N-[(9H-Fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl]-O-(phenylmethyl)-D-serine

别名: Fmoc-(R)-2-氨基-3-苄氧基丙酸;N-芴甲氧羰基-O-苄基-D-丝氨酸;N-[芴甲氧羰基]-O-(苄基)-D-丝氨酸;FMOC-O-苄基-D-丝氨酸
目录号: V68090
N-[(9H-芴-9-基甲氧基)羰基]-O-(苯基甲基)-D-丝氨酸是丝氨酸类似物。
N-[(9H-Fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl]-O-(phenylmethyl)-D-serine CAS号: 122889-11-6
产品类别: Amino Acid Derivatives
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
N-[(9H-芴-9-基甲氧基)羰基]-O-(苯甲基)-D-丝氨酸是一种丝氨酸类似物。
N-[(9H-芴-9-基甲氧基)羰基]-O-(苯甲基)-D-丝氨酸(CAS 122889-11-6),又称Fmoc-O-苄基-D-丝氨酸,是一种Fmoc保护的D-丝氨酸衍生物,其羟基侧链上带有苄基醚保护基。分子式为C₂₅H₂₃NO₅,分子量为417.45 g/mol,为白色至类白色固体粉末。该化合物是一种丝氨酸类似物,其氨基末端带有9-芴基甲氧基羰基(Fmoc)保护基,丝氨酸的羟基上带有苄基(苯甲基)醚保护基。 Fmoc基团对碱不稳定,在Fmoc固相肽合成(SPPS)过程中可用哌啶在DMF中脱除;而苄醚基团对酸不稳定,可在强酸性条件下(例如HF或HBr)裂解。该化合物是Fmoc固相肽合成的重要结构单元,可用于将O-苄基-D-丝氨酸残基引入肽序列。与未保护的丝氨酸相比,苄醚修饰可提高亲脂性和空间位阻。该化合物仅供研究使用,通常以粉末形式储存于-20°C下可保存长达3年,或在4°C下可保存长达2年。
生物活性&实验参考方法
靶点
As a synthetic intermediate, N-[(9H-Fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl]-O-(phenylmethyl)-D-serine has no specific biological target. Its role is to provide O-benzyl-D-serine residues in peptide chains. The Fmoc protecting group enables standard Fmoc solid-phase peptide synthesis (SPPS) workflows, allowing for the controlled assembly of peptide chains. The benzyl ether protecting group on the hydroxyl side chain prevents unwanted side reactions during peptide synthesis and can be selectively removed to generate free serine residues or to introduce modifications at the hydroxyl position. The D-configuration of the serine residue introduces stereochemical diversity compared to L-serine, which can be valuable for structure-activity relationship studies. The compound does not interact with enzymes or receptors in pharmacological assays. Its "target" is the peptide coupling reaction, where it acts as a protected amino acid donor.
体外研究 (In Vitro)
市售麦角补充剂由氨基酸及其衍生物制成。它们能够影响合成代谢激素的释放、活动所需能量的供应、压力下的清晰思维能力以及预防运动引起的肌肉损伤。它们被认为是具有协同增效作用的有益食品成分[1]。
N-[(9H-芴-9-基甲氧基)羰基]-O-(苯甲基)-D-丝氨酸的体外活性通过固相肽合成 (SPPS) 中的偶联效率来测定。通常,它使用标准的 Fmoc-SPPS 条件与树脂结合的胺偶联:首先用 20% 哌啶的 DMF 溶液脱除树脂结合的 Fmoc 基团,然后使用 HATU、HBTU 或 DIC 等偶联试剂(含 HOBt)和 DIEA 作为碱,将该化合物(通常为 3-5 当量)与树脂结合的胺偶联。偶联反应通常在室温下进行 1-4 小时。偶联效率通过凯撒试验(茚三酮试验)或定量高效液相色谱法(HPLC)进行监测。使用TFA/TIS/H₂O进行裂解和脱保护反应,得到目标肽。纯度≥98%。由于该化合物是受保护的氨基酸衍生物,因此未观察到其固有生物活性。氨基酸及其衍生物已被商业化用作增效剂。
体内研究 (In Vivo)
N-[(9H-芴-9-基甲氧基)羰基]-O-(苯甲基)-D-丝氨酸不具有体内活性。该化合物不用于动物实验,仅作为实验室合成的研究用化学品。它不用于治疗或诊断目的。
酶活实验
N-[(9H-芴-9-基甲氧基)羰基]-O-(苯甲基)-D-丝氨酸的体外酶/受体结合(非细胞)实验流程包括标准的Fmoc固相肽合成步骤。标准SPPS循环:用20%哌啶的DMF溶液脱除Fmoc保护基(通常2次,每次5-10分钟),用DMF洗涤,将化合物(3当量)与HATU(2.9当量)和DIEA(6当量)偶联1-2小时,洗涤,重复上述步骤。肽序列完全组装后,将肽从树脂上切割下来,并用含有TFA、TIS和水(通常比例为95:2.5:2.5)的切割混合液进行脱保护,反应2-4小时。用冷乙醚沉淀粗肽,并通过HPLC-MS分析产物。该化合物的LogP值为6,表明其具有高亲脂性。该化合物的沸点为642.4±55.0 °C,密度为1.3±0.1 g/cm³。
细胞实验
本中间体不进行体外细胞实验。最终脱保护的肽可用于细胞实验,但保护化合物本身不使用。当测试最终脱保护的肽时,典型的实验可能包括细胞活力检测(MTT 法)、细胞凋亡检测(Annexin V 染色)或受体结合研究,具体取决于合成肽的生物靶点。细胞通常在含 10% FBS 的 DMEM 培养基中培养,用浓度为 0.1 至 100 µM 的肽处理 24 至 72 小时,然后使用酶标仪或流式细胞仪进行检测。
动物实验
N-[(9H-芴-9-基甲氧基)羰基]-O-(苯甲基)-D-丝氨酸不适用于体内动物实验。该化合物以粉末形式储存于-20°C或4°C。该化合物未配制成任何给药途径。任何体内研究都将使用最终的脱保护肽产物,而非受保护的氨基酸本身。
药代性质 (ADME/PK)
N-[(9H-芴-9-基甲氧基)羰基]-O-(苯甲基)-D-丝氨酸的药代动力学性质尚未明确。该化合物并非药物。目前尚无ADME数据。该化合物在推荐的储存条件下稳定:粉末在-20°C下可保存长达3年,或在4°C下可保存长达2年;溶剂在-80°C下可保存长达1个月。如果给药,Fmoc和苄基保护基可能会在代谢过程中被裂解,释放出游离氨基酸,但尚未对该受保护的氨基酸进行此类研究。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
N-[(9H-芴-9-基甲氧基)羰基]-O-(苯甲基)-D-丝氨酸的毒理学数据尚不完善。应遵循标准的实验室安全操作规程。该化合物仅供研究使用,未获准用于人类或兽医用途。由于该化合物为合成中间体,因此未进行慢性毒性、致癌性或生殖毒性研究。
参考文献
[1]. Luckose F, et al. Effects of amino acid derivatives on physical, mental, and physiological activities. Crit Rev Food Sci Nutr. 2015;55(13):1793-1144.
其他信息
N-[(9H-芴-9-基甲氧基)羧基]-O-(苯基甲基)-D-丝氨酸是丝氨酸的类似物,是Fmoc基础固相肽合成中的一种重要构建块。该化合物是丝氨酸的衍生物,商业上可获得,纯度≥98%。苄醚修饰相比未保护的丝氨酸引入了更高的脂溶性和立体体积。该化合物不是药物,没有临床试验或批准。该化合物仅供研究使用。Fmoc保护基团使标准SPPS工作流程成为可能,使该化合物在肽研究中广泛使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C25H23NO5
分子量
417.45
精确质量
417.157
CAS号
122889-11-6
PubChem CID
7019719
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
沸点
642.4±55.0 °C at 760 mmHg
闪点
342.3±31.5 °C
蒸汽压
0.0±2.0 mmHg at 25°C
折射率
1.621
LogP
6
tPSA
84.86
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
9
重原子数目
31
分子复杂度/Complexity
583
定义原子立体中心数目
1
SMILES
C1=CC=C(C=C1)COC[C@H](C(=O)O)NC(=O)OCC2C3=CC=CC=C3C4=CC=CC=C24
InChi Key
DYBDGLCDMLNEMJ-HSZRJFAPSA-N
InChi Code
InChI=1S/C25H23NO5/c27-24(28)23(16-30-14-17-8-2-1-3-9-17)26-25(29)31-15-22-20-12-6-4-10-18(20)19-11-5-7-13-21(19)22/h1-13,22-23H,14-16H2,(H,26,29)(H,27,28)/t23-/m1/s1
化学名
(2R)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-phenylmethoxypropanoic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3955 mL 11.9775 mL 23.9550 mL
5 mM 0.4791 mL 2.3955 mL 4.7910 mL
10 mM 0.2395 mL 1.1977 mL 2.3955 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们