2,4-Dichloro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine

别名: 2,4-二氯-1H-吡咯并[2,3-d]嘧啶;2,4-二氯-7H吡咯[2,3-d]嘧啶;2,6-二氯-7-脱氮嘌呤;2,6-二氯-7-氮杂嘌呤
目录号: V68653 纯度: ≥98%
2,4-二氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶是一种生化化合物,可用作生物医学研究的生物材料或有机/化学试剂。
2,4-Dichloro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine CAS号: 90213-66-4
产品类别: Biochemical Assay Reagents
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产品描述
2,4-二氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶是一种生化化合物,可用作生物材料或生物医学研究中的有机/化学试剂。
2,4-二氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(又称2,4-二氯-1H-吡咯并[2,3-d]嘧啶,CAS 90213-66-4)是一种卤代杂环结构单元,由稠合的吡咯-嘧啶核心(一种7-脱氮嘌呤类似物)构成,其2位和4位带有氯取代基。其分子量为188.01 g/mol (C₆H3Cl2N3)。该化合物是合成多种药物(尤其是激酶抑制剂和核苷类似物)的关键中间体。7-脱氮嘌呤骨架是一种嘌呤等排体,已被广泛用于开发抗癌、抗病毒和抗炎药物。 C-2 和 C-4 位的两个氯原子对亲核取代反应具有反应活性,可以区域选择性地引入各种取代基(胺、醇盐、硫醇)。这使得 2,4-二氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶成为构建药物发现化合物库的多功能前体。
生物活性&实验参考方法
靶点
2,4-Dichloro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine does not have a defined biological target as a building block. However, the 7-deazapurine scaffold (after substitution) can target a variety of enzymes and receptors that recognize purines. These include: adenosine receptors (A1, A2A, A2B, A3), protein kinases (e.g., JAK, BTK, PI3K, EGFR), phosphodiesterases, and nucleoside transporters. The chlorine substituents are placeholders for installing pharmacophoric groups that enhance binding affinity and selectivity. Known drugs containing this scaffold include the JAK inhibitor ruxolitinib and various anticancer agents.
体外研究 (In Vitro)
90213-66-4|托法替尼杂质08的参考标准
该化合物本身不具有直接的体外生物活性;氯原子是后续取代反应所必需的,但并未针对受体结合进行优化。取代后(例如,用苯胺或胺取代),所得化合物可能表现出强效的激酶抑制活性(IC50 在纳摩尔范围内)。例如,鲁索替尼(一种 JAK1/2 抑制剂)的 IC50 值分别为 2.7 nM (JAK1) 和 4.5 nM (JAK2)。二氯结构单元本身没有活性。
体内研究 (In Vivo)
目前尚无该结构单元的体内活性数据。源自该骨架的激酶抑制剂已在癌症(例如,骨髓纤维化或白血病的异种移植小鼠模型)、炎症(例如,胶原诱导性关节炎)和自身免疫性疾病的动物模型中进行了评估。鲁索替尼已获得FDA批准用于治疗骨髓纤维化和真性红细胞增多症。目前尚无该结构单元的相关数据。
酶活实验
该化合物不直接用于结合实验。对于亲核取代反应,典型方案如下:在0℃下,向2,4-二氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(1当量,5 mmol)的无水DMF溶液(20 mL)中加入氢化钠(60%油状溶液,1.1当量)以使N7-H去质子化。30分钟后,加入烷基化试剂(例如,苄基溴,1.1当量)。室温搅拌12小时。用水淬灭反应,用乙酸乙酯萃取,并通过柱色谱法纯化得到7-烷基化产物。后续可在C-4或C-2位进行区域选择性胺化。未进行生物活性测定。
细胞实验
目前尚无针对该构建模块的细胞实验方案。对于由此衍生的激酶抑制剂,典型的细胞实验包括:用测试化合物(0.1 nM - 10 uM)处理癌细胞(例如,用于JAK2驱动的骨髓纤维化的HEL细胞)72小时,并使用CellTiter-Glo试剂盒检测细胞活力。处理2-6小时后,通过Western blot或流式细胞术检测STAT3或STAT5的磷酸化水平。细胞活性IC50值通常与酶抑制率相关。该构建模块本身并不用于此实验。
动物实验
尚未进行该结构单元的动物研究。对于鲁索替尼及其类似物,典型的体内研究方法如下:将 Ba/F3-JAK2V617F 细胞(5×10⁶)皮下注射到 BALB/c 小鼠体内。当肿瘤体积达到 100-150 mm³ 时,小鼠接受为期 14 天的口服试验化合物治疗(15-30 mg/kg,每日两次)。测量肿瘤体积和体重。同时测量脾脏重量和血细胞比容作为药效学指标。该研究不涉及结构单元的给药。
药代性质 (ADME/PK)
目前尚无2,4-二氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶的药代动力学数据。它并非候选药物。如果给药(但实际上并未给药),该化合物很可能与谷胱甘肽或其他硫醇发生快速的亲核取代反应,从而导致解毒。未见ADME研究报道。可溶于DMSO、DMF和THF。储存:粉末,-20℃避光防潮保存。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
安全性:可能引起皮肤和眼睛刺激。吞咽有害(估计LD50 > 2000 mg/kg)。未被列为致癌物或致突变物。使用标准个人防护装备:手套、实验服、护目镜、通风橱。避免吸入粉尘。在推荐的储存条件下稳定。
其他信息
2,4-二氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶并非已获批准的药物,也没有临床试验历史。它是一种用于药物合成的研究用化学品。它是合成JAK抑制剂(如鲁索替尼、巴瑞替尼、托法替尼类似物)、EGFR抑制剂(如奥希替尼)和其他蛋白激酶抑制剂的关键中间体。7-脱氮嘌呤环系也用于抗病毒核苷类似物(例如,抗HCV、HIV和埃博拉病毒)的设计。该结构单元可从化学品供应商处购买,并广泛用于药物化学研究中,以构建用于高通量筛选的化合物库。目前尚无已获批准的药物含有未保护的2,4-二氯形式;在最终的药物分子中,氯原子总是被取代。该化合物仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C6H3CL2N3
分子量
188.01
精确质量
186.97
CAS号
90213-66-4
PubChem CID
14116871
外观&性状
Off-white to yellow solid powder
密度
1.7±0.1 g/cm3
沸点
306.2±24.0 °C at 760 mmHg
熔点
247-250ºC
闪点
167.7±8.5 °C
蒸汽压
0.0±0.6 mmHg at 25°C
折射率
1.724
LogP
2.3
tPSA
41.57
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
2
可旋转键数目(RBC)
0
重原子数目
11
分子复杂度/Complexity
155
定义原子立体中心数目
0
SMILES
ClC1N=C2C(C=CN2)=C(Cl)N=1
InChi Key
GHXBPCSSQOKKGB-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C6H3Cl2N3/c7-4-3-1-2-9-5(3)11-6(8)10-4/h1-2H,(H,9,10,11)
化学名
2,4-dichloro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O: < 0.1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 5.3189 mL 26.5943 mL 53.1887 mL
5 mM 1.0638 mL 5.3189 mL 10.6377 mL
10 mM 0.5319 mL 2.6594 mL 5.3189 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们