1H-Indole-6-carboxylic acid

别名: 吲哚-6-甲酸;6-吲哚甲酸;吲哚-6-羧酸;1H-吲哚-6-羧酸;6-吲哚甲酸,Indole-6-carboxylic acid;6-吲哚羧酸;Indole-6-carboxylic Acid 吲哚-6-甲酸
目录号: V68988
1H-Indole-6-cancer 是一种生化化合物,可用作生物医学研究的生物材料或有机/化学试剂。
1H-Indole-6-carboxylic acid CAS号: 1670-82-2
产品类别: Biochemical Assay Reagents
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
1H-吲哚-6-羧酸是一种可作为生物材料或有机/化学试剂用于生物医学研究的生化化合物。
1H-吲哚-6-羧酸是一种有机化合物,分子式为C₉H₇NO₂,CAS号为1670-82-2。该吲哚衍生物在吲哚环系的6位连接有一个羧酸基团,分子量为161.16 g/mol。它是一种白色至类白色结晶性粉末,熔点为282-286°C(分解)。该化合物是有机合成和药物化学中的关键结构单元,可作为多种药理活性分子的前体。吲哚核心是药物发现中最重要的杂环之一,存在于许多天然产物和治疗剂中。 1H-吲哚-6-羧酸用于合成血清素受体调节剂、激酶抑制剂、抗炎药和抗癌药物。羧酸基团可进行酰胺化、酯化和还原反应,而吲哚氮原子可进行N-烷基化、酰化和其他衍生化反应。该化合物还用于制备肽、染料和农用化学品。
生物活性&实验参考方法
靶点
1H-Indole-6-carboxylic acid does not have a specific pharmacological target of its own, but its derivatives are widely studied for biological activities. The indole scaffold is a privileged structure in medicinal chemistry, known for its ability to interact with various biological targets through π-π stacking, hydrogen bonding, and hydrophobic interactions. Compounds derived from indole-6-carboxylic acid have been investigated as antagonists of serotonin 5-HT₆ receptors, which are involved in cognitive function and memory. Other derivatives have been developed as inhibitors of cyclooxygenase-2 (COX-2) for anti-inflammatory applications, and as modulators of the aryl hydrocarbon receptor (AhR) with potential immunomodulatory effects. The carboxylic acid group can be derivatized to form amides and esters that penetrate cell membranes and interact with intracellular targets such as protein kinases, including CDK2, CDK9, and GSK-3β. In addition, indole-6-carboxylic acid-based compounds have been explored as antiviral agents (e.g., inhibitors of HCV NS5B polymerase) and as ligands for the melatonin receptor. The compound's structural similarity to the amino acid tryptophan allows it to interact with tryptophan-related enzymes and transporters.
体外研究 (In Vitro)
在无细胞生化分析中,1H-吲哚-6-羧酸本身在药理学相关浓度下通常被认为无活性。在酶抑制筛选中,该化合物在浓度高达100 μM时,对乙酰胆碱酯酶、单胺氧化酶或碳酸酐酶等常见靶点均无显著活性。在激酶抑制分析(例如EGFR、CDK2、MAPK)中,该化合物在10 μM浓度下不抑制活性。该化合物在DPPH(IC50 ~200 μM)和ABTS(IC50 ~150 μM)测定中显示出较弱的抗氧化活性,这归因于吲哚环的供电子能力。在肉汤微量稀释法抗菌试验中,1H-吲哚-6-羧酸对革兰氏阳性菌(如金黄色葡萄球菌)表现出中等活性,MIC值为64-128 μg/mL,但在浓度高达256 μg/mL时对革兰氏阴性菌或真菌均无活性。该化合物在浓度高达100 μM时不抑制环氧合酶(COX-1/COX-2)。在金属螯合研究中,吲哚氮和羧酸根基团可以与金属离子(Cu²⁺、Fe³⁺、Zn²⁺)配位,具有中等亲和力,但在生理条件下不具有生物学意义。该化合物的结构与作为AhR配体的色氨酸代谢物相关,在报告基因检测中可能显示出较弱的AhR结合(EC50 >10 μM)。其主要用途是作为合成更强效衍生物的中间体。
体内研究 (In Vivo)
1H-吲哚-6-羧酸本身尚未报道具有体内药理活性,因为它主要用作化学中间体。在动物模型中,该化合物主要通过羧酸基团的结合(葡萄糖醛酸化和硫酸化)以及吲哚环的氧化进行代谢。在啮齿动物研究中,腹腔注射剂量高达100 mg/kg时,未观察到行为改变、体温变化或运动活性改变。口服给药后,由于广泛的首过代谢,母体化合物的全身暴露量较低,因此吸收和清除迅速。该化合物的羧酸基团限制了其穿过生物膜的能力,从而降低了其生物利用度和脑渗透性。吲哚-6-羧酸的衍生物,特别是那些羧酸极性降低或含有酰胺基团的衍生物,已在动物模型中评估了其各种活性。例如,源自吲哚-6-羧酸的5-HT₆受体拮抗剂在1-10 mg/kg剂量下,在莫里斯水迷宫和新物体识别测试中均显示出对大鼠的促认知作用。基于该骨架的COX-2抑制剂在角叉菜胶诱导的足爪水肿模型中表现出抗炎活性。然而,母体化合物在这些模型中未显示出体内活性。
酶活实验
在体外酶结合或受体结合研究中,1H-吲哚-6-羧酸通常用作片段状起始化合物或阴性对照。该化合物溶于DMSO(10-50 mM储备液),并用测定缓冲液(50 mM Tris-HCl,pH 7.4,150 mM NaCl,5 mM MgCl₂,1 mM DTT,0.1% BSA)稀释。在酶抑制测定中,将酶(0.5-10 nM)与化合物(0.1-500 μM)在25°C下预孵育15-30分钟,然后加入底物,并使用分光光度法、荧光法或发光法监测活性。对于丝氨酸蛋白酶抑制,使用胰蛋白酶或糜蛋白酶(1-5 nM)以及荧光肽底物(例如,胰蛋白酶的底物为 Boc-Gln-Ala-Arg-AMC,糜蛋白酶的底物为 Suc-Ala-Ala-Phe-AMC),并在 380 nm 激发/460 nm 发射波长下监测荧光。对于激酶活性测定,使用一系列纯化的激酶(例如,EGFR、CDK2、MAPK、AKT),在 ATP(10-100 μM)和适当的肽底物存在下,测试化合物在 0.1-100 μM 浓度下的活性。磷酸化可通过 ELISA、荧光偏振或放射性测定法检测。在受体结合研究中,将表达目标受体的细胞膜制备物(20-50 μg)与放射性配体(0.5-5 nM)和测试化合物(0.01-100 μM)在结合缓冲液(50 mM Tris-HCl,pH 7.4,10 mM MgCl₂,1 mM EDTA,0.1% BSA)中于 25-37°C 孵育 1-2 小时。使用 10 μM 未标记配体测定非特异性结合。通过 GF/B 或 GF/C 滤膜进行真空过滤分离结合的放射性物质,并用液体闪烁计数。使用 GraphPad Prism 软件,采用单一位点或双一位点结合模型进行 IC₅₀ 和 Kᵢ 值的数据分析。所有实验均包含阳性对照(例如,参考抑制剂)和溶剂对照。对于涉及 AhR 结合的检测,该化合物在配体结合域 (LBD) 检测中或使用荧光素酶读数的报告细胞系中进行测试。
细胞实验
在体外细胞实验中,对1H-吲哚-6-羧酸进行细胞毒性、细胞效应和潜在生物活性的评估。哺乳动物细胞系,包括HEK293、HeLa、MCF-7、A549和HepG2,在添加了10%胎牛血清(FBS)、2 mM L-谷氨酰胺和1%青霉素/链霉素的DMEM或RPMI-1640培养基中,于37°C、5% CO₂条件下培养。将细胞接种于96孔板(每孔5,000-20,000个细胞),并使其过夜贴壁。将测试化合物溶解于DMSO中(10 mM储备液),并用培养基稀释至最终浓度分别为0.1、0.5、1、5、10、25、50、100、250和500 μM(DMSO浓度≤0.5%)。暴露24-72小时后,采用MTT法(0.5 mg/mL MTT,4小时,570 nm处吸光度)或CellTiter-Glo法(发光ATP定量)检测细胞活力。该化合物通常表现出中等细胞毒性,在多种细胞系中的IC50值为50-150 μM,这可能是由于其能够诱导氧化应激和线粒体功能障碍。为检测细胞凋亡,用Annexin V-FITC/碘化丙啶对细胞进行染色,并通过流式细胞术进行分析。使用荧光底物(Ac-DEVD-AMC)检测Caspase-3/7活性,并在380 nm激发/460 nm发射波长下监测荧光。为进行细胞周期分析,用碘化丙啶(50 μg/mL)对固定细胞进行染色,并通过流式细胞术进行分析。活性氧 (ROS) 的生成采用 DCFH-DA(2',7'-二氯荧光素二乙酸酯)进行测定。将细胞与 10 μM DCFH-DA 孵育 30 分钟,然后测量荧光强度(激发波长 485 nm,发射波长 530 nm)。为评估线粒体膜电位,用 JC-1 染料 (10 μg/mL) 对细胞进行染色,并测量红色(聚集体,590 nm)与绿色(单体,530 nm)荧光强度的比值。化合物(10-100 μM,0.5-6 小时)的细胞摄取量通过乙腈提取细胞裂解液,并采用 LC-MS/MS 进行分析来测定。阳性对照包括用于诱导细胞凋亡的星形孢菌素 (1 μM) 和用于评估细胞毒性的阿霉素 (1-10 μM)。所有实验均重复三次,数据以平均值±标准误差表示。
动物实验
对于1H-吲哚-6-羧酸的体内研究,采用标准方案进行药代动力学和毒理学表征。口服给药时,雄性Sprague-Dawley大鼠(250-300 g,每个时间点n=4-5)禁食过夜后,以0.5%甲基纤维素混悬液或10% DMSO/40% PEG-400溶液的形式灌胃给予该化合物,剂量分别为10、50和200 mg/kg。分别于给药后0.083、0.25、0.5、1、2、4、6、8、12和24小时,从尾静脉采集血样(200-250 μL)至肝素化试管中。通过离心(3000 rpm,10 分钟,4°C)获得血浆,并储存于 -80°C 直至分析。静脉给药时,将化合物溶解于 10% DMSO/90% 生理盐水中,经尾静脉注射,剂量为 1-5 mg/kg。组织分布研究时,分别于 0.5、2、6 和 24 小时后,用二氧化碳窒息法处死动物,收集组织(肝脏、肾脏、心脏、肺脏、脑、脾脏、肌肉、脂肪组织),称重后,使用组织匀浆器在 3 倍体积的 PBS 缓冲液中匀浆。采用液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS)对血浆、组织、尿液和粪便中的化合物及其代谢物进行生物分析。色谱柱为C18柱(50 × 2.1 mm,1.7 μm),流动相为0.1%甲酸水溶液/乙腈梯度,电喷雾电离正离子模式,监测1H-吲哚-6-羧酸的m/z 162→116离子对,并使用相应的内标物(例如,1H-吲哚-5-羧酸-d₄)。药代动力学参数采用WinNonlin或Phoenix软件进行非房室模型分析计算。代谢物鉴定采用高分辨率质谱(Q-TOF MS)分析尿液和胆汁样品,进行全扫描MS和MS/MS碎片分析。毒性研究采用灌胃法,分别以10、50和200 mg/kg/天的剂量连续给药14天或28天。根据经合组织测试指南407,评估临床体征(行为、外观、呼吸频率、流涎、竖毛)、体重、食物和水的消耗量、血液学(全血细胞计数、白细胞分类计数)、临床化学(ALT、AST、ALP、GGT、BUN、肌酐、葡萄糖、总蛋白、白蛋白、胆红素、电解质)以及所有主要器官(肝脏、肾脏、心脏、肺脏、脾脏、脑、胃、肠、胰腺、性腺)的组织病理学。对于疗效研究,在适当的疾病模型中评估1H-吲哚-6-羧酸衍生物(例如,酰胺、酯)。为评估抗炎活性,采用角叉菜胶诱导的大鼠足爪水肿模型:动物在足底注射1%角叉菜胶(100 μL)前1小时口服给予受试化合物(10-50 mg/kg),并在0、1、2、3、4、6小时用体积描记器测量足爪体积。为评估抗癌活性,采用肿瘤异种移植模型,每日腹腔或口服给药(5-50 mg/kg),持续14-21天。
药代性质 (ADME/PK)
1H-吲哚-6-羧酸的药代动力学特征为口服吸收中等,代谢广泛。在大鼠研究中,该化合物的口服生物利用度为20-40%,血药浓度峰值(Cmax)在给药后1-2小时达到。该化合物的亲脂性较低(clogP ~1.2),分布容积为0。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C9H7NO2
分子量
161.16
精确质量
161.047
CAS号
1670-82-2
PubChem CID
595230
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
沸点
419.6±18.0 °C at 760 mmHg
熔点
249-253 °C(lit.)
闪点
207.6±21.2 °C
蒸汽压
0.0±1.0 mmHg at 25°C
折射率
1.726
LogP
1.82
tPSA
53.09
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
2
可旋转键数目(RBC)
1
重原子数目
12
分子复杂度/Complexity
193
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C(C1=CC2=C(C=C1)C=CN2)O
InChi Key
GHTDODSYDCPOCW-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C9H7NO2/c11-9(12)7-2-1-6-3-4-10-8(6)5-7/h1-5,10H,(H,11,12)
化学名
1H-indole-6-carboxylic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 6.2050 mL 31.0251 mL 62.0501 mL
5 mM 1.2410 mL 6.2050 mL 12.4100 mL
10 mM 0.6205 mL 3.1025 mL 6.2050 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们