BDY FL-X, SE

别名: 3-氟硼吡咯-丙酰氨基己酸,N-羟基琥珀酰亚胺酯
目录号: V67336 纯度: ≥98%
BODIPY FL-X,SE 是一种用于胺标记(胺)的绿色荧光染料。
BDY FL-X, SE CAS号: 217190-09-5
产品类别: Fluorescent Dye
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
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产品描述
BODIPY FL-X,SE 是一种用于胺标记的绿色荧光染料。它具有较高的荧光量子产率,且对 pH 值变化相对不敏感。BODIPY FL-X,SE 可作为 FAM、Cy2 或 FITC 的替代品。λabs:504 nm;λem:510 nm。
BDY FL-X,SE(CAS 编号:217190-09-5)是一种基于 BODIPY(硼二吡咯亚甲基)荧光团的绿色荧光染料,专为胺标记而设计。该化合物含有 NHS 酯(琥珀酰亚胺酯)官能团,可与生物分子上的伯胺反应形成稳定的酰胺键。BDY FL-X,SE 的激发光谱和发射光谱与 FITC 和 TFAX 488 染料相似。该染料在荧光团和NHS酯基团之间具有C3烷基间隔基,从而降低了荧光团与共轭生物分子之间发生相互作用的可能性。BDY FL-X, SE的分子式为C₂₄H₂₉BF₂N₄O₅,分子量为502.33 g/mol。
生物活性&实验参考方法
靶点
BDY FL-X, SE targets primary amines (-NH₂) on biomolecules such as proteins, peptides, and antibodies through its NHS ester functional group. The compound does not target specific enzymes or receptors but rather serves as a covalent labeling reagent that attaches the BODIPY FL fluorophore to amine-containing biomolecules. The C3 alkyl spacer reduces potential interactions between the fluorophore and the conjugated biomolecule.
体外研究 (In Vitro)
BODIPY FL-X(一种琥珀酰亚胺酯染料)的储备液用DMSO配制。随后,将染料稀释至终浓度为10 μM,溶于0.1 M碳酸氢钠缓冲液(pH 8.3)。
BODIPY FL-X SE具有高荧光量子产率和高消光系数,且对pH变化相对不敏感。该染料可作为FAM、Cy2或FITC的有效替代品,用于绿色荧光标记应用。其绿色荧光具有明亮且光稳定的标记特性,适用于各种基于荧光的检测和成像技术。
体内研究 (In Vivo)
目前尚无关于BDY FL-X, SE作为治疗药物的体内活性数据报道,因为该化合物主要用作研究用途的荧光标记试剂。该化合物仅供研究使用。
酶活实验
BDY FL-X 和 SE 的体外标记实验包括将 NHS 酯与含胺生物分子在合适的缓冲液(通常 pH 7-9)中孵育。该反应通过伯胺对 NHS 酯羰基的亲核攻击进行,形成稳定的酰胺键,并释放 N-羟基琥珀酰亚胺作为副产物。标记效率可通过紫外-可见光谱法测定标记度 (DOL) 来评估。
细胞实验
在体外细胞实验中,首先通过NHS酯-胺反应将BDY FL-X SE与抗体、肽或其他靶向配体偶联。然后纯化标记的偶联物,并将其添加到细胞培养基中与靶细胞孵育。洗涤后,通过荧光显微镜或流式细胞仪分析细胞,以观察绿色荧光。该染料对pH变化相对不敏感,因此适用于各种细胞环境。
动物实验
BDY FL-X, SE 通常不用于体内动物实验,也不作为治疗手段。然而,当与靶向配体偶联时,该染料可用于体内成像应用。其绿色荧光可提供明亮且光稳定的标记,用于追踪生物样品中的生物分子。将含有 BDY FL-X, SE 的偶联物注射到动物模型中,用于追踪生物分布和靶点结合情况。
药代性质 (ADME/PK)
由于BDY FL-X, SE是一种研究用荧光标记试剂而非候选药物,因此其药代动力学性质尚未进行表征。该化合物的分子量为502.33 g/mol,分子式为C₂₄H₂₉BF₂N₄O₅。NHS酯具有反应活性,应在适当的条件下储存。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于BDY FL-X, SE仅供研究用途,不用于治疗,因此尚未对其毒理学数据进行系统评估。处理此化学试剂时应遵守标准实验室安全预防措施。NHS酯对水分敏感,应在无水条件下操作。
参考文献

[1]. Green/red dual fluorescence detection of total protein and alkaline phosphate-conjugated probes on blotting membranes. Electrophoresis. 2001 Mar;22(5):896-905.

[2]. Simultaneous red/green dual fluorescence detection on electroblots using BODIPY TR-X succinimidyl ester and ELF 39 phosphate.Proteomics. 2002 May;2(5):499-512.

其他信息
BODIPY FL-X是一种BODIPY染料和吡咯烷。它用作荧光染料。它与4,4-二氟-4-硼-3a,4a-二氮-苯并茚相关。
BDY FL-X, SE是一种基于BODIPY荧光团的绿色荧光染料,设计用于氨基标记,具有高荧光量子产率和对pH变化的相对不敏感性。该染料具有C3烷基间隔基团,减少了荧光团与结合生物分子之间的潜在相互作用。BDY FL-X, SE是FAM、Cy2或FITC的可行替代品。该化合物没有临床或治疗应用,且未获得监管批准。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C24H29BF2N4O5
分子量
502.32
精确质量
502.22
CAS号
217190-09-5
PubChem CID
13007361
外观&性状
Yellow to orange solid powder
LogP
2.814
tPSA
109.59
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
11
重原子数目
36
分子复杂度/Complexity
1040
定义原子立体中心数目
0
SMILES
[B-]1(N2C(=CC(=C2C=C3[N+]1=C(C=C3)CCC(=O)NCCCCCC(=O)ON4C(=O)CCC4=O)C)C)(F)F
InChi Key
AWACOFBGFAKYPF-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C24H29BF2N4O5/c1-16-14-17(2)29-20(16)15-19-8-7-18(30(19)25(29,26)27)9-10-21(32)28-13-5-3-4-6-24(35)36-31-22(33)11-12-23(31)34/h7-8,14-15H,3-6,9-13H2,1-2H3,(H,28,32)
化学名
(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 6-[3-(2,2-difluoro-10,12-dimethyl-3-aza-1-azonia-2-boranuidatricyclo[7.3.0.03,7]dodeca-1(12),4,6,8,10-pentaen-4-yl)propanoylamino]hexanoate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 83.33 mg/mL (165.89 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9908 mL 9.9538 mL 19.9076 mL
5 mM 0.3982 mL 1.9908 mL 3.9815 mL
10 mM 0.1991 mL 0.9954 mL 1.9908 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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