(3R,4R)-4-(benzyloxy)-3-((tert-butoxycarbonyl)amino)pentanoic acid

别名: BOC-O-苯基-L-Β-同型苏氨酸(BOC-Β-同型酪氨酸(BZL)-OH);Boc-O-苄基-L-beta-同苏氨酸;N-叔丁氧羰基-O-苄基-L-BETA-高苏氨酸
目录号: V68542 纯度: ≥98%
(3R,4R)-4-(苄氧基)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)戊酸是苏氨酸类似物。
(3R,4R)-4-(benzyloxy)-3-((tert-butoxycarbonyl)amino)pentanoic acid CAS号: 254101-11-6
产品类别: Amino Acid Derivatives
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
(3R,4R)-4-(苄氧基)-3-((叔丁氧羰基)氨基)戊酸是苏氨酸类似物。
(3R,4R)-4-(苄氧基)-3-((叔丁氧羰基)氨基)戊酸(CAS 254101-11-6)是一种具有戊酸骨架的手性氨基酸衍生物。其4位连接有苄氧基(OBn)基团,3位连接有Boc保护的氨基,C端连接有游离羧酸基团。(3R,4R)立体化学表明两个手性中心均为R构型。其分子量为323.38 g/mol (C1₇H2₅NO₅)。该化合物是苏氨酸衍生物,可用作肽合成和药物化学的结构单元。它尤其适用于将beta-羟基-gamma-氨基酸残基引入肽链中,这些残基可以诱导形成二级结构(例如beta-转角、螺旋),或作为蛋白酶抑制剂的过渡态模拟物。苄氧基可通过氢化去除,从而释放出游离的羟基。
生物活性&实验参考方法
靶点
(3R,4R)-4-(Benzyloxy)-3-((tert-butoxycarbonyl)amino)pentanoic acid does not have a direct biological target as a building block. When incorporated into peptides, the beta-hydroxy-gamma-amino acid motif can target proteases (e.g., serine proteases, HIV protease), where the hydroxyl group may mimic the tetrahedral intermediate of peptide bond hydrolysis. The free hydroxyl (after debenzylation) can also serve as a hydrogen bond donor/acceptor in receptor binding. The compound is a threonine derivative.
体外研究 (In Vitro)
市售麦角补充剂由氨基酸及其衍生物制成。它们能够影响合成代谢激素的释放、运动所需能量的供应、压力下的清晰思维能力以及预防运动引起的肌肉损伤。它们被认为是具有协同增效作用的有益食品成分[1]。
目前尚无该结构单元的体外生物活性数据。它未进行酶抑制或受体结合试验。将其整合到肽或小分子中后,最终化合物可能以低纳摩尔IC50值抑制蛋白酶。例如,他汀类衍生物(含有羟乙烯等排体)是强效的HIV蛋白酶抑制剂。目前尚无该结构单元的相关数据。
体内研究 (In Vivo)
目前尚无体内活性数据。使用该结构单元组装的肽或拟肽可在动物模型中进行评估(例如,蛋白酶抑制剂可在HIV感染小鼠模型中进行评估,或在癌症异种移植模型中进行评估)。目前尚无相关数据。
酶活实验
该化合物不直接用于结合实验。化学分析采用高效液相色谱法(HPLC),使用C18色谱柱,紫外检测波长为210 nm。手性HPLC用于测定立体化学纯度。CDCl3中的核磁共振谱图证实了其结构:Boc保护基(~1.4 ppm),苄氧基(4.4-4.6 ppm和7.3-7.4 ppm)。肽合成:在固相肽合成(SPPS)中,Boc保护的氨基酸可使用HATU/DIEA进行偶联。肽组装完成后,用三氟乙酸(TFA)脱除Boc保护基。苄氧基可通过氢化(H2,Pd/C,甲醇)裂解,从而暴露羟基。
细胞实验
目前尚无基于细胞的实验方案。对于下游肽模拟物,典型的检测方法包括:将细胞(例如,HIV-1感染的MT-4细胞)与测试化合物(0.1 nM - 10 uM)孵育3-5天,通过ELISA检测病毒p24抗原以确定EC50值。或者,也可以在细胞裂解液中进行蛋白酶抑制实验。目前尚无该构建模块的相关数据。
动物实验
尚未对该结构单元进行动物实验。对于下游化合物,典型的体内研究方法为:使用感染 HIV-1 或用 HIV-1 感染细胞处理的重症联合免疫缺陷 (SCID) 小鼠;通过口服或腹腔注射给药(10-100 mg/kg,每日两次)测试化合物,以评估病毒载量降低和存活率。目前尚无相关数据。
药代性质 (ADME/PK)
尚无药代动力学数据。该化合物并非候选药物。若给药,Boc保护基将被裂解,苄氧基可能发生O-去甲基化(CYP450)。游离酸在生理pH值下(pKa约为4-5)会发生电离,从而限制口服吸收。可溶于DMSO和DMF。储存:粉末,-20℃保存。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
安全性:可能引起皮肤和眼睛刺激。吞咽有害(估计LD50 > 2000 mg/kg)。未被列为致癌物或致突变物。使用标准个人防护装备(手套、护目镜、实验服、通风橱)。避免吸入粉尘。苄基在强酸性条件下可裂解(有生成苄基阳离子的风险,但在正常操作条件下是安全的)。固体状态稳定。
参考文献
[1]. Luckose F, et al. Effects of amino acid derivatives on physical, mental, and physiological activities. Crit Rev Food Sci Nutr. 2015;55(13):1793-1144.
其他信息
该化合物并非已获批准的药物,也没有临床试验历史。它是一种用于肽合成和药物化学的研究用化学品。(3R,4R)-4-苄氧基-3-Boc-氨基戊酸是一种β,γ-二氨基酸衍生物(一个氮原子被氧原子取代)。该骨架与许多蛋白酶抑制剂(包括HIV蛋白酶抑制剂,例如沙奎那韦、茚地那韦)中发现的羟乙烯等排体相似。因此,该结构单元对于设计用于治疗病毒性疾病(HIV、HCV)、癌症和炎症的新型蛋白酶抑制剂具有重要价值。它还用于合成构象受限的肽,以用于G蛋白偶联受体(GPCR)的研究。该产品仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C17H25NO5
分子量
323.38
精确质量
323.173
CAS号
254101-11-6
PubChem CID
2761547
外观&性状
Light yellow to yellow viscous liquid
密度
1.135g/cm3
沸点
485.4ºC at 760mmHg
闪点
247.4ºC
蒸汽压
3.1E-10mmHg at 25°C
折射率
1.516
LogP
3.35
tPSA
84.86
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
9
重原子数目
23
分子复杂度/Complexity
385
定义原子立体中心数目
2
SMILES
C[C@@H](OCC1=CC=CC=C1)[C@H](NC(OC(C)(C)C)=O)CC(O)=O
InChi Key
FYZBABHQLFFCHH-TZMCWYRMSA-N
InChi Code
InChI=1S/C17H25NO5/c1-12(22-11-13-8-6-5-7-9-13)14(10-15(19)20)18-16(21)23-17(2,3)4/h5-9,12,14H,10-11H2,1-4H3,(H,18,21)(H,19,20)/t12-,14-/m1/s1
化学名
(3R,4R)-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]-4-phenylmethoxypentanoic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.0923 mL 15.4617 mL 30.9234 mL
5 mM 0.6185 mL 3.0923 mL 6.1847 mL
10 mM 0.3092 mL 1.5462 mL 3.0923 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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