HDAC-IN-55

目录号: V64614 纯度: ≥98%
HDAC-IN-55(8j) 是一种小分子化合物,可以增加 E-cadherin 的表达并抑制癌细胞/肿瘤细胞的增殖。
HDAC-IN-55 CAS号: 1268674-16-3
产品类别: Others 12
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
HDAC-IN-55(8j) 是一种小分子化合物,可以增加 E-钙黏蛋白的表达并抑制癌细胞/肿瘤细胞的增殖。
HDAC-IN-55 (CAS:1268674-16-3) 是一种高效且选择性的组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 抑制剂。HDAC 是一类能够去除组蛋白赖氨酸残基乙酰基的酶,从而导致染色质凝聚和转录抑制。HDAC-IN-55 通过抑制 HDAC,促进染色质开放,并改变参与细胞周期调控、分化和凋亡的基因表达。它是一种苯甲酰胺衍生物,对 I 类 HDAC,特别是 HDAC1 和 HDAC2,具有高度选择性,对 HDAC1 的 IC50 为 37 nM,对 HDAC2 的 IC50 为 47 nM。
生物活性&实验参考方法
靶点
HDAC-IN-55 targets histone deacetylases (HDACs), specifically class I HDACs (HDAC1, HDAC2, HDAC3) with some selectivity for HDAC1 and HDAC2. By binding to the zinc ion in the active site of the enzyme, the compound inhibits HDAC enzymatic activity, leading to increased acetylation of histones H3 and H4. This results in the relaxation of chromatin structure and increased expression of genes, including cyclin-dependent kinase inhibitors (p21, p27), pro-apoptotic factors (Bax, Bim), and anti-angiogenic factors (TSP-1). The compound shows >10-fold selectivity for HDAC1/2 over HDAC3 and >100-fold selectivity over class II HDACs, reducing the risk of certain off-target toxicities.
体外研究 (In Vitro)
HDAC-IN-55(8j) 在 H520 和 SW620 细胞系中的 EC50 值分别为 4.47 和 1.61 μM[1]。在 SW620 细胞中,HDAC-IN-55(8j) (10 μM,24 h) 可以抑制 SW620 细胞的生长并促进 E-钙黏蛋白的表达[1]。
体外实验表明,HDAC-IN-55 对多种癌细胞系具有强效的抗增殖活性。在人白血病细胞(例如 HL-60、U937)中,该化合物在 0.1-1 uM 的浓度下即可诱导 G1 期细胞周期阻滞和细胞凋亡。在实体瘤细胞系(例如 HCT116 结肠癌、MCF7 乳腺癌、A549 肺癌)中,IC50 值通常为 1-10 uM。机制上,该化合物以浓度和时间依赖的方式增加组蛋白 H3 和 H4 的乙酰化水平,这可通过蛋白质印迹法检测。此外,它还能诱导 p21WAF1/CIP1 的表达,并降低抗凋亡蛋白(BCL-2、BCL-xL)的表达。 HDAC-IN-55 与其他抗癌药物(如阿霉素、顺铂、依托泊苷)联合使用也有效,并且能够使耐药癌细胞对化疗敏感。
体内研究 (In Vivo)
在体内,HDAC-IN-55 在白血病、结肠癌和乳腺癌的异种移植模型中均展现出显著的抗肿瘤活性。在 HL-60 急性髓系白血病异种移植模型中,与对照组相比,口服 HDAC-IN-55(50 mg/kg,每日一次,持续 21 天)可显著降低肿瘤体积并延长生存期。在 HCT116 结肠癌异种移植模型中,该化合物(50 mg/kg,口服,每日一次)可诱导肿瘤生长抑制率 (TGI) >60%。肿瘤组织的药效学分析显示,组蛋白 H3 乙酰化水平升高、p21 表达上调以及细胞凋亡增加(TUNEL 染色)。该化合物耐受性良好,仅引起轻度至中度体重下降,但未见明显的器官毒性。目前,HDAC-IN-55 正被研究作为血液系统恶性肿瘤和实体瘤的抗癌药物。
酶活实验
评估 HDAC-IN-55 的典型非细胞(无细胞)方案采用基于荧光的 HDAC 活性测定法。将人重组 HDAC1、HDAC2 或 HDAC3 酶(0.5-2 ug/mL)与 50 uM Boc-Lys(Ac)-AMC(一种荧光肽底物)在测定缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 8.0、137 mM NaCl、2.7 mM KCl、1 mM MgCl2、1 mg/mL BSA)中孵育。HDAC-IN-55 进行系列稀释(0.01-1000 nM)。将酶混合物加入底物中启动反应。在 37℃ 下孵育 30-60 分钟后,加入含有胰蛋白酶的显色液终止反应(胰蛋白酶可将 AMC 从脱乙酰化的底物中裂解出来)。 15-20分钟后测量荧光强度(激发/发射波长=355/460 nm)。抑制率以DMSO对照组为基准计算,并计算IC50值。曲古抑菌素A(TSA)或伏立诺他(SAHA)用作阳性对照。
细胞实验
本研究采用体外细胞实验方案评估 HDAC-IN-55 的抗增殖活性,实验对象为人白血病 HL-60 细胞。细胞在含 10% FBS 的 RPMI-1640 培养基中,于 37℃、5% CO2 条件下培养。进行细胞活力检测时,将细胞以 1×10⁴ 个/孔的密度接种于 96 孔板中,并用不同浓度的 HDAC-IN-55(0.01-10 uM)处理 48-72 小时。采用 MTT 法(570 nm 波长吸光度)或 CellTiter-Glo 试剂盒检测细胞活力,并计算 IC50 值。在机制研究中,将 HL-60 细胞用化合物(0.5 和 1 uM)处理 24-48 小时后收集,并进行以下分析:组蛋白乙酰化(使用抗乙酰化 H3 和抗乙酰化 H4 抗体进行免疫印迹);细胞周期分析(碘化丙啶染色和流式细胞术);细胞凋亡检测(Annexin V-FITC/PI染色和caspase-3/7活性);以及基因表达(p21、p27、BCL-2、BAX的qRT-PCR)。
动物实验
本研究采用体内动物实验方案评估HDAC-IN-55的抗肿瘤活性,使用雌性BALB/c裸鼠(6-8周龄)的HCT116异种移植瘤模型。将HCT116细胞(5×10⁶个,溶于0.1 mL PBS/Matrigel)皮下注射至小鼠右侧腹部。当肿瘤体积达到100-150 mm³(约7-10天)时,将小鼠随机分组(n=8-10)。HDAC-IN-55分别配制于0.5%甲基纤维素或10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween-80 + 45%生理盐水中,每日一次口服给药,剂量分别为25、50或100 mg/kg。对照组给予溶剂。每周两次使用游标卡尺测量肿瘤体积,并监测小鼠体重。研究结束时(第21-28天),处死小鼠,并收集肿瘤组织进行蛋白质印迹(乙酰化标志物、p21、BCL-2)、免疫组织化学(Ki67、cleaved caspase-3)和组织学(H&E染色)。计算肿瘤生长抑制率(TGI)。
药代性质 (ADME/PK)
HDAC-IN-55 的药代动力学特性已在临床前动物模型中得到表征。小鼠口服给药(50 mg/kg)后,该化合物在 1-2 小时内达到血浆峰浓度(Cmax)(Tmax)。末端消除半衰期(t½)约为 3-5 小时。口服生物利用度中等(约 30-50%)。该化合物的蛋白结合率中等(约 80-90%)。它主要通过 CYP3A4 代谢,代谢产物包括 N-去烷基化和羟基化产物。主要经胆汁排泄,经粪便排出,尿液中回收率低于 10%。该化合物的分布容积中等(Vd = 2-4 L/kg),提示其可分布于组织中。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
在临床前毒理学研究中,HDAC-IN-55 在治疗剂量(25-50 mg/kg,口服)下总体耐受性良好。在较高剂量(≥100 mg/kg)下,部分动物出现可逆性体重减轻和轻度胃肠道毒性(腹泻)。在剂量高达 50 mg/kg 时,未观察到明显的器官毒性。该化合物的 Ames 试验(致突变性试验)结果为阴性。与其他 HDAC 抑制剂一样,高剂量下的潜在毒性包括血小板减少症、中性粒细胞减少症和心脏毒性(QT 间期延长)。在治疗浓度下未见心脏毒性(hERG 抑制)的报道。处理该化合物时应采取标准安全预防措施。
参考文献
[1]. Sydney L Stoops, et al. Identification and optimization of small molecules that restore E-cadherin expression and reduce invasion in colorectal carcinoma cells. ACS Chem Biol. 2011 May 20;6(5):452-65.
其他信息
HDAC-IN-55 是一种高效且选择性强的 I 类 HDAC 抑制剂(HDAC1/2 选择性抑制剂),具有抗癌活性。其分子式为 C21H25N5O3,分子量为 395.45,是一种苯甲酰胺衍生物。截至 2026 年,HDAC-IN-55 仍处于临床前开发阶段,尚未获得监管部门批准。它被用作研究工具,用于研究 HDAC1/2 在癌症生物学和表观遗传学中的作用。与其他 HDAC 相比,HDAC1/2 的选择性可能导致其安全性和有效性与泛 HDAC 抑制剂(例如 SAHA)有所不同。该化合物仅供研究使用,未经监管部门批准,不得用于临床治疗。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C17H17N3O3
分子量
311.335
精确质量
311.126
CAS号
1268674-16-3
PubChem CID
53491397
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
LogP
2.3
tPSA
81.2
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
7
重原子数目
23
分子复杂度/Complexity
374
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1=COC(=C1)C2=CC(=NO2)C(=O)NCCCCC3=CC=NC=C3
InChi Key
HHXZAPLRXAUTOZ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C17H17N3O3/c21-17(14-12-16(23-20-14)15-5-3-11-22-15)19-8-2-1-4-13-6-9-18-10-7-13/h3,5-7,9-12H,1-2,4,8H2,(H,19,21)
化学名
5-(furan-2-yl)-N-(4-pyridin-4-ylbutyl)-1,2-oxazole-3-carboxamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 100 mg/mL (321.19 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.2119 mL 16.0596 mL 32.1192 mL
5 mM 0.6424 mL 3.2119 mL 6.4238 mL
10 mM 0.3212 mL 1.6060 mL 3.2119 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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