5-Azaindole

别名: 5-氮杂吲哚; 1H-吡咯并[3,2-c]吡啶;1H-Pyrrolo[3,2-c]pyridine 1H-吡咯并[3,2-c]吡啶;5-杂氮吲哚
目录号: V65172 纯度: ≥98%
1H-吡咯并[3,2-c]吡啶是一种生化化合物,可用作生物医学研究的生物材料或有机/化学试剂。
5-Azaindole CAS号: 271-34-1
产品类别: Biochemical Assay Reagents
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
1H-吡咯并[3,2-c]吡啶是一种生物化学化合物,可用作生物材料或生物医学研究中的有机/化学试剂。
5-氮杂吲哚(CAS 271-34-1),又称1H-吡咯并[3,2-c]吡啶,是一种杂环化合物,化学式为C₇H₆N₂,分子量为118.14 g/mol。它是一种白色至浅黄色结晶固体,熔点为106-108°C。5-氮杂吲哚是一种稠合双环杂环化合物,由一个吲哚环系构成,其中苯环上的一个碳原子被氮原子取代。该化合物是药物化学中一种重要的骨架,可作为吲哚和嘌呤的生物等排体。它是一种高纯度(>98%)的生化试剂,适用于生命科学研究和药物发现中作为生物材料或有机合成中间体使用。
生物活性&实验参考方法
靶点
5-Azaindole does not have a defined biological target as a standalone compound, but it is a scaffold that can be functionalized to target various biological targets including kinases, GPCRs, and other enzymes. The azaindole scaffold is a privileged structure in medicinal chemistry, serving as a bioisostere for indole and purine, and is found in numerous bioactive compounds with anticancer, antiviral, and anti-inflammatory activities. When incorporated into pharmaceutical compounds, the azaindole scaffold can interact with biological targets through hydrogen bonding, π-π stacking, and hydrophobic interactions. The compound itself is not evaluated for biological activity against specific targets but serves as a versatile building block.
体外研究 (In Vitro)
5-氮杂吲哚是凝血因子VIIa的抑制剂,也是一种有用的药物中间体。
作为化学试剂,5-氮杂吲哚在体外不具有内在药理活性。其在药物化学中的应用价值在于,它是一种合成激酶抑制剂和其他生物活性化合物的优良骨架。氮杂吲哚骨架被用于制备多种靶向癌症、炎症和传染病的候选药物。在基于细胞的检测中,并不直接测试化合物本身的生物活性,而是评估由该骨架合成的功能化衍生物的药理学性质。该化合物在药物发现和药物化学研究中仅用作化学中间体和片段骨架。
体内研究 (In Vivo)
5-氮杂吲哚不具有体内生物活性,因为它并非治疗药物。该化合物用作合成候选药物的化学骨架。任何体内效应都与由该骨架合成的最终产物相关,而非骨架本身。该化合物未在药理学研究中用于动物,且无已知的生理效应。其作用仅限于化学层面——提供一种用途广泛的氮杂吲哚骨架,用于构建在肿瘤学、病毒学及其他疾病领域具有潜在治疗应用价值的复杂分子。该化合物仅供实验室研究使用。
酶活实验
由于5-氮杂吲哚不具有生物活性,因此体外酶/受体结合试验不适用于它。该试剂的标准表征方法包括核磁共振(¹H NMR、¹³C NMR)和质谱分析,以确认其结构和纯度。熔点测定(106-108°C)和高效液相色谱分析(纯度>98%)用于质量控制。在合成应用中,典型的反应包括在3位进行亲电芳香取代、N-烷基化和交叉偶联反应,以引入各种取代基,用于构效关系研究。所得功能化氮杂吲哚衍生物随后在适当的酶或细胞分析中评估其生物活性。
细胞实验
5-氮杂吲哚本身不用于细胞实验,因为它是一种化学骨架,而非生物活性测试化合物。当该化合物用于合成候选药物(例如激酶抑制剂)时,可以使用标准方案在细胞培养中进行测试。通常,将最终化合物溶解于DMSO中,并用培养基稀释至所需浓度(通常为0.1-100 µM)。细胞培养24-72小时后,使用MTT、CellTiter-Glo或Western blotting等适当的检测方法测量其对细胞活力、增殖或特定信号通路的影响。该骨架本身不用于细胞系统评估。
动物实验
由于5-氮杂吲哚是一种用于化学合成的研究骨架,因此不进行体内动物实验。当该化合物用于合成候选药物时,最终产物需进行标准的临床前评估。典型的候选药物评估方案包括:啮齿动物药代动力学研究(口服或静脉注射给药,采集血液样本进行LC-MS/MS分析)、疾病模型疗效研究(例如,抗癌药物的肿瘤异种移植模型)以及毒理学研究(急性毒性和重复给药毒性、组织病理学)。这些研究评估的是最终药物分子的安全性和有效性,而非合成骨架的安全性和有效性。
药代性质 (ADME/PK)
由于5-氮杂吲哚并非药物活性成分,因此其药代动力学性质尚未明确。根据其理化性质(分子量118.14,logP值约为1.5-2.0),该化合物预计口服生物利用度良好。它可能通过细胞色素P450介导的吡咯环或吡啶氮的氧化代谢。然而,该化合物并非用于人体,也未进行正式的药代动力学研究。对于基于该骨架合成的候选药物,其药代动力学性质(包括代谢稳定性和血浆蛋白结合率)的测定是药物开发过程的一部分。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
5-氮杂吲哚可能引起皮肤和眼睛刺激。处理该化合物时应遵循标准实验室安全预防措施,包括佩戴手套、护目镜并在通风橱内操作。该化合物应储存在阴凉干燥处,避光防潮。目前尚无急性毒性、致突变性或致癌性数据。该化合物不适用于药物、家用或其他用途。如不慎接触,请立即用水冲洗,若刺激持续,请就医。该化合物在正常储存条件下稳定,但应避免接触强氧化剂。
其他信息
第一个来源中的结构
5-氮杂吲哚是药物化学中一种重要的骨架,可作为吲哚和嘌呤的生物等排体。它也被称为1H-吡咯并[3,2-c]吡啶。该骨架用于合成多种激酶抑制剂和其他靶向癌症、炎症和传染病的生物活性化合物。该化合物为构效关系研究和药物优化提供了一个多功能的平台。它尚未进行临床试验,也未被批准作为药物上市。其作用机制是化学性的——作为合成具有多种治疗应用的生物活性氮杂吲哚衍生物的骨架。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C7H6N2
分子量
118.14
精确质量
118.053
CAS号
271-34-1
PubChem CID
9220
外观&性状
White to yellow solid powder
密度
1.2±0.1 g/cm3
沸点
295.8±13.0 °C at 760 mmHg
熔点
104.6-108.4°C
闪点
137.4±11.1 °C
蒸汽压
0.0±0.6 mmHg at 25°C
折射率
1.697
LogP
0.65
tPSA
28.68
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
1
可旋转键数目(RBC)
0
重原子数目
9
分子复杂度/Complexity
103
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1=C[NH]C2=C1C=NC=C2
InChi Key
SRSKXJVMVSSSHB-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C7H6N2/c1-4-9-7-2-3-8-5-6(1)7/h1-5,9H
化学名
1H-pyrrolo[3,2-c]pyridine
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 8.4645 mL 42.3227 mL 84.6453 mL
5 mM 1.6929 mL 8.4645 mL 16.9291 mL
10 mM 0.8465 mL 4.2323 mL 8.4645 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们