| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
Kd: 89 uM (TDP-43102–269)[1]
rTRD01 targets TDP-43 (TAR DNA-binding protein 43), a protein involved in RNA processing and metabolism that is implicated in neurodegenerative diseases including amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and frontotemporal dementia (FTD). The compound binds to TDP-43's RRM1 and RRM2 domains with a Kd of 89 µM for TDP-43102-269. By binding to these RNA recognition motifs, rTRD01 partially disrupts TDP-43's interaction with the hexanucleotide RNA repeat of the disease-linked c9orf72 gene. This disruption provides a basis for studying RNA-binding dysregulation mechanisms in neurodegenerative diseases. |
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| 体外研究 (In Vitro) |
体外研究表明，rTRD01 能与 TDP-43 的 RRM1 和 RRM2 结构域结合，对 TDP-43102-269 的解离常数 (Kd) 为 89 µM。该化合物能部分破坏 TDP-43 与致病基因 c9orf72 的六核苷酸 RNA 重复序列的相互作用。这些体外研究结果支持其在神经退行性疾病研究中的应用潜力。该化合物与 TDP-43 的结合为研究 TDP-43 在 RNA 代谢和神经退行性疾病中的作用提供了一种工具。
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| 体内研究 (In Vivo) |
由于rTRD01主要用作体外研究的工具，因此其体内研究较为有限。rTRD01能够结合TDP-43并破坏RNA相互作用，这提示其在ALS和FTD等神经退行性疾病动物模型中具有潜在的体内评估价值。然而，目前文献中缺乏针对rTRD01的全面体内药理学研究。该化合物仅供研究使用，不得用于人类治疗。
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| 酶活实验 |
rTRD01 的体外结合实验通常包括测试其与 TDP-43 的结合亲和力。结合亲和力可通过表面等离子共振、等温滴定量热法或荧光偏振法测定。该化合物对 TDP-43102-269 的解离常数 (Kd) 为 89 µM。该化合物破坏 TDP-43 与 RNA 相互作用的能力可通过电泳迁移率变动分析或 RNA 免疫沉淀法进行评估。该化合物的纯度和鉴定则通过核磁共振波谱、高效液相色谱和质谱等分析化学方法进行。所有实验均设置了相应的对照。
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| 细胞实验 |
rTRD01 的体外细胞实验包括培养神经元细胞，以评估其对 TDP-43 功能和 RNA 结合的影响。细胞用不同浓度的化合物处理，并评估 TDP-43 与 RNA 的相互作用。使用免疫荧光显微镜监测 TDP-43 的定位和聚集情况。采用 MTT 或类似的比色法评估细胞活力。通过定量 PCR 或 RNA 测序评估化合物对 RNA 代谢和基因表达的影响。所有实验均重复三次，并设置适当的对照，以确保统计学可靠性。
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| 动物实验 |
为评估rTRD01在神经退行性疾病研究中的潜力，将开展体内动物实验。实验将采用ALS或FTD动物模型。实验中，将给动物注射化合物并评估其神经功能。评估的参数包括运动功能、生存期、TDP-43病理以及神经退行性标志物。实验将设置仅注射溶剂的对照组进行比较。所有实验程序均将符合机构动物护理和使用委员会的指导原则。目前文献中缺乏全面的体内研究记录。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
rTRD01的药代动力学特性反映了其作为小分子TDP-43配体的特征。其分子量为344.38，分子式为C18H21FN4O2。该化合物可溶于DMSO，HPLC纯度为98%。作为一种小分子，它可以穿过生物膜，包括潜在的血脑屏障。预计该化合物将在肝脏中通过标准的异生物质代谢途径进行代谢。完整的药代动力学分析，包括半衰期、清除率、分布容积和生物利用度，还需要进一步的系统研究。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
rTRD01 的毒性特征已在其作为研究用化学品的背景下进行了评估。作为一种 TDP-43 配体，它可能具有一些生物学效应，应仔细评估。使用纯化合物时，建议采取适当的操作规程，包括使用个人防护装备。该化合物尚未获准用于人体治疗，仅供研究用途。需要进行长期毒性研究才能充分确定其在药物应用中的安全性。
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| 参考文献 |
[1]. François-Moutal L, et al. Small Molecule Targeting TDP-43's RNA Recognition Motifs Reduces Locomotor Defects in a Drosophila Model of Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS). ACS Chem Biol. 2019 Sep 20;14(9):2006-2013.
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| 其他信息 |
6-(3-(4-氟苄基)-3-(羟甲基)哌啶-1-基)吡嗪-2-甲酰胺是一种有机分子实体。
rTRD01（CAS# 1332175-56-0）是一种小分子TDP-43配体，分子式为C18H21FN4O2，分子量为344.38。它也被称为6-[3-(4-氟苄基)-3-(羟甲基)哌啶-1-基]吡嗪-2-甲酰胺，能与TDP-43的RRM1和RRM2结构域结合，对TDP-43102-269的解离常数Kd为89 µM。rTRD01能部分破坏TDP-43与c9orf72基因六核苷酸RNA重复序列的相互作用。该化合物具有用于神经退行性疾病研究的潜力。经高效液相色谱法（HPLC）测定，该化合物纯度为98%，且可溶于二甲基亚砜（DMSO）。本品仅供研究使用。 |
| 分子式 |
C18H21FN4O2
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|---|---|
| 分子量 |
344.38
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| 精确质量 |
344.164
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| CAS号 |
1332175-56-0
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| PubChem CID |
56739767
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| 外观&性状 |
Light yellow to yellow solid powder
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| 密度 |
1.292±0.06 g/cm3
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| 沸点 |
559.7±50.0 °C
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| LogP |
1.4
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| tPSA |
92.3
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
|
| 氢键受体(HBA)数目 |
6
|
| 可旋转键数目(RBC) |
5
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| 重原子数目 |
25
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| 分子复杂度/Complexity |
458
|
| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
C1(C(N)=O)=NC(N2CCCC(CC3=CC=C(F)C=C3)(CO)C2)=CN=C1
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| InChi Key |
MCTLSQYQBQKNRU-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C18H21FN4O2/c19-14-4-2-13(3-5-14)8-18(12-24)6-1-7-23(11-18)16-10-21-9-15(22-16)17(20)25/h2-5,9-10,24H,1,6-8,11-12H2,(H2,20,25)
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| 化学名 |
6-[3-[(4-fluorophenyl)methyl]-3-(hydroxymethyl)piperidin-1-yl]pyrazine-2-carboxamide
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO: 250 mg/mL (725.94 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.9038 mL | 14.5188 mL | 29.0377 mL | |
| 5 mM | 0.5808 mL | 2.9038 mL | 5.8075 mL | |
| 10 mM | 0.2904 mL | 1.4519 mL | 2.9038 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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