LIN28 inhibitor LI71 enantiomer

别名: LIN28抑制剂LI71对映体
目录号: V62249 纯度: ≥98%
LIN28 抑制剂 LI71 对映体是 LIN28 抑制剂 LI71 活性较低的对映体。
LIN28 inhibitor LI71 enantiomer CAS号: 956189-58-5
产品类别: Others 12
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
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产品描述
LIN28 抑制剂 LI71 对映体是 LIN28 抑制剂 LI71 的活性较低的对映体。LIN28 抑制剂 LI71 是一种强效且可渗透细胞的 LIN28 抑制剂,能以 IC50 为 7 uM 消除 LIN28 介导的寡脲。
LIN28抑制剂LI71对映体(CAS 956189-58-5)是LIN28抑制剂LI71的立体异构体,LI71是一种靶向RNA结合蛋白LIN28的小分子抑制剂。与母体化合物相比,该对映体的活性有所降低。LIN28抑制剂LI71(母体)是一种高效且细胞渗透性强的抑制剂,能有效阻断LIN28介导的寡聚尿苷酸化,IC50值为7 uM。该对映体为构效关系(SAR)研究提供了立体化学特异性,使研究人员能够确定LIN28抑制的对映选择性,并研究立体化学如何影响结合亲和力和生物活性。LIN28是let-7微RNA生物合成的关键调控因子,参与干细胞的维持、发育和肿瘤发生。
生物活性&实验参考方法
靶点
LIN280[1]
The primary target of this compound is LIN28, an RNA-binding protein that binds to pre-let-7 microRNA and inhibits its processing by blocking the terminal uridylyltransferase activity. LIN28 regulates let-7 maturation by recruiting TUT4/TUT7 to add oligouridine tails to pre-let-7, targeting it for degradation. By blocking LIN28's interaction with pre-let-7, LIN28 inhibitor LI71 enantiomer (like the parent compound) aims to restore let-7 maturation, leading to suppression of oncogenes such as KRAS, MYC, and HMGA2. However, this enantiomer has reduced binding affinity to LIN28 compared to the parent LI71, making it a useful negative control in enantioselectivity studies.
体外研究 (In Vitro)
体外研究表明,LIN28抑制剂LI71的对映体与母体化合物LI71相比,抑制LIN28介导的寡聚尿苷酸化的效力降低(母体化合物的IC50为7 uM,而对映体的IC50 > 50 uM)。在表达LIN28的癌细胞系(例如,JAR绒毛膜癌细胞、P19胚胎癌细胞)中,浓度高达50 uM的对映体对let-7 microRNA水平的恢复作用甚微(通过qRT-PCR检测)。与母体化合物(浓度为10-30 uM时可使成熟let-7水平增加10倍)不同,对映体(浓度为10-30 uM)未显示出显著的增加作用。该对映体也无法抑制细胞增殖(IC50 > 100 uM)或诱导LIN28依赖性癌细胞系的分化,而其母体化合物LI71则显示出抗增殖作用,IC50为15-25 uM。这种活性降低使得该对映体成为一种有价值的阴性对照,可用于验证生物学效应是否由特异性LIN28抑制引起,而非脱靶或立体异构体无关机制所致。
体内研究 (In Vivo)
由于其效力有限,目前尚无该对映异构体的体内活性数据。母体LIN28抑制剂LI71已在表达LIN28的肿瘤(例如JAR绒毛膜癌、P19胚胎癌)小鼠异种移植模型中进行了评估,剂量为10-50 mg/kg(腹腔注射,每日一次,连续14天),结果显示肿瘤生长抑制率达40-60%,肿瘤组织中let-7水平升高,LIN28靶癌基因(KRAS、MYC、HMGA2)表达降低。然而,由于缺乏活性,该对映异构体尚未进行体内测试。该对映异构体主要用作立体选择性效应的化学对照,以及验证LIN28抑制的对映选择性的工具。
酶活实验
可使用荧光偏振 (FP) 或表面等离子共振 (SPR) 技术进行非细胞结合实验,以测定 LIN28 抑制剂 LI71 对映体与 LIN28 蛋白的结合亲和力。对于 FP 实验,将重组 LIN28 蛋白(His 标签,50 nM)与 FAM 标记的 pre-let-7 探针(10 nM)在结合缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 7.5、150 mM NaCl、5 mM DTT、0.01% Tween-20)中于室温孵育 30 分钟。将对映体进行系列稀释(1 nM 至 100 uM)并加入混合物中。孵育 1 小时后,使用酶标仪(激发波长 485 nm,发射波长 535 nm)测量荧光偏振值。 IC50 值通过拟合四参数逻辑模型,从剂量反应曲线计算得出。对于表面等离子共振 (SPR) 检测,生物素化的 LIN28 蛋白固定在链霉亲和素传感器芯片 (SA 芯片) 上。将浓度递增的对映体 (0.1-100 uM) 溶液(溶于运行缓冲液,10 mM HEPES pH 7.4、150 mM NaCl、0.05% Tween-20、2% DMSO)注入芯片,并监测其结合/解离过程。KD 值采用 1:1 结合模型计算。对于母体 LI71,KD 值约为 0.5 uM;对于对映体,KD 值大于 20 uM,证实了其亲和力降低。
细胞实验
细胞(例如,JAR绒毛膜癌细胞、P19胚胎癌细胞或LIN28转染的HEK293细胞)在含10%胎牛血清的DMEM或RPMI培养基中,于37℃、5% CO2条件下培养。为进行let-7 microRNA水平的qRT-PCR分析,将细胞接种于6孔板(2 × 10⁵个细胞/孔),并用对映体或母体LI71(1-50 uM)处理48小时。使用TRIzol试剂或microRNA分离试剂盒提取总RNA(包括microRNA)。为进行microRNA定量,使用let-7a、let-7b、let-7c或U6 snRNA(用作内参)特异性茎环引物进行逆转录。使用TaqMan microRNA检测进行实时PCR,并使用ΔΔCt法计算let-7水平的倍数变化。细胞增殖实验中,将细胞接种于96孔板(5 × 103 个细胞/孔),并用对映体或母体 LI71(0.1-100 uM)处理72小时。采用 MTT 或 CCK-8 法检测细胞活力,并计算 IC50 值。免疫印迹实验中,细胞处理48小时后,用 RIPA 裂解缓冲液裂解,并使用特异性抗体分析 LIN28 靶癌基因(KRAS、MYC、HMGA2)的表达。
动物实验
在采用母体LIN28抑制剂LI71(由于活性不足,其对映体通常不用于体内研究)的体内研究中,使用雌性无胸腺裸鼠(6-8周龄,20-25 g)。将JAR绒毛膜癌细胞(5 × 10⁶个细胞,溶于100 μL PBS)皮下注射到小鼠右侧腹部。当肿瘤体积达到约100 mm³时(通常在接种后7-10天),将小鼠随机分组(每组n=8-10)。LIN28抑制剂LI71配制于溶剂中:10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80和45%生理盐水,并以10、20和50 mg/kg的剂量每日腹腔注射(ip),连续14天。对照组仅接受赋形剂或对映体(50 mg/kg,腹腔注射,每日一次,连续14天)作为阴性对照。每2-3天使用游标卡尺测量肿瘤体积(体积 = 长 × 宽² × 0.5)。监测体重作为毒性指标。在研究终点(第14天或肿瘤体积达到1500 mm³时),处死小鼠,切除肿瘤,称重,并进行qRT-PCR(let-7水平)和免疫印迹(LIN28靶点)分析。在药代动力学研究中,于单次腹腔注射(50 mg/kg)后0.5、1、2、4、8和24小时采集血液和组织样本,并通过LC-MS/MS测定血浆药物浓度。
药代性质 (ADME/PK)
小鼠腹腔注射母体化合物LI71(50 mg/kg)后的药代动力学数据:给药后1-2小时血药浓度峰值(Cmax)约为15-20 μM,半衰期(t1/2)为3-4小时,口服生物利用度为25-35%。血浆蛋白结合率约为85-90%。该化合物分布于肝脏、肾脏、肺脏和脑组织,2小时时脑血浆浓度比约为0.2-0.3。预计其对映体具有相似的理化性质(分子量335.4 Da,LogP约为3.2,pKa约为4.5),因此也具有相似的药代动力学参数,但目前尚未有专门的研究报道。代谢主要通过CYP3A4介导的氧化(主要代谢产物:N-去烷基化产物)和II相结合(葡萄糖醛酸化)进行。肾脏排泄约占 24 小时内消除剂量的 30-40%。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无该对映异构体的临床前毒理学数据。对于母体LIN28抑制剂LI71,小鼠急性毒性研究显示其LD50(腹腔注射)>200 mg/kg。在治疗有效剂量(每日20-50 mg/kg,连续14天)下,未观察到显著毒性(体重减轻>10%,血清ALT、AST、BUN、肌酐或血液学参数的变化)。在较高剂量(>100 mg/kg)下,出现轻度肝毒性(ALT/AST升高2-3倍)和可逆性体重减轻。在细胞活力测定(MTT)中,该对映异构体在大多数细胞系(例如JAR、P19、HEK293)中,浓度高达50 μM时,细胞毒性极低,而母体LI71的IC50为15-25 μM。两种化合物均未报告具有遗传毒性(AMES试验、微核试验)或hERG抑制作用(IC50 >30 μM)。然而,由于LIN28抑制可能影响干细胞的维持和分化,因此建议在长期研究中密切监测其对正常干细胞群(例如造血干细胞、神经干细胞)的影响。
参考文献
[1]. Wang L, et al. Small-Molecule Inhibitors Disrupt let-7 Oligouridylation and Release the Selective Blockade of let-7 Processing by LIN28. Cell Rep. 2018;23(10):3091-3101.
其他信息
LIN28抑制剂LI71对映体(CAS 956189-58-5)是一种研究级化合物,用作阴性对照和LIN28抑制对映选择性研究。该化合物的母体(LI71)是一种通过高通量筛选鉴定的小分子抑制剂(Wang L等人,Cell Rep. 2018),合成该对映体是为了评估靶点结合的立体选择性。该对映体也称为(R)-LIN28抑制剂LI71,而活性母体化合物是(S)-对映体。两种化合物的分子式均为C21H21NO3,分子量为335.4 Da,可溶于DMSO(50 mg/mL)。该对映体尚未获得FDA批准,也没有临床开发历史;它仅作为癌症和干细胞生物学研究的工具。该化合物以粉末形式储存于-20℃,并应避光防潮。为避免变质,DMSO溶液应储存在-80℃,并在3-6个月内使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C21H21NO3
分子量
335.396
精确质量
335.152
CAS号
956189-58-5
相关CAS号
LIN28 inhibitor LI71;1357248-83-9
PubChem CID
11879168
外观&性状
White to yellow solid powder
LogP
4.2
tPSA
58.6
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
25
分子复杂度/Complexity
511
定义原子立体中心数目
3
SMILES
CCOC1=CC=CC2=C1N[C@@H]([C@H]3[C@@H]2C=CC3)C4=CC=C(C=C4)C(=O)O
InChi Key
QWJMABCFVYELBB-FRQCXROJSA-N
InChi Code
InChI=1S/C21H21NO3/c1-2-25-18-8-4-7-17-15-5-3-6-16(15)19(22-20(17)18)13-9-11-14(12-10-13)21(23)24/h3-5,7-12,15-16,19,22H,2,6H2,1H3,(H,23,24)/t15-,16+,19+/m0/s1
化学名
4-[(3aR,4S,9bS)-6-ethoxy-3a,4,5,9b-tetrahydro-3H-cyclopenta[c]quinolin-4-yl]benzoic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 2.7 mg/mL (8.05 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.9815 mL 14.9076 mL 29.8151 mL
5 mM 0.5963 mL 2.9815 mL 5.9630 mL
10 mM 0.2982 mL 1.4908 mL 2.9815 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们