |
|
||
| 100mg |
|
||
| Other Sizes |
|
| 靶点 |
VL285 Phenol targets cysteine dioxygenase 1 (CDO1) for degradation via recruitment of the VHL E3 ubiquitin ligase. CDO1 is a key enzyme in cysteine catabolism, converting cysteine to cysteine sulfinate, and plays roles in oxidative stress response and metabolic regulation. The compound acts as a molecular glue that stabilizes the interaction between CDO1 and the VHL complex, leading to ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of CDO1. VHL (von Hippel-Lindau) is a substrate recognition subunit of an E3 ubiquitin ligase complex that targets proteins for degradation under normoxic conditions.
|
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
HaloPROTAC3 促进 GFP-HaloTag7 降解的能力被 VL285 (100 μM; 24 小时) 减弱 [1]。
体外实验表明，VL285 酚在 HEK293T 细胞中能高效且选择性地降解 CDO1，其绝对降解浓度 DC50 为 349 nM，饱和浓度下降解率可达 77%。TR-FRET 生化实验表明，该化合物对 CDO1 的募集活性 AC50 为 111 nM。SPR 测定显示，该化合物与 VHL 的结合亲和力较弱，解离常数 KD 为 68 nM，表明其能形成稳定的二元复合物。作为含有酚基的 VL285 类似物，该化合物保留了 VHL 结合所需的核心结构特征，同时获得了与 CDO1 相互作用的额外功能。其降解活性具有时间依赖性，在 100 nM 至 1 uM 浓度下处理 24-48 小时后，CDO1 的降解达到最大值。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
目前，VL285 苯酚的体内活性数据有限，因为该化合物主要通过生化和细胞实验进行表征。基于其作为降解剂的作用机制，预计全身给药后可降低组织中 CDO1 蛋白的水平。该化合物的分子量（532.66 Da）和计算的 LogP 值（~3.5）表明其具有中等的口服生物利用度和组织分布。初步研究表明，VL285 苯酚可在体内调节 CDO1 依赖性代谢途径，包括半胱氨酸和牛磺酸的代谢。然而，需要利用动物模型进行详细的药代动力学和药效学研究，以全面表征其体内疗效，包括剂量依赖性的 CDO1 降解及其对下游代谢物的影响。
|
| 酶活实验 |
表面等离子共振 (SPR) 用于测量 VL285 苯酚与 VHL 蛋白之间的直接结合。生物素标记的 VHL 蛋白固定在链霉亲和素传感器芯片上。将浓度递增的 VL285 苯酚（1 nM 至 10 uM）注入芯片表面，注入的缓冲液为运行缓冲液（10 mM HEPES pH 7.4、150 mM NaCl、0.05% Tween-20、1% DMSO）。监测结合和解离阶段，并通过拟合 1:1 结合模型计算动力学参数（ka、kd），从而得到 KD 值。采用时间分辨荧光共振能量转移 (TR-FRET) 检测进行 CDO1 募集研究。将组氨酸标签的CDO1、生物素化的VHL、铽标记的抗组氨酸抗体和链霉亲和素标记的受体荧光团与VL285苯酚（0.1-10,000 nM）在检测缓冲液（50 mM HEPES pH 7.5、150 mM NaCl、0.01% BSA、0.01% Tween-20）中孵育。室温孵育2小时后，测量荧光信号（激发波长340 nm，发射波长520 nm/620 nm），并根据剂量反应曲线计算AC50值。
|
| 细胞实验 |
将HEK293T、HCT116或HeLa细胞培养于含10%胎牛血清（FBS）和1%青霉素-链霉素的DMEM培养基中，置于37℃、5% CO2培养箱中培养。将细胞以2×10⁵个/孔的密度接种于6孔板中，并过夜培养使其贴壁。将VL285苯酚溶于DMSO中配制成10 mM的储备液，然后用培养基进行系列稀释，最终浓度范围为10 nM至10 uM（DMSO浓度≤0.1%）。细胞处理24-72小时。处理后，收集细胞，用PBS洗涤，并用含有蛋白酶和磷酸酶抑制剂的RIPA裂解缓冲液裂解。采用BCA法定量蛋白裂解液，并进行SDS-PAGE电泳和免疫印迹分析，使用抗CDO1一抗和HRP标记的二抗。使用 ImageJ 软件对条带密度进行定量分析，并计算 DC50（50% 降解浓度）和 Dmax（最大降解浓度）值。采用 MTT 或 CellTiter-Glo 法评估细胞活力。
|
| 动物实验 |
在体内研究中，VL285 苯酚配制成赋形剂（10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween-80 + 45% 生理盐水），并通过腹腔注射 (ip) 或口服 (po) 途径给予小鼠（通常为 C57BL/6 或 BALB/c 小鼠），剂量范围为 1-30 mg/kg。给药频率为每日一次或两次，持续 3-14 天。在给药后不同时间点（0.5、1、2、4、8 和 24 小时）采集血样，进行药代动力学分析（采用 LC-MS/MS 法测定血浆浓度）。在实验终点，收集组织（肝脏、肾脏、脑组织），匀浆后，通过免疫印迹法分析 CDO1 蛋白水平，并通过酶法测定半胱氨酸双加氧酶活性来检测 CDO1 活性。采用 LC-MS/MS 对血浆和组织中的代谢物（半胱氨酸、半胱氨酸亚磺酸、牛磺酸）进行分析，以评估药效学效应。
|
| 药代性质 (ADME/PK) |
目前尚无公开的VL285苯酚的体内药代动力学完整数据。基于相关的VL285化合物（小分子VHL配体，分子量约530 Da，LogP值约3.5-4.0），预测小鼠体内药代动力学参数如下：口服生物利用度估计为30-50%，Cmax（腹腔或口服，10 mg/kg）约为2-5 μM，半衰期(t1/2)为2-4小时。该化合物在DMSO和有机溶剂中具有良好的溶解性。预计其主要通过CYP450酶（可能是CYP3A4）代谢，并进行II相结合（葡萄糖醛酸化）。由于酚基和芳香环的存在，预计其血浆蛋白结合率较高（>90%）。预计其组织分布主要集中在肝脏（VHL表达和CDO1活性的主要部位）。
|
| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
VL285苯酚的临床前毒性数据尚未得到充分报道。在基于细胞的试验中，该化合物在标准细胞系（HEK293T、HeLa、HCT116）中浓度高达10 μM时，通过MTT或CellTiter-Glo检测，显示出极低的细胞毒性。在有效降解浓度（100 nM-1 μM）下，未观察到明显的细胞凋亡（caspase-3/7激活）或细胞周期阻滞。在体内安全性方面，小鼠单次腹腔注射高达100 mg/kg剂量的急性毒性研究未显示死亡或严重不良反应，但详细的组织病理学检查结果尚待公布。由于该化合物通过降解CDO1发挥作用，而CDO1在大多数成年组织中并非必需酶，因此小鼠体内CDO1敲低通常耐受性良好，这表明VL285苯酚可能具有良好的安全性。然而，治疗药物的开发需要进行全面的遗传毒性、生殖毒性和慢性毒性研究。
|
| 参考文献 |
[1]. Buckley DL, et al. HaloPROTACS: Use of Small Molecule PROTACs to Induce Degradation of HaloTag Fusion Proteins. ACS Chem Biol. 2015 Aug 21;10(8):1831-7.
|
| 其他信息 |
VL285 苯酚是一种研究级化学探针，用于研究 CDO1 生物学和 VHL 介导的蛋白质降解。它是一种分子胶降解剂，其作用机制不同于经典的二价 PROTAC，因为它无需单独的连接结构即可稳定三元复合物。该化合物含有一个酚基，可能有助于与 CDO1 形成氢键相互作用。VL285 苯酚并非 FDA 批准的药物，不适用于人体。它可作为参考标准，用于研究 CDO1 在半胱氨酸代谢、氧化应激以及癌症和代谢紊乱等疾病中的作用。该化合物以粉末形式储存于 -20℃，可溶于 DMSO（10 mM）。其结构和降解应用方面的专利申请已提交。
|
| 分子式 |
C29H32N4O5S
|
|---|---|
| 分子量 |
548.653185844421
|
| 精确质量 |
548.209
|
| CAS号 |
1448188-69-9
|
| PubChem CID |
89690874
|
| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
|
| LogP |
3.5
|
| tPSA |
151
|
| 氢键供体(HBD)数目 |
3
|
| 氢键受体(HBA)数目 |
7
|
| 可旋转键数目(RBC) |
7
|
| 重原子数目 |
39
|
| 分子复杂度/Complexity |
920
|
| 定义原子立体中心数目 |
3
|
| SMILES |
CC1=C(SC=N1)C2=CC(=C(C=C2)CNC(=O)[C@@H]3C[C@H](CN3C(=O)[C@H](C(C)C)N4CC5=CC=CC=C5C4=O)O)O
|
| InChi Key |
KNZQRBRUYSXXRG-VTZPFEBOSA-N
|
| InChi Code |
InChI=1S/C29H32N4O5S/c1-16(2)25(33-13-20-6-4-5-7-22(20)28(33)37)29(38)32-14-21(34)11-23(32)27(36)30-12-19-9-8-18(10-24(19)35)26-17(3)31-15-39-26/h4-10,15-16,21,23,25,34-35H,11-14H2,1-3H3,(H,30,36)/t21-,23+,25+/m1/s1
|
| 化学名 |
(2S,4R)-4-hydroxy-N-[[2-hydroxy-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2S)-3-methyl-2-(3-oxo-1H-isoindol-2-yl)butanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide
|
| HS Tariff Code |
2934.99.9001
|
| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
|
| 溶解度 (体外实验) |
DMSO: 100 mg/mL (182.27 mM)
|
|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.8227 mL | 9.1133 mL | 18.2266 mL | |
| 5 mM | 0.3645 mL | 1.8227 mL | 3.6453 mL | |
| 10 mM | 0.1823 mL | 0.9113 mL | 1.8227 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
Lalistat 2
D-(-)-3-Phosphoglyceric acid disodium (3-Phospho-D-glyceric acid disodium)
STC-15
TSR-033
InvivoChem的所有产品仅用于作科学研究，不面向患者销售
Copyright 2020 InvivoChem LLC | All Rights Reserved 粤ICP备20063088号-1
粤公网安备 44011102003439号
463611831
