Carboxyaminoimidazole ribotide (CAIR; 4-Carboxy-AIR)

别名: 4-羧基-5-氨基咪唑核苷酸
目录号: V72497 纯度: ≥98%
羧氨基咪唑核苷酸 (CAIR) 是大肠杆菌的代谢产物。
Carboxyaminoimidazole ribotide (CAIR; 4-Carboxy-AIR) CAS号: 6001-14-5
产品类别: Endogenous Metabolite
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
羧氨基咪唑核糖肽(CAIR)是大肠杆菌的代谢产物。羧氨基咪唑核糖肽可用于检测大肠杆菌PurE活性位点的独特特征,并从头合成真菌嘌呤。
羧基氨基咪唑核糖肽(CAIR;CAS:6001-14-5)是嘌呤从头合成途径中一种重要的天然生化中间体。具体而言,它是磷酸核糖基氨基咪唑-琥珀酰甲酰胺合成酶(SAICAR合成酶)的底物。这种化合物是存在于大肠杆菌等生物体内的内源性代谢物,并被用作酶学和生化途径分析的研究工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
CAIR is a key metabolite and the direct substrate for the enzyme SAICAR synthetase, the seventh step in the purine biosynthesis pathway. Its primary molecular target is this enzyme's active site. It is not a pharmacological target itself but is an essential intermediate. The enzymes that act on CAIR are potential targets for the development of antibiotics and anticancer drugs, as rapidly dividing cells have a high demand for purines.
体外研究 (In Vitro)
CAIR本身没有直接的药理活性,但它是体外研究酶功能的重要工具。它被用作特异性底物,用于测定其同源酶SAICAR合成酶的活性。在纯化体系中,可以监测CAIR转化为其产物SAICAR的过程。这使得我们能够详细表征该酶的动力学,并可用于筛选嘌呤合成这一步骤的抑制剂。
体内研究 (In Vivo)
在体内,CAIR 是一种短暂但至关重要的中间体。CAIR 是嘌呤从头合成途径的一部分,该途径对细胞增殖至关重要,因为它产生 DNA 和 RNA 的构建单元。未标记的 CAIR 不具有治疗作用;它的存在是短暂的,因为它会迅速转化为下一个代谢物。d8 标记的 CAIR 可用于追踪 CAIR 在生物体内的代谢途径。
酶活实验
对于体外(非细胞)检测,CAIR溶解于特定pH值的适宜缓冲液中,例如Tris-HCl或HEPES缓冲液。然后,将其与另一种底物L-天冬氨酸和能量来源ATP一起,作为底物与纯化的SAICAR合成酶进行酶促反应。通常使用高效液相色谱(HPLC)或液相色谱-质谱联用(LC-MS)监测CAIR的消失或产物SAICAR的生成,从而追踪反应进程。
细胞实验
在体外细胞实验中,通常不会向培养基中添加CAIR,因为它是一种细胞内代谢物,难以被细胞有效吸收。为了研究该代谢途径,研究人员使用同位素标记的前体,例如甘氨酸或甲酸,这些前体可以掺入嘌呤环中。然后,可以从细胞中提取标记的CAIR,并通过质谱分析来评估该特定生物合成步骤的通量。
动物实验
CAIR并非动物实验中常用的外源性化合物。为了在体内研究该通路,通常将标记的前体物质输注到动物体内。组织中内源性中间体(如CAIR)的浓度可以通过离体测量来评估通路活性。对于靶向示踪剂,可以输注下游代谢物的稳定同位素标记物来研究逆向代谢,但这属于高度专业化的方法。
药代性质 (ADME/PK)
作为一种高度极性的磷酸化核糖中间体,CAIR并非药物,也没有明确的药代动力学参数。它是一种可透过细胞膜的中间体,短暂存在于细胞内。任何可能存在于血液中的CAIR都可能不稳定,并会被普遍存在的磷酸酶迅速去磷酸化或分解,因此无法被肠道完整吸收。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
CAIR是一种天然的低分子量细胞内代谢产物,在生理浓度下被认为无毒。它并非常用的科研化学品,通常不会大量使用,因此缺乏正式的毒性数据。然而,与许多代谢中间体一样,它应被视为潜在的轻微刺激物,因此应遵守处理生化化学品的标准安全预防措施。
参考文献

[1]. Biochemical role of the Cryptococcus neoformans ADE2 protein in fungal de novo purine biosynthesis. Arch Biochem Biophys. 1998 Mar 1;351(1):123-34.

其他信息
5-氨基-1-(5-磷酸-D-核糖基)咪唑-4-羧酸是一种1-(磷酸-核糖基)咪唑鎓、咪唑鎓-4-羧酸和氨基咪唑鎓。它是大肠杆菌和小鼠的代谢产物。它是5-氨基-1-(5-膦酰基-D-核糖基)咪唑鎓-4-羧酸和5-氨基-1-(5-膦酰基-D-核糖基)咪唑鎓-4-羧酸(2-)的共轭酸。5-氨基-1-(5-磷酸-D-核糖基)咪唑鎓-4-羧酸是存在于大肠杆菌(K12菌株、MG1655菌株)中或由其产生的代谢产物。 5-氨基-1-(5-磷酸-D-核糖基)咪唑-4-羧酸是酿酒酵母中存在或产生的代谢物。
CAIR并非药物,而是一种研究用生化试剂。其主要用途是作为研究嘌呤合成生化过程的工具。它用于表征嘌呤生物合成途径中酶的功能和结构,特别是SAICAR合成酶(大肠杆菌中的PurC)和PurE(负责生成咪唑环)。这项研究对于开发靶向这些代谢途径的新型抗生素或抗癌药物至关重要。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C9H14N3O9P
分子量
339.20
精确质量
339.046
CAS号
6001-14-5
PubChem CID
165388
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
密度
2.3±0.1 g/cm3
沸点
865.9±75.0 °C at 760 mmHg
闪点
477.5±37.1 °C
蒸汽压
0.0±0.3 mmHg at 25°C
折射率
1.809
LogP
-0.87
tPSA
207.4
氢键供体(HBD)数目
6
氢键受体(HBA)数目
11
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
22
分子复杂度/Complexity
473
定义原子立体中心数目
4
SMILES
C1=NC(=C(N1[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)COP(=O)(O)O)O)O)N)C(=O)O
InChi Key
XFVULMDJZXYMSG-ZIYNGMLESA-N
InChi Code
InChI=1S/C9H14N3O9P/c10-7-4(9(15)16)11-2-12(7)8-6(14)5(13)3(21-8)1-20-22(17,18)19/h2-3,5-6,8,13-14H,1,10H2,(H,15,16)(H2,17,18,19)/t3-,5-,6-,8-/m1/s1
化学名
5-amino-1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(phosphonooxymethyl)oxolan-2-yl]imidazole-4-carboxylic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O: 250 mg/mL (737.03 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.9481 mL 14.7406 mL 29.4811 mL
5 mM 0.5896 mL 2.9481 mL 5.8962 mL
10 mM 0.2948 mL 1.4741 mL 2.9481 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

临床试验信息
Title:Quality-of-Life Management for COPD Patients
Status:Completed
updateDate:2022-11-08
Ctid:NCT04373070

Link: https://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT04373070

Conditions:Copd|Chronic Respiratory Disease
Interventions:CAir
Phase:N/A
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