Farnesyl pyrophosphate (Farnesyl diphosphate)

别名: 法尼基二磷酸-三铵盐; 法尼基焦磷酸(FPP);法尼基单磷酸-三铵盐;法尼基焦磷酸(FPP)
目录号: V70132 纯度: ≥95%
法尼基焦磷酸(法尼基二磷酸)是一种 15 碳类异戊二烯,是甲羟戊酸 (MVA) 途径中的代谢中间体。
Farnesyl pyrophosphate (Farnesyl diphosphate) CAS号: 13058-04-3
产品类别: Endogenous Metabolite
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10mg
25mg
50mg
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产品描述
法尼基焦磷酸(法尼基二磷酸)是一种15碳异戊二烯类化合物,也是甲羟戊酸(MVA)途径中的代谢中间体。法尼基焦磷酸是TRPM2(色氨酸通道)激动剂,可激活TRPM2通道使其开放,从而允许离子流入细胞。法尼基焦磷酸是胆固醇合成、泛醌合成、蛋白质法尼基化修饰以及香叶基-香叶基焦磷酸(GGPP)合成的关键分支底物。
法尼基焦磷酸(法尼基二磷酸)是一种15碳异戊二烯类化合物,也是甲羟戊酸(MVA)途径中的代谢中间体。该内源性代谢物的分子量为382.33,分子式为C15H28O7P2,包含一条疏水性的15碳异戊二烯链和一个带高电荷的焦磷酸基团。它作为胆固醇合成、泛醌合成、蛋白质法尼基化修饰和香叶基焦磷酸(GGPP)合成的关键底物发挥作用。法尼基焦磷酸还可作为TRPM2(TRP通道)激动剂,激活TRPM2通道使其开放,从而允许离子流入细胞。该化合物仅供研究使用,不得用于人体治疗。
生物活性&实验参考方法
靶点
Farnesyl pyrophosphate targets the transient receptor potential melastatin 2 (TRPM2) channel as an agonist, activating TRPM2 to open and allowing ion influx into cells. It also serves as a substrate for multiple enzymatic pathways, including cholesterol synthesis, ubiquinone synthesis, protein farnesylation, and geranyl-geranyl pyrophosphate (GGPP) synthesis. In stroke, farnesyl pyrophosphate functions as a danger signal that causes immediate cell death and subsequent loss of neurons. The cation channel TRPM2 and extracellular calcium influx are key mediators of the cell death caused by farnesyl pyrophosphate.
体外研究 (In Vitro)
在卒中中,法尼基焦磷酸盐是一种众所周知的危险信号,可导致细胞立即死亡并随后造成神经元丢失。法尼基焦磷酸盐具有高电荷的焦磷酸头部基团和疏水性的15碳异戊二烯链,可导致细胞突然死亡,而不会影响细胞的下游代谢途径。从机制上讲,阳离子通道瞬时受体电位melastatin 2 (TRPM2) 和细胞外钙离子内流是法尼基焦磷酸盐诱导细胞死亡的关键因素。TRPM2 被法尼基焦磷酸盐激活,从而打开离子内流[1]。体外研究表明,法尼基焦磷酸盐在卒中模型中是一种众所周知的危险信号,可导致细胞立即死亡并随后造成神经元丢失。法尼基焦磷酸盐具有高电荷的焦磷酸头部基团和疏水性的15碳异戊二烯链,可导致细胞突然死亡,而不会影响细胞的下游代谢途径。从机制上讲,阳离子通道TRPM2和细胞外钙离子内流是法尼基焦磷酸诱导细胞死亡的关键因素。TRPM2被法尼基焦磷酸激活,从而打开离子通道并允许离子内流。在基于胶原蛋白的细胞侵袭实验中,TRPM2作为异戊二烯化激动剂作用于人骨肉瘤细胞。
体内研究 (In Vivo)
在小鼠大脑中动脉闭塞(MCAO)模型中,法尼基焦磷酸酯在脑内积聚,提示法尼基焦磷酸酯和TRPM2危险信号通路在缺血性损伤中发挥作用。MVA通路和法尼基焦磷酸酯/TRPM2信号通路在脑缺血和可能的神经退行性疾病中具有重要功能[1]。体内研究表明,法尼基焦磷酸酯在小鼠大脑中动脉闭塞(MCAO)模型中积聚,提示法尼基焦磷酸酯和TRPM2危险信号通路在缺血性损伤中发挥作用。MVA通路和法尼基焦磷酸酯/TRPM2信号通路在脑缺血和可能的神经退行性疾病中具有重要功能。该化合物是合成更复杂的倍半萜类化合物、高级萜类化合物和甾类化合物的关键中间体。人们已经发现了法尼基焦磷酸及其相应的醇法尼醇的多种生物学功能。
酶活实验
对于 TRPM2 通道激活实验,首先培养表达 TRPM2 通道的细胞(例如 HEK293 细胞),并用钙敏感荧光染料标记。将法尼基焦磷酸溶解于合适的缓冲液中,并以不同浓度加入细胞。使用荧光酶标仪监测细胞内钙离子流,从而测定 TRPM2 通道的激活情况。定量分析该化合物打开 TRPM2 通道并允许离子内流的能力。对于酶活性测定,法尼基焦磷酸用作异戊二烯化反应或代谢途径研究的底物。反应在合适的缓冲液中进行,并使用纯化的酶(例如法尼基转移酶)。产物生成量通过高效液相色谱 (HPLC)、液相色谱-质谱联用 (LC-MS) 或放射性测定法进行定量。所有实验均设置重复,并设置适当的对照。
细胞实验
对于体外细胞实验,将表达TRPM2通道的细胞(例如HEK293细胞)或目标细胞系在标准条件下(37°C,5% CO2)于合适的培养基中培养。将法尼基焦磷酸溶解于DMSO或合适的缓冲液中,并用培养基稀释至所需浓度。用该化合物处理细胞指定时间。通过使用荧光指示剂测量钙离子内流、细胞活力检测(例如MTT法)或凋亡标志物来评估细胞反应。对于侵袭实验,使用人骨肉瘤细胞进行基于胶原的细胞侵袭实验,并以法尼基焦磷酸作为异戊二烯化激动剂。每个浓度均在重复孔中进行测试,并设置溶剂对照。
动物实验
在体内动物研究中,法尼基焦磷酸盐已在小鼠大脑中动脉闭塞(MCAO)模型中用于研究缺血性损伤。小鼠接受MCAO手术以诱导脑缺血。收集脑组织并分析法尼基焦磷酸盐的积累情况。该化合物通常以合适的制剂通过适当的途径(例如,静脉注射或腹腔注射)给药。给药方案因研究目的而异。在预定的时间点收集组织样本,用于分析法尼基焦磷酸盐水平及其下游信号通路标志物。可能还会进行行为学评估和组织病理学检查。所有操作均遵循机构动物护理和使用委员会的指导原则。
药代性质 (ADME/PK)
法尼基焦磷酸酯的药代动力学性质符合内源性异戊二烯代谢物的特征。该化合物的分子量为382.33,分子式为C15H28O7P2。通常以粉末形式储存于-20℃下可保存长达3年,或在4℃下可保存长达2年;溶剂中储存于-80℃下可保存长达6个月,或在-20℃下可保存长达1个月。在普通运输过程中,该化合物在室温下可稳定保存数日。溶解性:大多数情况下可溶于DMSO;若不溶于DMSO,可尝试其他溶剂,例如水、乙醇或DMF。在室温下,该化合物为固体。该化合物的CAS号为13058-04-3。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
法尼基焦磷酸酯的毒性信息属于内源性代谢物和研究用化学品的特征。在中风模型中,法尼基焦磷酸酯作为一种危险信号,可导致急性细胞死亡和随后的神经元丢失。该化合物通过激活TRPM2和钙离子内流引起细胞猝死。处理该化合物时应遵循标准的实验室安全预防措施,包括使用适当的个人防护装备(手套、实验服、护目镜)。应在通风良好的区域操作该化合物。避免产生粉尘和吸入。该化合物仅供研究使用,不得用于人体治疗。目前尚无临床毒性数据。
参考文献

[1]. Farnesyl pyrophosphate is a new danger signal inducing acute cell death. PLoS Biol. 2021 Apr 26;19(4):e3001134.

其他信息
2-trans,6-trans-法尼基二磷酸是法尼基二磷酸的反式、反式立体异构体。它是大肠杆菌和小鼠中的一种代谢产物。它是2-trans,6-trans-法尼基二磷酸的共轭酸(3-)。法尼基焦磷酸是大肠杆菌(K12株,MG1655株)中发现或产生的代谢产物。法尼基二磷酸也在雷公藤、粘球菌和其他相关数据的生物中被报道。法尼基焦磷酸是酿酒酵母中发现或产生的代谢产物。2-trans,6-trans-法尼基二磷酸是酿酒酵母中发现或产生的代谢产物。
法尼基焦磷酸(法尼基二磷酸)是一种15碳的异戊二烯类化合物,是美伐酸(MVA)途径中的关键代谢中间体。它是一种TRPM2激动剂,能够激活TRPM2以打开并允许离子流入。该化合物作为胆固醇合成、泛醌合成、蛋白质法尼基化修饰和香叶基-香叶基焦磷酸(GGPP)合成的关键分支底物。在中风中,它作为一种危险信号导致急性细胞死亡。法尼基焦磷酸盐/TRPM2信号轴在脑缺血和神经退行性疾病中发挥重要作用。该化合物仅供研究使用,未报告临床开发或监管批准。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C15H28O7P2
分子量
382.33
精确质量
433.21
CAS号
13058-04-3
相关CAS号
Farnesyl Pyrophosphate ammonium
PubChem CID
445713
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
闪点
16 °C - closed cup (lit.)
LogP
5.603
tPSA
142.63
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
11
重原子数目
24
分子复杂度/Complexity
568
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C/C(=C/CC/C(=C/CC/C(=C/COP(OP(=O)(O)O)(O)=O)/C)/C)/C
InChi Key
VWFJDQUYCIWHTN-YFVJMOTDSA-N
InChi Code
InChI=1S/C15H28O7P2/c1-13(2)7-5-8-14(3)9-6-10-15(4)11-12-21-24(19,20)22-23(16,17)18/h7,9,11H,5-6,8,10,12H2,1-4H3,(H,19,20)(H2,16,17,18)/b14-9+,15-11+
化学名
phosphono [(2E,6E)-3,7,11-trimethyldodeca-2,6,10-trienyl] hydrogen phosphate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.6155 mL 13.0777 mL 26.1554 mL
5 mM 0.5231 mL 2.6155 mL 5.2311 mL
10 mM 0.2616 mL 1.3078 mL 2.6155 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们