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PYBG

目录号: V67119 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
PYBG 是一种前体，可以通过反应轻松与多种荧光染料偶联。
PYBG CAS号: 680622-71-3
产品类别: Fluorescent Dye
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
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产品描述
PYBG是一种前体，可通过反应轻松与多种荧光染料偶联。PYBG是点击化学的试剂。它含有炔基，可与含有叠氮基的化合物发生CuAAc（铜催化叠氮-炔环加成反应）。
PYBG（CAS：680622-71-3）是一种用途广泛的点击化学前体，可作为柔性连接基团，方便地与各种荧光染料偶联。其分子式为C16H15N5O2，分子量为309.32。PYBG含有末端炔基，可用于铜催化叠氮-炔环加成反应（CuAAC），也可参与Sonogashira偶联反应。
生物活性&实验参考方法
靶点
Alkyne-reactive groups (azides or iodoarenes) are the primary molecular targets. PYBG contains a terminal alkyne group and can also act as a substrate for Sonogashira coupling. The compound is used to conjugate with fluorescent dyes or other functional molecules.
体外研究 (In Vitro)
在无细胞检测中，PYBG 被用作一种灵活的偶联前体。其活性通过与叠氮基功能化的荧光染料在铜催化剂（CuSO4、抗坏血酸）存在下偶联反应的效率和产率来衡量。标记的偶联物随后可用作生物检测中的荧光探针。
体内研究 (In Vivo)
目前尚无该化合物的具体体内活性数据。PYBG本身并非探针，而是一种结构单元，与荧光报告分子偶联后才具有活性。所得偶联物可用于细胞或动物的成像或追踪。
酶活实验
标准操作流程包括将 PYBG（例如，1-10 mM）溶解于反应溶剂中，例如 DMF 或 DMSO。对于 CuAAC 偶联反应，加入叠氮基功能化的荧光染料（例如，相对于 PYBG 的 1-1.5 当量）、铜(I)催化剂或硫酸铜(II)以及还原剂（例如，抗坏血酸钠）和配体（例如，TBTA）。在室温或 37℃ 下搅拌反应 2-24 小时。通过 HPLC 纯化偶联产物。
细胞实验
细胞成像的一般流程是：首先通过点击化学将PYBG与荧光报告分子偶联，然后纯化偶联物。所得荧光探针可用于细胞检测，浓度为1-10 uM，在37℃下孵育30-60分钟，随后进行洗涤和共聚焦显微镜观察。
动物实验
目前尚无针对PYBG本身的标准体内动物实验方案。PYBG与荧光染料偶联后，所得探针可通过静脉或腹腔注射给药于动物模型进行成像研究。荧光探针的常用剂量范围为0.1-10 mg/kg。
药代性质 (ADME/PK)
PYBG本身的通用药代动力学性质不适用。一旦发生偶联，所得荧光探针的药代动力学性质将取决于偶联物的性质（大小、电荷、疏水性）。制剂通常溶于DMSO或含有助溶剂的水性缓冲液中。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
点击化学前体的总体毒性被认为较低。在典型工作浓度下，未见明显的毒性报道。应遵守处理炔烃化合物和有机溶剂的标准安全预防措施。
参考文献

[1]. Terminal alkyne substituted O6-benzylguanine for versatile and effective syntheses of fluorescent labels to genetically encoded SNAP-tags. RSC Advances. 26 Feb 2015.
其他信息
PYBG是一种用于生物偶联和化学生物学的研究工具。它可用作柔性连接剂，通过点击化学反应连接各种荧光染料，从而构建用于生物分子成像、追踪和检测的定制荧光探针。炔丙基醚连接剂赋予了PYBG稳定性和柔韧性。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C16H15N5O2
分子量
309.323
精确质量
309.122
CAS号
680622-71-3
PubChem CID
58596748
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
1
tPSA
98.9
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
23
分子复杂度/Complexity
418
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C(OCC1=CC=C(COC2NC(N)=NC3C=2N=CN=3)C=C1)C#C
InChi Key
LZDBKQCASZCNSH-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C16H15N5O2/c1-2-7-22-8-11-3-5-12(6-4-11)9-23-15-13-14(19-10-18-13)20-16(17)21-15/h1,3-6,10H,7-9H2,(H3,17,18,19,20,21)
化学名
6-[[4-(prop-2-ynoxymethyl)phenyl]methoxy]-7H-purin-2-amine
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 6.25 mg/mL (20.21 mM)
H2O: < 0.1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil)
示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备（4°C，储存1周）：将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中，得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如： 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精)→ 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如： 50 μL DMSO → 100 μL PEG300 → 200 μL Castor oil → 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10： 10 : 80 (如： 100 μL Ethanol → 100 μL Cremophor → 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL EtOH → 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL EtOH → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)

口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合

注意: 以上为较为常见方法，仅供参考， InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型，对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物，需通过前期实验来确定（建议先取少量样品进行尝试），包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.2329 mL 16.1645 mL 32.3290 mL
5 mM 0.6466 mL 3.2329 mL 6.4658 mL
10 mM 0.3233 mL 1.6164 mL 3.2329 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
+
计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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