Acrylodan

别名: 6-丙烯酰-2-二甲氨基萘;6-丙烯酰基-2-二甲氨基萘
目录号: V67131 纯度: ≥98%
Acrylodan 与硫醇发生反应,并且对 Cys34 周围的结合口袋内的局部环境双极性和动态敏感。
Acrylodan CAS号: 86636-92-2
产品类别: Fluorescent Dye
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
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产品描述
丙烯酰丹(Acrylodan,CAS号:86636-92-2)是一种硫醇反应性、环境敏感的荧光染料,属于6-酰基-2-二甲氨基萘探针家族,该家族以其对溶剂极性的极高敏感性而闻名。其分子量为225.29 g/mol,分子式为C₁₅H₁₅NO。丙烯酰丹(6-丙烯酰基-2-二甲氨基萘)是一种高度特化的硫醇反应性荧光探针,专为定点蛋白质标记和实时构象分析而设计。该化合物的荧光对构象变化非常敏感,因此非常适合用于蛋白质结构分析。丙烯酰丹可与硫醇基团反应,并对结合口袋内的局部环境极性和动态变化敏感。
生物活性&实验参考方法
靶点
Acrylodan targets thiol (-SH) groups on proteins, specifically cysteine residues. The compound does not target a specific protein or enzyme but rather serves as a covalent labeling reagent that attaches the environment-sensitive fluorophore to cysteine residues on proteins for studying protein structure and dynamics.
体外研究 (In Vitro)
操作指南(以下是我们建议的操作流程;请根据您的具体需求进行调整,仅供参考)。步骤 1:1. 纯化和标记:1. 向聚合肌动蛋白中加入 20 倍摩尔过量的丙烯酰胺(Anaspec),并在冰上静置过夜。2. 将标记的肌动蛋白在 4 °C 下以 100,000 × g 离心 2 小时后,将沉淀物重悬于 10 mM Tris 缓冲液(pH 7.5)、0.5 mM β-巯基乙醇、0.2 mM CaCl₂ 和 50 μM ATP 中。随后,将混合物在 4 °C 下透析 70 小时。 3. 收集上清液后,利用肌动蛋白在290 nm处的消光系数26,600 M⁻¹ cm⁻¹、丙烯酰丹在385 nm处的消光系数18,500 M⁻¹ cm⁻¹以及Alexa Fluor 488在494 nm处的消光系数71,000 M⁻¹ cm⁻¹,计算肌动蛋白含量和标记程度。4. EDTA展开的丙烯酰化肌动蛋白1 (AcrylAct1I3) 的发射光谱与CCT结合的丙烯酰化肌动蛋白1 (AcrylAct1NAT) 的发射光谱非常相似。丙烯酰丹的体外活性在于其作为一种环境敏感型荧光探针用于蛋白质研究。该化合物与半胱氨酸残基上的巯基反应,形成共价键。丙烯酰胺的荧光对局部环境的极性和动态变化极其敏感,会随着标记蛋白构象的变化而改变。这一特性使其在研究蛋白质结构变化、蛋白质-蛋白质相互作用和蛋白质折叠方面具有重要价值。
体内研究 (In Vivo)
丙烯酰胺不作为治疗药物使用。其体内用途仅限于蛋白质结构分析等研究应用。该化合物不适用于全身治疗。
酶活实验
丙烯酰胺的体外标记实验包括将硫醇反应性探针与含有游离半胱氨酸残基的蛋白质在合适的缓冲液条件下孵育。该反应会在丙烯酰胺的丙烯酰基和半胱氨酸残基的硫醇基之间形成共价键。然后可以通过荧光光谱法分析标记后的蛋白质,以研究其构象变化和环境敏感性。
细胞实验
在体外细胞实验中,丙烯酰胺(Acrylodan)用于标记细胞裂解液或纯化蛋白中的蛋白质。标记后的蛋白质可通过荧光光谱法进行研究,以探究其构象变化和动力学。
动物实验
由于丙烯酰胺主要用作体外蛋白质结构研究的工具,因此通常不进行体内动物实验。该化合物仅供研究使用。
药代性质 (ADME/PK)
由于Acrylodan是一种研究用荧光探针而非候选药物,因此尚未对其药代动力学性质进行表征。该化合物的分子量为225.29 g/mol,应在4°C下避光保存。它在室温下为固体。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于Acrylodan仅供研究用途,不用于治疗,因此尚未对其毒理学数据进行系统评估。处理此化学试剂时,应遵守标准的实验室安全预防措施。
参考文献

[1]. A two-step mechanism for the folding of actin by the yeast cytosolic chaperonin. J Biol Chem. 2011 Jan 7;286(1):178-84.

[2]. Unfolding of acrylodan-labeled human serum albumin probed by steady-state and time-resolved fluorescence methods. Biophys J. 1998 Aug;75(2):1084-96.

其他信息
丙烯丹是一种与硫醇反应的、环境敏感的荧光染料,用于定点蛋白标记和构象分析。其荧光对构象变化高度敏感,使其在蛋白质结构研究中具有重要价值。该化合物没有临床或治疗应用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C15H15NO
分子量
225.29
精确质量
225.115
CAS号
86636-92-2
PubChem CID
104901
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
密度
1.1g/cm3
沸点
388.3ºC at 760mmHg
闪点
153.1ºC
折射率
1.63
LogP
3.274
tPSA
20.31
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
2
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
17
分子复杂度/Complexity
297
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CN(C)C1=CC2=C(C=C1)C=C(C=C2)C(=O)C=C
InChi Key
HMWAJFNEGAJETK-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C15H15NO/c1-4-15(17)13-6-5-12-10-14(16(2)3)8-7-11(12)9-13/h4-10H,1H2,2-3H3
化学名
1-[6-(dimethylamino)naphthalen-2-yl]prop-2-en-1-one
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 50 mg/mL (221.94 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.4387 mL 22.1936 mL 44.3872 mL
5 mM 0.8877 mL 4.4387 mL 8.8774 mL
10 mM 0.4439 mL 2.2194 mL 4.4387 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们