Digalacturonic acid

别名: Digalacturonic acid; 5894-59-7; Digalacturonate; C02273; D-4-O-alpha-D-Galactopyranuronosyl-galacturonic Acid;; AC1L97UT; alpha-D-galacturonosyl-(1->4)-D-galacturonate; SureCN13589989; 二半乳糖醛酸;乳糖醛酸
目录号: V70942 纯度: ≥98%
双半乳糖醛酸是果胶或果胶酸的代谢产物。
Digalacturonic acid CAS号: 5894-59-7
产品类别: Endogenous Metabolite
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
Other Sizes
点击了解更多
  • 与全球5000+客户建立关系
  • 覆盖全球主要大学、医院、科研院所、生物/制药公司等
  • 产品被大量CNS顶刊文章引用
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
二半乳糖醛酸是果胶或果胶酸的代谢产物。二半乳糖醛酸可用于与蛋白酶K等酶共结晶。
二半乳糖醛酸是一种二糖,由两个D-半乳糖醛酸单元通过糖苷键连接而成。它是果胶或果胶酸的代谢产物,天然来源于植物中果胶的分解代谢。由于其潜在的生物活性以及作为更复杂碳水化合物的组成单元,该化合物在生物化学、食品科学和药理学领域具有重要意义。
生物活性&实验参考方法
靶点
Human Endogenous Metabolite
No specific drug target identified; acts as a pectin metabolite and may influence gastric mucosal defense mechanisms.
体外研究 (In Vitro)
利用核磁共振数据和分子力学计算,分析了二半乳糖醛酸及其钠盐的溶液构象。通过CHARMM和SOLVOL程序计算孤立分子以及二甲基亚砜和水溶液中分子的弛豫势能面(φ, ψ),表征了糖苷键周围的柔性。测量了单键和三键质子-碳耦合常数,并利用NOESY实验估算了H-1'-H-4距离。利用计算得到的势能面确定了核磁共振数据的理论系综平均值。实验数据与理论数据吻合良好。计算结果表明,溶剂对两种化合物的溶液行为均有显著影响。溶剂化作用使二半乳糖醛酸的真空最低能量构象体稳定,而溶剂则诱导二半乳糖醛酸钠发生构象变化。将稳定构象体外推至多糖链表明,聚(半乳糖醛酸)在溶液中以三螺旋形式存在,而聚(半乳糖醛酸钠)以二螺旋形式存在[1]。
二半乳糖醛酸是果胶或果胶酸的代谢产物,在半乳糖醛酸代谢研究中被用作底物,以鉴定、区分和表征内切和外切聚半乳糖醛酸酶和葡萄糖醛酸酶。它有助于蛋白酶K等酶的共结晶,从而辅助这些酶的结构生物学研究。
体内研究 (In Vivo)
二半乳糖醛酸是一种治疗胃溃疡和促进消化的药物。它具有抗炎特性,并能影响胃黏膜的防御机制,因此可有效治疗胃炎和胃食管反流病(GERD)等疾病。二半乳糖醛酸在体内来源于果胶的分解代谢,可能有助于发挥膳食果胶对胃肠道的益处。
酶活实验
蛋白酶K是一种枯草杆菌蛋白酶样真菌蛋白酶,它是从含有二半乳糖醛酸(DGA)的小分子混合物中结晶得到的。晶体结构分辨率为1.32 Å,精修后的R因子为0.158。最终模型除了蛋白质外,还包含两个钙离子、379个水分子、一个DGA分子和一个部分占据的HEPES分子。DGA分子的一个糖基恰好位于晶体学二重轴上;第二个糖环未被观察到。DGA分子通过涉及Ser150和水分子的氢键网络,沿二重轴与两个蛋白质分子结合。其中一个钙离子结合位点此前未见报道。这项研究进一步阐明了小分子通过形成分子间晶格相互作用参与大分子结晶的过程[2]。
受体结合试验并非标准方法。通常采用以二半乳糖醛酸为底物的酶活性测定来表征聚半乳糖醛酸酶的活性。反应混合物包含二半乳糖醛酸、酶源和缓冲液(pH 4-5)。在30-37℃下孵育不同时间(15-60分钟)后,使用二硝基水杨酸(DNS)试剂测定还原糖的释放量,或通过高效液相色谱(HPLC)分析反应产物。
细胞实验
在基于细胞的研究中,可将肠上皮细胞或胃细胞系用浓度为 0.1-10 mg/mL 的二半乳糖醛酸处理 1-24 小时。通过 ELISA 或 qPCR 检测炎症标志物(IL-6、TNF-α、COX-2)、氧化应激和胃黏膜防御(黏液生成、前列腺素 E2),以评估其抗炎和胃保护作用。
动物实验
本研究在啮齿动物胃溃疡模型中评估了该药物对胃肠道的体内保护作用。大鼠禁食过夜后,灌胃给予二半乳糖醛酸(10-100 mg/kg),随后用乙醇、吲哚美辛或应激诱导胃损伤。1-4小时后,取出胃并测量病变面积。对胃黏膜参数进行组织学和生化分析。
药代性质 (ADME/PK)
二半乳糖醛酸的药代动力学特性尚未完全阐明。作为一种二糖,它可能在小肠中吸收不良,并可能完整地到达结肠,在那里被肠道菌群发酵。与其他寡糖一样,口服给药后其全身生物利用度预计较低。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
二半乳糖醛酸的毒性数据有限。由于它是膳食果胶的天然代谢产物,因此通常认为在正常摄入量下是安全的。标准的临床前安全性研究包括啮齿动物的急性及重复给药口服毒性试验。现有文献中尚未报道其具有显著毒性。
参考文献

[1]. Conformational study of digalacturonic acid and sodium digalacturonate in solution. Carbohydr Res. 1994 Aug 17;261(2):187-202.

[2]. High-resolution structure of proteinase K cocrystallized with digalacturonic acid. Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun. 2009 Mar 1;65(Pt 3):192-8.

其他信息
α-D-GalpA-(1->4)-D-GalpA 是一种二半乳糖醛酸,其中 α-D-吡喃半乳糖醛酸单元通过 α-(1->4)-糖苷键与 D-吡喃半乳糖醛酸单元相连。它是 α-D-半乳糖醛酸 (2-) 的共轭酸。据报道,二半乳糖醛酸存在于菜豆(Phaseolus vulgaris)中,相关数据可供参考。
二半乳糖醛酸是果胶的天然代谢产物,存在于水果和蔬菜中。它是研究果胶降解途径和植物细胞壁代谢的重要研究工具。此外,它还用于酶的共结晶,以进行结构生物学研究。该化合物并非药物,也没有获批的临床适应症,但它作为一种促进胃部健康的营养保健品,在胃肠病学领域具有潜在的应用价值。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C12H18O13
分子量
370.26
精确质量
370.075
CAS号
5894-59-7
PubChem CID
439694
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
密度
1.97 g/cm3
沸点
793.8ºC at 760 mmHg
闪点
296.6ºC
折射率
1.682
LogP
-4.2
tPSA
223.67
氢键供体(HBD)数目
8
氢键受体(HBA)数目
13
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
25
分子复杂度/Complexity
511
定义原子立体中心数目
9
SMILES
[C@@H]1([C@H]([C@H](O[C@@H]([C@@H]1O)O[C@@H]2[C@@H]([C@H](C(O[C@@H]2C(=O)O)O)O)O)C(=O)O)O)O
InChi Key
IGSYEZFZPOZFNC-LKIWRGPLSA-N
InChi Code
InChI=1S/C12H18O13/c13-1-2(14)7(9(18)19)25-12(5(1)17)24-6-3(15)4(16)11(22)23-8(6)10(20)21/h1-8,11-17,22H,(H,18,19)(H,20,21)/t1-,2+,3+,4+,5+,6+,7-,8-,11?,12-/m0/s1
化学名
(2S,3R,4S,5R,6S)-6-[(2S,3R,4R,5R)-2-carboxy-4,5,6-trihydroxyoxan-3-yl]oxy-3,4,5-trihydroxyoxane-2-carboxylic acid
别名
Digalacturonic acid; 5894-59-7; Digalacturonate; C02273; D-4-O-alpha-D-Galactopyranuronosyl-galacturonic Acid;; AC1L97UT; alpha-D-galacturonosyl-(1->4)-D-galacturonate; SureCN13589989;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
View More

注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
View More

口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.7008 mL 13.5040 mL 27.0080 mL
5 mM 0.5402 mL 2.7008 mL 5.4016 mL
10 mM 0.2701 mL 1.3504 mL 2.7008 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们