CLK8

别名: CLK-8
目录号: V71987 纯度: ≥98%
CLK8 是一种有效且特异性的 CLOCK 抑制剂,可破坏 CLOCK 和 BMAL1 之间的相互作用并干扰 CLOCK 核易位。
CLK8 CAS号: 898920-65-5
产品类别: Others 12
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
50mg
Other Sizes
点击了解更多
  • 与全球5000+客户建立关系
  • 覆盖全球主要大学、医院、科研院所、生物/制药公司等
  • 产品被大量CNS顶刊文章引用
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
CLK8 是一种强效且特异性的 CLOCK 抑制剂,它能破坏 CLOCK 与 BMAL1 之间的相互作用,并干扰 CLOCK 的核转位。CLK8 可用于研究与昼夜节律减弱相关的疾病。
CLK8 是一种高效且特异性的小分子 CLOCK(昼夜节律运动输出周期抑制蛋白)抑制剂。它作为一种选择性 CLOCK 抑制剂,能够破坏 CLOCK 与其结合伴侣 BMAL1 之间的相互作用,而 BMAL1 是昼夜节律时钟机制的核心组成部分。因此,CLK8 是研究昼夜节律相关疾病的宝贵工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
CLOCK[1]
The primary target of CLK8 is the CLOCK protein. It binds to and interferes with CLOCK activity, specifically disrupting the protein-protein interaction between CLOCK and BMAL1. CLK8 does not affect the interaction of CLOCK with other mutants like CLOCK-F80A or K220A, confirming its selectivity for the native binding interface with BMAL1.
体外研究 (In Vitro)
在U2OS和NIH 3T3细胞中,CLK8(10-40 μM;4-6天)以剂量依赖的方式增加Bmal1-dLuc信号的幅度,且不引起周期性变化[1]。在HEK293T细胞中,CLK8(10-40 μM)减弱BMAL1-CLOCK的连接,但对CLOCK-F80A、K220A和BMAL1之间的相互作用没有影响[1]。在U2OS细胞中,CLK8(20 μM;2天)降低CLOCK的核定位[1]。
体外实验表明,CLK8 通过调节昼夜节律的振幅发挥其活性。在 U2OS 和 NIH 3T3 细胞中,用浓度为 10 至 40 uM 的 CLK8 处理 4 至 6 天,可剂量依赖性地增强 Bmal1-dLuc 报告基因信号的振幅,而不会改变振荡周期。
体内研究 (In Vivo)
在小鼠肝脏全细胞裂解液中,CLK8(25 mg/kg;单次腹腔注射)可降低 CLOCK 水平,而对 BMAL1 和 CRY1 水平无影响[1]。在 5 和 25 mg/kg 剂量下,CLK8(5-1000 mg/kg;腹腔注射)未引起任何死亡或临床症状(呼吸困难、反射减弱、运动减少、竖毛、驼背和角膜混浊)[1]。
体内实验表明,CLK8 能有效降低小鼠体内 CLOCK 蛋白水平。单次腹腔注射 25 mg/kg 的 CLK8 可降低小鼠肝脏全细胞裂解液中的 CLOCK 蛋白水平。这种降低具有特异性,因为其他昼夜节律蛋白(如 BMAL1 和 CRY1)的水平保持不变。
酶活实验
这些文献中并未描述标准的非细胞CLK8检测方法,因为其作用机制涉及破坏蛋白质-蛋白质相互作用。然而,为了研究其结合,可以进行表面等离子共振(SPR)检测。将重组CLOCK和BMAL1蛋白固定在芯片上,然后通入不同浓度的CLK8,以测量其结合亲和力和动力学。
细胞实验
为了测量 CLK8 对生物钟的影响,我们使用稳定表达 Bmal1-dLuc 报告基因的 U2OS 或 NIH 3T3 细胞。首先用 100 nM 地塞米松处理细胞 2 小时使其同步化。然后,将培养基更换为含有不同浓度 CLK8(10-40 uM)的新鲜培养基。在 37℃ 下,使用发光仪连续记录 4-6 天的发光强度,以测量其对生物钟振幅和周期的影响。
动物实验
动物/疾病模型:雄性C57BL/6J小鼠(8周龄,18-24 g)[1]
剂量:25 mg/kg
给药途径:单次腹腔注射
实验结果:在小鼠肝脏全细胞裂解液中检测到CLOCK水平降低,而BMAL1和CRY1水平未发生改变。细胞核内CLOCK丰度降低。胞质和细胞核内BMAL1和CRY1丰度未发生改变。Cry1转录水平降低。
CLK8 的体内实验方案包括将该化合物注射到 C57BL/6J 小鼠体内。将 25 mg/kg 的 CLK8 溶于溶剂(例如,5% DMSO、45% PEG300 和 50% 水)中,并通过腹腔注射给药。在指定时间(例如,6-12 小时)后,处死小鼠并收集肝组织。然后通过蛋白质印迹法分析肝组织裂解液中 CLOCK 蛋白的水平。
药代性质 (ADME/PK)
CLK8的具体药代动力学数据尚不详细。然而,一项毒性研究表明其耐受性良好。单次腹腔注射25 mg/kg即可降低肝脏中CLOCK蛋白的水平,这表明该化合物可通过此给药途径获得全身生物利用度,但未提供诸如t1/2或Cmax等详细参数。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
对小鼠进行了毒性评估。CLK8 通过腹腔注射给药,剂量范围为 5 至 1000 mg/kg。在 5 和 25 mg/kg 剂量下,未观察到死亡或毒性临床症状。监测的临床症状包括呼吸困难、反射减弱、运动活性降低、竖毛、弓背姿势和角膜混浊。
参考文献

[1]. A CLOCK-binding small molecule disrupts the interaction between CLOCK and BMAL1 and enhances circadian rhythm amplitude. J Biol Chem. 2020 Mar 13;295(11):3518-3531.

其他信息
CLK8 是一种独特的药理学工具,因为它靶向的是 CLOCK 和 BMAL1 之间的蛋白质-蛋白质相互作用,而非酶活性位点。这种作用机制能够在不改变周期长度的情况下调节昼夜节律的振幅,这可能有利于治疗与昼夜节律减弱相关的疾病,例如某些睡眠障碍或代谢综合征。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C29H26N2O6
分子量
498.526547908783
精确质量
498.179
CAS号
898920-65-5
PubChem CID
4869040
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
4.4
tPSA
117
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
37
分子复杂度/Complexity
910
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C(N)(=O)C1=CC=CC=C1NC(COC1=C2C(C3=CC=CC=C3)=CC(=O)OC2=C2CCC(C)(C)OC2=C1)=O
InChi Key
SVELPNHVEDZZRQ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C29H26N2O6/c1-29(2)13-12-19-22(37-29)15-23(35-16-24(32)31-21-11-7-6-10-18(21)28(30)34)26-20(14-25(33)36-27(19)26)17-8-4-3-5-9-17/h3-11,14-15H,12-13,16H2,1-2H3,(H2,30,34)(H,31,32)
化学名
2-[[2-[(8,8-dimethyl-2-oxo-4-phenyl-9,10-dihydropyrano[2,3-h]chromen-5-yl)oxy]acetyl]amino]benzamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 50 mg/mL (100.29 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
View More

注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
View More

口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0059 mL 10.0295 mL 20.0590 mL
5 mM 0.4012 mL 2.0059 mL 4.0118 mL
10 mM 0.2006 mL 1.0029 mL 2.0059 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们