Cucurbit[8]uril (cucurbit[8]uril; cucurbit[8]uril)

别名: 葫芦[8]脲;葫芦脲[8]
目录号: V64485 纯度: ≥98%
Cucurbit[8]uril 是一种高效、低毒、口服生物活性的蛋白质异二聚化超分子诱导剂。
Cucurbit[8]uril (cucurbit[8]uril; cucurbit[8]uril) CAS号: 259886-51-6
产品类别: Others 12
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产品描述
葫芦脲[8]是一种高效、低毒、口服具有生物活性的蛋白质异二聚体超分子诱导剂。葫芦脲[8]可诱导甲基紫精和萘功能化蛋白质的异二聚化,并诱导能量转移。
葫芦脲[8] (CB[8]) 是一种大环主体分子,由八个乙二脲单元通过亚甲基桥连接而成,分子式为C48H48N32O16,分子量为1329.1 g/mol。它具有一个大的、高度疏水的空腔,能够包裹阳离子和芳香族底物。CB[8]是一种强效、低毒、口服具有生物活性的蛋白质异二聚体超分子诱导剂,可用于纳米酶催化、分子识别和超分子组装等领域。
生物活性&实验参考方法
靶点
Protein Heterodimerization[1]
The primary targets of cucurbit[8]uril are not traditional biological receptors but rather guest molecules that can be encapsulated within its cavity. It induces heterodimerization of methylviologen (MV) and naphthalene (NP) functionalized proteins. The compound forms stable ternary complexes with MV and NP, enabling selective protein heterodimerization. It can also induce energy transfer between proteins.
体外研究 (In Vitro)
葫芦脲[8](0~20 μM;48 小时;CHO-K1 细胞)可使细胞相对存活率略微下降至 86%[2]。葫芦脲[8]确实能特异性地诱导 MV-eYFP 与 Np-eCFP 形成异二聚体。由于葫芦脲[8]诱导蛋白质间发生高能量转移,因此只有当三种超分子组分都存在时,三元复合物才能形成。葫芦脲[8]可抑制甲基紫精诱导的非特异性蛋白质组装。此外,利用葫芦脲[8]三元体系与甲基紫精 (MV) 和萘 (NP) 也能成功形成疏水性更强的蛋白质的选择性异二聚体。为了防止MV诱导的与疏水性蛋白表面的非特异性二聚化,必须存在葫芦脲[8]作为宿主分子[1]。体外研究表明,在CHO-K1细胞中,葫芦脲[8](0-20 μM;48小时)可使细胞相对存活率略微下降至86%。该化合物可诱导MV-eYFP与Np-eCFP蛋白的异二聚化。在葫芦脲[8]存在的情况下,甲基紫精诱导的非特异性蛋白组装受到抑制。葫芦脲[8]与MV和NP的三元体系可成功用于形成疏水性蛋白的选择性异二聚体。
体内研究 (In Vivo)
对小鼠的口服给药研究也表明,葫芦脲[8]在体内静脉注射给药时毒性极低[2]。
小鼠体内研究表明,葫芦脲[8]在静脉注射和口服给药后均具有极低的毒性。该化合物可作为蛋白质异二聚化的超分子诱导剂口服发挥作用。其低毒性和良好的口服生物利用度使其成为药物递送应用的理想候选药物。需要进一步的体内研究来全面表征其药代动力学和药效学特性。
酶活实验
葫芦脲[8]的非细胞分析通常涉及利用紫外-可见光谱、荧光光谱和核磁共振光谱等光谱技术进行主客体化学研究。这些分析方法测定了葫芦脲[8]与各种客体分子(包括阳离子和芳香族底物)的结合亲和力和化学计量比。等温滴定量热法(ITC)用于测定包合物形成的热力学参数。这些无细胞体系能够精确表征该化合物的分子识别特性。
细胞实验
细胞活力测定[1]
细胞类型: CHO-K1 细胞
测试浓度: 0~20 μM
孵育时间: 48 小时
实验结果: 在最高研究浓度 20 μM 下孵育 48 小时后,相对细胞活力略微下降至 86%。
使用 CHO-K1 细胞进行葫芦脲[8]的细胞毒性测定。将细胞用浓度高达 20 μM 的葫芦脲[8]处理 48 小时,并使用 MTT 或类似方法测定细胞活力。在表达 MV 和 NP 功能化荧光蛋白(例如 eYFP 和 eCFP)的细胞中进行蛋白质异二聚化研究,并使用 FRET 或荧光显微镜测量能量转移。
动物实验
为了评估葫芦脲[8]的毒性,已在小鼠体内开展了动物实验。该化合物通过静脉注射或灌胃给药,并监测动物的毒性反应、体重减轻和行为改变。可采集组织样本进行组织病理学检查。这些研究表明,葫芦脲[8]在体内具有极低的毒性。
药代性质 (ADME/PK)
葫芦脲[8]的药代动力学数据有限,但提示该化合物具有口服活性。应在4°C避光氮气保护下保存。原液可在-20°C以下保存数月。该化合物通常在室温或蓝冰条件下运输。其较大的分子量(1329.1 g/mol)和亲水性表明其膜渗透性有限,但已证实其具有口服活性。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
毒理学研究表明,葫芦脲[8]的毒性极低。在CHO-K1细胞中,浓度高达20 μM的葫芦脲处理48小时后,细胞活力仅略微下降至86%。小鼠体内研究表明,静脉注射和口服给药后,葫芦脲[8]的毒性均较低。在所测试的剂量范围内,未报告任何显著的不良反应。
参考文献

[1]. Cucurbit[8]uril induced heterodimerization of methylviologen and naphthalene functionalized proteins. Chem Commun (Camb). 2011;47(24):6798-6800.

[2]. Toxicity of cucurbit[7]uril and cucurbit[8]uril: an exploratory in vitro and in vivo study. Org Biomol Chem. 2010;8(9):2037-2042.

其他信息
葫芦脲[8]是一种葫芦脲类化合物。
其他信息包括该化合物在药物递送、纳米酶催化、分子识别和超分子组装中的应用。它具有一个大的、高度疏水的空腔,可以包裹阳离子和芳香族底物。CB[8]可诱导甲基紫精和萘功能化蛋白的异二聚化。由于其能够以高亲和力选择性地结合各种药物和生物分子靶点,因此在靶向药物递送方面具有潜在的应用价值。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C48H48N32O16
分子量
1329.10
精确质量
1328.39
CAS号
259886-51-6
PubChem CID
16133299
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
2.71
LogP
-9.1
tPSA
376.8
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
16
可旋转键数目(RBC)
0
重原子数目
96
分子复杂度/Complexity
2960
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1N2C3C4N(C2=O)CN5C6C7N(C5=O)CN8C9C2N(C8=O)CN5C8C%10N(C5=O)CN5C%11C%12N(C5=O)CN5C%13C%14N(C5=O)CN5C%15C%16N(C5=O)CN5C%17C(N1C5=O)N1CN3C(=O)N4CN6C(=O)N7CN9C(=O)N2CN8C(=O)N%10CN%11C(=O)N%12CN%13C(=O)N%14CN%15C(=O)N%16CN%17C1=O
InChi Key
CONWISUOKHSUDR-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C48H48N32O16/c81-33-49-1-50-18-20-54(34(50)82)4-58-22-24-62(38(58)86)8-66-26-28-70(42(66)90)12-74-30-32-78(46(74)94)15-77-31-29-73(45(77)93)11-69-27-25-65(41(69)89)7-61-23-21-57(37(61)85)3-53(33)19-17(49)51-2-52(18)36(84)56(20)6-60(22)40(88)64(24)10-68(26)44(92)72(28)14-76(30)48(96)80(32)16-79(31)47(95)75(29)13-71(27)43(91)67(25)9-63(23)39(87)59(21)5-55(19)35(51)83/h17-32H,1-16H2
化学名
3,5,8,10,13,15,18,20,23,25,28,30,33,35,38,40,41,43,45,47,51,53,55,57,59,61,63,65,67,69,71,73-dotriacontazapentacosacyclo[35.3.3.36,7.311,12.316,17.321,22.326,27.331,32.22,41.236,43.13,40.15,8.110,13.115,18.120,23.125,28.130,33.135,38.145,51.147,73.153,55.157,59.161,63.165,67.169,71]octacontane-44,46,48,49,50,52,54,56,58,60,62,64,66,68,70,72-hexadecone
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: < 1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 0.7524 mL 3.7619 mL 7.5239 mL
5 mM 0.1505 mL 0.7524 mL 1.5048 mL
10 mM 0.0752 mL 0.3762 mL 0.7524 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们