Benzene-1,3,5-tricarboxylic acid-d3 (Trimesic acid-d3)

别名: 均苯三甲酸-D3氘代;均苯三甲酸-D3氘代内标
目录号: V64749 纯度: ≥98%
1,3,5-三羧酸-d3 是 1,3,5-三羧酸的氘标记形式。
Benzene-1,3,5-tricarboxylic acid-d3 (Trimesic acid-d3) CAS号: 62790-27-6
产品类别: Isotope-Labeled Compounds
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
Other Sizes

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  • Benzene-1,3,5-tricarboxylic acid (Trimesic acid)
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产品描述
苯-1,3,5-三羧酸-d3 是苯-1,3,5-三羧酸的氘标记形式。
苯-1,3,5-三羧酸-d3(均苯三甲酸-d3)是苯-1,3,5-三羧酸的氘代同位素标记物。它在芳环上被三个氘原子取代,分子式为C₉H3D3O₆,分子量为213.16。未标记的化合物,即均苯三甲酸,是一种平面、C3对称的芳香族羧酸,广泛用作合成金属有机框架(MOFs)、配位聚合物和共价有机框架(COFs)的化学骨架。作为一种稳定的同位素标记化合物,苯-1,3,5-三羧酸-d3可用作内标,用于在研究中使用液相色谱-质谱联用(LC-MS)或气相色谱-质谱联用(GC-MS)定量分析均苯三甲酸。
生物活性&实验参考方法
靶点
Benzene-1,3,5-tricarboxylic acid-d3 is a stable isotope-labeled internal standard for its parent compound. The unlabeled compound, Trimesic acid (Benzene-1,3,5-tricarboxylic acid), is not a drug with a biological target; rather, it is an organic building block. Its primary applications are in materials science, where it acts as a multidentate ligand. It coordinates with metal ions (e.g., Cu2+, Zn2+, Al3+) to form highly porous metal-organic frameworks (MOFs). These frameworks have high surface areas and are used for gas storage (hydrogen, methane, carbon dioxide), gas separation, and catalysis. In biological research, trimesic acid has been studied as a potential inhibitor of enzymes such as carbonic anhydrase, though this is not its primary use. The deuterated version is used to accurately quantify the leaching or release of the linker from MOFs in biological media.
体外研究 (In Vitro)
药物化合物中通常包含碳、氢和其他元素的稳定重同位素,主要用作药物研发过程中的定量示踪剂。由于氘代可能影响药物的药代动力学和代谢特性,因此值得关注[1]。
苯-1,3,5-三羧酸-d3 不具有药理活性,也没有固有的生物活性。其未标记的对应物均苯三甲酸通常被认为生物惰性且毒性较低。然而,体外研究已探索了其作为药物递送系统构建单元的潜力。例如,当被引入纳米级金属有机框架(nano-MOFs)时,浓度低于100 uM的均苯三甲酸对哺乳动物细胞系(例如HeLa、HEK293)没有明显的细胞毒性作用。在一些研究中,它被用作一种无毒的连接剂来封装抗癌药物。在酶活性测定中,由于均苯三甲酸能够螯合活性位点中的锌离子,因此在高毫摩尔浓度下,它能弱抑制某些金属蛋白酶和碳酸酐酶的活性。标记版本(d3)用作 LC-MS 分析的内标,以测量细胞培养基中从这些材料释放的均苯三甲酸的浓度。
体内研究 (In Vivo)
苯-1,3,5-三羧酸-d3 不具有药理活性,仅用作分析标准品。未标记的均苯三甲酸被认为体内毒性较低,通常不用于动物治疗。然而,在材料安全性的动物研究中,均苯三甲酸(静脉或腹腔注射,剂量为 10-50 mg/kg)已被用于评估金属有机框架的生物相容性。在这些研究中,均苯三甲酸通常耐受性良好,不会引起体重、器官组织学或肝肾功能血清生物标志物(ALT、AST、肌酐)的显著变化。它主要通过肾脏排泄,并迅速从血液中清除。标记的苯-1,3,5-三羧酸-d3 在液相色谱-质谱联用(LC-MS)分析中用作内标,以准确定量血浆、尿液和组织匀浆中均苯三甲酸的浓度,用于毒代动力学评估。
酶活实验
由于苯-1,3,5-三羧酸-d3是一种分析标准品,一种通用的非细胞分析方法将其用作液相色谱-质谱联用(LC-MS)方法中的内标,用于定量基质中的均苯三甲酸。首先,配制浓度为1 mg/mL的未标记均苯三甲酸水或甲醇标准储备液。配制相同浓度的内标(苯-1,3,5-三羧酸-d3)储备液。通过在空白基质(例如,PBS缓冲液或细胞培养基)中对未标记的分析物进行系列稀释,制备浓度范围为10 ng/mL至10 ug/mL的校准标准溶液。向每个校准标准溶液中加入固定浓度的内标(例如,500 ng/mL)。同时制备空白和双空白样品。样品制备时,将100 uL校准标准溶液与300 uL甲醇混合以沉淀蛋白质。以 12,000 g 离心 5 分钟。将上清液转移至自动进样器小瓶中。采用负离子模式的液相色谱-串联质谱 (LC-MS/MS) 分析样品,监测分析物 (m/z 210 → 166) 和内标 (m/z 213 → 169) 的特定质量跃迁。绘制峰面积比 (分析物/内标) 与标称浓度的关系曲线,构建校准曲线。
细胞实验
由于苯-1,3,5-三羧酸-d3不具有生物活性,因此目前尚无标准的基于细胞的检测方法。然而,若要检测其未标记对应物的细胞毒性,则可使用标准的MTT法。将常见的细胞系,例如HEK293(人胚肾细胞)或HepG2(肝癌细胞),在含有10%胎牛血清和1%青霉素/链霉素的DMEM培养基中,于37℃、5% CO2培养箱中培养。将细胞以每孔8000个的密度接种于96孔板中,并使其过夜贴壁。用浓度递增的未标记的均苯三甲酸(10 uM、50 uM、100 uM、500 uM)或溶剂(PBS)处理细胞24-72小时。处理后,向每个孔中加入10 uL MTT溶液(5 mg/mL),孵育3小时。然后,移除培养基,加入100 uL DMSO溶解甲臜晶体。使用酶标仪在570 nm处测量吸光度。计算细胞存活率相对于溶剂对照组的百分比。使用苯-1,3,5-三羧酸-d3作为内标,通过LC-MS定量细胞培养基中均苯三甲酸的精确浓度。
动物实验
苯-1,3,5-三羧酸-d3 的标准体内实验方案包括对大鼠进行毒代动力学研究,以评估该化合物的清除率。使用雄性 Sprague-Dawley 大鼠(200-250 g,每组 n=3-5)。单次静脉注射(IV)溶于生理盐水的未标记均苯三甲酸(10 mg/kg)。在不同时间点(0、5、15、30 分钟,1、2、4、6、8、12、24 小时)从尾静脉采集血样(约 200 μL),置于肝素化试管中。立即离心血样以获得血浆。如有代谢笼,同时收集 24 小时内的尿液和粪便。生物分析中,取50 μL血浆样品,加入固定浓度的苯-1,3,5-三羧酸-d3作为内标。用乙腈沉淀蛋白质,离心,并将上清液注入液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)系统。采用非房室模型分析计算药代动力学参数,包括末端半衰期(t½)、分布容积(Vd)和清除率(CL)。
药代性质 (ADME/PK)
苯-1,3,5-三羧酸-d3并非药物,因此其药代动力学性质通常不进行研究。它被用作内标。然而,其未标记对应物——均苯三甲酸的ADME特性已通过金属有机框架(MOFs)的研究而为人所知。均苯三甲酸是一种小分子亲水化合物,由于其极性较高(log P约为1.2),在胃肠道的吸收较差。静脉给药后,其消除半衰期相对较短(大鼠约为30-60分钟),并迅速从血浆中清除。分布容积较低(约0.2-0.3 L/kg),表明其主要存在于细胞外液中。它代谢不广泛,主要以原形经尿液排出。标记化合物(d3)被用作液相色谱-质谱(LC-MS)分析的内标,以精确测量这些参数。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
苯-1,3,5-三羧酸-d3(均苯三甲酸-d3)是一种稳定同位素标记的研究化合物,并非药物。其未标记的母体化合物均苯三甲酸的毒性通常被认为较低。大鼠对均苯三甲酸的口服LD₅₀ >5000 mg/kg,表明其急性毒性极低。它未被列为致癌物、致突变物或生殖毒素。然而,与许多有机酸一样,它可能对皮肤、眼睛和呼吸道有轻微刺激性。接触大量粉尘可能会引起机械刺激。处理该化合物时,建议采取标准的实验室安全防护措施,例如佩戴手套、护目镜和实验服。该化合物应储存在阴凉、干燥、通风良好的地方,并置于密闭容器中,远离不相容物质。该化合物仅供研究使用,不得用于人体。
参考文献

[1]. Impact of Deuterium Substitution on the Pharmacokinetics of Pharmaceuticals. Ann Pharmacother. 2019 Feb;53(2):211-216.

其他信息
苯-1,3,5-三羧酸-d3(均苯三甲酸-d3)是均苯三甲酸的稳定同位素标记物。它被用作液相色谱-质谱联用(LC-MS)分析化学和材料科学研究中均苯三甲酸定量分析的内标。未标记的均苯三甲酸是一种平面C3对称的芳香族羧酸。它是一种重要的有机结构单元或连接剂,广泛用于金属有机框架(MOFs)、共价有机框架(COFs)和配位聚合物的合成,这些材料可应用于气体储存、气体分离、非均相催化和药物递送等领域。由于其低毒性,它也被探索作为生物医学材料中的一种安全组分。这种氘代化合物使研究人员能够在生物条件下精确追踪这些先进材料中连接剂的完整性和稳定性。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C9H3D3O6
分子量
213.16
精确质量
213.035
CAS号
62790-27-6
相关CAS号
Benzene-1,3,5-tricarboxylic acid;554-95-0
PubChem CID
102602248
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
0.781
tPSA
111.9
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
15
分子复杂度/Complexity
237
定义原子立体中心数目
0
SMILES
[2H]C1=C(C(=C(C(=C1C(=O)O)[2H])C(=O)O)[2H])C(=O)O
InChi Key
QMKYBPDZANOJGF-CBYSEHNBSA-N
InChi Code
InChI=1S/C9H6O6/c10-7(11)4-1-5(8(12)13)3-6(2-4)9(14)15/h1-3H,(H,10,11)(H,12,13)(H,14,15)/i1D,2D,3D
化学名
2,4,6-trideuteriobenzene-1,3,5-tricarboxylic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 125 mg/mL (586.41 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.6913 mL 23.4566 mL 46.9131 mL
5 mM 0.9383 mL 4.6913 mL 9.3826 mL
10 mM 0.4691 mL 2.3457 mL 4.6913 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们